Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3F3QGW8

Protein Details
Accession A0A3F3QGW8    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
104-123GVAPRAKMNQQRARRFRSAQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
410-443RRRRQAEERRAANEKRRKQEAQAREEGARKRRKS
Subcellular Location(s) cyto 10, mito 9, nucl 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGVPALFRWLSNKYPKIISPVIEEFPQEINGEEVPVDTTRPNPNGDEMDNLYLDMNGIVHPCTHPEGKPPPANEQEMMLEIFKYTDRVVNMVRPRKLLMIAVDGVAPRAKMNQQRARRFRSAQEAREADEKKEEFRKMLEKQNGKKEDEDMQEHVIQKTWDSNVITPGTPFMDILAAALRYWIAYKLNTDPAWEKLKIIISDATVPGEGEHKIMEFVRSQRASPEHDPNTRHVIYGLDADLIMLGLATHEPYFRVLREDVFFQESRARTCRLCGQAGHKAEECKGQAKEKNGQFDEKGKGTSLKPFIWLNVSILREYLAAELYVPQQPFPFDLERALDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLDIRENGIDTLIAIWRDNIPVMGGYLTEDGHVDLKRAQLILQGLAKQEDAIFRRRRQAEERRAANEKRRKQEAQAREEGARKRRKSSPNYEAYDTPEANPTGGRSKGAADAAPPNAVELITPARGELTREARQLTHSMVTNRGAVYKANMANKSAAAILKSKLMKGPEAEEPSDNTGESGSEAPEPSEEKTEEQTSPSVLGKRKADAVAEEAATTPTKKPSAGDSQNDELPPDTVRLWEEGYADRYYEQKFGVDPEDKEFRHKVARAYAEGLAWVLRYYFQGCPSWTWYYPYHYAPFAADFVDIGDMELQFEKGTPFKPFEQLMGVLPASSNHAIPEVFHDLMSDPDSEIIDFYPEDFPVDLNGKKFAWQGVVLLPFIDEKRLLAAMEKKYPLLSDDEKLRNCVGRDVLLISESHPLYHDLVANFYSKKQGAPKYSINQRISEGLAGKVERNDSYIPHSSLVSSLEEYGMPSLDDDRSLTVNYEIPKSKHVHKSMLLRGAKLPPPTLDNADIQAVKNKAHHSGRSHGGAPLRNGHRGGRINYASERPNPFAAHLDPKFMPPGNSGGAPMGMPAGWVPPNAGGGNYNRGPPPPPRGGGGGGYHQRSHYGGGGGGDSYNQPTGNYDYYGRSQQGYYQQGSYGGSNHNNAYRGRSNNYGGSDQRGGYSRGGYSGRDHYSSRNSGGGGGYGRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.48
3 0.52
4 0.52
5 0.47
6 0.44
7 0.44
8 0.43
9 0.39
10 0.37
11 0.32
12 0.29
13 0.28
14 0.21
15 0.16
16 0.16
17 0.15
18 0.15
19 0.12
20 0.11
21 0.11
22 0.11
23 0.13
24 0.12
25 0.16
26 0.23
27 0.26
28 0.28
29 0.28
30 0.32
31 0.35
32 0.36
33 0.36
34 0.32
35 0.32
36 0.3
37 0.28
38 0.23
39 0.19
40 0.17
41 0.12
42 0.09
43 0.07
44 0.08
45 0.08
46 0.09
47 0.1
48 0.12
49 0.17
50 0.2
51 0.2
52 0.28
53 0.36
54 0.44
55 0.5
56 0.5
57 0.54
58 0.57
59 0.6
60 0.52
61 0.46
62 0.39
63 0.34
64 0.32
65 0.24
66 0.18
67 0.14
68 0.14
69 0.12
70 0.12
71 0.11
72 0.14
73 0.14
74 0.18
75 0.2
76 0.28
77 0.37
78 0.44
79 0.46
80 0.45
81 0.46
82 0.45
83 0.44
84 0.39
85 0.32
86 0.29
87 0.27
88 0.25
89 0.24
90 0.21
91 0.2
92 0.18
93 0.15
94 0.1
95 0.13
96 0.19
97 0.26
98 0.36
99 0.45
100 0.54
101 0.65
102 0.74
103 0.79
104 0.8
105 0.77
106 0.73
107 0.75
108 0.74
109 0.68
110 0.69
111 0.62
112 0.57
113 0.61
114 0.56
115 0.47
116 0.46
117 0.42
118 0.38
119 0.44
120 0.43
121 0.36
122 0.39
123 0.46
124 0.44
125 0.53
126 0.56
127 0.58
128 0.65
129 0.73
130 0.75
131 0.69
132 0.65
133 0.58
134 0.57
135 0.53
136 0.5
137 0.42
138 0.4
139 0.41
140 0.41
141 0.38
142 0.32
143 0.26
144 0.23
145 0.24
146 0.21
147 0.22
148 0.22
149 0.23
150 0.25
151 0.27
152 0.26
153 0.22
154 0.23
155 0.19
156 0.17
157 0.15
158 0.11
159 0.09
160 0.09
161 0.09
162 0.09
163 0.08
164 0.08
165 0.08
166 0.07
167 0.07
168 0.08
169 0.09
170 0.09
171 0.1
172 0.13
173 0.18
174 0.25
175 0.25
176 0.27
177 0.28
178 0.31
179 0.36
180 0.33
181 0.29
182 0.26
183 0.32
184 0.29
185 0.29
186 0.26
187 0.21
188 0.24
189 0.24
190 0.21
191 0.16
192 0.15
193 0.13
194 0.13
195 0.12
196 0.09
197 0.09
198 0.08
199 0.09
200 0.1
201 0.11
202 0.13
203 0.16
204 0.24
205 0.25
206 0.25
207 0.29
208 0.32
209 0.38
210 0.4
211 0.47
212 0.45
213 0.5
214 0.52
215 0.5
216 0.55
217 0.48
218 0.42
219 0.33
220 0.27
221 0.23
222 0.23
223 0.19
224 0.11
225 0.1
226 0.1
227 0.09
228 0.08
229 0.06
230 0.03
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.04
235 0.04
236 0.05
237 0.06
238 0.08
239 0.1
240 0.11
241 0.15
242 0.15
243 0.17
244 0.19
245 0.21
246 0.21
247 0.24
248 0.23
249 0.21
250 0.26
251 0.25
252 0.27
253 0.29
254 0.29
255 0.24
256 0.27
257 0.34
258 0.32
259 0.34
260 0.33
261 0.37
262 0.43
263 0.45
264 0.46
265 0.41
266 0.37
267 0.36
268 0.38
269 0.33
270 0.3
271 0.3
272 0.33
273 0.35
274 0.39
275 0.46
276 0.45
277 0.52
278 0.48
279 0.49
280 0.44
281 0.46
282 0.45
283 0.38
284 0.35
285 0.27
286 0.29
287 0.27
288 0.32
289 0.31
290 0.26
291 0.27
292 0.27
293 0.27
294 0.27
295 0.26
296 0.21
297 0.21
298 0.22
299 0.19
300 0.18
301 0.17
302 0.14
303 0.14
304 0.12
305 0.07
306 0.06
307 0.06
308 0.08
309 0.09
310 0.13
311 0.12
312 0.12
313 0.12
314 0.13
315 0.14
316 0.16
317 0.16
318 0.13
319 0.15
320 0.16
321 0.17
322 0.17
323 0.17
324 0.13
325 0.11
326 0.11
327 0.1
328 0.08
329 0.07
330 0.06
331 0.05
332 0.05
333 0.06
334 0.06
335 0.06
336 0.06
337 0.07
338 0.07
339 0.08
340 0.08
341 0.08
342 0.07
343 0.08
344 0.12
345 0.15
346 0.16
347 0.15
348 0.16
349 0.16
350 0.15
351 0.15
352 0.1
353 0.06
354 0.06
355 0.07
356 0.07
357 0.06
358 0.07
359 0.08
360 0.08
361 0.08
362 0.07
363 0.06
364 0.06
365 0.06
366 0.06
367 0.05
368 0.05
369 0.06
370 0.06
371 0.06
372 0.06
373 0.06
374 0.09
375 0.09
376 0.09
377 0.09
378 0.11
379 0.11
380 0.11
381 0.11
382 0.11
383 0.12
384 0.14
385 0.14
386 0.15
387 0.14
388 0.15
389 0.14
390 0.12
391 0.11
392 0.13
393 0.13
394 0.2
395 0.26
396 0.28
397 0.37
398 0.39
399 0.43
400 0.48
401 0.57
402 0.59
403 0.62
404 0.65
405 0.61
406 0.65
407 0.65
408 0.65
409 0.64
410 0.61
411 0.59
412 0.62
413 0.59
414 0.59
415 0.65
416 0.64
417 0.62
418 0.6
419 0.55
420 0.51
421 0.55
422 0.53
423 0.53
424 0.53
425 0.47
426 0.47
427 0.53
428 0.59
429 0.62
430 0.67
431 0.67
432 0.67
433 0.69
434 0.66
435 0.59
436 0.54
437 0.5
438 0.4
439 0.31
440 0.25
441 0.21
442 0.19
443 0.18
444 0.14
445 0.14
446 0.14
447 0.13
448 0.11
449 0.12
450 0.14
451 0.14
452 0.13
453 0.11
454 0.13
455 0.14
456 0.14
457 0.12
458 0.1
459 0.09
460 0.09
461 0.07
462 0.06
463 0.07
464 0.07
465 0.07
466 0.07
467 0.07
468 0.07
469 0.09
470 0.12
471 0.16
472 0.19
473 0.2
474 0.21
475 0.21
476 0.22
477 0.23
478 0.2
479 0.16
480 0.15
481 0.15
482 0.17
483 0.17
484 0.17
485 0.16
486 0.15
487 0.13
488 0.11
489 0.11
490 0.14
491 0.16
492 0.19
493 0.2
494 0.2
495 0.2
496 0.2
497 0.19
498 0.15
499 0.12
500 0.09
501 0.1
502 0.09
503 0.14
504 0.14
505 0.14
506 0.15
507 0.15
508 0.16
509 0.15
510 0.17
511 0.18
512 0.2
513 0.21
514 0.19
515 0.2
516 0.2
517 0.2
518 0.17
519 0.11
520 0.09
521 0.08
522 0.08
523 0.07
524 0.06
525 0.06
526 0.06
527 0.06
528 0.07
529 0.08
530 0.08
531 0.1
532 0.1
533 0.11
534 0.13
535 0.15
536 0.15
537 0.15
538 0.15
539 0.13
540 0.14
541 0.14
542 0.17
543 0.16
544 0.2
545 0.2
546 0.21
547 0.23
548 0.22
549 0.21
550 0.17
551 0.17
552 0.15
553 0.14
554 0.13
555 0.11
556 0.11
557 0.1
558 0.11
559 0.09
560 0.1
561 0.1
562 0.1
563 0.11
564 0.15
565 0.24
566 0.29
567 0.32
568 0.34
569 0.35
570 0.37
571 0.36
572 0.32
573 0.22
574 0.17
575 0.14
576 0.11
577 0.09
578 0.07
579 0.08
580 0.09
581 0.09
582 0.1
583 0.1
584 0.11
585 0.14
586 0.13
587 0.13
588 0.12
589 0.14
590 0.14
591 0.15
592 0.13
593 0.11
594 0.11
595 0.13
596 0.17
597 0.18
598 0.17
599 0.2
600 0.26
601 0.25
602 0.29
603 0.28
604 0.26
605 0.29
606 0.3
607 0.29
608 0.3
609 0.33
610 0.3
611 0.32
612 0.31
613 0.24
614 0.22
615 0.19
616 0.12
617 0.09
618 0.07
619 0.05
620 0.04
621 0.05
622 0.08
623 0.09
624 0.11
625 0.14
626 0.15
627 0.17
628 0.21
629 0.24
630 0.22
631 0.25
632 0.24
633 0.27
634 0.3
635 0.3
636 0.28
637 0.24
638 0.24
639 0.21
640 0.2
641 0.15
642 0.12
643 0.09
644 0.07
645 0.07
646 0.07
647 0.06
648 0.05
649 0.06
650 0.05
651 0.06
652 0.06
653 0.06
654 0.05
655 0.06
656 0.06
657 0.07
658 0.09
659 0.11
660 0.14
661 0.15
662 0.19
663 0.2
664 0.2
665 0.2
666 0.2
667 0.18
668 0.18
669 0.16
670 0.12
671 0.11
672 0.1
673 0.11
674 0.11
675 0.1
676 0.08
677 0.09
678 0.09
679 0.09
680 0.14
681 0.15
682 0.15
683 0.14
684 0.15
685 0.14
686 0.15
687 0.16
688 0.12
689 0.08
690 0.08
691 0.09
692 0.08
693 0.08
694 0.07
695 0.07
696 0.06
697 0.08
698 0.08
699 0.08
700 0.09
701 0.08
702 0.08
703 0.1
704 0.13
705 0.14
706 0.13
707 0.16
708 0.15
709 0.17
710 0.18
711 0.16
712 0.15
713 0.14
714 0.14
715 0.16
716 0.17
717 0.15
718 0.14
719 0.13
720 0.12
721 0.12
722 0.12
723 0.08
724 0.07
725 0.09
726 0.09
727 0.09
728 0.12
729 0.19
730 0.22
731 0.27
732 0.28
733 0.27
734 0.26
735 0.27
736 0.24
737 0.23
738 0.22
739 0.2
740 0.27
741 0.34
742 0.34
743 0.36
744 0.36
745 0.34
746 0.32
747 0.32
748 0.25
749 0.2
750 0.2
751 0.19
752 0.18
753 0.15
754 0.14
755 0.12
756 0.16
757 0.14
758 0.13
759 0.12
760 0.14
761 0.15
762 0.16
763 0.19
764 0.14
765 0.15
766 0.16
767 0.18
768 0.17
769 0.16
770 0.19
771 0.16
772 0.19
773 0.25
774 0.31
775 0.34
776 0.4
777 0.47
778 0.51
779 0.59
780 0.66
781 0.6
782 0.55
783 0.51
784 0.47
785 0.4
786 0.35
787 0.27
788 0.19
789 0.19
790 0.18
791 0.18
792 0.18
793 0.18
794 0.16
795 0.17
796 0.17
797 0.16
798 0.22
799 0.26
800 0.25
801 0.24
802 0.24
803 0.21
804 0.22
805 0.22
806 0.17
807 0.13
808 0.12
809 0.11
810 0.11
811 0.11
812 0.11
813 0.09
814 0.07
815 0.07
816 0.08
817 0.08
818 0.09
819 0.09
820 0.1
821 0.11
822 0.12
823 0.12
824 0.12
825 0.15
826 0.16
827 0.21
828 0.24
829 0.24
830 0.29
831 0.32
832 0.4
833 0.46
834 0.48
835 0.49
836 0.51
837 0.59
838 0.61
839 0.66
840 0.59
841 0.51
842 0.51
843 0.51
844 0.49
845 0.43
846 0.37
847 0.29
848 0.31
849 0.33
850 0.33
851 0.29
852 0.26
853 0.25
854 0.26
855 0.26
856 0.23
857 0.26
858 0.23
859 0.22
860 0.25
861 0.25
862 0.3
863 0.35
864 0.4
865 0.39
866 0.45
867 0.49
868 0.49
869 0.48
870 0.43
871 0.43
872 0.41
873 0.39
874 0.41
875 0.39
876 0.39
877 0.39
878 0.38
879 0.41
880 0.43
881 0.43
882 0.43
883 0.41
884 0.41
885 0.43
886 0.46
887 0.42
888 0.43
889 0.45
890 0.39
891 0.4
892 0.37
893 0.35
894 0.35
895 0.35
896 0.37
897 0.33
898 0.35
899 0.33
900 0.33
901 0.36
902 0.33
903 0.31
904 0.23
905 0.26
906 0.24
907 0.23
908 0.22
909 0.19
910 0.18
911 0.16
912 0.14
913 0.1
914 0.07
915 0.07
916 0.06
917 0.09
918 0.09
919 0.09
920 0.1
921 0.11
922 0.14
923 0.14
924 0.14
925 0.14
926 0.16
927 0.23
928 0.24
929 0.26
930 0.24
931 0.26
932 0.29
933 0.32
934 0.38
935 0.38
936 0.38
937 0.38
938 0.4
939 0.41
940 0.41
941 0.38
942 0.38
943 0.37
944 0.38
945 0.37
946 0.34
947 0.33
948 0.3
949 0.3
950 0.25
951 0.2
952 0.18
953 0.18
954 0.19
955 0.17
956 0.16
957 0.14
958 0.12
959 0.13
960 0.13
961 0.12
962 0.11
963 0.14
964 0.18
965 0.2
966 0.21
967 0.21
968 0.24
969 0.28
970 0.33
971 0.31
972 0.29
973 0.27
974 0.31
975 0.37
976 0.39
977 0.38
978 0.34
979 0.34
980 0.33
981 0.35
982 0.3
983 0.25
984 0.24
985 0.25
986 0.26
987 0.29
988 0.31
989 0.33
990 0.33
991 0.37
992 0.39
993 0.4
994 0.42
995 0.46
996 0.46
997 0.48
998 0.51
999 0.49
1000 0.44
1001 0.45
1002 0.43
1003 0.38
1004 0.37
1005 0.34
1006 0.32
1007 0.28
1008 0.29
1009 0.24
1010 0.25
1011 0.27
1012 0.25
1013 0.27
1014 0.33
1015 0.35
1016 0.35
1017 0.36
1018 0.37
1019 0.44
1020 0.47
1021 0.45
1022 0.4
1023 0.36
1024 0.35
1025 0.34
1026 0.31