FuNGI

A0A3D8RSY2

Protein Details

Accession

A0A3D8RSY2

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
27-54	IRKPKAADPLRPRTKKPVRRPNVAPGTN	Hydrophilic
527-551	ASGNESARKKHKKKHGQSSSQATGS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
28-49	RKPKAADPLRPRTKKPVRRPNV
421-437	LRRKKLGKGVKKALKKR
479-480	KA
511-516	RNKLKR
533-541	ARKKHKKKH
619-634	GKKKKIKLNYGKGSPS

Subcellular Location(s)

nucl 23, cyto_nucl 14.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSASPSGMSNGRTPTPNAGPGGAPQFIRKPKAADPLRPRTKKPVRRPNVAPGTNGAASGKAPAEKAFHGAGQGLFPRPKPNPNLPKANGGWTHAPQGEYHDFPLVTTKRALREGLRHHIARFTAKRDVDPADQDEFTRPLALHRRDPRQPARGEAPKEEEPVPGEPMDSKEKEKLEILKAEKEARRAADLAQIAPTGNNAAAAVKKPQAFRNEKTTQVHRLDKTAQQKKESDLRYEEALPWHLEDADNKNTWVGNYEAALSDTNVILLVDGGTFRMVPLEKWYKFTPKNQFKTLTIEEAEAQIAKKTKESRWVMKTQEKQKKEEEEANNRRAAYGLYTVKSESNTFKNAKRETQDTDDLDFEADDLFQDDDEQVTVEPDKDEDVKDSKDRIKREMLGANLFGEADEGEVDQELDAEEKEALRRKKLGKGVKKALKKREQNLIYESDSEHPYSSSSEDDTSDEEKQAEIDRKKDEEAKAKAKLESSKAPSGTSSKGTNTPSGRPKHSDPLMRNKLKRPGSPNLSETEASGNESARKKHKKKHGQSSSQATGSSTPAPGTRPLSPTPGGQPQSPRKSSLVKLSMNPSKLADIQSSPPNPSPTGAMSDGEATGGEMSDGAGGKKKKIKLNYGKGSPSGSRAGSPAVGRSGSPGAGGSRAGTPASQGPAGARSPGSGPLQVSEVIAAIPSTGTSITDLMKKFAGRVGDKKGEQTDKKEFIKMVKENSVYGPDKLLRPKT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.35
2	0.37
3	0.4
4	0.37
5	0.34
6	0.31
7	0.33
8	0.35
9	0.3
10	0.26
11	0.25
12	0.32
13	0.37
14	0.41
15	0.4
16	0.4
17	0.44
18	0.54
19	0.58
20	0.6
21	0.63
22	0.7
23	0.78
24	0.79
25	0.77
26	0.77
27	0.81
28	0.82
29	0.83
30	0.83
31	0.81
32	0.84
33	0.86
34	0.86
35	0.86
36	0.78
37	0.69
38	0.61
39	0.58
40	0.49
41	0.42
42	0.32
43	0.21
44	0.19
45	0.19
46	0.18
47	0.13
48	0.14
49	0.15
50	0.19
51	0.19
52	0.22
53	0.21
54	0.19
55	0.19
56	0.2
57	0.18
58	0.18
59	0.2
60	0.22
61	0.23
62	0.24
63	0.31
64	0.33
65	0.4
66	0.45
67	0.53
68	0.58
69	0.63
70	0.73
71	0.68
72	0.72
73	0.66
74	0.66
75	0.58
76	0.51
77	0.49
78	0.41
79	0.44
80	0.37
81	0.36
82	0.28
83	0.33
84	0.34
85	0.29
86	0.29
87	0.27
88	0.24
89	0.24
90	0.33
91	0.26
92	0.24
93	0.27
94	0.29
95	0.3
96	0.33
97	0.36
98	0.32
99	0.39
100	0.45
101	0.5
102	0.54
103	0.51
104	0.49
105	0.51
106	0.48
107	0.48
108	0.45
109	0.41
110	0.42
111	0.41
112	0.42
113	0.42
114	0.44
115	0.39
116	0.38
117	0.37
118	0.32
119	0.32
120	0.31
121	0.3
122	0.27
123	0.23
124	0.2
125	0.16
126	0.19
127	0.29
128	0.32
129	0.38
130	0.46
131	0.53
132	0.58
133	0.68
134	0.7
135	0.69
136	0.67
137	0.63
138	0.64
139	0.64
140	0.62
141	0.57
142	0.55
143	0.49
144	0.5
145	0.45
146	0.37
147	0.32
148	0.3
149	0.28
150	0.21
151	0.18
152	0.16
153	0.19
154	0.24
155	0.24
156	0.24
157	0.27
158	0.29
159	0.3
160	0.33
161	0.35
162	0.33
163	0.39
164	0.39
165	0.39
166	0.41
167	0.47
168	0.45
169	0.43
170	0.42
171	0.36
172	0.35
173	0.3
174	0.28
175	0.27
176	0.25
177	0.22
178	0.2
179	0.18
180	0.16
181	0.15
182	0.14
183	0.09
184	0.07
185	0.07
186	0.06
187	0.06
188	0.08
189	0.09
190	0.12
191	0.15
192	0.19
193	0.22
194	0.26
195	0.35
196	0.41
197	0.43
198	0.5
199	0.49
200	0.52
201	0.55
202	0.55
203	0.54
204	0.54
205	0.58
206	0.49
207	0.5
208	0.48
209	0.49
210	0.54
211	0.55
212	0.52
213	0.49
214	0.5
215	0.5
216	0.55
217	0.51
218	0.46
219	0.41
220	0.39
221	0.37
222	0.36
223	0.33
224	0.26
225	0.25
226	0.21
227	0.17
228	0.16
229	0.13
230	0.12
231	0.14
232	0.17
233	0.2
234	0.2
235	0.19
236	0.19
237	0.19
238	0.19
239	0.18
240	0.14
241	0.1
242	0.09
243	0.1
244	0.1
245	0.1
246	0.11
247	0.09
248	0.08
249	0.07
250	0.07
251	0.06
252	0.05
253	0.04
254	0.04
255	0.04
256	0.03
257	0.03
258	0.03
259	0.04
260	0.04
261	0.03
262	0.06
263	0.06
264	0.06
265	0.13
266	0.22
267	0.22
268	0.26
269	0.29
270	0.36
271	0.39
272	0.47
273	0.51
274	0.53
275	0.58
276	0.6
277	0.62
278	0.54
279	0.58
280	0.52
281	0.44
282	0.34
283	0.29
284	0.24
285	0.21
286	0.2
287	0.13
288	0.11
289	0.1
290	0.11
291	0.11
292	0.14
293	0.18
294	0.2
295	0.29
296	0.34
297	0.41
298	0.44
299	0.5
300	0.53
301	0.57
302	0.63
303	0.64
304	0.67
305	0.62
306	0.6
307	0.6
308	0.59
309	0.55
310	0.56
311	0.53
312	0.55
313	0.59
314	0.59
315	0.55
316	0.49
317	0.45
318	0.36
319	0.29
320	0.19
321	0.18
322	0.17
323	0.15
324	0.16
325	0.17
326	0.17
327	0.18
328	0.18
329	0.15
330	0.15
331	0.2
332	0.22
333	0.26
334	0.33
335	0.34
336	0.37
337	0.37
338	0.37
339	0.36
340	0.39
341	0.4
342	0.34
343	0.33
344	0.29
345	0.26
346	0.22
347	0.18
348	0.12
349	0.07
350	0.05
351	0.04
352	0.04
353	0.04
354	0.04
355	0.04
356	0.04
357	0.04
358	0.04
359	0.04
360	0.03
361	0.04
362	0.05
363	0.05
364	0.05
365	0.05
366	0.06
367	0.07
368	0.07
369	0.09
370	0.11
371	0.13
372	0.15
373	0.18
374	0.24
375	0.28
376	0.29
377	0.31
378	0.33
379	0.33
380	0.36
381	0.36
382	0.32
383	0.28
384	0.27
385	0.23
386	0.19
387	0.16
388	0.12
389	0.08
390	0.06
391	0.04
392	0.04
393	0.03
394	0.03
395	0.03
396	0.03
397	0.03
398	0.03
399	0.03
400	0.03
401	0.03
402	0.04
403	0.04
404	0.05
405	0.07
406	0.14
407	0.16
408	0.17
409	0.23
410	0.26
411	0.33
412	0.41
413	0.48
414	0.51
415	0.59
416	0.67
417	0.69
418	0.75
419	0.76
420	0.78
421	0.78
422	0.76
423	0.72
424	0.72
425	0.67
426	0.62
427	0.58
428	0.52
429	0.43
430	0.37
431	0.32
432	0.25
433	0.23
434	0.2
435	0.17
436	0.13
437	0.12
438	0.12
439	0.12
440	0.1
441	0.1
442	0.1
443	0.11
444	0.12
445	0.14
446	0.15
447	0.15
448	0.15
449	0.14
450	0.13
451	0.13
452	0.16
453	0.21
454	0.2
455	0.23
456	0.26
457	0.28
458	0.3
459	0.35
460	0.36
461	0.37
462	0.42
463	0.45
464	0.48
465	0.49
466	0.48
467	0.46
468	0.45
469	0.4
470	0.41
471	0.4
472	0.39
473	0.37
474	0.36
475	0.34
476	0.34
477	0.31
478	0.27
479	0.23
480	0.21
481	0.25
482	0.27
483	0.31
484	0.31
485	0.35
486	0.4
487	0.43
488	0.45
489	0.45
490	0.48
491	0.5
492	0.54
493	0.54
494	0.52
495	0.58
496	0.64
497	0.67
498	0.67
499	0.65
500	0.68
501	0.67
502	0.68
503	0.63
504	0.62
505	0.62
506	0.62
507	0.57
508	0.51
509	0.48
510	0.42
511	0.35
512	0.29
513	0.22
514	0.18
515	0.17
516	0.15
517	0.18
518	0.21
519	0.25
520	0.32
521	0.42
522	0.48
523	0.57
524	0.67
525	0.72
526	0.8
527	0.87
528	0.88
529	0.86
530	0.87
531	0.87
532	0.81
533	0.71
534	0.61
535	0.5
536	0.41
537	0.33
538	0.27
539	0.18
540	0.14
541	0.14
542	0.15
543	0.18
544	0.2
545	0.22
546	0.24
547	0.26
548	0.3
549	0.3
550	0.31
551	0.32
552	0.37
553	0.35
554	0.34
555	0.41
556	0.46
557	0.54
558	0.54
559	0.52
560	0.47
561	0.51
562	0.52
563	0.53
564	0.51
565	0.45
566	0.47
567	0.52
568	0.54
569	0.5
570	0.47
571	0.38
572	0.33
573	0.32
574	0.3
575	0.24
576	0.21
577	0.23
578	0.3
579	0.31
580	0.32
581	0.33
582	0.34
583	0.32
584	0.3
585	0.29
586	0.23
587	0.26
588	0.23
589	0.2
590	0.18
591	0.18
592	0.17
593	0.15
594	0.13
595	0.08
596	0.07
597	0.06
598	0.05
599	0.04
600	0.04
601	0.06
602	0.06
603	0.07
604	0.13
605	0.14
606	0.2
607	0.27
608	0.34
609	0.39
610	0.47
611	0.57
612	0.62
613	0.72
614	0.76
615	0.77
616	0.74
617	0.69
618	0.66
619	0.56
620	0.49
621	0.43
622	0.34
623	0.27
624	0.25
625	0.25
626	0.23
627	0.22
628	0.21
629	0.19
630	0.19
631	0.18
632	0.2
633	0.2
634	0.17
635	0.16
636	0.15
637	0.13
638	0.14
639	0.14
640	0.12
641	0.12
642	0.13
643	0.13
644	0.12
645	0.13
646	0.15
647	0.18
648	0.17
649	0.15
650	0.15
651	0.19
652	0.2
653	0.2
654	0.16
655	0.14
656	0.16
657	0.2
658	0.22
659	0.21
660	0.2
661	0.2
662	0.21
663	0.21
664	0.19
665	0.15
666	0.12
667	0.09
668	0.09
669	0.07
670	0.06
671	0.05
672	0.05
673	0.05
674	0.05
675	0.06
676	0.07
677	0.09
678	0.11
679	0.17
680	0.18
681	0.19
682	0.22
683	0.22
684	0.22
685	0.24
686	0.3
687	0.3
688	0.36
689	0.43
690	0.49
691	0.5
692	0.54
693	0.59
694	0.61
695	0.61
696	0.62
697	0.63
698	0.63
699	0.65
700	0.64
701	0.58
702	0.55
703	0.6
704	0.58
705	0.55
706	0.55
707	0.53
708	0.5
709	0.51
710	0.53
711	0.45
712	0.4
713	0.39
714	0.35
715	0.39

A0A3D8RSY2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer