Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3D8SFR1

Protein Details
Accession A0A3D8SFR1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
70-90DIPNWRTKNYVPKNPRNWYRVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
377-386RGASKKPRQR
Subcellular Location(s) mito 14, nucl 10, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010684  RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A  
Gene Ontology GO:0070449  C:elongin complex  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF06881  Elongin_A  
Amino Acid Sequences MPAPRLVDSCIKVCIRNVRGLTDVGDFEYQTIRPVLKCVSSAEQLHKIEQNSPQIQGEDAELWQAFIARDIPNWRTKNYVPKNPRNWYRVYCKYKKEQQQEIARDEEILRQSMLGLKRERETHVSKVVDLKSLPKIPRDPRMIANNGGVPLKGKTGFKKAPPSALTWTAGSKTKLTDGKSVLTRARREAKEMTQRGKLATPTGQLNIRHGQVKQAPAAMVKEYRTAAQPPLKILSRKHGVGGIKGGIRGPSLEEREARLRAAMAGGSSNRQTYNDPKATYVGSSDDEEDSGLEDLFDSKPKQQNRSVSSRRLSSPPSVPHSSSSRLQSASESSKAGSSRPLPRALSPPPASSQIANAAPGPKPMMARKRPQVDIFNRGASKKPRQR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.4
3 0.45
4 0.45
5 0.42
6 0.42
7 0.42
8 0.39
9 0.32
10 0.28
11 0.23
12 0.22
13 0.18
14 0.17
15 0.18
16 0.16
17 0.15
18 0.16
19 0.16
20 0.15
21 0.18
22 0.21
23 0.2
24 0.22
25 0.24
26 0.27
27 0.3
28 0.34
29 0.37
30 0.42
31 0.41
32 0.44
33 0.44
34 0.4
35 0.39
36 0.41
37 0.45
38 0.38
39 0.39
40 0.38
41 0.34
42 0.33
43 0.28
44 0.24
45 0.16
46 0.14
47 0.14
48 0.12
49 0.11
50 0.11
51 0.11
52 0.09
53 0.09
54 0.12
55 0.1
56 0.13
57 0.18
58 0.22
59 0.3
60 0.33
61 0.33
62 0.36
63 0.39
64 0.47
65 0.52
66 0.59
67 0.6
68 0.68
69 0.77
70 0.81
71 0.85
72 0.79
73 0.76
74 0.72
75 0.71
76 0.71
77 0.72
78 0.7
79 0.68
80 0.74
81 0.77
82 0.8
83 0.8
84 0.78
85 0.77
86 0.79
87 0.78
88 0.72
89 0.65
90 0.55
91 0.47
92 0.39
93 0.34
94 0.26
95 0.2
96 0.17
97 0.14
98 0.14
99 0.18
100 0.2
101 0.21
102 0.22
103 0.24
104 0.27
105 0.3
106 0.32
107 0.33
108 0.35
109 0.34
110 0.39
111 0.37
112 0.36
113 0.4
114 0.38
115 0.34
116 0.3
117 0.28
118 0.26
119 0.32
120 0.32
121 0.3
122 0.36
123 0.39
124 0.47
125 0.49
126 0.46
127 0.46
128 0.51
129 0.5
130 0.44
131 0.41
132 0.34
133 0.3
134 0.27
135 0.21
136 0.15
137 0.13
138 0.13
139 0.13
140 0.14
141 0.16
142 0.24
143 0.28
144 0.32
145 0.41
146 0.4
147 0.45
148 0.44
149 0.44
150 0.4
151 0.39
152 0.35
153 0.26
154 0.26
155 0.21
156 0.22
157 0.2
158 0.17
159 0.14
160 0.18
161 0.21
162 0.22
163 0.25
164 0.24
165 0.27
166 0.28
167 0.3
168 0.29
169 0.3
170 0.3
171 0.3
172 0.37
173 0.34
174 0.36
175 0.37
176 0.4
177 0.45
178 0.49
179 0.47
180 0.42
181 0.42
182 0.39
183 0.37
184 0.3
185 0.22
186 0.19
187 0.18
188 0.15
189 0.16
190 0.19
191 0.18
192 0.2
193 0.21
194 0.21
195 0.21
196 0.2
197 0.23
198 0.23
199 0.25
200 0.22
201 0.21
202 0.2
203 0.18
204 0.19
205 0.16
206 0.14
207 0.12
208 0.14
209 0.13
210 0.13
211 0.14
212 0.15
213 0.19
214 0.22
215 0.22
216 0.22
217 0.25
218 0.28
219 0.29
220 0.29
221 0.31
222 0.31
223 0.3
224 0.3
225 0.3
226 0.28
227 0.26
228 0.28
229 0.22
230 0.19
231 0.19
232 0.18
233 0.14
234 0.13
235 0.12
236 0.12
237 0.15
238 0.17
239 0.18
240 0.19
241 0.22
242 0.26
243 0.27
244 0.24
245 0.19
246 0.17
247 0.15
248 0.15
249 0.11
250 0.07
251 0.08
252 0.09
253 0.1
254 0.11
255 0.12
256 0.12
257 0.13
258 0.16
259 0.2
260 0.29
261 0.32
262 0.32
263 0.32
264 0.34
265 0.33
266 0.3
267 0.26
268 0.18
269 0.15
270 0.15
271 0.15
272 0.14
273 0.13
274 0.13
275 0.11
276 0.1
277 0.09
278 0.08
279 0.06
280 0.05
281 0.07
282 0.08
283 0.11
284 0.12
285 0.18
286 0.25
287 0.31
288 0.37
289 0.43
290 0.51
291 0.54
292 0.63
293 0.65
294 0.66
295 0.66
296 0.65
297 0.61
298 0.57
299 0.55
300 0.5
301 0.5
302 0.48
303 0.51
304 0.5
305 0.48
306 0.47
307 0.48
308 0.47
309 0.44
310 0.42
311 0.39
312 0.35
313 0.35
314 0.33
315 0.34
316 0.34
317 0.32
318 0.28
319 0.24
320 0.27
321 0.26
322 0.25
323 0.25
324 0.27
325 0.34
326 0.38
327 0.43
328 0.42
329 0.46
330 0.52
331 0.51
332 0.54
333 0.48
334 0.46
335 0.43
336 0.46
337 0.44
338 0.37
339 0.35
340 0.31
341 0.29
342 0.27
343 0.26
344 0.25
345 0.24
346 0.25
347 0.25
348 0.21
349 0.24
350 0.31
351 0.4
352 0.45
353 0.54
354 0.61
355 0.67
356 0.71
357 0.74
358 0.75
359 0.72
360 0.72
361 0.67
362 0.66
363 0.61
364 0.56
365 0.57
366 0.56