Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B8MWP0

Protein Details
Accession B8MWP0    Localization Confidence High Confidence Score 18.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
20-46GDRGDRGDRRRSRSPHHSSRSSRREYEBasic
129-148GDRRERRRSASPPPRKREATBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
16-37RRERGDRGDRGDRRRSRSPHHS
81-145DRGDRRRRDYDDRSSRRDRERGDLFEERPRRDGRDRDRERDRGDRGDRGDRRERRRSASPPPRKR
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR006529  U2AF_lg  
Gene Ontology GO:0000243  C:commitment complex  
GO:0071004  C:U2-type prespliceosome  
GO:0089701  C:U2AF complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
GO:0000245  P:spliceosomal complex assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12231  RRM2_U2AF65  
cd12232  RRM3_U2AF65  
Amino Acid Sequences MVADSGRSRDYYRDERRERGDRGDRGDRRRSRSPHHSSRSSRREYEVDTYSSSRDYRAREREDRYSSRRDDREWDRDRGGDRGDRRRRDYDDRSSRRDRERGDLFEERPRRDGRDRDRERDRGDRGDRGDRRERRRSASPPPRKREATPDLTEVESVLHRKRRLTQWDIKPPGYENVTAEQAKLSGMFPLPGAPRQQPMDPSRLQAFMSQPGAGTAESASLKPSNSRQAKRLFVSNLPASATGENLLSFFNLQLNGLNVIHSVDPCISAQVSDDRSFALLEFKTPNDATVALAFDGITMDESEAAGNGAANGAPQGLEVRRPKDYIVPSGNEQEYQEGVLLNEVPDSPNKICVSNIPHYIPEEPVTMLLKSFGELKSFVLVKDGSTEESRGIAFCEYADPNATSIAVEGLNGMELGDRHLKVVRASIGITQAAGLDMGVNAMSMFAKTTSQDLETSRVLQLLNMVTPEELMDNDDYDEICDDVREECAKYGQVVELKIPRPSGGSRQSPGVGKIFVKFDSVESTTNALKALAGRKFSDRTVVTTYFSEENFDVNAW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.68
3 0.75
4 0.78
5 0.74
6 0.74
7 0.73
8 0.69
9 0.71
10 0.74
11 0.73
12 0.73
13 0.79
14 0.76
15 0.74
16 0.78
17 0.77
18 0.76
19 0.79
20 0.81
21 0.81
22 0.82
23 0.85
24 0.84
25 0.88
26 0.89
27 0.86
28 0.79
29 0.74
30 0.69
31 0.64
32 0.62
33 0.56
34 0.48
35 0.44
36 0.42
37 0.38
38 0.36
39 0.31
40 0.28
41 0.28
42 0.31
43 0.37
44 0.45
45 0.52
46 0.58
47 0.64
48 0.69
49 0.74
50 0.76
51 0.73
52 0.72
53 0.7
54 0.72
55 0.7
56 0.64
57 0.64
58 0.64
59 0.68
60 0.66
61 0.65
62 0.58
63 0.58
64 0.56
65 0.51
66 0.47
67 0.44
68 0.45
69 0.5
70 0.57
71 0.61
72 0.65
73 0.68
74 0.71
75 0.73
76 0.74
77 0.74
78 0.76
79 0.76
80 0.77
81 0.79
82 0.79
83 0.78
84 0.76
85 0.68
86 0.66
87 0.66
88 0.62
89 0.61
90 0.6
91 0.54
92 0.56
93 0.6
94 0.53
95 0.51
96 0.49
97 0.48
98 0.49
99 0.56
100 0.57
101 0.62
102 0.67
103 0.71
104 0.77
105 0.77
106 0.75
107 0.74
108 0.69
109 0.67
110 0.64
111 0.62
112 0.58
113 0.61
114 0.6
115 0.59
116 0.64
117 0.63
118 0.68
119 0.71
120 0.71
121 0.68
122 0.72
123 0.72
124 0.73
125 0.75
126 0.77
127 0.78
128 0.8
129 0.81
130 0.76
131 0.72
132 0.71
133 0.68
134 0.65
135 0.58
136 0.54
137 0.48
138 0.44
139 0.41
140 0.31
141 0.24
142 0.17
143 0.17
144 0.19
145 0.23
146 0.24
147 0.27
148 0.34
149 0.42
150 0.49
151 0.54
152 0.59
153 0.63
154 0.72
155 0.75
156 0.69
157 0.62
158 0.55
159 0.5
160 0.42
161 0.33
162 0.24
163 0.21
164 0.24
165 0.23
166 0.21
167 0.17
168 0.15
169 0.13
170 0.13
171 0.1
172 0.07
173 0.07
174 0.08
175 0.07
176 0.11
177 0.12
178 0.14
179 0.17
180 0.16
181 0.19
182 0.21
183 0.23
184 0.26
185 0.27
186 0.31
187 0.29
188 0.31
189 0.3
190 0.29
191 0.27
192 0.24
193 0.23
194 0.2
195 0.2
196 0.18
197 0.15
198 0.14
199 0.15
200 0.12
201 0.1
202 0.06
203 0.07
204 0.08
205 0.08
206 0.09
207 0.09
208 0.1
209 0.11
210 0.14
211 0.22
212 0.3
213 0.33
214 0.37
215 0.43
216 0.48
217 0.47
218 0.5
219 0.43
220 0.37
221 0.4
222 0.34
223 0.29
224 0.24
225 0.23
226 0.18
227 0.15
228 0.13
229 0.08
230 0.08
231 0.07
232 0.06
233 0.06
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.08
243 0.08
244 0.08
245 0.07
246 0.07
247 0.08
248 0.07
249 0.07
250 0.05
251 0.06
252 0.06
253 0.07
254 0.06
255 0.05
256 0.06
257 0.09
258 0.12
259 0.12
260 0.12
261 0.11
262 0.12
263 0.12
264 0.11
265 0.11
266 0.08
267 0.09
268 0.1
269 0.1
270 0.13
271 0.13
272 0.13
273 0.1
274 0.1
275 0.09
276 0.09
277 0.09
278 0.06
279 0.07
280 0.06
281 0.05
282 0.05
283 0.04
284 0.04
285 0.03
286 0.03
287 0.03
288 0.04
289 0.03
290 0.03
291 0.04
292 0.03
293 0.03
294 0.03
295 0.03
296 0.03
297 0.03
298 0.03
299 0.03
300 0.03
301 0.03
302 0.05
303 0.05
304 0.11
305 0.15
306 0.17
307 0.19
308 0.2
309 0.21
310 0.26
311 0.28
312 0.29
313 0.29
314 0.29
315 0.29
316 0.33
317 0.33
318 0.27
319 0.25
320 0.19
321 0.15
322 0.13
323 0.12
324 0.07
325 0.07
326 0.07
327 0.07
328 0.05
329 0.06
330 0.05
331 0.06
332 0.06
333 0.1
334 0.1
335 0.15
336 0.16
337 0.16
338 0.16
339 0.2
340 0.26
341 0.26
342 0.3
343 0.26
344 0.27
345 0.28
346 0.29
347 0.26
348 0.21
349 0.17
350 0.13
351 0.13
352 0.14
353 0.12
354 0.11
355 0.11
356 0.09
357 0.08
358 0.11
359 0.1
360 0.11
361 0.11
362 0.12
363 0.14
364 0.15
365 0.14
366 0.14
367 0.14
368 0.12
369 0.15
370 0.15
371 0.13
372 0.14
373 0.15
374 0.12
375 0.13
376 0.13
377 0.1
378 0.11
379 0.09
380 0.08
381 0.07
382 0.1
383 0.1
384 0.1
385 0.12
386 0.12
387 0.12
388 0.12
389 0.12
390 0.08
391 0.08
392 0.08
393 0.06
394 0.06
395 0.05
396 0.05
397 0.05
398 0.05
399 0.05
400 0.04
401 0.04
402 0.08
403 0.12
404 0.12
405 0.13
406 0.16
407 0.17
408 0.17
409 0.21
410 0.2
411 0.17
412 0.18
413 0.19
414 0.19
415 0.18
416 0.17
417 0.13
418 0.11
419 0.1
420 0.09
421 0.06
422 0.04
423 0.04
424 0.04
425 0.04
426 0.03
427 0.03
428 0.04
429 0.04
430 0.04
431 0.05
432 0.05
433 0.06
434 0.07
435 0.09
436 0.11
437 0.12
438 0.15
439 0.16
440 0.2
441 0.2
442 0.22
443 0.21
444 0.21
445 0.19
446 0.17
447 0.18
448 0.16
449 0.15
450 0.13
451 0.13
452 0.11
453 0.11
454 0.12
455 0.09
456 0.07
457 0.08
458 0.09
459 0.09
460 0.1
461 0.1
462 0.1
463 0.1
464 0.11
465 0.09
466 0.08
467 0.07
468 0.07
469 0.08
470 0.11
471 0.12
472 0.13
473 0.14
474 0.16
475 0.17
476 0.17
477 0.18
478 0.2
479 0.21
480 0.21
481 0.25
482 0.3
483 0.32
484 0.34
485 0.33
486 0.29
487 0.29
488 0.31
489 0.35
490 0.37
491 0.41
492 0.41
493 0.44
494 0.47
495 0.47
496 0.46
497 0.41
498 0.35
499 0.3
500 0.31
501 0.3
502 0.27
503 0.26
504 0.23
505 0.21
506 0.24
507 0.25
508 0.23
509 0.22
510 0.25
511 0.24
512 0.24
513 0.23
514 0.16
515 0.15
516 0.18
517 0.24
518 0.25
519 0.28
520 0.3
521 0.35
522 0.38
523 0.38
524 0.42
525 0.36
526 0.36
527 0.4
528 0.4
529 0.37
530 0.35
531 0.38
532 0.32
533 0.3
534 0.29
535 0.22
536 0.22