Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A367Y4B1

Protein Details
Accession A0A367Y4B1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
133-153LYDNPLSKKRHRKPAEIKSEKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
140-150KKRHRKPAEIK
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR009145  U2AF_small  
IPR000571  Znf_CCCH  
Gene Ontology GO:0089701  C:U2AF complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MSYNGAPQEPLYGDSHMGAIPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPENEPAEPEVQLKQEPLPEEPQEQPRVNPRLQGPNGGPPQRKRARTNLYNGGEGLLLCSFYTKVGACRHGEKCVKRHINPTTSYTIKLSNLYDNPLSKKRHRKPAEIKSEKGPEDKNGNVDETVAEPASESTTESTTESPQENTDRSAEDTSISIQDEPEVELTEDEIQANFDQFYRDIFTRISRIGEIKYLVVCENTNDHLNGNVYVQFVRAEDASACNTELNSEWFNEKPVYSSLSPVSDFSEAFCHEYDSGNCERDGICNYMHLRYPSPAVQNEMFRSQEKTYLTKRLLRLRKELPVAGDINQLGKDVAATRNGTNPVDQSTRTLLQQLY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.19
3 0.15
4 0.15
5 0.12
6 0.12
7 0.13
8 0.15
9 0.17
10 0.19
11 0.23
12 0.28
13 0.36
14 0.42
15 0.48
16 0.54
17 0.6
18 0.65
19 0.7
20 0.72
21 0.73
22 0.73
23 0.73
24 0.73
25 0.73
26 0.72
27 0.69
28 0.67
29 0.65
30 0.63
31 0.61
32 0.56
33 0.52
34 0.49
35 0.45
36 0.39
37 0.35
38 0.3
39 0.26
40 0.24
41 0.2
42 0.19
43 0.21
44 0.22
45 0.23
46 0.26
47 0.27
48 0.3
49 0.34
50 0.39
51 0.42
52 0.41
53 0.41
54 0.45
55 0.49
56 0.46
57 0.46
58 0.44
59 0.47
60 0.47
61 0.5
62 0.43
63 0.47
64 0.53
65 0.55
66 0.56
67 0.49
68 0.59
69 0.61
70 0.65
71 0.61
72 0.64
73 0.67
74 0.68
75 0.73
76 0.72
77 0.67
78 0.61
79 0.56
80 0.46
81 0.36
82 0.28
83 0.21
84 0.11
85 0.08
86 0.06
87 0.07
88 0.06
89 0.06
90 0.08
91 0.08
92 0.13
93 0.17
94 0.22
95 0.24
96 0.31
97 0.33
98 0.4
99 0.46
100 0.47
101 0.48
102 0.54
103 0.6
104 0.56
105 0.63
106 0.63
107 0.62
108 0.6
109 0.59
110 0.54
111 0.47
112 0.45
113 0.38
114 0.32
115 0.27
116 0.26
117 0.23
118 0.22
119 0.21
120 0.23
121 0.24
122 0.24
123 0.28
124 0.32
125 0.36
126 0.39
127 0.5
128 0.55
129 0.64
130 0.67
131 0.72
132 0.76
133 0.81
134 0.84
135 0.79
136 0.73
137 0.69
138 0.7
139 0.61
140 0.54
141 0.45
142 0.37
143 0.36
144 0.34
145 0.31
146 0.25
147 0.24
148 0.21
149 0.19
150 0.16
151 0.12
152 0.12
153 0.08
154 0.07
155 0.06
156 0.06
157 0.07
158 0.06
159 0.05
160 0.05
161 0.06
162 0.07
163 0.08
164 0.08
165 0.09
166 0.11
167 0.11
168 0.11
169 0.12
170 0.14
171 0.14
172 0.14
173 0.14
174 0.13
175 0.14
176 0.14
177 0.12
178 0.11
179 0.1
180 0.1
181 0.1
182 0.09
183 0.08
184 0.07
185 0.07
186 0.07
187 0.07
188 0.07
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.07
193 0.07
194 0.07
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.07
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.07
205 0.1
206 0.1
207 0.11
208 0.11
209 0.13
210 0.15
211 0.15
212 0.16
213 0.14
214 0.15
215 0.15
216 0.16
217 0.15
218 0.14
219 0.13
220 0.13
221 0.12
222 0.11
223 0.11
224 0.1
225 0.11
226 0.12
227 0.13
228 0.12
229 0.12
230 0.13
231 0.14
232 0.13
233 0.12
234 0.11
235 0.11
236 0.1
237 0.11
238 0.1
239 0.09
240 0.09
241 0.08
242 0.08
243 0.08
244 0.09
245 0.1
246 0.11
247 0.11
248 0.1
249 0.1
250 0.1
251 0.1
252 0.12
253 0.11
254 0.12
255 0.14
256 0.14
257 0.16
258 0.17
259 0.16
260 0.14
261 0.15
262 0.19
263 0.17
264 0.19
265 0.19
266 0.2
267 0.21
268 0.19
269 0.2
270 0.17
271 0.16
272 0.14
273 0.16
274 0.15
275 0.16
276 0.16
277 0.15
278 0.15
279 0.17
280 0.17
281 0.18
282 0.21
283 0.2
284 0.2
285 0.19
286 0.19
287 0.19
288 0.22
289 0.19
290 0.16
291 0.19
292 0.22
293 0.23
294 0.26
295 0.26
296 0.25
297 0.25
298 0.29
299 0.28
300 0.32
301 0.31
302 0.33
303 0.34
304 0.37
305 0.38
306 0.39
307 0.36
308 0.32
309 0.35
310 0.31
311 0.33
312 0.31
313 0.34
314 0.36
315 0.42
316 0.45
317 0.48
318 0.54
319 0.59
320 0.64
321 0.64
322 0.67
323 0.65
324 0.69
325 0.67
326 0.63
327 0.56
328 0.52
329 0.48
330 0.41
331 0.38
332 0.3
333 0.27
334 0.24
335 0.21
336 0.16
337 0.14
338 0.14
339 0.12
340 0.14
341 0.17
342 0.2
343 0.21
344 0.27
345 0.31
346 0.31
347 0.3
348 0.29
349 0.3
350 0.31
351 0.31
352 0.29
353 0.31
354 0.33
355 0.32