FuNGI

B8NPD6

Protein Details

Accession

B8NPD6

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-25	MPKSSVKQKPRQKFKPASRSPFENA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 11, nucl 10.5, cyto_nucl 8, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045161 Utp18 IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0034388 C:Pwp2p-containing subcomplex of 90S preribosome GO:0032040 C:small-subunit processome GO:0000480 P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000447 P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000472 P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000292 P:RNA fragment catabolic process
PROSITE	View protein in PROSITE PS50082 WD_REPEATS_2 PS50294 WD_REPEATS_REGION

Amino Acid Sequences

MPKSSVKQKPRQKFKPASRSPFENARPTQEDSDMETNSNLSDGTDGIPEKDEAEKKLERLLFGDDEGFQGALKSQKERSLIALSKESDDEGSDAGHREDGTEDQELDGIADADLFFLDSGAGPVSTDLAESPETSSEPDEEDLEETPVVWHDSDDELLAVSLASQQRLRKLRVAESEDVISGNEYIRRLRRHYQQLHPTPEWAIPGQQKSPGDSDSEHADIMDTDDEEQTSAQPLAKLLQGAADLTKLDDARPGGKRKLRQEVIDIQRLKDVGGDQPVSSSVDSLSFHPHYPLLLSSGPAATLFLHHIAPSAAAPNPILTSFHIRRTPIHTSAFAPPTGNKIFASGRRRYFHIWDLDTGKVDKVNGSADRKEEQKSMERFKLSPCGRYVGLVGTSRKGGGLINVLDSGTAQWIAQVRVDGQGGVADFSWWGDGEGMTVVSKNGEVSEWDGSLNQVVARWMDAGAVGTTVLALGGRSGRTQLGGDRWVAIGSSSGVVNVYDRREWAAAYAAQSSSADINTPAIPRNPEPVRALDQLTTPISHLVFAPDGQFLVMASRWKRDALRIVHLPSCTVYRNWPTSNTPLGRISSVAVSPNSEQLAVGNEQGRVRLWEIRG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.91
2	0.93
3	0.93
4	0.91
5	0.87
6	0.84
7	0.79
8	0.79
9	0.74
10	0.72
11	0.64
12	0.63
13	0.6
14	0.58
15	0.56
16	0.49
17	0.44
18	0.41
19	0.43
20	0.36
21	0.33
22	0.28
23	0.25
24	0.22
25	0.2
26	0.13
27	0.08
28	0.08
29	0.07
30	0.08
31	0.12
32	0.12
33	0.13
34	0.15
35	0.15
36	0.16
37	0.22
38	0.24
39	0.23
40	0.29
41	0.31
42	0.31
43	0.38
44	0.39
45	0.33
46	0.31
47	0.34
48	0.29
49	0.26
50	0.27
51	0.19
52	0.18
53	0.18
54	0.16
55	0.11
56	0.09
57	0.11
58	0.14
59	0.16
60	0.19
61	0.21
62	0.27
63	0.3
64	0.31
65	0.33
66	0.37
67	0.39
68	0.39
69	0.42
70	0.38
71	0.38
72	0.37
73	0.33
74	0.24
75	0.21
76	0.18
77	0.12
78	0.11
79	0.11
80	0.12
81	0.11
82	0.12
83	0.11
84	0.11
85	0.12
86	0.13
87	0.15
88	0.15
89	0.15
90	0.13
91	0.14
92	0.13
93	0.12
94	0.1
95	0.08
96	0.05
97	0.05
98	0.05
99	0.05
100	0.05
101	0.05
102	0.04
103	0.04
104	0.04
105	0.04
106	0.04
107	0.05
108	0.05
109	0.05
110	0.05
111	0.06
112	0.06
113	0.06
114	0.05
115	0.07
116	0.08
117	0.08
118	0.09
119	0.1
120	0.1
121	0.11
122	0.12
123	0.11
124	0.12
125	0.12
126	0.12
127	0.12
128	0.12
129	0.12
130	0.12
131	0.11
132	0.1
133	0.09
134	0.09
135	0.1
136	0.08
137	0.07
138	0.08
139	0.09
140	0.09
141	0.09
142	0.08
143	0.07
144	0.07
145	0.07
146	0.05
147	0.04
148	0.08
149	0.09
150	0.1
151	0.13
152	0.15
153	0.23
154	0.29
155	0.32
156	0.34
157	0.37
158	0.42
159	0.47
160	0.52
161	0.47
162	0.43
163	0.41
164	0.35
165	0.32
166	0.25
167	0.17
168	0.11
169	0.09
170	0.1
171	0.09
172	0.13
173	0.19
174	0.23
175	0.28
176	0.35
177	0.43
178	0.52
179	0.59
180	0.65
181	0.7
182	0.75
183	0.77
184	0.7
185	0.62
186	0.53
187	0.46
188	0.39
189	0.28
190	0.24
191	0.21
192	0.23
193	0.23
194	0.26
195	0.25
196	0.25
197	0.27
198	0.23
199	0.2
200	0.18
201	0.19
202	0.18
203	0.18
204	0.16
205	0.13
206	0.13
207	0.1
208	0.11
209	0.1
210	0.06
211	0.06
212	0.07
213	0.07
214	0.07
215	0.07
216	0.06
217	0.07
218	0.07
219	0.07
220	0.07
221	0.08
222	0.09
223	0.1
224	0.09
225	0.08
226	0.08
227	0.08
228	0.08
229	0.08
230	0.07
231	0.06
232	0.06
233	0.08
234	0.07
235	0.06
236	0.08
237	0.09
238	0.14
239	0.19
240	0.24
241	0.29
242	0.33
243	0.4
244	0.44
245	0.54
246	0.52
247	0.48
248	0.49
249	0.52
250	0.53
251	0.55
252	0.49
253	0.39
254	0.37
255	0.36
256	0.3
257	0.21
258	0.17
259	0.11
260	0.13
261	0.14
262	0.12
263	0.12
264	0.13
265	0.13
266	0.11
267	0.09
268	0.06
269	0.07
270	0.08
271	0.09
272	0.13
273	0.13
274	0.13
275	0.14
276	0.14
277	0.12
278	0.12
279	0.11
280	0.1
281	0.09
282	0.09
283	0.09
284	0.08
285	0.08
286	0.08
287	0.08
288	0.05
289	0.05
290	0.06
291	0.06
292	0.06
293	0.06
294	0.07
295	0.06
296	0.07
297	0.06
298	0.07
299	0.06
300	0.06
301	0.06
302	0.06
303	0.07
304	0.07
305	0.07
306	0.07
307	0.14
308	0.16
309	0.2
310	0.23
311	0.23
312	0.25
313	0.31
314	0.35
315	0.32
316	0.32
317	0.29
318	0.29
319	0.33
320	0.33
321	0.27
322	0.22
323	0.18
324	0.21
325	0.21
326	0.19
327	0.14
328	0.15
329	0.17
330	0.23
331	0.29
332	0.3
333	0.36
334	0.37
335	0.39
336	0.4
337	0.41
338	0.4
339	0.4
340	0.35
341	0.32
342	0.33
343	0.31
344	0.29
345	0.26
346	0.21
347	0.15
348	0.14
349	0.11
350	0.09
351	0.12
352	0.15
353	0.18
354	0.2
355	0.22
356	0.24
357	0.26
358	0.27
359	0.25
360	0.24
361	0.29
362	0.33
363	0.38
364	0.41
365	0.4
366	0.39
367	0.39
368	0.46
369	0.39
370	0.37
371	0.32
372	0.3
373	0.28
374	0.28
375	0.27
376	0.19
377	0.2
378	0.19
379	0.19
380	0.17
381	0.17
382	0.16
383	0.15
384	0.14
385	0.11
386	0.08
387	0.11
388	0.1
389	0.11
390	0.11
391	0.11
392	0.11
393	0.1
394	0.09
395	0.06
396	0.06
397	0.04
398	0.06
399	0.08
400	0.09
401	0.09
402	0.1
403	0.1
404	0.11
405	0.12
406	0.1
407	0.08
408	0.08
409	0.08
410	0.08
411	0.07
412	0.05
413	0.05
414	0.05
415	0.06
416	0.05
417	0.05
418	0.05
419	0.05
420	0.05
421	0.06
422	0.06
423	0.05
424	0.06
425	0.05
426	0.05
427	0.06
428	0.05
429	0.05
430	0.05
431	0.06
432	0.08
433	0.1
434	0.1
435	0.1
436	0.1
437	0.1
438	0.11
439	0.1
440	0.08
441	0.07
442	0.07
443	0.07
444	0.07
445	0.08
446	0.07
447	0.07
448	0.07
449	0.07
450	0.06
451	0.06
452	0.05
453	0.05
454	0.04
455	0.04
456	0.04
457	0.03
458	0.03
459	0.03
460	0.05
461	0.06
462	0.07
463	0.08
464	0.09
465	0.1
466	0.11
467	0.14
468	0.17
469	0.18
470	0.18
471	0.18
472	0.18
473	0.17
474	0.16
475	0.13
476	0.09
477	0.08
478	0.08
479	0.07
480	0.07
481	0.07
482	0.07
483	0.09
484	0.11
485	0.13
486	0.13
487	0.14
488	0.17
489	0.17
490	0.17
491	0.17
492	0.18
493	0.17
494	0.18
495	0.2
496	0.17
497	0.17
498	0.17
499	0.17
500	0.13
501	0.11
502	0.1
503	0.08
504	0.11
505	0.12
506	0.14
507	0.16
508	0.18
509	0.22
510	0.23
511	0.32
512	0.32
513	0.35
514	0.36
515	0.38
516	0.41
517	0.39
518	0.4
519	0.32
520	0.31
521	0.3
522	0.29
523	0.25
524	0.19
525	0.19
526	0.17
527	0.16
528	0.15
529	0.14
530	0.13
531	0.13
532	0.14
533	0.12
534	0.12
535	0.11
536	0.11
537	0.08
538	0.09
539	0.11
540	0.16
541	0.17
542	0.21
543	0.23
544	0.26
545	0.28
546	0.33
547	0.4
548	0.39
549	0.46
550	0.49
551	0.52
552	0.53
553	0.51
554	0.46
555	0.39
556	0.36
557	0.3
558	0.25
559	0.28
560	0.32
561	0.39
562	0.4
563	0.44
564	0.45
565	0.49
566	0.57
567	0.52
568	0.48
569	0.45
570	0.45
571	0.41
572	0.36
573	0.32
574	0.25
575	0.24
576	0.24
577	0.2
578	0.22
579	0.22
580	0.25
581	0.24
582	0.21
583	0.19
584	0.16
585	0.2
586	0.18
587	0.2
588	0.19
589	0.21
590	0.21
591	0.23
592	0.23
593	0.22
594	0.24

B8NPD6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer