Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A367YM35

Protein Details
Accession A0A367YM35    Localization Confidence High Confidence Score 23.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
34-53VLVPQTKKQEPRKKVFTTSDHydrophilic
269-292PSIAGKKMSKTKMRKKKGAMTDTSHydrophilic
356-378ESGGRKLAKKDEEKKKLQKAASSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
274-285KKMSKTKMRKKK
360-387RKLAKKDEEKKKLQKAASSVSKGKAARK
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MGRRFDKKNATTFNVVHRAHDDAKFFDDEASEHVLVPQTKKQEPRKKVFTTSDLQAKLANEDIRDNEGLAAQYGITYDDSKYDYMQHLKPMGHSDAVFVGAKQQEPEKKQTIEDLIRDQLPSEQTRKVARDLNQSIPDELQGFNPNMDPRLREVLEALEDEAYIGEEDEQADEDVFNTLLKSGEVEDEDDFYYGSGAEEYDEWDLDNYEDEYNEKYELGEPTEAVEPGTVNQDWQRDFMKFKKETKNKANEWDSDDEFEDEEDDVPDLPSIAGKKMSKTKMRKKKGAMTDTSSFSMSSSALFRTEGLTLLDDRYEQLNKKFESDEQEETHKPFNMKEERHDLEGMLDEFLDNYELESGGRKLAKKDEEKKKLQKAASSVSKGKAARKLNLAFSDMTI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.58
3 0.51
4 0.46
5 0.45
6 0.43
7 0.45
8 0.38
9 0.3
10 0.34
11 0.33
12 0.31
13 0.26
14 0.22
15 0.19
16 0.19
17 0.23
18 0.2
19 0.18
20 0.19
21 0.22
22 0.24
23 0.28
24 0.29
25 0.3
26 0.35
27 0.44
28 0.54
29 0.6
30 0.67
31 0.73
32 0.78
33 0.78
34 0.81
35 0.79
36 0.74
37 0.69
38 0.66
39 0.64
40 0.56
41 0.5
42 0.44
43 0.37
44 0.33
45 0.32
46 0.28
47 0.2
48 0.21
49 0.23
50 0.24
51 0.23
52 0.22
53 0.17
54 0.17
55 0.16
56 0.14
57 0.12
58 0.08
59 0.07
60 0.07
61 0.08
62 0.07
63 0.08
64 0.08
65 0.1
66 0.12
67 0.13
68 0.13
69 0.15
70 0.19
71 0.24
72 0.26
73 0.29
74 0.31
75 0.31
76 0.33
77 0.34
78 0.32
79 0.28
80 0.26
81 0.22
82 0.18
83 0.2
84 0.18
85 0.13
86 0.15
87 0.15
88 0.15
89 0.15
90 0.2
91 0.25
92 0.29
93 0.36
94 0.37
95 0.37
96 0.37
97 0.4
98 0.42
99 0.39
100 0.38
101 0.35
102 0.31
103 0.31
104 0.3
105 0.26
106 0.22
107 0.22
108 0.22
109 0.22
110 0.22
111 0.24
112 0.29
113 0.31
114 0.32
115 0.34
116 0.35
117 0.42
118 0.44
119 0.48
120 0.48
121 0.47
122 0.44
123 0.38
124 0.34
125 0.25
126 0.21
127 0.16
128 0.14
129 0.13
130 0.13
131 0.14
132 0.14
133 0.15
134 0.15
135 0.14
136 0.15
137 0.2
138 0.2
139 0.18
140 0.18
141 0.18
142 0.18
143 0.17
144 0.14
145 0.08
146 0.08
147 0.07
148 0.07
149 0.06
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.04
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.04
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.04
165 0.04
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.06
171 0.06
172 0.08
173 0.08
174 0.09
175 0.09
176 0.09
177 0.08
178 0.07
179 0.06
180 0.05
181 0.05
182 0.03
183 0.03
184 0.03
185 0.04
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.07
199 0.08
200 0.08
201 0.08
202 0.07
203 0.09
204 0.1
205 0.11
206 0.1
207 0.09
208 0.11
209 0.12
210 0.11
211 0.09
212 0.08
213 0.07
214 0.07
215 0.1
216 0.08
217 0.08
218 0.1
219 0.13
220 0.14
221 0.15
222 0.17
223 0.15
224 0.19
225 0.23
226 0.31
227 0.33
228 0.4
229 0.49
230 0.56
231 0.64
232 0.7
233 0.75
234 0.7
235 0.74
236 0.71
237 0.63
238 0.6
239 0.55
240 0.46
241 0.38
242 0.35
243 0.26
244 0.22
245 0.18
246 0.14
247 0.1
248 0.09
249 0.07
250 0.07
251 0.06
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.05
256 0.06
257 0.07
258 0.08
259 0.13
260 0.14
261 0.18
262 0.26
263 0.34
264 0.42
265 0.52
266 0.61
267 0.67
268 0.77
269 0.81
270 0.81
271 0.83
272 0.84
273 0.82
274 0.77
275 0.72
276 0.67
277 0.61
278 0.55
279 0.46
280 0.35
281 0.27
282 0.22
283 0.15
284 0.12
285 0.1
286 0.1
287 0.1
288 0.1
289 0.1
290 0.11
291 0.11
292 0.11
293 0.1
294 0.11
295 0.11
296 0.12
297 0.12
298 0.1
299 0.11
300 0.14
301 0.17
302 0.19
303 0.24
304 0.31
305 0.31
306 0.34
307 0.34
308 0.34
309 0.38
310 0.4
311 0.4
312 0.35
313 0.41
314 0.4
315 0.41
316 0.42
317 0.38
318 0.34
319 0.3
320 0.37
321 0.4
322 0.41
323 0.45
324 0.49
325 0.49
326 0.51
327 0.5
328 0.41
329 0.33
330 0.34
331 0.28
332 0.19
333 0.16
334 0.12
335 0.11
336 0.11
337 0.11
338 0.06
339 0.06
340 0.07
341 0.07
342 0.07
343 0.1
344 0.11
345 0.14
346 0.19
347 0.2
348 0.24
349 0.32
350 0.41
351 0.48
352 0.58
353 0.65
354 0.71
355 0.79
356 0.86
357 0.88
358 0.87
359 0.81
360 0.77
361 0.72
362 0.72
363 0.72
364 0.69
365 0.64
366 0.58
367 0.61
368 0.58
369 0.58
370 0.57
371 0.54
372 0.53
373 0.57
374 0.59
375 0.6
376 0.6
377 0.56