Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3D8RBC4

Protein Details
Accession A0A3D8RBC4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
228-250AGSGGKAKRERERKQKQVLDIDQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
100-105RGRGGR
233-241KAKRERERK
262-300GFRGGRGGDRGDGPRGRGRGGRGRGDFNSPRGRGAPRGG
Subcellular Location(s) cyto_nucl 11.5, nucl 10.5, cyto 9.5, pero 3, mito 1, extr 1, cysk 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04774  HABP4_PAI-RBP1  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences MTEIASKNLYELLGNTHDEDSDKEPEPPVKVIDKTPARTTKRNAPAEAPASKAPVEGRGGRRGGYSGNEGAFRDRNAGSANNRGKPTEDRAAGTYDGRGRGRGGRGRGNFDRHSRNVVGDSEKQVGHGWGATEGGAELADEQAGEAIAKSEQKEALTGDGQGAEAEAEQEPEDNSISYADYLAQQAEKKLALGAPIPEARKPNEGSKQDKKWANAKAITKEEEEDFVAGSGGKAKRERERKQKQVLDIDQRFVEPPQQSRGGFRGGRGGDRGDGPRGRGRGGRGRGDFNSPRGRGAPRGGAPGASIKIDDASAFPSLGA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.21
3 0.2
4 0.2
5 0.2
6 0.23
7 0.21
8 0.23
9 0.23
10 0.23
11 0.26
12 0.3
13 0.32
14 0.31
15 0.3
16 0.31
17 0.32
18 0.33
19 0.39
20 0.43
21 0.44
22 0.51
23 0.56
24 0.58
25 0.63
26 0.66
27 0.67
28 0.7
29 0.72
30 0.66
31 0.6
32 0.61
33 0.59
34 0.56
35 0.49
36 0.4
37 0.35
38 0.32
39 0.3
40 0.23
41 0.21
42 0.22
43 0.26
44 0.29
45 0.34
46 0.35
47 0.34
48 0.34
49 0.31
50 0.29
51 0.24
52 0.24
53 0.2
54 0.21
55 0.21
56 0.21
57 0.24
58 0.24
59 0.21
60 0.21
61 0.18
62 0.18
63 0.19
64 0.22
65 0.22
66 0.3
67 0.36
68 0.37
69 0.39
70 0.38
71 0.38
72 0.38
73 0.42
74 0.4
75 0.35
76 0.32
77 0.32
78 0.34
79 0.32
80 0.29
81 0.25
82 0.2
83 0.22
84 0.21
85 0.2
86 0.19
87 0.23
88 0.29
89 0.31
90 0.32
91 0.36
92 0.39
93 0.46
94 0.49
95 0.51
96 0.49
97 0.5
98 0.52
99 0.46
100 0.49
101 0.42
102 0.38
103 0.34
104 0.32
105 0.3
106 0.26
107 0.27
108 0.24
109 0.23
110 0.22
111 0.2
112 0.18
113 0.14
114 0.12
115 0.09
116 0.07
117 0.07
118 0.06
119 0.05
120 0.05
121 0.05
122 0.04
123 0.03
124 0.03
125 0.03
126 0.03
127 0.03
128 0.02
129 0.02
130 0.03
131 0.03
132 0.02
133 0.03
134 0.04
135 0.05
136 0.06
137 0.07
138 0.08
139 0.08
140 0.09
141 0.09
142 0.1
143 0.1
144 0.09
145 0.08
146 0.07
147 0.07
148 0.06
149 0.06
150 0.04
151 0.03
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.05
158 0.05
159 0.06
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.07
171 0.07
172 0.08
173 0.09
174 0.09
175 0.08
176 0.08
177 0.08
178 0.08
179 0.09
180 0.09
181 0.11
182 0.15
183 0.15
184 0.17
185 0.19
186 0.2
187 0.23
188 0.25
189 0.29
190 0.34
191 0.4
192 0.46
193 0.52
194 0.57
195 0.6
196 0.62
197 0.59
198 0.57
199 0.57
200 0.56
201 0.53
202 0.52
203 0.5
204 0.5
205 0.49
206 0.43
207 0.39
208 0.33
209 0.28
210 0.23
211 0.17
212 0.13
213 0.1
214 0.09
215 0.07
216 0.07
217 0.12
218 0.12
219 0.16
220 0.19
221 0.23
222 0.32
223 0.43
224 0.53
225 0.57
226 0.67
227 0.74
228 0.81
229 0.83
230 0.81
231 0.81
232 0.79
233 0.79
234 0.71
235 0.63
236 0.53
237 0.48
238 0.41
239 0.32
240 0.3
241 0.23
242 0.23
243 0.26
244 0.31
245 0.3
246 0.33
247 0.35
248 0.36
249 0.34
250 0.31
251 0.34
252 0.3
253 0.33
254 0.31
255 0.31
256 0.25
257 0.28
258 0.3
259 0.29
260 0.29
261 0.31
262 0.34
263 0.34
264 0.35
265 0.34
266 0.38
267 0.41
268 0.46
269 0.51
270 0.49
271 0.54
272 0.53
273 0.59
274 0.57
275 0.54
276 0.57
277 0.49
278 0.48
279 0.46
280 0.47
281 0.43
282 0.45
283 0.46
284 0.39
285 0.45
286 0.42
287 0.38
288 0.36
289 0.36
290 0.32
291 0.23
292 0.21
293 0.15
294 0.15
295 0.15
296 0.14
297 0.1
298 0.11
299 0.12