Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3D8ST27

Protein Details
Accession A0A3D8ST27    Localization Confidence Low Confidence Score 9.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
756-777EKLQNSRSKHQKDNQSDRNGRQHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 13, cyto 6.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR001656  PsdUridine_synth_TruD  
IPR020119  PsdUridine_synth_TruD_CS  
IPR011760  PsdUridine_synth_TruD_insert  
IPR042214  TruD_catalytic  
Gene Ontology GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0008033  P:tRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01142  TruD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50984  TRUD  
PS01268  UPF0024  
CDD cd02576  PseudoU_synth_ScPUS7  
Amino Acid Sequences MASLSSSNDLDERPSKRIKASPSQLPSSSSTDHNTASVTQSGVAKMDPENLKPNDKNGGFQPEREAEVGILCFVNSTNPGFSGILKQRYTDFLVNEITPDGTVVHLTDDRAPKFSQLPKPDEAASVKPASNTDENVTPPVKAEIKIEEKKTIAPRFAAQDVRLEDPEFAAKIKPKSPAQTSTEGDEYAPVVKDVTNAQASPNTTEPSPDATKTQASLLSADDEARLASYFGDTIKEQLIKFHAEVISKPDKKASLFGSLMSDPISDKEIRTKVHQDVRRIFSSTLETELVSDDVIKISAAPRAGAKQQNNPRQFRQGQSKGKLGWQELGGQYLHFSLYKENKDTMEVVSFLAKMLKLKPRDFAFSGTKDRRAVTVQRVSVFRQYADRVAGINRELRGSRVGNFKYEKHALELGELQGNQFHITLRNCHFGDDAGMDLTSRVQVANTIVGDAVKYLQQRGFLNYFGLQRFGTFGIGTDIVGTRILKGDFEGAVRAILTVSEESLRAVSDPGSVPEGTLVSRDDLARAEAISLFNKTGASHAALQKLPRKFSAESAIIRHLGHQARKTDYLGALQTINRNLKLMYVHAYQSLVWNAVTSERWSRYGDKVIQGDLVLVDGQAIRNAAAAKENEVDENGEVVIRPAVDDTALSHDDLFQRARPLSAEEAASGQYSIFDIVLPTPGYDINYPDNDIGDYYKEFMNSERGGRLDPANMRRPQKDFSLSGSYRKILGQVTQQMSFEVKVYHDENEQLVETDLEKLQNSRSKHQKDNQSDRNGRQHNGQGDHRNGNDRVGRPQANPQAPAEANTAALAAWNALPTKLAAEDKAAAEAAAIAALNPSDLSEIKQPTFKDTYIQTAIDQNGFAQRTGNRTTVMHQGTVDEPAEASGIKVSAPLQYDGCSDSNMEVDKSNSLDRVTGSRVPSSSTTDSADGGVRLDTSPARLTVKRSADSMLNGMDTTCNTVEQTPRTVMVQSEQVDAKDMASAKIGVVVKFALGSSQYATMALRELMKVGGVKTYKPDFSGGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.41
3 0.46
4 0.52
5 0.55
6 0.58
7 0.62
8 0.66
9 0.66
10 0.69
11 0.64
12 0.62
13 0.58
14 0.52
15 0.47
16 0.4
17 0.37
18 0.34
19 0.33
20 0.3
21 0.28
22 0.24
23 0.24
24 0.23
25 0.19
26 0.18
27 0.19
28 0.19
29 0.18
30 0.17
31 0.16
32 0.15
33 0.22
34 0.23
35 0.25
36 0.33
37 0.36
38 0.45
39 0.44
40 0.48
41 0.49
42 0.47
43 0.47
44 0.43
45 0.5
46 0.43
47 0.43
48 0.46
49 0.39
50 0.41
51 0.38
52 0.33
53 0.23
54 0.24
55 0.22
56 0.16
57 0.13
58 0.1
59 0.1
60 0.09
61 0.11
62 0.1
63 0.12
64 0.12
65 0.13
66 0.16
67 0.16
68 0.17
69 0.25
70 0.3
71 0.36
72 0.35
73 0.36
74 0.35
75 0.39
76 0.43
77 0.39
78 0.32
79 0.28
80 0.31
81 0.29
82 0.28
83 0.25
84 0.2
85 0.15
86 0.14
87 0.11
88 0.08
89 0.08
90 0.07
91 0.1
92 0.11
93 0.12
94 0.19
95 0.25
96 0.26
97 0.29
98 0.29
99 0.29
100 0.35
101 0.42
102 0.45
103 0.46
104 0.51
105 0.5
106 0.53
107 0.51
108 0.49
109 0.44
110 0.38
111 0.35
112 0.33
113 0.31
114 0.29
115 0.29
116 0.29
117 0.28
118 0.27
119 0.25
120 0.25
121 0.25
122 0.29
123 0.28
124 0.23
125 0.22
126 0.24
127 0.24
128 0.21
129 0.22
130 0.26
131 0.34
132 0.41
133 0.43
134 0.42
135 0.41
136 0.46
137 0.53
138 0.51
139 0.44
140 0.4
141 0.4
142 0.41
143 0.45
144 0.42
145 0.34
146 0.35
147 0.35
148 0.36
149 0.34
150 0.3
151 0.25
152 0.22
153 0.24
154 0.18
155 0.16
156 0.16
157 0.2
158 0.24
159 0.28
160 0.33
161 0.36
162 0.43
163 0.48
164 0.52
165 0.52
166 0.55
167 0.53
168 0.5
169 0.47
170 0.4
171 0.34
172 0.26
173 0.22
174 0.17
175 0.15
176 0.11
177 0.1
178 0.1
179 0.11
180 0.12
181 0.16
182 0.15
183 0.15
184 0.16
185 0.2
186 0.21
187 0.23
188 0.24
189 0.21
190 0.19
191 0.2
192 0.2
193 0.22
194 0.24
195 0.22
196 0.21
197 0.22
198 0.23
199 0.23
200 0.24
201 0.19
202 0.17
203 0.17
204 0.16
205 0.16
206 0.14
207 0.14
208 0.12
209 0.1
210 0.09
211 0.09
212 0.08
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.07
218 0.09
219 0.09
220 0.1
221 0.13
222 0.16
223 0.16
224 0.18
225 0.2
226 0.21
227 0.21
228 0.24
229 0.23
230 0.21
231 0.22
232 0.26
233 0.34
234 0.33
235 0.34
236 0.33
237 0.33
238 0.33
239 0.37
240 0.32
241 0.29
242 0.27
243 0.28
244 0.29
245 0.26
246 0.25
247 0.21
248 0.18
249 0.11
250 0.12
251 0.14
252 0.1
253 0.11
254 0.18
255 0.22
256 0.24
257 0.29
258 0.34
259 0.38
260 0.47
261 0.51
262 0.52
263 0.57
264 0.6
265 0.58
266 0.55
267 0.48
268 0.41
269 0.4
270 0.32
271 0.27
272 0.22
273 0.19
274 0.16
275 0.16
276 0.14
277 0.1
278 0.09
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.05
283 0.05
284 0.06
285 0.08
286 0.08
287 0.08
288 0.09
289 0.12
290 0.19
291 0.25
292 0.28
293 0.35
294 0.45
295 0.54
296 0.6
297 0.63
298 0.6
299 0.63
300 0.63
301 0.6
302 0.61
303 0.62
304 0.63
305 0.62
306 0.64
307 0.56
308 0.56
309 0.53
310 0.44
311 0.37
312 0.28
313 0.28
314 0.24
315 0.24
316 0.21
317 0.16
318 0.15
319 0.13
320 0.12
321 0.08
322 0.08
323 0.12
324 0.19
325 0.22
326 0.25
327 0.26
328 0.26
329 0.27
330 0.28
331 0.23
332 0.18
333 0.15
334 0.13
335 0.13
336 0.12
337 0.1
338 0.11
339 0.09
340 0.09
341 0.14
342 0.2
343 0.25
344 0.26
345 0.32
346 0.33
347 0.38
348 0.38
349 0.38
350 0.37
351 0.36
352 0.44
353 0.42
354 0.43
355 0.4
356 0.39
357 0.35
358 0.34
359 0.34
360 0.33
361 0.37
362 0.35
363 0.37
364 0.38
365 0.38
366 0.39
367 0.35
368 0.27
369 0.23
370 0.23
371 0.21
372 0.21
373 0.19
374 0.15
375 0.15
376 0.16
377 0.14
378 0.16
379 0.14
380 0.15
381 0.14
382 0.15
383 0.18
384 0.17
385 0.2
386 0.25
387 0.25
388 0.29
389 0.31
390 0.31
391 0.34
392 0.36
393 0.33
394 0.28
395 0.29
396 0.24
397 0.23
398 0.23
399 0.18
400 0.17
401 0.16
402 0.13
403 0.11
404 0.11
405 0.1
406 0.09
407 0.08
408 0.11
409 0.12
410 0.17
411 0.19
412 0.25
413 0.24
414 0.25
415 0.25
416 0.2
417 0.2
418 0.16
419 0.13
420 0.07
421 0.07
422 0.06
423 0.06
424 0.06
425 0.05
426 0.04
427 0.04
428 0.03
429 0.05
430 0.05
431 0.07
432 0.07
433 0.07
434 0.07
435 0.07
436 0.07
437 0.06
438 0.06
439 0.06
440 0.07
441 0.08
442 0.09
443 0.12
444 0.13
445 0.17
446 0.18
447 0.16
448 0.17
449 0.18
450 0.2
451 0.17
452 0.17
453 0.13
454 0.12
455 0.13
456 0.12
457 0.1
458 0.07
459 0.07
460 0.08
461 0.08
462 0.08
463 0.07
464 0.06
465 0.06
466 0.07
467 0.07
468 0.05
469 0.07
470 0.07
471 0.06
472 0.07
473 0.08
474 0.07
475 0.08
476 0.08
477 0.06
478 0.06
479 0.06
480 0.06
481 0.04
482 0.04
483 0.04
484 0.04
485 0.04
486 0.04
487 0.05
488 0.05
489 0.05
490 0.05
491 0.05
492 0.05
493 0.05
494 0.06
495 0.06
496 0.07
497 0.08
498 0.08
499 0.08
500 0.08
501 0.08
502 0.06
503 0.07
504 0.07
505 0.06
506 0.07
507 0.07
508 0.07
509 0.07
510 0.07
511 0.07
512 0.06
513 0.06
514 0.06
515 0.07
516 0.07
517 0.08
518 0.07
519 0.07
520 0.08
521 0.07
522 0.07
523 0.07
524 0.08
525 0.11
526 0.14
527 0.17
528 0.18
529 0.21
530 0.26
531 0.28
532 0.27
533 0.25
534 0.27
535 0.24
536 0.26
537 0.29
538 0.27
539 0.26
540 0.27
541 0.28
542 0.25
543 0.24
544 0.22
545 0.22
546 0.22
547 0.23
548 0.25
549 0.26
550 0.28
551 0.3
552 0.29
553 0.26
554 0.23
555 0.21
556 0.18
557 0.15
558 0.13
559 0.13
560 0.14
561 0.16
562 0.17
563 0.15
564 0.15
565 0.14
566 0.15
567 0.14
568 0.13
569 0.13
570 0.14
571 0.14
572 0.14
573 0.15
574 0.13
575 0.14
576 0.14
577 0.1
578 0.08
579 0.08
580 0.07
581 0.08
582 0.09
583 0.09
584 0.13
585 0.14
586 0.16
587 0.18
588 0.21
589 0.23
590 0.29
591 0.3
592 0.3
593 0.3
594 0.28
595 0.27
596 0.23
597 0.2
598 0.14
599 0.11
600 0.06
601 0.05
602 0.04
603 0.04
604 0.04
605 0.04
606 0.05
607 0.04
608 0.06
609 0.06
610 0.06
611 0.09
612 0.09
613 0.11
614 0.12
615 0.12
616 0.11
617 0.12
618 0.12
619 0.09
620 0.09
621 0.07
622 0.06
623 0.05
624 0.05
625 0.06
626 0.05
627 0.05
628 0.04
629 0.04
630 0.04
631 0.04
632 0.05
633 0.09
634 0.1
635 0.1
636 0.1
637 0.12
638 0.13
639 0.15
640 0.15
641 0.12
642 0.14
643 0.15
644 0.15
645 0.14
646 0.16
647 0.16
648 0.17
649 0.16
650 0.13
651 0.13
652 0.13
653 0.13
654 0.1
655 0.08
656 0.06
657 0.06
658 0.06
659 0.05
660 0.04
661 0.04
662 0.05
663 0.07
664 0.07
665 0.07
666 0.07
667 0.07
668 0.09
669 0.09
670 0.11
671 0.13
672 0.14
673 0.15
674 0.14
675 0.14
676 0.13
677 0.13
678 0.11
679 0.1
680 0.09
681 0.1
682 0.1
683 0.1
684 0.1
685 0.11
686 0.16
687 0.16
688 0.18
689 0.18
690 0.18
691 0.18
692 0.2
693 0.2
694 0.19
695 0.23
696 0.28
697 0.35
698 0.4
699 0.44
700 0.46
701 0.48
702 0.46
703 0.45
704 0.44
705 0.37
706 0.37
707 0.42
708 0.39
709 0.41
710 0.41
711 0.36
712 0.32
713 0.31
714 0.27
715 0.19
716 0.2
717 0.22
718 0.27
719 0.29
720 0.29
721 0.29
722 0.27
723 0.27
724 0.25
725 0.2
726 0.13
727 0.1
728 0.12
729 0.14
730 0.15
731 0.15
732 0.16
733 0.15
734 0.16
735 0.16
736 0.13
737 0.12
738 0.1
739 0.1
740 0.11
741 0.11
742 0.1
743 0.1
744 0.11
745 0.16
746 0.21
747 0.25
748 0.31
749 0.41
750 0.46
751 0.55
752 0.62
753 0.67
754 0.72
755 0.79
756 0.8
757 0.8
758 0.8
759 0.77
760 0.8
761 0.74
762 0.65
763 0.59
764 0.57
765 0.53
766 0.52
767 0.53
768 0.5
769 0.52
770 0.55
771 0.51
772 0.51
773 0.44
774 0.44
775 0.43
776 0.37
777 0.37
778 0.39
779 0.41
780 0.36
781 0.45
782 0.49
783 0.47
784 0.47
785 0.42
786 0.41
787 0.38
788 0.39
789 0.32
790 0.23
791 0.2
792 0.18
793 0.17
794 0.1
795 0.1
796 0.07
797 0.05
798 0.05
799 0.06
800 0.07
801 0.06
802 0.07
803 0.07
804 0.08
805 0.1
806 0.11
807 0.11
808 0.13
809 0.16
810 0.16
811 0.16
812 0.15
813 0.12
814 0.11
815 0.1
816 0.08
817 0.05
818 0.05
819 0.03
820 0.04
821 0.04
822 0.04
823 0.04
824 0.04
825 0.05
826 0.06
827 0.09
828 0.15
829 0.19
830 0.2
831 0.24
832 0.25
833 0.29
834 0.33
835 0.31
836 0.29
837 0.27
838 0.33
839 0.32
840 0.33
841 0.28
842 0.29
843 0.3
844 0.27
845 0.25
846 0.18
847 0.21
848 0.21
849 0.2
850 0.18
851 0.19
852 0.23
853 0.27
854 0.28
855 0.24
856 0.24
857 0.27
858 0.33
859 0.33
860 0.29
861 0.25
862 0.26
863 0.25
864 0.27
865 0.24
866 0.15
867 0.13
868 0.12
869 0.12
870 0.1
871 0.09
872 0.07
873 0.06
874 0.06
875 0.07
876 0.08
877 0.11
878 0.13
879 0.15
880 0.15
881 0.16
882 0.17
883 0.2
884 0.2
885 0.17
886 0.15
887 0.14
888 0.16
889 0.16
890 0.16
891 0.14
892 0.15
893 0.16
894 0.18
895 0.19
896 0.18
897 0.17
898 0.18
899 0.18
900 0.21
901 0.24
902 0.27
903 0.27
904 0.29
905 0.29
906 0.31
907 0.32
908 0.35
909 0.33
910 0.3
911 0.3
912 0.28
913 0.28
914 0.25
915 0.25
916 0.18
917 0.15
918 0.14
919 0.11
920 0.11
921 0.12
922 0.12
923 0.13
924 0.15
925 0.17
926 0.22
927 0.23
928 0.28
929 0.35
930 0.41
931 0.4
932 0.39
933 0.39
934 0.38
935 0.38
936 0.36
937 0.28
938 0.22
939 0.21
940 0.19
941 0.18
942 0.15
943 0.17
944 0.14
945 0.13
946 0.14
947 0.17
948 0.22
949 0.25
950 0.29
951 0.26
952 0.27
953 0.28
954 0.28
955 0.26
956 0.24
957 0.27
958 0.24
959 0.26
960 0.26
961 0.25
962 0.27
963 0.26
964 0.23
965 0.2
966 0.2
967 0.16
968 0.17
969 0.17
970 0.13
971 0.2
972 0.22
973 0.18
974 0.18
975 0.18
976 0.16
977 0.16
978 0.16
979 0.11
980 0.09
981 0.11
982 0.11
983 0.13
984 0.13
985 0.13
986 0.14
987 0.13
988 0.14
989 0.14
990 0.14
991 0.12
992 0.13
993 0.13
994 0.15
995 0.16
996 0.14
997 0.2
998 0.2
999 0.21
1000 0.27
1001 0.33
1002 0.33
1003 0.33