FuNGI

A0A3D8SQG9

Protein Details

Accession

A0A3D8SQG9

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
108-128	GAAKSKFKPKIIRRDQSERDL	Hydrophilic
406-434	SPVAKKTRSHSHSKKKKDKKPVLQTEEDK	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
4-22	KGAPRGRGAGRGRGRGGKA
108-119	GAAKSKFKPKII
146-164	FKASRAAKAMMRGRGRGRG
410-425	KKTRSHSHSKKKKDKK

Subcellular Location(s)

nucl 15, mito 10

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MPPKGAPRGRGAGRGRGRGGKAAASTAPEGDQPSTDTGIEGTASSADPATNNASTQPSPNSSPVDVPTETPASTPNQPPIQRAPSSRGRGDSARGASSSRGRGDSTAGAAKSKFKPKIIRRDQSERDLLQQQAEKRAEQLRKDAEFKASRAAKAMMRGRGRGRGDAMGRGTLLGRGGGGTASGPFAMAPDEIKRSGGDFTGFSVSSSGGGGGGGGGGGSGGRSGGFSTSKGIKTEGGGSWGSGGGSGGRGRNPGDADFYEPNYPDEDDGPRIDIERINLVSDDDEPVVTSVAKVNKSKAAPGRGGLRPVRLDRVEHKERVAIVNTDSAVKLPDDEDDSDVVMADGNAASRIAPPVEPQREWKGVYLDDEDIKVKPEEDASLVLASIPSPELKKAELVAGAKSEIVSPVAKKTRSHSHSKKKKDKKPVLQTEEDKAEYERHLEDVAILANELGGLQAARADTDGDINMEGGTEGQVDQKEGRLYLFQFPPILPPLCHPDEAGGDVEIVGATSHDNEFTKLEGQEEEVVIKTENKDDFFQGREQLVSEEGFIGKLIVRESGKVELSWGGTSLVVGRGVESGFLSTVVVTDDRPGMDEGVAMGMGKVMGKFVVTPDFEKMI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.64
2	0.62
3	0.61
4	0.6
5	0.56
6	0.54
7	0.48
8	0.42
9	0.38
10	0.34
11	0.3
12	0.29
13	0.24
14	0.23
15	0.2
16	0.21
17	0.18
18	0.18
19	0.16
20	0.18
21	0.19
22	0.18
23	0.16
24	0.14
25	0.14
26	0.13
27	0.11
28	0.09
29	0.08
30	0.08
31	0.08
32	0.08
33	0.08
34	0.08
35	0.1
36	0.14
37	0.14
38	0.14
39	0.16
40	0.2
41	0.21
42	0.24
43	0.27
44	0.26
45	0.3
46	0.33
47	0.35
48	0.32
49	0.34
50	0.33
51	0.34
52	0.3
53	0.28
54	0.28
55	0.26
56	0.25
57	0.22
58	0.22
59	0.21
60	0.26
61	0.28
62	0.31
63	0.36
64	0.38
65	0.42
66	0.48
67	0.51
68	0.5
69	0.5
70	0.5
71	0.51
72	0.56
73	0.55
74	0.51
75	0.48
76	0.46
77	0.47
78	0.47
79	0.41
80	0.36
81	0.33
82	0.31
83	0.31
84	0.34
85	0.35
86	0.3
87	0.29
88	0.27
89	0.28
90	0.3
91	0.28
92	0.26
93	0.26
94	0.23
95	0.23
96	0.23
97	0.29
98	0.33
99	0.4
100	0.41
101	0.42
102	0.52
103	0.6
104	0.7
105	0.74
106	0.77
107	0.76
108	0.81
109	0.81
110	0.78
111	0.76
112	0.66
113	0.6
114	0.56
115	0.49
116	0.43
117	0.42
118	0.37
119	0.38
120	0.39
121	0.34
122	0.33
123	0.4
124	0.41
125	0.39
126	0.44
127	0.43
128	0.45
129	0.49
130	0.46
131	0.47
132	0.45
133	0.43
134	0.44
135	0.4
136	0.36
137	0.36
138	0.36
139	0.3
140	0.35
141	0.4
142	0.38
143	0.38
144	0.42
145	0.42
146	0.47
147	0.48
148	0.42
149	0.39
150	0.37
151	0.35
152	0.35
153	0.33
154	0.26
155	0.24
156	0.21
157	0.19
158	0.14
159	0.13
160	0.08
161	0.06
162	0.05
163	0.06
164	0.05
165	0.05
166	0.04
167	0.04
168	0.05
169	0.05
170	0.04
171	0.04
172	0.04
173	0.05
174	0.05
175	0.06
176	0.08
177	0.11
178	0.11
179	0.12
180	0.12
181	0.12
182	0.13
183	0.13
184	0.12
185	0.09
186	0.11
187	0.14
188	0.13
189	0.12
190	0.12
191	0.11
192	0.1
193	0.1
194	0.08
195	0.05
196	0.05
197	0.04
198	0.03
199	0.03
200	0.02
201	0.02
202	0.02
203	0.02
204	0.02
205	0.02
206	0.02
207	0.02
208	0.02
209	0.03
210	0.03
211	0.05
212	0.06
213	0.07
214	0.1
215	0.15
216	0.16
217	0.17
218	0.18
219	0.17
220	0.17
221	0.2
222	0.17
223	0.16
224	0.15
225	0.14
226	0.13
227	0.13
228	0.11
229	0.07
230	0.07
231	0.04
232	0.05
233	0.07
234	0.08
235	0.08
236	0.1
237	0.1
238	0.13
239	0.14
240	0.13
241	0.15
242	0.14
243	0.18
244	0.19
245	0.2
246	0.19
247	0.18
248	0.18
249	0.16
250	0.16
251	0.12
252	0.12
253	0.12
254	0.12
255	0.12
256	0.13
257	0.11
258	0.12
259	0.12
260	0.12
261	0.11
262	0.12
263	0.12
264	0.11
265	0.11
266	0.1
267	0.1
268	0.1
269	0.1
270	0.07
271	0.07
272	0.06
273	0.06
274	0.06
275	0.06
276	0.05
277	0.07
278	0.1
279	0.14
280	0.15
281	0.16
282	0.21
283	0.21
284	0.26
285	0.27
286	0.28
287	0.26
288	0.27
289	0.32
290	0.28
291	0.33
292	0.29
293	0.27
294	0.26
295	0.26
296	0.28
297	0.23
298	0.23
299	0.24
300	0.32
301	0.34
302	0.32
303	0.32
304	0.29
305	0.3
306	0.3
307	0.26
308	0.18
309	0.14
310	0.14
311	0.14
312	0.13
313	0.12
314	0.1
315	0.09
316	0.08
317	0.07
318	0.06
319	0.06
320	0.08
321	0.09
322	0.09
323	0.09
324	0.09
325	0.09
326	0.08
327	0.07
328	0.05
329	0.04
330	0.03
331	0.03
332	0.03
333	0.03
334	0.03
335	0.03
336	0.04
337	0.05
338	0.05
339	0.05
340	0.08
341	0.16
342	0.2
343	0.2
344	0.24
345	0.29
346	0.32
347	0.32
348	0.32
349	0.26
350	0.23
351	0.25
352	0.23
353	0.19
354	0.17
355	0.17
356	0.16
357	0.13
358	0.15
359	0.13
360	0.1
361	0.09
362	0.09
363	0.09
364	0.09
365	0.1
366	0.09
367	0.09
368	0.08
369	0.08
370	0.07
371	0.06
372	0.05
373	0.05
374	0.05
375	0.06
376	0.07
377	0.08
378	0.09
379	0.1
380	0.1
381	0.11
382	0.13
383	0.14
384	0.13
385	0.13
386	0.13
387	0.12
388	0.11
389	0.1
390	0.07
391	0.08
392	0.08
393	0.08
394	0.15
395	0.21
396	0.23
397	0.24
398	0.29
399	0.38
400	0.41
401	0.51
402	0.55
403	0.61
404	0.69
405	0.79
406	0.85
407	0.85
408	0.9
409	0.9
410	0.91
411	0.9
412	0.91
413	0.91
414	0.88
415	0.85
416	0.79
417	0.73
418	0.66
419	0.56
420	0.46
421	0.36
422	0.31
423	0.23
424	0.22
425	0.17
426	0.14
427	0.13
428	0.12
429	0.11
430	0.1
431	0.1
432	0.08
433	0.07
434	0.06
435	0.05
436	0.05
437	0.05
438	0.03
439	0.03
440	0.03
441	0.02
442	0.04
443	0.04
444	0.04
445	0.05
446	0.06
447	0.06
448	0.07
449	0.08
450	0.07
451	0.07
452	0.08
453	0.07
454	0.06
455	0.06
456	0.05
457	0.05
458	0.05
459	0.05
460	0.07
461	0.08
462	0.09
463	0.1
464	0.13
465	0.14
466	0.14
467	0.15
468	0.15
469	0.17
470	0.23
471	0.24
472	0.22
473	0.23
474	0.22
475	0.25
476	0.27
477	0.26
478	0.2
479	0.21
480	0.27
481	0.28
482	0.28
483	0.25
484	0.22
485	0.22
486	0.23
487	0.22
488	0.14
489	0.12
490	0.11
491	0.11
492	0.08
493	0.07
494	0.05
495	0.04
496	0.04
497	0.05
498	0.06
499	0.08
500	0.09
501	0.1
502	0.11
503	0.13
504	0.16
505	0.15
506	0.16
507	0.15
508	0.17
509	0.18
510	0.18
511	0.17
512	0.14
513	0.14
514	0.14
515	0.16
516	0.15
517	0.18
518	0.2
519	0.22
520	0.23
521	0.26
522	0.28
523	0.29
524	0.31
525	0.29
526	0.28
527	0.26
528	0.25
529	0.22
530	0.21
531	0.18
532	0.15
533	0.13
534	0.12
535	0.11
536	0.1
537	0.1
538	0.09
539	0.1
540	0.1
541	0.14
542	0.14
543	0.16
544	0.19
545	0.23
546	0.23
547	0.21
548	0.22
549	0.2
550	0.21
551	0.2
552	0.18
553	0.14
554	0.12
555	0.13
556	0.13
557	0.12
558	0.11
559	0.1
560	0.1
561	0.11
562	0.11
563	0.11
564	0.1
565	0.09
566	0.09
567	0.09
568	0.08
569	0.07
570	0.07
571	0.09
572	0.09
573	0.08
574	0.1
575	0.12
576	0.12
577	0.14
578	0.15
579	0.14
580	0.14
581	0.14
582	0.12
583	0.11
584	0.11
585	0.08
586	0.07
587	0.06
588	0.07
589	0.07
590	0.07
591	0.06
592	0.06
593	0.07
594	0.08
595	0.1
596	0.17
597	0.18
598	0.21

A0A3D8SQG9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer