Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

B8NRZ0

Protein Details
Accession B8NRZ0    Localization Confidence High Confidence Score 17.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
51-79QYFRSAKKLSSAEKKKKRLRISRFSFGKLHydrophilic
96-120VDTAQSISKKRKRKHGGNARKEEAAHydrophilic
134-161KEEVTVEKKKAKKEKSKKQKVEHMSSDEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
56-82AKKLSSAEKKKKRLRISRFSFGKLSRR
103-116SKKRKRKHGGNARK
141-153KKKAKKEKSKKQK
Subcellular Location(s) mito 10, golg 5, E.R. 4, plas 2, vacu 2, nucl 1, cyto 1, extr 1, cyto_nucl 1, pero 1, cyto_pero 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR044773  DDX18/Has1_DEADc  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR025313  DUF4217  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR014014  RNA_helicase_DEAD_Q_motif  
Gene Ontology GO:0005635  C:nuclear envelope  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0042802  F:identical protein binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:1990417  P:snoRNA release from pre-rRNA  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF13959  DUF4217  
PF00271  Helicase_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
PS51195  Q_MOTIF  
CDD cd17942  DEADc_DDX18  
cd18787  SF2_C_DEAD  
Amino Acid Sequences MLSGPPFIYSSSYGKAPLPPVISALLAWLIICRPPSYQGLSARDAGSLARQYFRSAKKLSSAEKKKKRLRISRFSFGKLSRRNPSGEILAKMPIPVDTAQSISKKRKRKHGGNARKEEAAAPAATEAVIESPEKEEVTVEKKKAKKEKSKKQKVEHMSSDEEQKNTEESEQEASDNEEEKSDAEETPAANGEDLPSADTIRLPQQDGDPVKFTELGLSEKTMKGIEGMGFETMTEVQRRTIPPLLAGRDVLGAAKTGSGKTLSFLIPAIEMLSALRFKPRNGTGAIIVSPTRELALQIFGQVRELLAHHSQTYGIVIGGANRRAEAEKLMKGVNLLVATPGRLLDHLQNTQGFVFKNLRTLISTINLFRIAIDEADRILEVGFEDEMRQIAKILPSENRQTMLFSATQTTKVEDLARISLRPGPLYINVDHRKEHSTVEGLEQGYVICEADKRFLLLFSFLKRNLRKKIIVFLSSCNSVKYYGELLNYIDLPVLDLHGKQKQQKRTNTFFEFCNAKQGTLICTDVAARGLDIPAVDWIIQFDPPDDPRDYIHRVGRTARGSNGKGRSLMFLQPSEVGFLKHLKEARVPVVEFDFPTQKIVNVQSQLEKLIGQNYYLNKSAKEGYRSYLQAYASHSLRSVFDVHKLDLVKVSKGFGFSTPPRIDIQLGSSLKDKPPQGRRNYGSQPGSKFKRKHNDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.29
3 0.29
4 0.31
5 0.3
6 0.27
7 0.27
8 0.27
9 0.25
10 0.2
11 0.18
12 0.13
13 0.1
14 0.1
15 0.09
16 0.08
17 0.1
18 0.12
19 0.12
20 0.13
21 0.17
22 0.21
23 0.26
24 0.31
25 0.37
26 0.41
27 0.44
28 0.45
29 0.42
30 0.38
31 0.33
32 0.27
33 0.24
34 0.24
35 0.22
36 0.23
37 0.23
38 0.27
39 0.35
40 0.4
41 0.43
42 0.41
43 0.42
44 0.46
45 0.53
46 0.57
47 0.6
48 0.65
49 0.68
50 0.76
51 0.84
52 0.85
53 0.88
54 0.9
55 0.89
56 0.89
57 0.89
58 0.87
59 0.87
60 0.84
61 0.79
62 0.75
63 0.7
64 0.7
65 0.68
66 0.67
67 0.64
68 0.63
69 0.61
70 0.57
71 0.55
72 0.53
73 0.49
74 0.43
75 0.36
76 0.35
77 0.32
78 0.29
79 0.25
80 0.17
81 0.15
82 0.13
83 0.14
84 0.13
85 0.15
86 0.19
87 0.24
88 0.31
89 0.39
90 0.46
91 0.53
92 0.59
93 0.68
94 0.75
95 0.8
96 0.84
97 0.85
98 0.89
99 0.9
100 0.93
101 0.85
102 0.76
103 0.66
104 0.56
105 0.47
106 0.39
107 0.27
108 0.18
109 0.14
110 0.13
111 0.12
112 0.1
113 0.07
114 0.05
115 0.06
116 0.06
117 0.06
118 0.08
119 0.09
120 0.1
121 0.09
122 0.1
123 0.12
124 0.2
125 0.26
126 0.28
127 0.34
128 0.39
129 0.48
130 0.57
131 0.64
132 0.68
133 0.73
134 0.8
135 0.84
136 0.91
137 0.92
138 0.92
139 0.92
140 0.9
141 0.88
142 0.84
143 0.78
144 0.72
145 0.64
146 0.64
147 0.57
148 0.47
149 0.39
150 0.33
151 0.28
152 0.23
153 0.23
154 0.15
155 0.14
156 0.17
157 0.16
158 0.15
159 0.14
160 0.15
161 0.16
162 0.16
163 0.14
164 0.11
165 0.11
166 0.11
167 0.13
168 0.12
169 0.11
170 0.1
171 0.12
172 0.11
173 0.12
174 0.14
175 0.11
176 0.1
177 0.1
178 0.1
179 0.09
180 0.09
181 0.09
182 0.08
183 0.08
184 0.08
185 0.08
186 0.09
187 0.13
188 0.15
189 0.15
190 0.16
191 0.17
192 0.24
193 0.27
194 0.27
195 0.25
196 0.23
197 0.23
198 0.23
199 0.21
200 0.16
201 0.15
202 0.15
203 0.13
204 0.15
205 0.16
206 0.16
207 0.17
208 0.14
209 0.13
210 0.11
211 0.11
212 0.1
213 0.1
214 0.1
215 0.1
216 0.09
217 0.09
218 0.09
219 0.08
220 0.09
221 0.09
222 0.09
223 0.1
224 0.14
225 0.16
226 0.19
227 0.23
228 0.22
229 0.24
230 0.29
231 0.3
232 0.27
233 0.26
234 0.22
235 0.18
236 0.17
237 0.14
238 0.09
239 0.07
240 0.06
241 0.07
242 0.07
243 0.06
244 0.07
245 0.08
246 0.08
247 0.08
248 0.11
249 0.1
250 0.1
251 0.1
252 0.09
253 0.08
254 0.08
255 0.08
256 0.05
257 0.05
258 0.05
259 0.06
260 0.06
261 0.06
262 0.11
263 0.12
264 0.12
265 0.19
266 0.21
267 0.23
268 0.23
269 0.25
270 0.21
271 0.22
272 0.22
273 0.16
274 0.14
275 0.12
276 0.1
277 0.09
278 0.08
279 0.06
280 0.06
281 0.05
282 0.08
283 0.07
284 0.09
285 0.11
286 0.1
287 0.11
288 0.1
289 0.09
290 0.08
291 0.08
292 0.09
293 0.09
294 0.1
295 0.1
296 0.1
297 0.1
298 0.1
299 0.1
300 0.07
301 0.05
302 0.05
303 0.05
304 0.07
305 0.09
306 0.11
307 0.1
308 0.1
309 0.11
310 0.11
311 0.12
312 0.13
313 0.14
314 0.14
315 0.15
316 0.16
317 0.15
318 0.15
319 0.14
320 0.12
321 0.09
322 0.07
323 0.07
324 0.06
325 0.06
326 0.06
327 0.06
328 0.05
329 0.05
330 0.06
331 0.09
332 0.12
333 0.13
334 0.14
335 0.14
336 0.15
337 0.15
338 0.16
339 0.12
340 0.11
341 0.14
342 0.13
343 0.17
344 0.17
345 0.17
346 0.16
347 0.17
348 0.16
349 0.14
350 0.15
351 0.12
352 0.13
353 0.12
354 0.11
355 0.1
356 0.1
357 0.08
358 0.07
359 0.08
360 0.07
361 0.07
362 0.07
363 0.07
364 0.06
365 0.05
366 0.05
367 0.04
368 0.04
369 0.04
370 0.04
371 0.04
372 0.05
373 0.05
374 0.05
375 0.05
376 0.05
377 0.06
378 0.08
379 0.09
380 0.11
381 0.14
382 0.17
383 0.21
384 0.21
385 0.21
386 0.2
387 0.2
388 0.18
389 0.17
390 0.15
391 0.11
392 0.13
393 0.13
394 0.14
395 0.14
396 0.15
397 0.13
398 0.13
399 0.14
400 0.12
401 0.12
402 0.14
403 0.15
404 0.13
405 0.14
406 0.16
407 0.15
408 0.15
409 0.14
410 0.12
411 0.14
412 0.17
413 0.17
414 0.24
415 0.28
416 0.29
417 0.29
418 0.3
419 0.3
420 0.28
421 0.28
422 0.21
423 0.19
424 0.18
425 0.19
426 0.21
427 0.18
428 0.16
429 0.15
430 0.13
431 0.11
432 0.1
433 0.08
434 0.04
435 0.06
436 0.06
437 0.08
438 0.08
439 0.09
440 0.09
441 0.1
442 0.11
443 0.13
444 0.14
445 0.16
446 0.2
447 0.21
448 0.29
449 0.35
450 0.42
451 0.46
452 0.5
453 0.52
454 0.5
455 0.57
456 0.54
457 0.53
458 0.47
459 0.43
460 0.39
461 0.38
462 0.36
463 0.28
464 0.23
465 0.19
466 0.18
467 0.17
468 0.17
469 0.15
470 0.16
471 0.16
472 0.16
473 0.16
474 0.16
475 0.14
476 0.11
477 0.08
478 0.08
479 0.07
480 0.08
481 0.07
482 0.08
483 0.11
484 0.16
485 0.2
486 0.27
487 0.35
488 0.44
489 0.52
490 0.61
491 0.67
492 0.7
493 0.75
494 0.75
495 0.69
496 0.6
497 0.56
498 0.51
499 0.43
500 0.44
501 0.36
502 0.28
503 0.28
504 0.28
505 0.25
506 0.22
507 0.23
508 0.13
509 0.13
510 0.13
511 0.12
512 0.12
513 0.1
514 0.07
515 0.07
516 0.08
517 0.08
518 0.07
519 0.07
520 0.06
521 0.07
522 0.07
523 0.06
524 0.08
525 0.08
526 0.09
527 0.09
528 0.09
529 0.12
530 0.14
531 0.18
532 0.18
533 0.18
534 0.2
535 0.26
536 0.3
537 0.31
538 0.36
539 0.35
540 0.36
541 0.39
542 0.44
543 0.43
544 0.41
545 0.42
546 0.44
547 0.43
548 0.49
549 0.5
550 0.46
551 0.43
552 0.41
553 0.39
554 0.34
555 0.36
556 0.31
557 0.26
558 0.25
559 0.25
560 0.24
561 0.23
562 0.21
563 0.17
564 0.15
565 0.18
566 0.18
567 0.21
568 0.23
569 0.22
570 0.27
571 0.3
572 0.34
573 0.36
574 0.34
575 0.32
576 0.33
577 0.33
578 0.29
579 0.28
580 0.27
581 0.22
582 0.24
583 0.23
584 0.2
585 0.22
586 0.26
587 0.28
588 0.27
589 0.29
590 0.3
591 0.31
592 0.31
593 0.27
594 0.24
595 0.19
596 0.21
597 0.19
598 0.16
599 0.2
600 0.22
601 0.26
602 0.3
603 0.3
604 0.26
605 0.29
606 0.34
607 0.35
608 0.37
609 0.35
610 0.34
611 0.4
612 0.41
613 0.4
614 0.38
615 0.34
616 0.31
617 0.34
618 0.35
619 0.3
620 0.29
621 0.27
622 0.24
623 0.23
624 0.23
625 0.23
626 0.19
627 0.25
628 0.28
629 0.28
630 0.31
631 0.32
632 0.3
633 0.32
634 0.33
635 0.3
636 0.27
637 0.28
638 0.25
639 0.26
640 0.26
641 0.21
642 0.27
643 0.26
644 0.35
645 0.35
646 0.35
647 0.35
648 0.36
649 0.36
650 0.29
651 0.3
652 0.29
653 0.29
654 0.29
655 0.3
656 0.32
657 0.33
658 0.38
659 0.39
660 0.39
661 0.49
662 0.57
663 0.63
664 0.7
665 0.71
666 0.74
667 0.77
668 0.77
669 0.74
670 0.72
671 0.7
672 0.7
673 0.75
674 0.74
675 0.73
676 0.74