Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3D8QKS6

Protein Details
Accession A0A3D8QKS6    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
363-385LLGYTHRKNHRRRIKPQPPISALHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
369-380RKNHRRRIKPQP
Subcellular Location(s) cyto 12.5, cyto_nucl 12, nucl 10.5, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019313  Mediator_Med17  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF10156  Med17  
Amino Acid Sequences MGSIPDQFPISLRAWPSEENSVNALPSLISRINFERGDFRNVSEESLREEIRQIEAGTGANAEDDGSSDEEEEQPDRLKELMTAREEMVMQIEQAHTATIFALDFVSLLLSKDTPVQASSSISPIIRDAVGMGTLGADKVQASRVSEAQKQDNMRIAKGWKIQNINKSVESILASATRLEKEIESETKYWEQVLAVSEQGWAVCRLPQERHTLGVRFGFSEAAPTFRNRSLAALRRNPDGSVYLDQGVISSGPQQLRVRIRTNGVETGETSLASAVPADAAIEDFILQARNTIFNEELWQELNRESRTLASYGVRAHETMITCPISPSKTMVLDLVPMEEATSAKSGADNNLAEGLSLVLKILLGYTHRKNHRRRIKPQPPISALKRPNPPYDLLRPIITRLSHQDSLSSLNRLFSSICRTLQSTGLTPTPSYTITTTSAGTSNELTAAENIIMTLLDRLEVTTTLTITPSLTLTIKSRTAQYLVGNPHQGGMAGTIHLPSIPTPSPLPETFKVPPNLHNFEEVKDFVYWVVSCGLATAFVAENGDETSIEAAGKLGWYATSQANVLRKSFEGKGRSKQLCFDVKEGEILEVRWEWLNGADTGKATRKLMPGEGLYDWRCKSPHVNGEIEEVVKSLDDVVEEAGKWIVAKNDSIGD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.28
3 0.31
4 0.35
5 0.36
6 0.33
7 0.35
8 0.32
9 0.3
10 0.27
11 0.23
12 0.14
13 0.13
14 0.16
15 0.15
16 0.15
17 0.18
18 0.22
19 0.28
20 0.29
21 0.3
22 0.33
23 0.34
24 0.41
25 0.39
26 0.37
27 0.37
28 0.37
29 0.39
30 0.34
31 0.31
32 0.28
33 0.32
34 0.31
35 0.25
36 0.27
37 0.25
38 0.25
39 0.27
40 0.22
41 0.18
42 0.18
43 0.18
44 0.15
45 0.14
46 0.11
47 0.08
48 0.08
49 0.07
50 0.06
51 0.06
52 0.08
53 0.09
54 0.09
55 0.1
56 0.11
57 0.12
58 0.14
59 0.14
60 0.14
61 0.16
62 0.16
63 0.17
64 0.16
65 0.16
66 0.18
67 0.22
68 0.28
69 0.28
70 0.3
71 0.29
72 0.3
73 0.3
74 0.26
75 0.23
76 0.16
77 0.13
78 0.12
79 0.12
80 0.1
81 0.1
82 0.1
83 0.08
84 0.08
85 0.08
86 0.06
87 0.06
88 0.06
89 0.06
90 0.05
91 0.05
92 0.05
93 0.06
94 0.05
95 0.06
96 0.07
97 0.07
98 0.08
99 0.11
100 0.12
101 0.12
102 0.12
103 0.13
104 0.13
105 0.16
106 0.17
107 0.15
108 0.17
109 0.16
110 0.16
111 0.15
112 0.16
113 0.13
114 0.11
115 0.1
116 0.08
117 0.08
118 0.08
119 0.07
120 0.06
121 0.06
122 0.06
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.06
127 0.09
128 0.1
129 0.12
130 0.15
131 0.19
132 0.24
133 0.28
134 0.32
135 0.33
136 0.37
137 0.37
138 0.38
139 0.41
140 0.38
141 0.34
142 0.34
143 0.31
144 0.32
145 0.37
146 0.38
147 0.37
148 0.44
149 0.48
150 0.51
151 0.55
152 0.53
153 0.46
154 0.43
155 0.38
156 0.31
157 0.27
158 0.2
159 0.16
160 0.13
161 0.12
162 0.11
163 0.13
164 0.12
165 0.11
166 0.12
167 0.11
168 0.13
169 0.17
170 0.19
171 0.21
172 0.21
173 0.24
174 0.25
175 0.25
176 0.23
177 0.19
178 0.16
179 0.14
180 0.15
181 0.12
182 0.1
183 0.1
184 0.1
185 0.1
186 0.09
187 0.08
188 0.08
189 0.07
190 0.09
191 0.11
192 0.14
193 0.18
194 0.22
195 0.29
196 0.29
197 0.32
198 0.33
199 0.32
200 0.31
201 0.31
202 0.27
203 0.21
204 0.2
205 0.17
206 0.14
207 0.17
208 0.14
209 0.14
210 0.14
211 0.15
212 0.18
213 0.18
214 0.2
215 0.16
216 0.2
217 0.24
218 0.31
219 0.38
220 0.42
221 0.42
222 0.44
223 0.45
224 0.41
225 0.35
226 0.29
227 0.25
228 0.2
229 0.19
230 0.16
231 0.16
232 0.15
233 0.14
234 0.12
235 0.09
236 0.06
237 0.07
238 0.09
239 0.09
240 0.14
241 0.14
242 0.2
243 0.26
244 0.3
245 0.32
246 0.31
247 0.34
248 0.33
249 0.35
250 0.33
251 0.29
252 0.25
253 0.21
254 0.22
255 0.19
256 0.15
257 0.13
258 0.09
259 0.08
260 0.07
261 0.06
262 0.03
263 0.03
264 0.03
265 0.03
266 0.03
267 0.03
268 0.03
269 0.03
270 0.03
271 0.03
272 0.04
273 0.05
274 0.05
275 0.06
276 0.06
277 0.08
278 0.08
279 0.1
280 0.1
281 0.09
282 0.11
283 0.11
284 0.11
285 0.1
286 0.1
287 0.1
288 0.11
289 0.15
290 0.13
291 0.13
292 0.13
293 0.13
294 0.14
295 0.14
296 0.14
297 0.1
298 0.12
299 0.12
300 0.14
301 0.13
302 0.11
303 0.11
304 0.12
305 0.12
306 0.11
307 0.13
308 0.12
309 0.12
310 0.12
311 0.13
312 0.11
313 0.11
314 0.12
315 0.11
316 0.1
317 0.11
318 0.11
319 0.1
320 0.1
321 0.1
322 0.09
323 0.07
324 0.06
325 0.06
326 0.05
327 0.05
328 0.05
329 0.05
330 0.05
331 0.05
332 0.06
333 0.06
334 0.07
335 0.11
336 0.1
337 0.09
338 0.11
339 0.1
340 0.09
341 0.09
342 0.08
343 0.05
344 0.05
345 0.04
346 0.03
347 0.03
348 0.03
349 0.03
350 0.03
351 0.05
352 0.1
353 0.15
354 0.22
355 0.3
356 0.39
357 0.46
358 0.56
359 0.65
360 0.7
361 0.75
362 0.8
363 0.82
364 0.84
365 0.85
366 0.83
367 0.78
368 0.75
369 0.71
370 0.69
371 0.64
372 0.6
373 0.6
374 0.55
375 0.54
376 0.49
377 0.47
378 0.42
379 0.44
380 0.42
381 0.35
382 0.33
383 0.3
384 0.29
385 0.29
386 0.25
387 0.2
388 0.21
389 0.25
390 0.26
391 0.25
392 0.25
393 0.22
394 0.27
395 0.27
396 0.24
397 0.18
398 0.17
399 0.17
400 0.17
401 0.17
402 0.13
403 0.18
404 0.19
405 0.2
406 0.2
407 0.21
408 0.22
409 0.24
410 0.25
411 0.19
412 0.19
413 0.19
414 0.19
415 0.17
416 0.17
417 0.15
418 0.14
419 0.14
420 0.12
421 0.12
422 0.14
423 0.15
424 0.15
425 0.14
426 0.16
427 0.14
428 0.15
429 0.13
430 0.11
431 0.1
432 0.1
433 0.09
434 0.08
435 0.08
436 0.07
437 0.06
438 0.06
439 0.05
440 0.05
441 0.04
442 0.05
443 0.04
444 0.04
445 0.04
446 0.05
447 0.05
448 0.06
449 0.07
450 0.07
451 0.08
452 0.08
453 0.08
454 0.08
455 0.08
456 0.08
457 0.07
458 0.08
459 0.08
460 0.1
461 0.11
462 0.15
463 0.18
464 0.18
465 0.2
466 0.2
467 0.22
468 0.23
469 0.23
470 0.26
471 0.28
472 0.31
473 0.3
474 0.28
475 0.27
476 0.24
477 0.22
478 0.15
479 0.12
480 0.09
481 0.08
482 0.08
483 0.08
484 0.08
485 0.07
486 0.07
487 0.06
488 0.1
489 0.11
490 0.13
491 0.13
492 0.16
493 0.21
494 0.22
495 0.29
496 0.25
497 0.31
498 0.32
499 0.38
500 0.42
501 0.39
502 0.45
503 0.46
504 0.5
505 0.45
506 0.48
507 0.42
508 0.37
509 0.4
510 0.33
511 0.27
512 0.22
513 0.22
514 0.15
515 0.17
516 0.15
517 0.12
518 0.12
519 0.1
520 0.09
521 0.1
522 0.09
523 0.07
524 0.07
525 0.07
526 0.06
527 0.07
528 0.07
529 0.06
530 0.07
531 0.07
532 0.08
533 0.06
534 0.06
535 0.07
536 0.07
537 0.07
538 0.06
539 0.06
540 0.06
541 0.06
542 0.05
543 0.05
544 0.05
545 0.06
546 0.09
547 0.1
548 0.11
549 0.12
550 0.16
551 0.22
552 0.24
553 0.24
554 0.24
555 0.24
556 0.27
557 0.32
558 0.35
559 0.37
560 0.42
561 0.5
562 0.58
563 0.63
564 0.6
565 0.6
566 0.61
567 0.61
568 0.58
569 0.52
570 0.47
571 0.41
572 0.42
573 0.38
574 0.31
575 0.24
576 0.2
577 0.2
578 0.16
579 0.16
580 0.15
581 0.14
582 0.13
583 0.14
584 0.16
585 0.14
586 0.15
587 0.15
588 0.15
589 0.19
590 0.24
591 0.25
592 0.25
593 0.29
594 0.32
595 0.34
596 0.37
597 0.37
598 0.33
599 0.34
600 0.35
601 0.35
602 0.33
603 0.36
604 0.34
605 0.32
606 0.31
607 0.31
608 0.36
609 0.39
610 0.46
611 0.45
612 0.48
613 0.46
614 0.51
615 0.5
616 0.43
617 0.34
618 0.25
619 0.19
620 0.15
621 0.14
622 0.09
623 0.07
624 0.07
625 0.07
626 0.09
627 0.11
628 0.11
629 0.12
630 0.11
631 0.11
632 0.11
633 0.12
634 0.15
635 0.15
636 0.16