Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3F3Q3Y0

Protein Details
Accession A0A3F3Q3Y0    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-26ATAISKPTSHTPKMKRPPPPFVQTGHydrophilic
421-440SPLHRDPPPSPKRRKRTVAEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
431-435PKRRK
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 10.333, mito 7.5, cyto_mito 5.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
CDD cd22249  UDM1_RNF168_RNF169-like  
Amino Acid Sequences MATAISKPTSHTPKMKRPPPPFVQTGVNGVKSQQSSSSSPPSSAKRLPGSNHPASASSAGGPTSNGVNGAANAGAGSNKAIQNRPKKEAQKPGDQAARLQKPLLRSLSIDNDRRAGNRCPEPYVKTSSYILKKFSKCPPSLILHLHPTHFRFEQQDGSFPYNSEMKVIIEHIRAGTVPHDMMEELLRANVRFYEGTLPHATNSPLHGCLIVRVVDHKSVSAQARKSTAPTSNENNTPFSIHNYNEHVTPSAYVPYPKQSQLNSDKPAAKEAPTGNQPDAKTNGEQSGDSESRAKEATSNSAQSKQPPKPRVFTTVLHPTPRSLQAELTLLATTPDPKAAKQSASNATSRPQQSSSTAPPSPGGSSNQTERSHPAKRQKMLVEPQEFLECEARLTRALAPPLFLDPVNSFDAVQDLLKIMESPLHRDPPPSPKRRKRTVAELAADEALAAEEERFMLIMDERLEPTTSGGAGGPKSAVVDDTGGGAPFEPRFSRFKTLENIRMQHEEKAKREHEVKMKQELAKRQQQEQEREKRRLMEQRQNEEHAKEEARRQHFAAQAQAQLAAQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQNRHVMAQTNGVSQAPQSSPVVRNQTPHNTSSPVVGNTMAAQASVPMSMTSSMQGAGSPPRPPSALQHAHPTVMSHPMAPSRSQQGQSRHGTPQMTQGTPAMSHATPIMRNVTPTQRMSHASPSHTTMAPTPVMNQATMMGTPQMGGGMGLTPQQQQQMLLQQRQQLLAQQGHMVQNQFSPKQVAQMQANAHAQQNIQAHQQQMLQAQQQNFQAQPKFPNPQAYQAQLMRAQLAQMHMAQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQPQQPQGQQSQNQQGQVHQNSPHMNPQQQQMLMAAAQANGGHLPQNMQGVNLAQGVITPQRYQQLFTQRLVRLRQEMAARLMPQYGSPSQFPPHIQRQYTTGLEQNAKAWVHDIVRRERELIQQRANQVAHVQAQVMQQQHQQQQQQQQNMMQNARGSS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.75
2 0.8
3 0.82
4 0.82
5 0.85
6 0.84
7 0.82
8 0.75
9 0.69
10 0.67
11 0.58
12 0.58
13 0.53
14 0.47
15 0.39
16 0.36
17 0.38
18 0.32
19 0.32
20 0.27
21 0.27
22 0.29
23 0.34
24 0.43
25 0.38
26 0.4
27 0.44
28 0.46
29 0.48
30 0.5
31 0.51
32 0.49
33 0.54
34 0.55
35 0.6
36 0.63
37 0.61
38 0.59
39 0.53
40 0.47
41 0.44
42 0.41
43 0.32
44 0.24
45 0.19
46 0.16
47 0.15
48 0.14
49 0.12
50 0.12
51 0.11
52 0.11
53 0.1
54 0.11
55 0.11
56 0.12
57 0.1
58 0.08
59 0.08
60 0.07
61 0.07
62 0.06
63 0.08
64 0.11
65 0.14
66 0.19
67 0.25
68 0.34
69 0.44
70 0.52
71 0.56
72 0.61
73 0.67
74 0.73
75 0.77
76 0.75
77 0.75
78 0.73
79 0.75
80 0.73
81 0.65
82 0.62
83 0.61
84 0.61
85 0.52
86 0.49
87 0.42
88 0.39
89 0.46
90 0.43
91 0.34
92 0.3
93 0.34
94 0.41
95 0.47
96 0.49
97 0.44
98 0.44
99 0.44
100 0.44
101 0.44
102 0.41
103 0.42
104 0.45
105 0.45
106 0.48
107 0.52
108 0.55
109 0.54
110 0.55
111 0.49
112 0.43
113 0.44
114 0.46
115 0.49
116 0.47
117 0.49
118 0.5
119 0.52
120 0.56
121 0.62
122 0.63
123 0.56
124 0.58
125 0.58
126 0.55
127 0.56
128 0.56
129 0.51
130 0.49
131 0.5
132 0.47
133 0.46
134 0.42
135 0.41
136 0.36
137 0.34
138 0.3
139 0.3
140 0.36
141 0.33
142 0.37
143 0.36
144 0.4
145 0.38
146 0.34
147 0.33
148 0.28
149 0.27
150 0.22
151 0.19
152 0.15
153 0.15
154 0.18
155 0.19
156 0.17
157 0.18
158 0.16
159 0.16
160 0.16
161 0.15
162 0.14
163 0.12
164 0.11
165 0.1
166 0.11
167 0.1
168 0.11
169 0.11
170 0.11
171 0.08
172 0.1
173 0.11
174 0.1
175 0.11
176 0.1
177 0.12
178 0.11
179 0.13
180 0.19
181 0.18
182 0.23
183 0.26
184 0.26
185 0.24
186 0.26
187 0.26
188 0.19
189 0.22
190 0.2
191 0.18
192 0.17
193 0.18
194 0.15
195 0.16
196 0.17
197 0.15
198 0.12
199 0.14
200 0.17
201 0.19
202 0.19
203 0.18
204 0.16
205 0.21
206 0.26
207 0.29
208 0.3
209 0.3
210 0.33
211 0.34
212 0.35
213 0.35
214 0.36
215 0.34
216 0.36
217 0.39
218 0.41
219 0.46
220 0.45
221 0.43
222 0.37
223 0.35
224 0.3
225 0.29
226 0.27
227 0.23
228 0.25
229 0.28
230 0.28
231 0.27
232 0.27
233 0.23
234 0.2
235 0.2
236 0.17
237 0.15
238 0.15
239 0.15
240 0.16
241 0.21
242 0.24
243 0.26
244 0.29
245 0.27
246 0.35
247 0.42
248 0.48
249 0.46
250 0.48
251 0.5
252 0.47
253 0.51
254 0.43
255 0.36
256 0.34
257 0.32
258 0.31
259 0.31
260 0.34
261 0.3
262 0.33
263 0.33
264 0.31
265 0.33
266 0.29
267 0.26
268 0.25
269 0.26
270 0.23
271 0.22
272 0.19
273 0.24
274 0.21
275 0.21
276 0.22
277 0.19
278 0.2
279 0.2
280 0.19
281 0.14
282 0.16
283 0.21
284 0.22
285 0.26
286 0.27
287 0.32
288 0.33
289 0.37
290 0.44
291 0.46
292 0.51
293 0.55
294 0.57
295 0.57
296 0.6
297 0.6
298 0.55
299 0.49
300 0.47
301 0.5
302 0.49
303 0.46
304 0.43
305 0.37
306 0.36
307 0.39
308 0.35
309 0.25
310 0.23
311 0.21
312 0.22
313 0.22
314 0.19
315 0.14
316 0.11
317 0.1
318 0.1
319 0.09
320 0.08
321 0.11
322 0.11
323 0.11
324 0.17
325 0.19
326 0.22
327 0.23
328 0.29
329 0.32
330 0.34
331 0.36
332 0.31
333 0.31
334 0.35
335 0.34
336 0.3
337 0.25
338 0.24
339 0.25
340 0.3
341 0.32
342 0.32
343 0.31
344 0.28
345 0.27
346 0.27
347 0.26
348 0.23
349 0.2
350 0.18
351 0.2
352 0.23
353 0.29
354 0.29
355 0.28
356 0.31
357 0.34
358 0.36
359 0.4
360 0.47
361 0.48
362 0.5
363 0.55
364 0.54
365 0.56
366 0.57
367 0.6
368 0.53
369 0.45
370 0.44
371 0.39
372 0.35
373 0.29
374 0.23
375 0.15
376 0.12
377 0.12
378 0.11
379 0.1
380 0.11
381 0.13
382 0.14
383 0.17
384 0.16
385 0.16
386 0.16
387 0.17
388 0.16
389 0.13
390 0.12
391 0.09
392 0.13
393 0.13
394 0.13
395 0.11
396 0.1
397 0.11
398 0.1
399 0.09
400 0.06
401 0.05
402 0.05
403 0.05
404 0.05
405 0.05
406 0.08
407 0.08
408 0.13
409 0.16
410 0.2
411 0.2
412 0.22
413 0.25
414 0.32
415 0.42
416 0.47
417 0.54
418 0.6
419 0.69
420 0.77
421 0.82
422 0.76
423 0.77
424 0.77
425 0.74
426 0.66
427 0.58
428 0.5
429 0.42
430 0.36
431 0.26
432 0.16
433 0.08
434 0.05
435 0.04
436 0.03
437 0.03
438 0.03
439 0.03
440 0.03
441 0.03
442 0.03
443 0.04
444 0.05
445 0.07
446 0.07
447 0.08
448 0.09
449 0.09
450 0.09
451 0.09
452 0.08
453 0.06
454 0.06
455 0.06
456 0.07
457 0.07
458 0.07
459 0.06
460 0.06
461 0.06
462 0.05
463 0.05
464 0.04
465 0.05
466 0.05
467 0.06
468 0.06
469 0.06
470 0.06
471 0.06
472 0.06
473 0.06
474 0.07
475 0.06
476 0.08
477 0.11
478 0.14
479 0.2
480 0.21
481 0.24
482 0.3
483 0.35
484 0.41
485 0.42
486 0.42
487 0.38
488 0.41
489 0.39
490 0.37
491 0.39
492 0.36
493 0.34
494 0.39
495 0.38
496 0.37
497 0.39
498 0.4
499 0.42
500 0.44
501 0.45
502 0.45
503 0.48
504 0.48
505 0.49
506 0.51
507 0.48
508 0.48
509 0.47
510 0.45
511 0.47
512 0.5
513 0.54
514 0.57
515 0.61
516 0.6
517 0.63
518 0.59
519 0.56
520 0.55
521 0.56
522 0.55
523 0.53
524 0.54
525 0.58
526 0.6
527 0.61
528 0.57
529 0.48
530 0.42
531 0.36
532 0.29
533 0.22
534 0.24
535 0.28
536 0.3
537 0.31
538 0.3
539 0.33
540 0.34
541 0.34
542 0.33
543 0.27
544 0.25
545 0.24
546 0.23
547 0.17
548 0.15
549 0.14
550 0.12
551 0.11
552 0.14
553 0.17
554 0.22
555 0.26
556 0.29
557 0.33
558 0.37
559 0.43
560 0.45
561 0.5
562 0.51
563 0.54
564 0.57
565 0.6
566 0.6
567 0.6
568 0.6
569 0.6
570 0.61
571 0.61
572 0.6
573 0.6
574 0.6
575 0.59
576 0.53
577 0.47
578 0.41
579 0.36
580 0.31
581 0.29
582 0.24
583 0.18
584 0.18
585 0.17
586 0.15
587 0.13
588 0.15
589 0.1
590 0.1
591 0.1
592 0.13
593 0.15
594 0.2
595 0.27
596 0.25
597 0.27
598 0.3
599 0.38
600 0.38
601 0.38
602 0.35
603 0.31
604 0.3
605 0.31
606 0.28
607 0.2
608 0.18
609 0.16
610 0.14
611 0.12
612 0.13
613 0.09
614 0.07
615 0.06
616 0.05
617 0.06
618 0.05
619 0.05
620 0.04
621 0.04
622 0.05
623 0.06
624 0.06
625 0.06
626 0.06
627 0.06
628 0.06
629 0.07
630 0.1
631 0.12
632 0.14
633 0.14
634 0.15
635 0.16
636 0.17
637 0.21
638 0.27
639 0.3
640 0.3
641 0.37
642 0.36
643 0.36
644 0.36
645 0.32
646 0.23
647 0.22
648 0.21
649 0.14
650 0.14
651 0.16
652 0.18
653 0.18
654 0.19
655 0.2
656 0.24
657 0.27
658 0.33
659 0.36
660 0.43
661 0.46
662 0.48
663 0.45
664 0.44
665 0.42
666 0.36
667 0.39
668 0.35
669 0.31
670 0.27
671 0.26
672 0.23
673 0.22
674 0.22
675 0.16
676 0.11
677 0.11
678 0.12
679 0.13
680 0.13
681 0.14
682 0.18
683 0.14
684 0.16
685 0.19
686 0.24
687 0.28
688 0.29
689 0.3
690 0.29
691 0.32
692 0.33
693 0.38
694 0.35
695 0.33
696 0.33
697 0.35
698 0.35
699 0.32
700 0.3
701 0.23
702 0.22
703 0.21
704 0.19
705 0.17
706 0.19
707 0.19
708 0.18
709 0.16
710 0.14
711 0.14
712 0.14
713 0.12
714 0.08
715 0.07
716 0.07
717 0.07
718 0.05
719 0.04
720 0.04
721 0.04
722 0.04
723 0.04
724 0.06
725 0.07
726 0.08
727 0.09
728 0.11
729 0.11
730 0.12
731 0.14
732 0.21
733 0.27
734 0.29
735 0.32
736 0.35
737 0.36
738 0.36
739 0.35
740 0.3
741 0.29
742 0.27
743 0.25
744 0.22
745 0.23
746 0.25
747 0.26
748 0.23
749 0.18
750 0.2
751 0.24
752 0.22
753 0.21
754 0.22
755 0.2
756 0.25
757 0.28
758 0.29
759 0.27
760 0.31
761 0.31
762 0.33
763 0.35
764 0.31
765 0.29
766 0.26
767 0.23
768 0.24
769 0.25
770 0.21
771 0.23
772 0.24
773 0.24
774 0.25
775 0.26
776 0.23
777 0.23
778 0.25
779 0.25
780 0.28
781 0.28
782 0.3
783 0.32
784 0.32
785 0.31
786 0.33
787 0.31
788 0.29
789 0.34
790 0.36
791 0.39
792 0.39
793 0.47
794 0.43
795 0.48
796 0.5
797 0.46
798 0.46
799 0.42
800 0.43
801 0.36
802 0.35
803 0.28
804 0.23
805 0.21
806 0.16
807 0.16
808 0.15
809 0.13
810 0.15
811 0.16
812 0.18
813 0.21
814 0.24
815 0.3
816 0.35
817 0.4
818 0.43
819 0.46
820 0.5
821 0.54
822 0.56
823 0.55
824 0.56
825 0.57
826 0.57
827 0.6
828 0.62
829 0.63
830 0.65
831 0.66
832 0.67
833 0.67
834 0.68
835 0.68
836 0.64
837 0.62
838 0.61
839 0.61
840 0.59
841 0.6
842 0.63
843 0.59
844 0.59
845 0.53
846 0.5
847 0.51
848 0.5
849 0.47
850 0.39
851 0.41
852 0.41
853 0.42
854 0.47
855 0.43
856 0.43
857 0.41
858 0.44
859 0.45
860 0.41
861 0.4
862 0.31
863 0.28
864 0.23
865 0.21
866 0.17
867 0.1
868 0.1
869 0.09
870 0.09
871 0.08
872 0.08
873 0.09
874 0.08
875 0.1
876 0.12
877 0.17
878 0.16
879 0.16
880 0.17
881 0.16
882 0.18
883 0.16
884 0.14
885 0.09
886 0.09
887 0.11
888 0.14
889 0.15
890 0.14
891 0.15
892 0.23
893 0.24
894 0.26
895 0.31
896 0.38
897 0.4
898 0.42
899 0.49
900 0.46
901 0.52
902 0.55
903 0.53
904 0.47
905 0.45
906 0.47
907 0.43
908 0.42
909 0.41
910 0.4
911 0.37
912 0.33
913 0.32
914 0.27
915 0.24
916 0.25
917 0.24
918 0.23
919 0.24
920 0.26
921 0.28
922 0.31
923 0.35
924 0.38
925 0.44
926 0.49
927 0.49
928 0.47
929 0.49
930 0.51
931 0.5
932 0.45
933 0.39
934 0.37
935 0.38
936 0.37
937 0.35
938 0.34
939 0.31
940 0.28
941 0.25
942 0.23
943 0.24
944 0.27
945 0.32
946 0.36
947 0.42
948 0.44
949 0.45
950 0.44
951 0.5
952 0.56
953 0.58
954 0.57
955 0.56
956 0.58
957 0.63
958 0.6
959 0.51
960 0.43
961 0.39
962 0.34
963 0.3
964 0.26
965 0.23
966 0.26
967 0.29
968 0.29
969 0.27
970 0.28
971 0.35
972 0.42
973 0.45
974 0.49
975 0.51
976 0.59
977 0.65
978 0.67
979 0.64
980 0.63
981 0.64
982 0.64
983 0.59
984 0.52