Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3D8R1C9

Protein Details
Accession A0A3D8R1C9    Localization Confidence High Confidence Score 20.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MRGKRSKQYRKLMQQYGLSFHydrophilic
209-229DAAAKKKSKYGKGPKGPNPLSHydrophilic
262-288TADGSEPGSKKKRRRKHKSGNEGGDSEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
180-193LKGRGSGSQGMKRK
212-237AKKKSKYGKGPKGPNPLSVKKSKKKA
269-280GSKKKRRRKHKS
Subcellular Location(s) nucl 12, mito 12, mito_nucl 12
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006984  Fcf1/Utp23  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF04900  Fcf1  
CDD cd09865  PIN_ScUtp23p-like  
Amino Acid Sequences MRGKRSKQYRKLMQQYGLSFGFREPYQVLVDAEILKDADRFKMDLVGGLERTLHGKVKPMITQCSMRHLYAATNEPGMSFVIDKAKMYERRRCDHRPEDYPEPLSAKECLASVVDPKGAKTNKHRYVVASQELEVRKHMRGILGVPLVYINRSVMIMEPMAGATAEMREKEEKVKFRDGLKGRGSGSQGMKRKREDDGDDKETANDGADAAAKKKSKYGKGPKGPNPLSVKKSKKKADGEATAPEKKQDAEEAGDASTVAATADGSEPGSKKKRRRKHKSGNEGGDSEAVAASREGAEADMDVDAED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.73
3 0.68
4 0.59
5 0.48
6 0.38
7 0.31
8 0.28
9 0.2
10 0.22
11 0.16
12 0.17
13 0.19
14 0.2
15 0.2
16 0.17
17 0.19
18 0.16
19 0.16
20 0.14
21 0.12
22 0.1
23 0.12
24 0.12
25 0.13
26 0.14
27 0.14
28 0.14
29 0.19
30 0.18
31 0.2
32 0.21
33 0.22
34 0.2
35 0.2
36 0.19
37 0.15
38 0.17
39 0.15
40 0.16
41 0.13
42 0.2
43 0.23
44 0.28
45 0.33
46 0.35
47 0.38
48 0.39
49 0.45
50 0.39
51 0.44
52 0.43
53 0.37
54 0.34
55 0.3
56 0.28
57 0.25
58 0.29
59 0.21
60 0.19
61 0.19
62 0.18
63 0.18
64 0.16
65 0.12
66 0.08
67 0.09
68 0.12
69 0.13
70 0.13
71 0.15
72 0.22
73 0.3
74 0.35
75 0.42
76 0.44
77 0.51
78 0.59
79 0.63
80 0.65
81 0.66
82 0.68
83 0.68
84 0.69
85 0.68
86 0.65
87 0.6
88 0.52
89 0.45
90 0.37
91 0.31
92 0.24
93 0.17
94 0.14
95 0.12
96 0.11
97 0.09
98 0.09
99 0.09
100 0.1
101 0.12
102 0.12
103 0.12
104 0.19
105 0.2
106 0.24
107 0.31
108 0.41
109 0.46
110 0.5
111 0.5
112 0.46
113 0.5
114 0.51
115 0.46
116 0.36
117 0.29
118 0.31
119 0.31
120 0.29
121 0.25
122 0.22
123 0.18
124 0.18
125 0.18
126 0.13
127 0.12
128 0.13
129 0.15
130 0.13
131 0.13
132 0.11
133 0.11
134 0.1
135 0.1
136 0.09
137 0.05
138 0.04
139 0.04
140 0.05
141 0.04
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.04
149 0.04
150 0.03
151 0.04
152 0.05
153 0.05
154 0.07
155 0.08
156 0.09
157 0.15
158 0.2
159 0.25
160 0.29
161 0.36
162 0.37
163 0.38
164 0.47
165 0.44
166 0.46
167 0.43
168 0.42
169 0.37
170 0.37
171 0.36
172 0.32
173 0.34
174 0.33
175 0.37
176 0.4
177 0.44
178 0.44
179 0.44
180 0.43
181 0.44
182 0.43
183 0.44
184 0.46
185 0.46
186 0.45
187 0.43
188 0.39
189 0.35
190 0.28
191 0.2
192 0.12
193 0.07
194 0.06
195 0.08
196 0.09
197 0.1
198 0.14
199 0.16
200 0.16
201 0.22
202 0.28
203 0.33
204 0.43
205 0.53
206 0.59
207 0.67
208 0.77
209 0.8
210 0.84
211 0.78
212 0.75
213 0.72
214 0.68
215 0.65
216 0.64
217 0.66
218 0.63
219 0.71
220 0.71
221 0.72
222 0.73
223 0.76
224 0.76
225 0.72
226 0.68
227 0.67
228 0.65
229 0.61
230 0.54
231 0.45
232 0.37
233 0.31
234 0.29
235 0.24
236 0.2
237 0.19
238 0.2
239 0.2
240 0.19
241 0.18
242 0.16
243 0.13
244 0.1
245 0.06
246 0.05
247 0.04
248 0.03
249 0.04
250 0.05
251 0.06
252 0.07
253 0.1
254 0.11
255 0.19
256 0.29
257 0.36
258 0.45
259 0.56
260 0.65
261 0.74
262 0.84
263 0.88
264 0.9
265 0.94
266 0.95
267 0.95
268 0.94
269 0.89
270 0.79
271 0.69
272 0.59
273 0.47
274 0.36
275 0.26
276 0.16
277 0.11
278 0.09
279 0.08
280 0.07
281 0.08
282 0.07
283 0.07
284 0.07
285 0.07
286 0.08
287 0.07