Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3D8SS80

Protein Details
Accession A0A3D8SS80    Localization Confidence High Confidence Score 23
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
365-393LQALKDKENTRKKRERRRENEKKQKEVIRBasic
725-758ALNARPIKKVREAKDRKKFKAAQRLEKLRKKSALHydrophilic
772-797NSISKLMSKAAKKKPRQEVKVVVARGHydrophilic
816-835VDARLKKDVRADKRLAKKKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-23KHGKGRLDKWYKLAKEKG
373-389NTRKKRERRRENEKKQK
715-756AAAAIKEKLRALNARPIKKVREAKDRKKFKAAQRLEKLRKKS
776-835KLMSKAAKKKPRQEVKVVVARGGNRGIAGRPRGVKGKYKIVDARLKKDVRADKRLAKKKK
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto 6, mito 3, cyto_pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002877  RNA_MeTrfase_FtsJ_dom  
IPR015507  rRNA-MeTfrase_E  
IPR012920  rRNA_MeTfrase_SPB1-like_C  
IPR024576  rRNA_MeTfrase_Spb1_DUF3381  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
IPR028589  SPB1-like  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0070039  F:rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase activity  
GO:0008650  F:rRNA (uridine-2'-O-)-methyltransferase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF11861  DUF3381  
PF01728  FtsJ  
PF07780  Spb1_C  
Amino Acid Sequences MAIQKKHGKGRLDKWYKLAKEKGYRARAAFKLIQLNKKYGFLEKSKVLLDLCAAPGSWCQVAAETMPVSSLIVGVDLAPIKSIPRVITFQSDITTDKCRATIRQHLKTWKADTVLHDGAPNVGTAWVQDSFNQAELVLQSMKLATEFLVEGGTFVTKVFRSKDYNSLLWVFNQLFTKVEATKPPSSRNVSAEIFVVCQGFKAPKRIDPKFLDPRSVFAELSDPTPNNEAKVFNPEIKKRKRDGYEEGNYTQFKEVPASEFIQTTDPIAILGSLNRLSFAQPANGDVALAALDKLPETTTEIRDCCNDLRVLGRKEFRMLLKWRLKVREKFGFATKKSAKAAAEAAAEEVAEVEPMDEELKIQEELQALKDKENTRKKRERRRENEKKQKEVIRMQLHMTAPTEIGLEQAGPNGEGSMFGLKAVDKSGAVDKIAKGKMAILKESDAHKEFDFGSGGESDADSDPEEDELDREMDAMYEQYQERKSEADAKYRAKKARKEHEDGDWEGFSAGGSDDDGELEEDSSDDDSDEEAPSKRSLLTNLERKEQKAGGLSKRAAQFFDQDIFKDIGGVIEEVEEDEGSLDEDDQEALAAGLDELEIIRESKADSEEESELAEEVGAESDESEEDGFEVVKRKDQDANWEDEEPRKDGKLDIDIITAEAMTLAQQIASGEKSRYDLIDDGFNKYAFKDRDGLPEWFLDDEGRHDKPHKPISASAAAAIKEKLRALNARPIKKVREAKDRKKFKAAQRLEKLRKKSALLADEEGMTEKEKANSISKLMSKAAKKKPRQEVKVVVARGGNRGIAGRPRGVKGKYKIVDARLKKDVRADKRLAKKKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.72
2 0.75
3 0.73
4 0.72
5 0.71
6 0.7
7 0.71
8 0.77
9 0.79
10 0.77
11 0.78
12 0.73
13 0.74
14 0.67
15 0.65
16 0.59
17 0.55
18 0.57
19 0.57
20 0.62
21 0.57
22 0.6
23 0.55
24 0.54
25 0.51
26 0.47
27 0.47
28 0.43
29 0.46
30 0.43
31 0.44
32 0.41
33 0.42
34 0.35
35 0.29
36 0.26
37 0.23
38 0.21
39 0.18
40 0.17
41 0.15
42 0.16
43 0.18
44 0.16
45 0.13
46 0.11
47 0.12
48 0.13
49 0.13
50 0.15
51 0.12
52 0.11
53 0.12
54 0.11
55 0.1
56 0.09
57 0.09
58 0.05
59 0.05
60 0.05
61 0.05
62 0.07
63 0.08
64 0.08
65 0.08
66 0.09
67 0.09
68 0.11
69 0.14
70 0.13
71 0.16
72 0.2
73 0.22
74 0.28
75 0.29
76 0.29
77 0.27
78 0.27
79 0.25
80 0.24
81 0.27
82 0.23
83 0.22
84 0.24
85 0.25
86 0.29
87 0.34
88 0.42
89 0.48
90 0.55
91 0.61
92 0.67
93 0.72
94 0.74
95 0.71
96 0.65
97 0.58
98 0.52
99 0.48
100 0.48
101 0.43
102 0.37
103 0.32
104 0.28
105 0.26
106 0.22
107 0.18
108 0.1
109 0.08
110 0.08
111 0.07
112 0.1
113 0.1
114 0.1
115 0.11
116 0.14
117 0.15
118 0.17
119 0.16
120 0.13
121 0.13
122 0.13
123 0.15
124 0.11
125 0.1
126 0.09
127 0.09
128 0.09
129 0.08
130 0.09
131 0.06
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.07
140 0.06
141 0.06
142 0.08
143 0.08
144 0.12
145 0.15
146 0.2
147 0.25
148 0.29
149 0.38
150 0.41
151 0.41
152 0.41
153 0.42
154 0.38
155 0.33
156 0.33
157 0.25
158 0.22
159 0.23
160 0.2
161 0.17
162 0.18
163 0.2
164 0.17
165 0.19
166 0.22
167 0.27
168 0.34
169 0.36
170 0.4
171 0.44
172 0.49
173 0.5
174 0.47
175 0.47
176 0.4
177 0.38
178 0.35
179 0.28
180 0.22
181 0.19
182 0.17
183 0.1
184 0.09
185 0.1
186 0.14
187 0.16
188 0.24
189 0.25
190 0.32
191 0.41
192 0.45
193 0.51
194 0.52
195 0.59
196 0.61
197 0.61
198 0.63
199 0.54
200 0.53
201 0.5
202 0.46
203 0.36
204 0.26
205 0.27
206 0.19
207 0.22
208 0.22
209 0.17
210 0.17
211 0.2
212 0.2
213 0.18
214 0.19
215 0.18
216 0.15
217 0.23
218 0.23
219 0.26
220 0.32
221 0.39
222 0.48
223 0.55
224 0.62
225 0.6
226 0.66
227 0.67
228 0.67
229 0.67
230 0.67
231 0.66
232 0.64
233 0.61
234 0.56
235 0.5
236 0.44
237 0.37
238 0.28
239 0.2
240 0.18
241 0.16
242 0.15
243 0.17
244 0.18
245 0.17
246 0.17
247 0.17
248 0.17
249 0.16
250 0.14
251 0.11
252 0.09
253 0.08
254 0.08
255 0.07
256 0.05
257 0.06
258 0.07
259 0.08
260 0.07
261 0.08
262 0.08
263 0.09
264 0.11
265 0.12
266 0.13
267 0.12
268 0.13
269 0.14
270 0.13
271 0.13
272 0.1
273 0.09
274 0.06
275 0.06
276 0.05
277 0.04
278 0.04
279 0.04
280 0.04
281 0.05
282 0.05
283 0.09
284 0.12
285 0.15
286 0.18
287 0.19
288 0.2
289 0.21
290 0.23
291 0.19
292 0.19
293 0.16
294 0.13
295 0.19
296 0.25
297 0.27
298 0.3
299 0.32
300 0.3
301 0.32
302 0.35
303 0.31
304 0.31
305 0.32
306 0.37
307 0.41
308 0.46
309 0.49
310 0.54
311 0.61
312 0.59
313 0.62
314 0.61
315 0.57
316 0.54
317 0.57
318 0.58
319 0.5
320 0.54
321 0.49
322 0.45
323 0.43
324 0.43
325 0.35
326 0.29
327 0.29
328 0.22
329 0.2
330 0.15
331 0.15
332 0.11
333 0.11
334 0.08
335 0.07
336 0.04
337 0.03
338 0.03
339 0.03
340 0.03
341 0.03
342 0.04
343 0.03
344 0.04
345 0.04
346 0.05
347 0.05
348 0.06
349 0.08
350 0.08
351 0.09
352 0.11
353 0.17
354 0.16
355 0.17
356 0.23
357 0.25
358 0.34
359 0.44
360 0.5
361 0.53
362 0.63
363 0.71
364 0.77
365 0.84
366 0.86
367 0.86
368 0.89
369 0.91
370 0.93
371 0.94
372 0.91
373 0.87
374 0.82
375 0.78
376 0.73
377 0.68
378 0.65
379 0.59
380 0.52
381 0.47
382 0.44
383 0.38
384 0.33
385 0.28
386 0.19
387 0.14
388 0.13
389 0.12
390 0.07
391 0.07
392 0.05
393 0.05
394 0.04
395 0.05
396 0.05
397 0.04
398 0.04
399 0.04
400 0.04
401 0.04
402 0.04
403 0.05
404 0.04
405 0.04
406 0.05
407 0.05
408 0.05
409 0.06
410 0.06
411 0.05
412 0.06
413 0.08
414 0.09
415 0.09
416 0.1
417 0.11
418 0.17
419 0.18
420 0.17
421 0.14
422 0.16
423 0.19
424 0.19
425 0.19
426 0.13
427 0.14
428 0.16
429 0.18
430 0.19
431 0.17
432 0.18
433 0.17
434 0.17
435 0.16
436 0.15
437 0.14
438 0.1
439 0.1
440 0.08
441 0.08
442 0.07
443 0.07
444 0.07
445 0.06
446 0.07
447 0.06
448 0.06
449 0.06
450 0.06
451 0.06
452 0.05
453 0.05
454 0.06
455 0.06
456 0.05
457 0.05
458 0.05
459 0.05
460 0.05
461 0.05
462 0.05
463 0.07
464 0.07
465 0.1
466 0.12
467 0.13
468 0.13
469 0.14
470 0.14
471 0.21
472 0.24
473 0.29
474 0.33
475 0.39
476 0.46
477 0.52
478 0.57
479 0.56
480 0.6
481 0.62
482 0.67
483 0.69
484 0.67
485 0.64
486 0.64
487 0.62
488 0.57
489 0.5
490 0.39
491 0.31
492 0.24
493 0.21
494 0.13
495 0.09
496 0.07
497 0.04
498 0.04
499 0.04
500 0.04
501 0.04
502 0.04
503 0.04
504 0.04
505 0.05
506 0.04
507 0.04
508 0.05
509 0.05
510 0.05
511 0.04
512 0.05
513 0.05
514 0.06
515 0.07
516 0.08
517 0.08
518 0.1
519 0.1
520 0.11
521 0.11
522 0.11
523 0.13
524 0.19
525 0.26
526 0.34
527 0.36
528 0.43
529 0.43
530 0.43
531 0.46
532 0.39
533 0.33
534 0.31
535 0.35
536 0.33
537 0.38
538 0.37
539 0.38
540 0.41
541 0.4
542 0.34
543 0.29
544 0.27
545 0.23
546 0.27
547 0.22
548 0.19
549 0.21
550 0.2
551 0.19
552 0.16
553 0.13
554 0.09
555 0.09
556 0.09
557 0.06
558 0.05
559 0.05
560 0.05
561 0.05
562 0.05
563 0.04
564 0.04
565 0.04
566 0.04
567 0.04
568 0.04
569 0.04
570 0.05
571 0.05
572 0.04
573 0.04
574 0.04
575 0.04
576 0.03
577 0.03
578 0.03
579 0.03
580 0.03
581 0.03
582 0.03
583 0.03
584 0.04
585 0.04
586 0.05
587 0.05
588 0.06
589 0.08
590 0.09
591 0.09
592 0.1
593 0.13
594 0.14
595 0.14
596 0.14
597 0.12
598 0.11
599 0.1
600 0.09
601 0.05
602 0.04
603 0.05
604 0.04
605 0.04
606 0.04
607 0.04
608 0.04
609 0.05
610 0.05
611 0.04
612 0.05
613 0.05
614 0.05
615 0.06
616 0.12
617 0.12
618 0.17
619 0.19
620 0.22
621 0.27
622 0.28
623 0.38
624 0.36
625 0.42
626 0.4
627 0.41
628 0.4
629 0.39
630 0.41
631 0.33
632 0.31
633 0.25
634 0.23
635 0.23
636 0.25
637 0.24
638 0.25
639 0.23
640 0.22
641 0.21
642 0.2
643 0.18
644 0.15
645 0.09
646 0.06
647 0.05
648 0.04
649 0.04
650 0.04
651 0.04
652 0.04
653 0.05
654 0.06
655 0.08
656 0.1
657 0.1
658 0.11
659 0.14
660 0.14
661 0.15
662 0.16
663 0.17
664 0.16
665 0.24
666 0.24
667 0.27
668 0.28
669 0.28
670 0.25
671 0.24
672 0.31
673 0.23
674 0.25
675 0.26
676 0.26
677 0.34
678 0.39
679 0.4
680 0.33
681 0.33
682 0.32
683 0.27
684 0.25
685 0.17
686 0.13
687 0.16
688 0.2
689 0.21
690 0.22
691 0.25
692 0.31
693 0.39
694 0.48
695 0.47
696 0.46
697 0.48
698 0.52
699 0.55
700 0.49
701 0.43
702 0.38
703 0.33
704 0.31
705 0.28
706 0.22
707 0.19
708 0.2
709 0.19
710 0.2
711 0.25
712 0.28
713 0.37
714 0.45
715 0.49
716 0.55
717 0.59
718 0.59
719 0.64
720 0.69
721 0.66
722 0.69
723 0.73
724 0.77
725 0.82
726 0.87
727 0.83
728 0.85
729 0.85
730 0.83
731 0.84
732 0.83
733 0.83
734 0.83
735 0.88
736 0.88
737 0.88
738 0.86
739 0.83
740 0.79
741 0.71
742 0.69
743 0.66
744 0.62
745 0.58
746 0.54
747 0.47
748 0.42
749 0.39
750 0.32
751 0.24
752 0.19
753 0.16
754 0.15
755 0.16
756 0.18
757 0.21
758 0.25
759 0.26
760 0.28
761 0.33
762 0.34
763 0.35
764 0.37
765 0.41
766 0.44
767 0.51
768 0.59
769 0.63
770 0.69
771 0.76
772 0.82
773 0.86
774 0.86
775 0.85
776 0.84
777 0.84
778 0.83
779 0.74
780 0.66
781 0.59
782 0.53
783 0.47
784 0.39
785 0.3
786 0.22
787 0.23
788 0.24
789 0.28
790 0.3
791 0.32
792 0.35
793 0.38
794 0.45
795 0.48
796 0.54
797 0.53
798 0.6
799 0.56
800 0.61
801 0.63
802 0.64
803 0.69
804 0.67
805 0.68
806 0.67
807 0.66
808 0.6
809 0.63
810 0.65
811 0.64
812 0.66
813 0.67
814 0.67
815 0.75