Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A3D8RTB8

Protein Details
Accession A0A3D8RTB8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-37YLTASNPEKTSKKRKRKQGTSSGLIIAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
21-27SKKRKRK
158-171EEKAAGRGKKGKGK
Subcellular Location(s) mito 14.5, nucl 9, cyto_mito 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018609  Bud13  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
Pfam View protein in Pfam  
PF09736  Bud13  
Amino Acid Sequences MSLSSYLASKYLTASNPEKTSKKRKRKQGTSSGLIIADDDALGWGASTSADGDEDGQPLTVNSGSAEFRKAKKNAWKTVGVPALQPTSNGDDEAAEKIIRDAAAENAAALHADEEPVVEDDGVVKMGDGTHAGLQSASAVAEQFARRKREEAAAWEAEEKAAGRGKKGKGKDAGEETVYRDATGRRIDISMRRQEARRELDEKARKEAEEKEAQKGDVQRREQEKRRADLDEARFMPVARGVDDKEMNDDLREVERWNDPAAQFLTKKEKTRTGGGGGSAKKVYSGAAAPNRYGIRPGHRWDGVDRGNGWEGERFKAINRRARNKDLGFAWEMDT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.34
3 0.39
4 0.45
5 0.49
6 0.53
7 0.62
8 0.67
9 0.74
10 0.77
11 0.82
12 0.87
13 0.91
14 0.93
15 0.93
16 0.91
17 0.86
18 0.81
19 0.72
20 0.61
21 0.5
22 0.39
23 0.28
24 0.19
25 0.12
26 0.08
27 0.05
28 0.05
29 0.05
30 0.04
31 0.04
32 0.04
33 0.04
34 0.04
35 0.05
36 0.05
37 0.05
38 0.05
39 0.08
40 0.09
41 0.1
42 0.1
43 0.09
44 0.09
45 0.09
46 0.1
47 0.08
48 0.07
49 0.07
50 0.09
51 0.1
52 0.11
53 0.16
54 0.19
55 0.23
56 0.32
57 0.34
58 0.39
59 0.49
60 0.57
61 0.61
62 0.62
63 0.63
64 0.57
65 0.63
66 0.6
67 0.5
68 0.42
69 0.36
70 0.33
71 0.28
72 0.26
73 0.2
74 0.19
75 0.19
76 0.18
77 0.15
78 0.13
79 0.14
80 0.15
81 0.14
82 0.09
83 0.09
84 0.09
85 0.1
86 0.09
87 0.08
88 0.08
89 0.08
90 0.09
91 0.09
92 0.09
93 0.07
94 0.07
95 0.07
96 0.06
97 0.05
98 0.04
99 0.04
100 0.04
101 0.04
102 0.05
103 0.06
104 0.06
105 0.05
106 0.05
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.05
111 0.04
112 0.04
113 0.04
114 0.05
115 0.04
116 0.05
117 0.06
118 0.06
119 0.07
120 0.06
121 0.06
122 0.06
123 0.06
124 0.05
125 0.03
126 0.03
127 0.04
128 0.06
129 0.08
130 0.12
131 0.18
132 0.21
133 0.22
134 0.24
135 0.25
136 0.29
137 0.29
138 0.29
139 0.31
140 0.28
141 0.28
142 0.27
143 0.25
144 0.19
145 0.17
146 0.12
147 0.08
148 0.1
149 0.09
150 0.1
151 0.17
152 0.21
153 0.27
154 0.29
155 0.33
156 0.37
157 0.38
158 0.41
159 0.39
160 0.37
161 0.32
162 0.31
163 0.27
164 0.24
165 0.22
166 0.17
167 0.14
168 0.13
169 0.14
170 0.15
171 0.14
172 0.11
173 0.12
174 0.14
175 0.2
176 0.26
177 0.3
178 0.31
179 0.34
180 0.35
181 0.38
182 0.44
183 0.43
184 0.41
185 0.37
186 0.36
187 0.43
188 0.49
189 0.47
190 0.45
191 0.41
192 0.37
193 0.36
194 0.38
195 0.35
196 0.37
197 0.37
198 0.37
199 0.37
200 0.37
201 0.38
202 0.4
203 0.41
204 0.39
205 0.4
206 0.41
207 0.48
208 0.56
209 0.61
210 0.65
211 0.64
212 0.61
213 0.62
214 0.57
215 0.53
216 0.53
217 0.49
218 0.48
219 0.42
220 0.39
221 0.36
222 0.33
223 0.3
224 0.24
225 0.2
226 0.13
227 0.14
228 0.13
229 0.17
230 0.19
231 0.18
232 0.19
233 0.2
234 0.19
235 0.18
236 0.17
237 0.14
238 0.15
239 0.15
240 0.13
241 0.14
242 0.17
243 0.18
244 0.19
245 0.22
246 0.19
247 0.23
248 0.24
249 0.26
250 0.24
251 0.27
252 0.35
253 0.36
254 0.42
255 0.43
256 0.49
257 0.49
258 0.54
259 0.54
260 0.49
261 0.47
262 0.44
263 0.46
264 0.39
265 0.39
266 0.33
267 0.28
268 0.24
269 0.21
270 0.18
271 0.13
272 0.14
273 0.19
274 0.26
275 0.28
276 0.28
277 0.33
278 0.34
279 0.32
280 0.33
281 0.29
282 0.3
283 0.35
284 0.4
285 0.43
286 0.44
287 0.45
288 0.45
289 0.5
290 0.46
291 0.44
292 0.39
293 0.36
294 0.37
295 0.35
296 0.34
297 0.3
298 0.28
299 0.26
300 0.28
301 0.24
302 0.27
303 0.35
304 0.42
305 0.46
306 0.54
307 0.61
308 0.67
309 0.75
310 0.79
311 0.73
312 0.72
313 0.66
314 0.61
315 0.54