Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3D8QJR4

Protein Details
Accession A0A3D8QJR4    Localization Confidence High Confidence Score 22.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
90-168AKTLKAGKRKRVDGEKKPKEARRDKTKKKKTRRDDDEDPDGEQLDGKRVRKPKRAEGERKERDRTKERKKTPEPENEENBasic
183-204MDAALKNPNKRRRKKDEVDLEEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
94-122KAGKRKRVDGEKKPKEARRDKTKKKKTRR
135-161GKRVRKPKRAEGERKERDRTKERKKTP
174-197RRRRALDRAMDAALKNPNKRRRKK
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MSDSDLGSRPTSPPADNEDVNRPDSEDREGTPPAANPDLDMDDEDNNLSGDDSDNDSLLSEVDEAEFADFDPTNVTLEDRPLVNIDEDVAKTLKAGKRKRVDGEKKPKEARRDKTKKKKTRRDDDEDPDGEQLDGKRVRKPKRAEGERKERDRTKERKKTPEPENEENLTPDERRRRALDRAMDAALKNPNKRRRKKDEVDLEEAFDDEIAALKIRMEQACEADNTAREKGQPAIHKLKMLPEVVALLNRNTVQHSIVDPDTNFLQSVKFFLEPLNDGSLPAYNIQRDLFAALARLPIEKEALLSSGIGKVVLYYTKSKRPEIGIKRTAERLLGEWSRPILKRSDDYKKRKIATREFDHQAAQLAIRPGAMPSSQSASQRGPQLSQRELDRERMLAPPKISNRARMESSNTSYTIAPRSTFDASRGPDPLTRPVGAGGMDAFRRMTAKQGKKRS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.38
3 0.39
4 0.41
5 0.45
6 0.44
7 0.45
8 0.41
9 0.35
10 0.32
11 0.32
12 0.34
13 0.27
14 0.27
15 0.3
16 0.3
17 0.29
18 0.29
19 0.29
20 0.28
21 0.28
22 0.26
23 0.21
24 0.23
25 0.23
26 0.21
27 0.21
28 0.18
29 0.15
30 0.16
31 0.16
32 0.13
33 0.11
34 0.1
35 0.09
36 0.07
37 0.08
38 0.09
39 0.13
40 0.13
41 0.13
42 0.13
43 0.13
44 0.12
45 0.11
46 0.1
47 0.06
48 0.06
49 0.06
50 0.06
51 0.06
52 0.07
53 0.07
54 0.06
55 0.08
56 0.08
57 0.08
58 0.1
59 0.1
60 0.1
61 0.11
62 0.12
63 0.11
64 0.13
65 0.15
66 0.13
67 0.14
68 0.14
69 0.15
70 0.14
71 0.13
72 0.12
73 0.13
74 0.13
75 0.14
76 0.13
77 0.12
78 0.12
79 0.19
80 0.21
81 0.27
82 0.34
83 0.42
84 0.5
85 0.57
86 0.66
87 0.7
88 0.77
89 0.79
90 0.83
91 0.83
92 0.84
93 0.86
94 0.83
95 0.83
96 0.82
97 0.81
98 0.81
99 0.83
100 0.85
101 0.87
102 0.93
103 0.93
104 0.94
105 0.95
106 0.94
107 0.94
108 0.93
109 0.91
110 0.9
111 0.86
112 0.84
113 0.74
114 0.64
115 0.53
116 0.44
117 0.34
118 0.26
119 0.19
120 0.17
121 0.21
122 0.21
123 0.28
124 0.36
125 0.44
126 0.51
127 0.58
128 0.61
129 0.67
130 0.76
131 0.8
132 0.82
133 0.85
134 0.86
135 0.86
136 0.84
137 0.78
138 0.76
139 0.75
140 0.76
141 0.76
142 0.77
143 0.78
144 0.81
145 0.84
146 0.85
147 0.84
148 0.85
149 0.82
150 0.78
151 0.75
152 0.67
153 0.59
154 0.5
155 0.42
156 0.33
157 0.26
158 0.25
159 0.27
160 0.26
161 0.29
162 0.32
163 0.35
164 0.39
165 0.46
166 0.47
167 0.42
168 0.43
169 0.41
170 0.38
171 0.33
172 0.3
173 0.29
174 0.26
175 0.28
176 0.33
177 0.42
178 0.51
179 0.61
180 0.68
181 0.71
182 0.78
183 0.81
184 0.83
185 0.84
186 0.8
187 0.77
188 0.67
189 0.58
190 0.47
191 0.4
192 0.29
193 0.18
194 0.11
195 0.04
196 0.04
197 0.03
198 0.04
199 0.03
200 0.04
201 0.05
202 0.08
203 0.08
204 0.09
205 0.09
206 0.11
207 0.12
208 0.12
209 0.12
210 0.1
211 0.12
212 0.13
213 0.13
214 0.12
215 0.11
216 0.12
217 0.15
218 0.18
219 0.2
220 0.25
221 0.31
222 0.32
223 0.34
224 0.33
225 0.34
226 0.33
227 0.3
228 0.23
229 0.16
230 0.17
231 0.15
232 0.16
233 0.12
234 0.09
235 0.1
236 0.1
237 0.1
238 0.09
239 0.1
240 0.09
241 0.1
242 0.1
243 0.12
244 0.12
245 0.13
246 0.12
247 0.12
248 0.12
249 0.11
250 0.11
251 0.08
252 0.09
253 0.07
254 0.08
255 0.09
256 0.08
257 0.08
258 0.09
259 0.11
260 0.11
261 0.13
262 0.15
263 0.14
264 0.13
265 0.14
266 0.14
267 0.12
268 0.13
269 0.13
270 0.09
271 0.1
272 0.11
273 0.11
274 0.1
275 0.1
276 0.09
277 0.07
278 0.08
279 0.07
280 0.08
281 0.08
282 0.08
283 0.08
284 0.08
285 0.09
286 0.08
287 0.08
288 0.07
289 0.08
290 0.08
291 0.08
292 0.08
293 0.08
294 0.08
295 0.07
296 0.06
297 0.06
298 0.07
299 0.08
300 0.1
301 0.15
302 0.19
303 0.27
304 0.31
305 0.33
306 0.35
307 0.4
308 0.48
309 0.51
310 0.57
311 0.57
312 0.57
313 0.58
314 0.58
315 0.53
316 0.44
317 0.35
318 0.27
319 0.26
320 0.25
321 0.23
322 0.21
323 0.22
324 0.27
325 0.27
326 0.27
327 0.24
328 0.25
329 0.31
330 0.38
331 0.47
332 0.51
333 0.6
334 0.67
335 0.71
336 0.73
337 0.74
338 0.76
339 0.75
340 0.75
341 0.74
342 0.73
343 0.69
344 0.65
345 0.59
346 0.5
347 0.42
348 0.32
349 0.25
350 0.2
351 0.17
352 0.15
353 0.14
354 0.14
355 0.12
356 0.13
357 0.12
358 0.1
359 0.1
360 0.15
361 0.18
362 0.2
363 0.23
364 0.24
365 0.28
366 0.34
367 0.34
368 0.32
369 0.36
370 0.4
371 0.4
372 0.4
373 0.4
374 0.41
375 0.42
376 0.45
377 0.41
378 0.36
379 0.34
380 0.37
381 0.39
382 0.36
383 0.36
384 0.38
385 0.41
386 0.49
387 0.5
388 0.52
389 0.54
390 0.55
391 0.56
392 0.52
393 0.54
394 0.52
395 0.56
396 0.5
397 0.44
398 0.4
399 0.37
400 0.36
401 0.34
402 0.28
403 0.24
404 0.22
405 0.26
406 0.29
407 0.29
408 0.29
409 0.31
410 0.32
411 0.35
412 0.36
413 0.34
414 0.33
415 0.36
416 0.4
417 0.38
418 0.35
419 0.31
420 0.3
421 0.29
422 0.26
423 0.23
424 0.17
425 0.16
426 0.16
427 0.16
428 0.15
429 0.14
430 0.15
431 0.15
432 0.23
433 0.3
434 0.4