Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1CFQ3

Protein Details
Accession A0A0D1CFQ3    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
173-193QESNPRQKKRAKTGTKIIDDDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 14, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003958  CBFA_NFYB_domain  
IPR009072  Histone-fold  
IPR027113  Transc_fact_NFYB/HAP3  
IPR003956  Transcrpt_fac_NFYB/HAP3_CS  
Gene Ontology GO:0016602  C:CCAAT-binding factor complex  
GO:0001228  F:DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG uma:UMAG_10971  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00808  CBFD_NFYB_HMF  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00685  NFYB_HAP3  
Amino Acid Sequences MSTSTSTSTPIGASTLLDAPISGTCTPVSYASPSPNPASHTHTHSHLHHSTTASNHDTSTPSSTTSIDLSNLASHPTYTALFPDPDLPIANISRIMKRSLPENAKIAKDAKECVQACVSELISFITSEASDKCAAEKRKTINGDDILYAMRVLGFDNYEEVLRVYLSRYRMDQESNPRQKKRAKTGTKIIDDDDDDDDEEDDDDAAEPDLTTRPHSLFHSPAFHHDSSNP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.12
3 0.12
4 0.11
5 0.11
6 0.11
7 0.11
8 0.14
9 0.12
10 0.11
11 0.1
12 0.12
13 0.13
14 0.13
15 0.14
16 0.15
17 0.18
18 0.22
19 0.26
20 0.28
21 0.3
22 0.3
23 0.32
24 0.31
25 0.35
26 0.33
27 0.35
28 0.35
29 0.36
30 0.39
31 0.38
32 0.43
33 0.4
34 0.38
35 0.37
36 0.36
37 0.34
38 0.31
39 0.34
40 0.29
41 0.26
42 0.24
43 0.22
44 0.22
45 0.21
46 0.23
47 0.18
48 0.17
49 0.17
50 0.17
51 0.17
52 0.17
53 0.15
54 0.12
55 0.12
56 0.11
57 0.11
58 0.11
59 0.11
60 0.09
61 0.09
62 0.08
63 0.09
64 0.09
65 0.08
66 0.09
67 0.1
68 0.1
69 0.11
70 0.13
71 0.12
72 0.12
73 0.12
74 0.11
75 0.11
76 0.11
77 0.11
78 0.11
79 0.12
80 0.14
81 0.15
82 0.17
83 0.17
84 0.17
85 0.2
86 0.25
87 0.28
88 0.28
89 0.31
90 0.32
91 0.31
92 0.32
93 0.31
94 0.27
95 0.24
96 0.23
97 0.2
98 0.26
99 0.25
100 0.25
101 0.24
102 0.2
103 0.19
104 0.19
105 0.18
106 0.09
107 0.09
108 0.08
109 0.07
110 0.07
111 0.06
112 0.05
113 0.05
114 0.05
115 0.06
116 0.07
117 0.08
118 0.08
119 0.09
120 0.16
121 0.19
122 0.22
123 0.27
124 0.29
125 0.36
126 0.39
127 0.39
128 0.38
129 0.38
130 0.36
131 0.3
132 0.27
133 0.2
134 0.17
135 0.15
136 0.09
137 0.06
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.06
144 0.07
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.06
150 0.06
151 0.07
152 0.11
153 0.13
154 0.14
155 0.16
156 0.18
157 0.2
158 0.24
159 0.28
160 0.35
161 0.44
162 0.54
163 0.61
164 0.61
165 0.66
166 0.7
167 0.74
168 0.74
169 0.74
170 0.73
171 0.73
172 0.8
173 0.83
174 0.81
175 0.73
176 0.64
177 0.56
178 0.48
179 0.42
180 0.34
181 0.25
182 0.19
183 0.18
184 0.16
185 0.13
186 0.12
187 0.1
188 0.07
189 0.07
190 0.07
191 0.07
192 0.07
193 0.07
194 0.06
195 0.07
196 0.1
197 0.11
198 0.13
199 0.16
200 0.16
201 0.19
202 0.23
203 0.27
204 0.29
205 0.34
206 0.38
207 0.37
208 0.43
209 0.47
210 0.44