Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3D8RLJ8

Protein Details
Accession A0A3D8RLJ8    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
32-56SQFTLPPNPNKRQRLSPNPPSQPGSHydrophilic
495-521APEPNEKPSTKKEQKKKQEAKINEAASHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
506-510KEQKK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13.333, cyto 5, cyto_mito 3.999
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
Amino Acid Sequences MAQPQPQQPQQFPMPQRPFSPPQSATSPGTPSQFTLPPNPNKRQRLSPNPPSQPGSPYVQSPYAMSPGASGPPSATASPHFQNIQLPPNVYNTPYSNGNTTPTLNHTQTPSTPTPQTPNAPPSTPQNGFAPPQGQQNFNYMMPPQQGPQGTGAMGPPSKPQMEKKEDGADMMDVLGGTGIDLREEEQYTFQLYNTSFNSQVSGSQSGTISASHSFTQFPPGSESSFYGAGPANTNESIGDKSQEKFEQEAADAAWQKAAKDIAVSRSRELNNPFLQVAMVHKKAATIARENGLVLNTDMKGSMGHMKLPDQFDKTVNIKTKTGPDGALVETYGVFVPEDSFLVDQLALLSIATKHRLRLLLEDAVRLTKGRQTGSHGIVPAEWADAAAPVHAANSSLILEDAGRSAWENAVSPQTNPLKRSLSSANLLPTPVSDGAKTPATPIKFGNEVVNALRASAAKERDFEEARLRKRQARTNPDGTPRQGSVAPGTPGSIAPEPNEKPSTKKEQKKKQEAKINEAASHESANATSSKFLGGGGGLFGKKKKYSWMTGGAGGGSGASTPAKIMTQGLPGTPGGGVPSAPEKLTSEGARRLGTWREDHEKGKNIQLRDWITVLEDDGKEKRALQMAYALLDDSQPK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.6
3 0.61
4 0.62
5 0.62
6 0.59
7 0.63
8 0.54
9 0.51
10 0.53
11 0.54
12 0.5
13 0.47
14 0.45
15 0.39
16 0.4
17 0.36
18 0.32
19 0.32
20 0.32
21 0.31
22 0.36
23 0.42
24 0.49
25 0.57
26 0.65
27 0.7
28 0.74
29 0.77
30 0.78
31 0.79
32 0.8
33 0.82
34 0.83
35 0.84
36 0.83
37 0.83
38 0.77
39 0.69
40 0.62
41 0.55
42 0.51
43 0.42
44 0.37
45 0.36
46 0.34
47 0.32
48 0.3
49 0.28
50 0.25
51 0.23
52 0.2
53 0.17
54 0.16
55 0.18
56 0.17
57 0.14
58 0.12
59 0.15
60 0.17
61 0.16
62 0.16
63 0.16
64 0.21
65 0.23
66 0.26
67 0.24
68 0.23
69 0.29
70 0.31
71 0.36
72 0.34
73 0.34
74 0.31
75 0.35
76 0.35
77 0.31
78 0.3
79 0.25
80 0.25
81 0.28
82 0.28
83 0.26
84 0.26
85 0.28
86 0.27
87 0.25
88 0.24
89 0.25
90 0.3
91 0.29
92 0.3
93 0.3
94 0.31
95 0.32
96 0.37
97 0.35
98 0.33
99 0.35
100 0.35
101 0.38
102 0.41
103 0.43
104 0.41
105 0.45
106 0.44
107 0.42
108 0.41
109 0.43
110 0.46
111 0.42
112 0.38
113 0.35
114 0.34
115 0.34
116 0.35
117 0.3
118 0.23
119 0.31
120 0.31
121 0.3
122 0.28
123 0.31
124 0.32
125 0.29
126 0.29
127 0.21
128 0.22
129 0.23
130 0.22
131 0.19
132 0.21
133 0.21
134 0.21
135 0.22
136 0.2
137 0.17
138 0.16
139 0.16
140 0.14
141 0.14
142 0.13
143 0.13
144 0.16
145 0.18
146 0.2
147 0.27
148 0.33
149 0.4
150 0.43
151 0.45
152 0.48
153 0.46
154 0.44
155 0.38
156 0.28
157 0.2
158 0.18
159 0.13
160 0.06
161 0.06
162 0.05
163 0.03
164 0.03
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.06
170 0.08
171 0.09
172 0.1
173 0.1
174 0.11
175 0.13
176 0.13
177 0.12
178 0.14
179 0.13
180 0.17
181 0.18
182 0.2
183 0.18
184 0.18
185 0.19
186 0.15
187 0.17
188 0.17
189 0.17
190 0.15
191 0.16
192 0.15
193 0.15
194 0.15
195 0.13
196 0.11
197 0.09
198 0.11
199 0.1
200 0.11
201 0.12
202 0.11
203 0.19
204 0.18
205 0.18
206 0.21
207 0.22
208 0.22
209 0.22
210 0.23
211 0.18
212 0.17
213 0.16
214 0.13
215 0.13
216 0.12
217 0.13
218 0.12
219 0.12
220 0.11
221 0.12
222 0.1
223 0.11
224 0.12
225 0.1
226 0.12
227 0.12
228 0.12
229 0.16
230 0.18
231 0.18
232 0.18
233 0.19
234 0.18
235 0.17
236 0.17
237 0.13
238 0.15
239 0.14
240 0.13
241 0.13
242 0.12
243 0.12
244 0.13
245 0.13
246 0.09
247 0.1
248 0.11
249 0.17
250 0.22
251 0.24
252 0.23
253 0.29
254 0.3
255 0.33
256 0.34
257 0.33
258 0.29
259 0.3
260 0.28
261 0.22
262 0.21
263 0.17
264 0.18
265 0.17
266 0.16
267 0.15
268 0.15
269 0.15
270 0.17
271 0.2
272 0.18
273 0.16
274 0.17
275 0.18
276 0.18
277 0.18
278 0.17
279 0.14
280 0.12
281 0.09
282 0.08
283 0.07
284 0.07
285 0.07
286 0.06
287 0.06
288 0.07
289 0.12
290 0.1
291 0.12
292 0.12
293 0.14
294 0.18
295 0.2
296 0.22
297 0.19
298 0.2
299 0.19
300 0.23
301 0.23
302 0.25
303 0.27
304 0.27
305 0.26
306 0.26
307 0.29
308 0.28
309 0.27
310 0.22
311 0.17
312 0.17
313 0.16
314 0.15
315 0.11
316 0.08
317 0.07
318 0.07
319 0.06
320 0.05
321 0.04
322 0.04
323 0.04
324 0.04
325 0.05
326 0.05
327 0.05
328 0.05
329 0.05
330 0.05
331 0.04
332 0.04
333 0.04
334 0.03
335 0.03
336 0.04
337 0.04
338 0.05
339 0.09
340 0.1
341 0.1
342 0.13
343 0.15
344 0.16
345 0.19
346 0.22
347 0.24
348 0.24
349 0.24
350 0.22
351 0.2
352 0.19
353 0.16
354 0.13
355 0.1
356 0.12
357 0.12
358 0.13
359 0.2
360 0.26
361 0.29
362 0.3
363 0.28
364 0.25
365 0.24
366 0.23
367 0.17
368 0.11
369 0.07
370 0.05
371 0.04
372 0.05
373 0.05
374 0.04
375 0.04
376 0.04
377 0.04
378 0.04
379 0.05
380 0.04
381 0.05
382 0.05
383 0.05
384 0.05
385 0.05
386 0.05
387 0.05
388 0.05
389 0.04
390 0.04
391 0.05
392 0.05
393 0.06
394 0.07
395 0.07
396 0.08
397 0.13
398 0.14
399 0.13
400 0.2
401 0.27
402 0.29
403 0.3
404 0.33
405 0.31
406 0.31
407 0.35
408 0.32
409 0.29
410 0.28
411 0.29
412 0.27
413 0.25
414 0.24
415 0.2
416 0.16
417 0.16
418 0.15
419 0.13
420 0.11
421 0.12
422 0.14
423 0.16
424 0.16
425 0.15
426 0.18
427 0.18
428 0.19
429 0.19
430 0.2
431 0.2
432 0.21
433 0.21
434 0.18
435 0.19
436 0.18
437 0.2
438 0.16
439 0.15
440 0.15
441 0.12
442 0.13
443 0.17
444 0.2
445 0.18
446 0.2
447 0.22
448 0.26
449 0.28
450 0.27
451 0.32
452 0.36
453 0.4
454 0.47
455 0.49
456 0.51
457 0.56
458 0.63
459 0.63
460 0.66
461 0.69
462 0.68
463 0.71
464 0.72
465 0.7
466 0.64
467 0.58
468 0.49
469 0.43
470 0.36
471 0.31
472 0.27
473 0.26
474 0.24
475 0.2
476 0.19
477 0.18
478 0.16
479 0.19
480 0.17
481 0.13
482 0.14
483 0.21
484 0.22
485 0.27
486 0.31
487 0.28
488 0.31
489 0.38
490 0.47
491 0.5
492 0.58
493 0.64
494 0.71
495 0.81
496 0.88
497 0.9
498 0.89
499 0.89
500 0.85
501 0.83
502 0.81
503 0.73
504 0.64
505 0.56
506 0.49
507 0.4
508 0.35
509 0.26
510 0.18
511 0.15
512 0.13
513 0.13
514 0.11
515 0.1
516 0.1
517 0.1
518 0.1
519 0.09
520 0.09
521 0.07
522 0.07
523 0.07
524 0.1
525 0.1
526 0.12
527 0.14
528 0.19
529 0.21
530 0.22
531 0.3
532 0.34
533 0.4
534 0.45
535 0.52
536 0.5
537 0.51
538 0.5
539 0.41
540 0.34
541 0.27
542 0.2
543 0.11
544 0.07
545 0.05
546 0.05
547 0.05
548 0.05
549 0.06
550 0.07
551 0.08
552 0.1
553 0.12
554 0.17
555 0.18
556 0.18
557 0.19
558 0.19
559 0.19
560 0.16
561 0.14
562 0.1
563 0.09
564 0.09
565 0.09
566 0.13
567 0.14
568 0.14
569 0.15
570 0.16
571 0.18
572 0.23
573 0.25
574 0.27
575 0.32
576 0.35
577 0.35
578 0.34
579 0.35
580 0.37
581 0.38
582 0.38
583 0.39
584 0.43
585 0.47
586 0.51
587 0.55
588 0.57
589 0.55
590 0.59
591 0.58
592 0.53
593 0.52
594 0.56
595 0.52
596 0.47
597 0.45
598 0.35
599 0.32
600 0.3
601 0.27
602 0.25
603 0.21
604 0.21
605 0.23
606 0.26
607 0.25
608 0.25
609 0.28
610 0.29
611 0.29
612 0.26
613 0.3
614 0.29
615 0.3
616 0.29
617 0.24
618 0.18