Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3F3QHU5

Protein Details
Accession A0A3F3QHU5    Localization Confidence High Confidence Score 18.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
135-163GGDEERSKRKREGRREKKSRRMRELEDGGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
126-178GRHKRKRTEGGDEERSKRKREGRREKKSRRMRELEDGGASDEEKASRRRKKKE
193-215RRRALDRAMDEALKKPTKRRFRK
446-461RKMRARQIAASKGSRR
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MSEPRSPEPELKPAAEVDEQQQQQEAPPTPGGDAVSDEEPAKEVEAEVEPEAEEQQQEQEEQGEEEAAQDNGGDNDDDDDEDKISDDESILSEVDEAQFEDFDPENVDIEDRPQLAIDEDNLKLIGRHKRKRTEGGDEERSKRKREGRREKKSRRMRELEDGGASDEEKASRRRKKKEAEIADEELLDPATRRRRALDRAMDEALKKPTKRRFRKADGIDLEQMADAEIEDMRKRMTHAAQMDAINRREGKPAMHKLKMLPEVVSLLNRNQYVNSLVDPEINLLEAVKFFLEPLDDGSLPAYNIQRDLMTALGKLPINKEALVASGIGKVIVFYTRSKRPEPGIKRMAERLLAEWTRPILQRSDDYSKRVYQEAAFDPTKLSATRTQSVQATAAEARARELLPPRLANRARADMTHTSYTVVPRPTMVQESKFARPLGASGEDRFRKMRARQIAASKGSRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.34
3 0.31
4 0.26
5 0.31
6 0.3
7 0.28
8 0.29
9 0.25
10 0.25
11 0.31
12 0.3
13 0.24
14 0.26
15 0.26
16 0.25
17 0.27
18 0.24
19 0.18
20 0.17
21 0.17
22 0.16
23 0.16
24 0.16
25 0.14
26 0.14
27 0.14
28 0.13
29 0.1
30 0.09
31 0.1
32 0.12
33 0.14
34 0.13
35 0.14
36 0.13
37 0.13
38 0.14
39 0.12
40 0.11
41 0.09
42 0.12
43 0.12
44 0.13
45 0.13
46 0.14
47 0.14
48 0.14
49 0.14
50 0.11
51 0.1
52 0.11
53 0.11
54 0.09
55 0.08
56 0.07
57 0.08
58 0.08
59 0.09
60 0.07
61 0.06
62 0.08
63 0.09
64 0.09
65 0.09
66 0.1
67 0.09
68 0.09
69 0.1
70 0.08
71 0.08
72 0.08
73 0.07
74 0.07
75 0.07
76 0.08
77 0.08
78 0.08
79 0.08
80 0.08
81 0.08
82 0.08
83 0.07
84 0.07
85 0.07
86 0.07
87 0.1
88 0.1
89 0.09
90 0.11
91 0.11
92 0.12
93 0.12
94 0.12
95 0.09
96 0.11
97 0.14
98 0.12
99 0.12
100 0.11
101 0.11
102 0.12
103 0.12
104 0.12
105 0.13
106 0.12
107 0.13
108 0.13
109 0.12
110 0.13
111 0.18
112 0.26
113 0.33
114 0.41
115 0.5
116 0.59
117 0.66
118 0.75
119 0.75
120 0.75
121 0.74
122 0.74
123 0.75
124 0.72
125 0.71
126 0.71
127 0.68
128 0.61
129 0.59
130 0.59
131 0.59
132 0.64
133 0.7
134 0.72
135 0.81
136 0.88
137 0.92
138 0.93
139 0.94
140 0.93
141 0.92
142 0.88
143 0.82
144 0.8
145 0.74
146 0.66
147 0.56
148 0.46
149 0.37
150 0.3
151 0.24
152 0.15
153 0.1
154 0.09
155 0.1
156 0.16
157 0.24
158 0.34
159 0.42
160 0.51
161 0.59
162 0.68
163 0.76
164 0.8
165 0.8
166 0.79
167 0.76
168 0.71
169 0.62
170 0.52
171 0.42
172 0.31
173 0.22
174 0.14
175 0.08
176 0.1
177 0.17
178 0.18
179 0.19
180 0.23
181 0.29
182 0.35
183 0.43
184 0.47
185 0.43
186 0.45
187 0.46
188 0.44
189 0.38
190 0.36
191 0.33
192 0.28
193 0.26
194 0.29
195 0.36
196 0.46
197 0.55
198 0.62
199 0.65
200 0.7
201 0.79
202 0.76
203 0.77
204 0.7
205 0.64
206 0.56
207 0.46
208 0.38
209 0.27
210 0.22
211 0.13
212 0.09
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.06
221 0.07
222 0.1
223 0.11
224 0.16
225 0.17
226 0.19
227 0.22
228 0.23
229 0.25
230 0.26
231 0.25
232 0.22
233 0.22
234 0.2
235 0.21
236 0.2
237 0.2
238 0.24
239 0.33
240 0.38
241 0.39
242 0.39
243 0.38
244 0.44
245 0.45
246 0.37
247 0.28
248 0.22
249 0.22
250 0.21
251 0.2
252 0.15
253 0.12
254 0.14
255 0.15
256 0.14
257 0.12
258 0.13
259 0.14
260 0.13
261 0.13
262 0.12
263 0.12
264 0.12
265 0.12
266 0.12
267 0.09
268 0.09
269 0.08
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.04
275 0.04
276 0.04
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.07
281 0.09
282 0.09
283 0.1
284 0.1
285 0.1
286 0.1
287 0.12
288 0.12
289 0.09
290 0.1
291 0.1
292 0.1
293 0.09
294 0.1
295 0.09
296 0.08
297 0.08
298 0.08
299 0.11
300 0.12
301 0.13
302 0.13
303 0.15
304 0.16
305 0.16
306 0.16
307 0.13
308 0.13
309 0.12
310 0.11
311 0.09
312 0.09
313 0.08
314 0.08
315 0.07
316 0.06
317 0.06
318 0.08
319 0.08
320 0.11
321 0.17
322 0.24
323 0.29
324 0.31
325 0.35
326 0.4
327 0.49
328 0.53
329 0.58
330 0.59
331 0.58
332 0.59
333 0.6
334 0.56
335 0.48
336 0.42
337 0.33
338 0.33
339 0.3
340 0.26
341 0.24
342 0.23
343 0.24
344 0.24
345 0.24
346 0.19
347 0.21
348 0.25
349 0.31
350 0.38
351 0.38
352 0.4
353 0.42
354 0.43
355 0.43
356 0.4
357 0.35
358 0.28
359 0.31
360 0.32
361 0.34
362 0.31
363 0.29
364 0.28
365 0.27
366 0.27
367 0.21
368 0.2
369 0.2
370 0.26
371 0.3
372 0.3
373 0.33
374 0.33
375 0.34
376 0.33
377 0.26
378 0.23
379 0.2
380 0.21
381 0.19
382 0.17
383 0.17
384 0.17
385 0.17
386 0.18
387 0.23
388 0.28
389 0.31
390 0.36
391 0.37
392 0.44
393 0.46
394 0.49
395 0.49
396 0.49
397 0.45
398 0.42
399 0.46
400 0.42
401 0.46
402 0.43
403 0.37
404 0.32
405 0.32
406 0.35
407 0.34
408 0.31
409 0.25
410 0.23
411 0.26
412 0.28
413 0.34
414 0.34
415 0.32
416 0.36
417 0.41
418 0.45
419 0.47
420 0.43
421 0.36
422 0.33
423 0.31
424 0.29
425 0.3
426 0.27
427 0.26
428 0.36
429 0.38
430 0.4
431 0.41
432 0.39
433 0.41
434 0.45
435 0.52
436 0.52
437 0.57
438 0.61
439 0.69
440 0.75
441 0.73