Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3D8STW7

Protein Details
Accession A0A3D8STW7    Localization Confidence High Confidence Score 21.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MADSTRRSRRPDSKQMWDESEHydrophilic
31-65EREEPRDRRDDRRDDRDRNRRYRSRSPRGFRDSRGBasic
285-305ISAVRKEKKTEYRQYMNRVGGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
21-89ERRAPGRERGEREEPRDRRDDRRDDRDRNRRYRSRSPRGFRDSRGGRDRDRGSRRDDPRDFRDGRDRRD
142-171RDKPRDHERDRSREDRRRERASRSRSPRGG
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MADSTRRSRRPDSKQMWDESERRAPGRERGEREEPRDRRDDRRDDRDRNRRYRSRSPRGFRDSRGGRDRDRGSRRDDPRDFRDGRDRRDDRGDDRRAGDRGRYDRGDYSAYSSRSVDDTTLVIRTGSRANSSTENGRDRDSRDKPRDHERDRSREDRRRERASRSRSPRGGVDHEREGGAKRSTLDIQKDEELTKSRTATPPVSFKVGGSAKDEGPLKPGQDHDRMEMDEPIKTTSSKRKQIVDPPSEDEDDIVVEDDGLAAMQAMMGFGGFGTTHQKKVAGNDISAVRKEKKTEYRQYMNRVGGFNRPLDEI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.81
3 0.78
4 0.75
5 0.68
6 0.64
7 0.64
8 0.57
9 0.51
10 0.5
11 0.47
12 0.49
13 0.55
14 0.57
15 0.55
16 0.59
17 0.68
18 0.69
19 0.73
20 0.75
21 0.7
22 0.68
23 0.7
24 0.66
25 0.66
26 0.69
27 0.72
28 0.7
29 0.76
30 0.79
31 0.81
32 0.87
33 0.88
34 0.88
35 0.88
36 0.89
37 0.87
38 0.86
39 0.87
40 0.87
41 0.87
42 0.88
43 0.86
44 0.86
45 0.87
46 0.84
47 0.76
48 0.76
49 0.72
50 0.7
51 0.7
52 0.64
53 0.58
54 0.61
55 0.63
56 0.63
57 0.63
58 0.58
59 0.58
60 0.63
61 0.67
62 0.68
63 0.7
64 0.67
65 0.65
66 0.7
67 0.64
68 0.59
69 0.62
70 0.58
71 0.57
72 0.6
73 0.57
74 0.51
75 0.58
76 0.57
77 0.53
78 0.57
79 0.57
80 0.49
81 0.5
82 0.5
83 0.44
84 0.42
85 0.39
86 0.36
87 0.35
88 0.37
89 0.36
90 0.34
91 0.33
92 0.34
93 0.33
94 0.26
95 0.27
96 0.27
97 0.26
98 0.25
99 0.23
100 0.22
101 0.21
102 0.21
103 0.15
104 0.1
105 0.1
106 0.09
107 0.1
108 0.09
109 0.08
110 0.07
111 0.09
112 0.1
113 0.1
114 0.11
115 0.12
116 0.14
117 0.17
118 0.18
119 0.21
120 0.23
121 0.26
122 0.25
123 0.26
124 0.26
125 0.27
126 0.34
127 0.38
128 0.43
129 0.47
130 0.51
131 0.53
132 0.62
133 0.68
134 0.63
135 0.66
136 0.64
137 0.66
138 0.67
139 0.72
140 0.71
141 0.68
142 0.72
143 0.73
144 0.72
145 0.72
146 0.7
147 0.71
148 0.71
149 0.72
150 0.73
151 0.71
152 0.73
153 0.65
154 0.63
155 0.57
156 0.52
157 0.51
158 0.46
159 0.42
160 0.35
161 0.34
162 0.32
163 0.29
164 0.26
165 0.23
166 0.18
167 0.15
168 0.13
169 0.15
170 0.17
171 0.21
172 0.23
173 0.21
174 0.23
175 0.23
176 0.24
177 0.22
178 0.22
179 0.21
180 0.2
181 0.2
182 0.19
183 0.21
184 0.23
185 0.26
186 0.28
187 0.28
188 0.31
189 0.31
190 0.33
191 0.3
192 0.27
193 0.31
194 0.29
195 0.27
196 0.24
197 0.25
198 0.21
199 0.25
200 0.27
201 0.19
202 0.2
203 0.21
204 0.18
205 0.18
206 0.22
207 0.23
208 0.28
209 0.3
210 0.29
211 0.31
212 0.31
213 0.3
214 0.31
215 0.26
216 0.21
217 0.21
218 0.2
219 0.17
220 0.17
221 0.2
222 0.27
223 0.36
224 0.43
225 0.47
226 0.52
227 0.57
228 0.66
229 0.71
230 0.68
231 0.63
232 0.59
233 0.59
234 0.53
235 0.46
236 0.37
237 0.27
238 0.2
239 0.16
240 0.11
241 0.07
242 0.06
243 0.06
244 0.05
245 0.05
246 0.04
247 0.03
248 0.03
249 0.02
250 0.03
251 0.03
252 0.03
253 0.03
254 0.03
255 0.03
256 0.02
257 0.03
258 0.03
259 0.04
260 0.13
261 0.15
262 0.18
263 0.19
264 0.21
265 0.23
266 0.28
267 0.37
268 0.31
269 0.3
270 0.32
271 0.37
272 0.39
273 0.4
274 0.41
275 0.37
276 0.37
277 0.41
278 0.46
279 0.51
280 0.57
281 0.66
282 0.7
283 0.75
284 0.79
285 0.83
286 0.82
287 0.79
288 0.73
289 0.65
290 0.58
291 0.55
292 0.51
293 0.44