Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3D8SFG0

Protein Details
Accession A0A3D8SFG0    Localization Confidence High Confidence Score 16.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
13-32LELKGRSKPNAPFKPPRPAMHydrophilic
298-322RFSEKIQRHSTKKRRRETKEEDSEDBasic
429-455FTQQTKFCRSHQKKSAKTKWQSKGYPEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
294-313GVKSRFSEKIQRHSTKKRRR
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 10.833, cyto 5, cyto_mito 4.833, mito 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039024  RTC4  
IPR028094  RTC4_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF14474  RTC4  
Amino Acid Sequences MATRERQIVYQGLELKGRSKPNAPFKPPRPAMPQSRNASNPSLVETEPGLINPIEDIHAPPISSSDEDDCSANIKHTHFGSRAKSREETASAKPSSRLTATATTKKRNAGSFAKPSRPGRAQESPAPLGWTAGARHLKNKMPTYGKSEKLKAGQSFLTSRKPLRGKGSDSEESVELESPQPAKLPVVAKKMTSRKRSISSSPRKELINFSDIDDTPEKPRYGTPEAGLGWVDPAGLCDSISPEPNRRLKDIASPLSNSTFIRPDSLSDDCSDLDRKLSPADVDVRSTPVRHKSGVKSRFSEKIQRHSTKKRRRETKEEDSEDEVQPAFVVPEGSDIAETSFDFKPIDFGEDDSLLNHVPDIAKAMAQEDGYGELLKGLDGAGRRSSFLAERDANSTTIPGIVCPVCNEPVDEDDLKAWIEKTGKKNMDFTQQTKFCRSHQKKSAKTKWQSKGYPEIDWDELDSRVSRQHTLIKVLIRGGPCYYRTALDRAVKSGKHRTLKEMSSGLVPGYYGSRGLRVMQENIMKNFSALLKERAMKDRLISARGVPSFVQAVLVLEVACVLIMEDMKIEEEEARTVLKDSIRLGELVNDEAKEFVRKRASTDDELSD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.34
3 0.36
4 0.39
5 0.37
6 0.39
7 0.46
8 0.54
9 0.64
10 0.69
11 0.73
12 0.75
13 0.82
14 0.78
15 0.76
16 0.74
17 0.72
18 0.74
19 0.73
20 0.75
21 0.7
22 0.74
23 0.71
24 0.66
25 0.62
26 0.54
27 0.45
28 0.4
29 0.37
30 0.29
31 0.27
32 0.23
33 0.21
34 0.18
35 0.17
36 0.15
37 0.12
38 0.12
39 0.11
40 0.11
41 0.1
42 0.1
43 0.12
44 0.13
45 0.14
46 0.14
47 0.14
48 0.15
49 0.16
50 0.16
51 0.17
52 0.16
53 0.18
54 0.19
55 0.19
56 0.18
57 0.18
58 0.18
59 0.19
60 0.2
61 0.19
62 0.22
63 0.24
64 0.3
65 0.31
66 0.37
67 0.43
68 0.48
69 0.52
70 0.53
71 0.53
72 0.5
73 0.51
74 0.5
75 0.46
76 0.43
77 0.47
78 0.43
79 0.42
80 0.42
81 0.38
82 0.37
83 0.33
84 0.28
85 0.25
86 0.32
87 0.37
88 0.44
89 0.49
90 0.52
91 0.55
92 0.58
93 0.58
94 0.53
95 0.52
96 0.5
97 0.52
98 0.56
99 0.59
100 0.61
101 0.64
102 0.63
103 0.65
104 0.63
105 0.58
106 0.55
107 0.57
108 0.54
109 0.54
110 0.58
111 0.52
112 0.47
113 0.45
114 0.37
115 0.29
116 0.25
117 0.19
118 0.13
119 0.18
120 0.24
121 0.23
122 0.28
123 0.33
124 0.38
125 0.43
126 0.47
127 0.47
128 0.47
129 0.49
130 0.54
131 0.56
132 0.58
133 0.57
134 0.56
135 0.53
136 0.52
137 0.56
138 0.48
139 0.44
140 0.39
141 0.36
142 0.37
143 0.36
144 0.38
145 0.35
146 0.35
147 0.4
148 0.42
149 0.44
150 0.47
151 0.5
152 0.48
153 0.51
154 0.57
155 0.51
156 0.48
157 0.46
158 0.37
159 0.32
160 0.27
161 0.22
162 0.14
163 0.12
164 0.13
165 0.11
166 0.11
167 0.11
168 0.1
169 0.1
170 0.14
171 0.18
172 0.22
173 0.29
174 0.3
175 0.31
176 0.38
177 0.48
178 0.52
179 0.54
180 0.54
181 0.54
182 0.58
183 0.62
184 0.63
185 0.65
186 0.67
187 0.69
188 0.68
189 0.65
190 0.6
191 0.56
192 0.53
193 0.46
194 0.39
195 0.3
196 0.27
197 0.29
198 0.27
199 0.29
200 0.25
201 0.22
202 0.22
203 0.26
204 0.24
205 0.2
206 0.21
207 0.24
208 0.28
209 0.28
210 0.25
211 0.25
212 0.26
213 0.25
214 0.24
215 0.17
216 0.12
217 0.1
218 0.09
219 0.04
220 0.05
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.08
226 0.09
227 0.13
228 0.14
229 0.17
230 0.24
231 0.3
232 0.32
233 0.31
234 0.32
235 0.3
236 0.37
237 0.4
238 0.37
239 0.34
240 0.33
241 0.32
242 0.32
243 0.32
244 0.24
245 0.18
246 0.16
247 0.14
248 0.15
249 0.14
250 0.14
251 0.16
252 0.17
253 0.16
254 0.14
255 0.15
256 0.13
257 0.14
258 0.15
259 0.11
260 0.11
261 0.11
262 0.11
263 0.1
264 0.1
265 0.09
266 0.1
267 0.15
268 0.14
269 0.15
270 0.15
271 0.17
272 0.17
273 0.18
274 0.19
275 0.21
276 0.22
277 0.23
278 0.27
279 0.32
280 0.41
281 0.48
282 0.49
283 0.46
284 0.47
285 0.51
286 0.49
287 0.5
288 0.44
289 0.46
290 0.51
291 0.55
292 0.59
293 0.64
294 0.72
295 0.73
296 0.79
297 0.79
298 0.8
299 0.81
300 0.84
301 0.83
302 0.83
303 0.83
304 0.77
305 0.7
306 0.64
307 0.6
308 0.49
309 0.41
310 0.29
311 0.19
312 0.15
313 0.12
314 0.08
315 0.04
316 0.04
317 0.03
318 0.05
319 0.05
320 0.05
321 0.05
322 0.05
323 0.05
324 0.06
325 0.06
326 0.08
327 0.08
328 0.09
329 0.09
330 0.09
331 0.1
332 0.1
333 0.12
334 0.09
335 0.1
336 0.11
337 0.12
338 0.12
339 0.1
340 0.1
341 0.08
342 0.08
343 0.07
344 0.06
345 0.05
346 0.05
347 0.07
348 0.07
349 0.07
350 0.07
351 0.08
352 0.09
353 0.09
354 0.09
355 0.06
356 0.07
357 0.07
358 0.07
359 0.06
360 0.05
361 0.06
362 0.05
363 0.05
364 0.04
365 0.05
366 0.06
367 0.08
368 0.11
369 0.11
370 0.12
371 0.12
372 0.14
373 0.14
374 0.15
375 0.19
376 0.18
377 0.19
378 0.21
379 0.22
380 0.21
381 0.19
382 0.18
383 0.12
384 0.12
385 0.1
386 0.08
387 0.09
388 0.09
389 0.09
390 0.11
391 0.13
392 0.13
393 0.13
394 0.14
395 0.12
396 0.13
397 0.17
398 0.16
399 0.14
400 0.13
401 0.13
402 0.13
403 0.12
404 0.11
405 0.1
406 0.13
407 0.19
408 0.24
409 0.33
410 0.38
411 0.39
412 0.44
413 0.44
414 0.5
415 0.49
416 0.47
417 0.47
418 0.48
419 0.49
420 0.49
421 0.48
422 0.43
423 0.5
424 0.55
425 0.55
426 0.59
427 0.67
428 0.72
429 0.81
430 0.86
431 0.85
432 0.87
433 0.88
434 0.87
435 0.86
436 0.81
437 0.75
438 0.76
439 0.68
440 0.61
441 0.53
442 0.47
443 0.39
444 0.34
445 0.3
446 0.21
447 0.19
448 0.17
449 0.15
450 0.13
451 0.16
452 0.17
453 0.17
454 0.18
455 0.26
456 0.27
457 0.31
458 0.34
459 0.33
460 0.33
461 0.33
462 0.34
463 0.28
464 0.26
465 0.24
466 0.23
467 0.22
468 0.24
469 0.23
470 0.21
471 0.23
472 0.26
473 0.3
474 0.34
475 0.34
476 0.35
477 0.4
478 0.4
479 0.43
480 0.5
481 0.51
482 0.52
483 0.53
484 0.55
485 0.57
486 0.58
487 0.57
488 0.49
489 0.42
490 0.35
491 0.34
492 0.26
493 0.19
494 0.16
495 0.11
496 0.11
497 0.1
498 0.1
499 0.1
500 0.11
501 0.12
502 0.14
503 0.19
504 0.21
505 0.24
506 0.28
507 0.34
508 0.37
509 0.39
510 0.39
511 0.33
512 0.29
513 0.29
514 0.25
515 0.23
516 0.21
517 0.23
518 0.26
519 0.31
520 0.36
521 0.4
522 0.41
523 0.37
524 0.36
525 0.41
526 0.39
527 0.37
528 0.34
529 0.31
530 0.36
531 0.35
532 0.35
533 0.27
534 0.25
535 0.24
536 0.23
537 0.2
538 0.12
539 0.13
540 0.12
541 0.12
542 0.09
543 0.07
544 0.07
545 0.06
546 0.06
547 0.04
548 0.04
549 0.04
550 0.05
551 0.05
552 0.06
553 0.06
554 0.08
555 0.08
556 0.09
557 0.09
558 0.11
559 0.12
560 0.12
561 0.13
562 0.13
563 0.14
564 0.17
565 0.17
566 0.19
567 0.2
568 0.24
569 0.24
570 0.24
571 0.22
572 0.24
573 0.24
574 0.24
575 0.24
576 0.2
577 0.19
578 0.2
579 0.2
580 0.23
581 0.23
582 0.28
583 0.35
584 0.35
585 0.4
586 0.49
587 0.54
588 0.53