Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3D8SDD8

Protein Details
Accession A0A3D8SDD8    Localization Confidence High Confidence Score 23.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
123-147LIEASNTKPERKRKRNKDEDDLEGKBasic
158-181REEEERKAERRQKRQKVIAEKGSDBasic
569-593MGGGGGKKKGKPRTRSSNRASEWKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
131-139PERKRKRNK
163-172RKAERRQKRQ
561-598AGKPRDLKMGGGGGKKKGKPRTRSSNRASEWKKTGGRK
Subcellular Location(s) nucl 18, mito 6.5, cyto_mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MGKRSRKEQGIDPVGANGSGKVSTKSFLADDKTVDPALASLFAASAGPVIAPPKSRYSEPPPVKQRAKEEEDEEDEEEQEEDVESEGDDEELSSVDGDLEDEDILGDIDVSESLIEEPQLDKLIEASNTKPERKRKRNKDEDDLEGKYMQKLAKEEEREEEERKAERRQKRQKVIAEKGSDDAEEAEDQSIDDDDEVSEEDSDSEAAAPQRITPADVPMHESLAPNKDAVELEKASRTVFLANVSTLAISSKSAKKTLLAHMGSFLESLPDPPEGKPKHKVESLRFRSTAYAGAKLPKKAAFAKKELMDATTKSTNAYVVYSTAFAAREAAKRLNGTIVLDRHLRVDGVAHPAKTDHRRCVFVGNLGFVDDESLLDQGGENERKRSKIPSDIEEGLWRQFGKAGTVESVRVVRDEKTRVGKGFAYVQFHDANSVEAALLFNEKKYPPMLPRVLRVVRAKAVKKTALASQHANPQRPIVNGSGNANKTPIYNPKMTSQEASLQGRASKLLGRAGAAQFRKRDSMDAKQRNRAPPQNGVRNGMEGIKTPEAIVFEGHRASANAGKPRDLKMGGGGGKKKGKPRTRSSNRASEWKKTGGRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.4
3 0.31
4 0.21
5 0.15
6 0.14
7 0.14
8 0.14
9 0.15
10 0.16
11 0.16
12 0.18
13 0.18
14 0.21
15 0.26
16 0.25
17 0.27
18 0.28
19 0.31
20 0.28
21 0.26
22 0.21
23 0.16
24 0.15
25 0.13
26 0.11
27 0.07
28 0.07
29 0.07
30 0.07
31 0.06
32 0.06
33 0.05
34 0.05
35 0.05
36 0.07
37 0.09
38 0.13
39 0.16
40 0.22
41 0.26
42 0.29
43 0.36
44 0.43
45 0.52
46 0.57
47 0.64
48 0.67
49 0.73
50 0.77
51 0.76
52 0.76
53 0.74
54 0.73
55 0.68
56 0.63
57 0.6
58 0.58
59 0.55
60 0.48
61 0.4
62 0.33
63 0.28
64 0.24
65 0.17
66 0.12
67 0.09
68 0.07
69 0.07
70 0.06
71 0.06
72 0.06
73 0.06
74 0.06
75 0.06
76 0.05
77 0.05
78 0.05
79 0.06
80 0.05
81 0.05
82 0.05
83 0.05
84 0.05
85 0.05
86 0.06
87 0.05
88 0.05
89 0.05
90 0.05
91 0.05
92 0.05
93 0.04
94 0.03
95 0.04
96 0.04
97 0.04
98 0.03
99 0.04
100 0.05
101 0.05
102 0.05
103 0.06
104 0.07
105 0.08
106 0.1
107 0.1
108 0.09
109 0.1
110 0.13
111 0.14
112 0.16
113 0.16
114 0.24
115 0.29
116 0.35
117 0.41
118 0.48
119 0.58
120 0.67
121 0.77
122 0.79
123 0.85
124 0.9
125 0.92
126 0.92
127 0.87
128 0.84
129 0.79
130 0.7
131 0.61
132 0.51
133 0.44
134 0.34
135 0.31
136 0.24
137 0.19
138 0.19
139 0.22
140 0.28
141 0.31
142 0.32
143 0.34
144 0.39
145 0.4
146 0.41
147 0.39
148 0.35
149 0.36
150 0.37
151 0.41
152 0.44
153 0.5
154 0.58
155 0.66
156 0.73
157 0.78
158 0.84
159 0.84
160 0.85
161 0.85
162 0.82
163 0.74
164 0.65
165 0.56
166 0.48
167 0.39
168 0.29
169 0.21
170 0.14
171 0.1
172 0.1
173 0.08
174 0.07
175 0.07
176 0.07
177 0.07
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.04
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.06
188 0.05
189 0.06
190 0.05
191 0.05
192 0.06
193 0.06
194 0.08
195 0.08
196 0.08
197 0.1
198 0.1
199 0.12
200 0.11
201 0.14
202 0.14
203 0.15
204 0.19
205 0.17
206 0.18
207 0.17
208 0.17
209 0.16
210 0.18
211 0.18
212 0.14
213 0.13
214 0.13
215 0.13
216 0.14
217 0.15
218 0.13
219 0.13
220 0.15
221 0.15
222 0.14
223 0.14
224 0.13
225 0.1
226 0.1
227 0.1
228 0.09
229 0.09
230 0.09
231 0.09
232 0.08
233 0.07
234 0.07
235 0.05
236 0.05
237 0.09
238 0.13
239 0.15
240 0.17
241 0.17
242 0.19
243 0.23
244 0.28
245 0.33
246 0.29
247 0.27
248 0.28
249 0.28
250 0.25
251 0.21
252 0.16
253 0.08
254 0.07
255 0.07
256 0.07
257 0.08
258 0.09
259 0.09
260 0.18
261 0.2
262 0.24
263 0.32
264 0.34
265 0.37
266 0.4
267 0.46
268 0.46
269 0.55
270 0.58
271 0.56
272 0.53
273 0.49
274 0.46
275 0.41
276 0.38
277 0.28
278 0.23
279 0.18
280 0.23
281 0.25
282 0.25
283 0.26
284 0.22
285 0.23
286 0.27
287 0.34
288 0.32
289 0.33
290 0.37
291 0.36
292 0.37
293 0.34
294 0.29
295 0.23
296 0.19
297 0.19
298 0.17
299 0.16
300 0.14
301 0.14
302 0.13
303 0.12
304 0.12
305 0.08
306 0.07
307 0.07
308 0.07
309 0.07
310 0.08
311 0.08
312 0.07
313 0.08
314 0.1
315 0.11
316 0.13
317 0.15
318 0.15
319 0.15
320 0.16
321 0.15
322 0.14
323 0.13
324 0.15
325 0.14
326 0.15
327 0.16
328 0.16
329 0.15
330 0.15
331 0.14
332 0.09
333 0.1
334 0.1
335 0.16
336 0.18
337 0.17
338 0.17
339 0.18
340 0.23
341 0.3
342 0.32
343 0.33
344 0.34
345 0.37
346 0.38
347 0.42
348 0.38
349 0.34
350 0.31
351 0.24
352 0.21
353 0.19
354 0.18
355 0.13
356 0.12
357 0.07
358 0.06
359 0.05
360 0.05
361 0.04
362 0.04
363 0.05
364 0.05
365 0.1
366 0.15
367 0.15
368 0.2
369 0.22
370 0.24
371 0.26
372 0.31
373 0.3
374 0.35
375 0.38
376 0.37
377 0.41
378 0.42
379 0.41
380 0.38
381 0.35
382 0.27
383 0.24
384 0.2
385 0.13
386 0.15
387 0.14
388 0.13
389 0.13
390 0.13
391 0.14
392 0.15
393 0.15
394 0.14
395 0.15
396 0.13
397 0.13
398 0.13
399 0.14
400 0.19
401 0.22
402 0.26
403 0.31
404 0.35
405 0.35
406 0.37
407 0.35
408 0.31
409 0.36
410 0.34
411 0.31
412 0.28
413 0.3
414 0.29
415 0.27
416 0.27
417 0.19
418 0.17
419 0.12
420 0.11
421 0.08
422 0.07
423 0.07
424 0.06
425 0.09
426 0.08
427 0.08
428 0.12
429 0.12
430 0.13
431 0.15
432 0.19
433 0.2
434 0.29
435 0.37
436 0.36
437 0.4
438 0.47
439 0.48
440 0.5
441 0.5
442 0.46
443 0.44
444 0.49
445 0.49
446 0.47
447 0.51
448 0.47
449 0.45
450 0.42
451 0.42
452 0.4
453 0.4
454 0.38
455 0.35
456 0.42
457 0.46
458 0.46
459 0.42
460 0.39
461 0.39
462 0.36
463 0.35
464 0.29
465 0.28
466 0.26
467 0.3
468 0.34
469 0.32
470 0.31
471 0.29
472 0.26
473 0.23
474 0.26
475 0.3
476 0.28
477 0.31
478 0.33
479 0.39
480 0.43
481 0.43
482 0.41
483 0.35
484 0.36
485 0.38
486 0.4
487 0.35
488 0.31
489 0.31
490 0.3
491 0.28
492 0.22
493 0.19
494 0.18
495 0.2
496 0.19
497 0.19
498 0.24
499 0.26
500 0.33
501 0.33
502 0.36
503 0.36
504 0.39
505 0.41
506 0.37
507 0.41
508 0.4
509 0.46
510 0.52
511 0.59
512 0.64
513 0.69
514 0.75
515 0.77
516 0.8
517 0.78
518 0.72
519 0.72
520 0.75
521 0.76
522 0.72
523 0.69
524 0.61
525 0.54
526 0.5
527 0.43
528 0.34
529 0.26
530 0.28
531 0.24
532 0.23
533 0.21
534 0.21
535 0.2
536 0.19
537 0.19
538 0.15
539 0.16
540 0.16
541 0.16
542 0.16
543 0.15
544 0.17
545 0.21
546 0.25
547 0.31
548 0.32
549 0.37
550 0.39
551 0.43
552 0.47
553 0.42
554 0.37
555 0.33
556 0.4
557 0.39
558 0.44
559 0.44
560 0.45
561 0.53
562 0.57
563 0.61
564 0.64
565 0.68
566 0.7
567 0.76
568 0.8
569 0.82
570 0.87
571 0.87
572 0.87
573 0.83
574 0.84
575 0.79
576 0.77
577 0.73
578 0.71