Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B8NH73

Protein Details
Accession B8NH73    Localization Confidence High Confidence Score 16.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-40FPDRSGSTKRSRSRSPSSRRPQKLPRRYDERDYQSDHydrophilic
410-434SQPQWANKYRPRKPRYFNRVQMGYEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
13-30KRSRSRSPSSRRPQKLPR
85-90KKAEIR
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 10.5, mito 6, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019134  Cactin_C  
IPR018816  Cactin_central  
Gene Ontology GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF10312  Cactin_mid  
PF09732  CactinC_cactus  
Amino Acid Sequences MSSRFPDRSGSTKRSRSRSPSSRRPQKLPRRYDERDYQSDGRGRPAQSQSRNMKDQMRLNQLQEDEQVREWVAQEDVFVLKQAKKKAEIRVKEGRAKPIDWLTVTLRFIDPTRNPLDDEIADSDLDIVDPDGVFEGLSQSQLLDLEKDIDTFLSLEANSQNRDFWKTMRIICRDRQKITAPEGRALNSVAADINRLLSPKTYEQLQTLEIQVKKKLDSNEPIDTDYWEELLRSLTVWKARAKLKKVFQAVIDERVRGLRQQQRDEADSVRAKLAPLAPVSQPPTEGKAQAGSDEEFRDLDPDPLLQIRPEDKVLEIVDESNFLDQVARERQKVLKMGFVPLRQRQAEKSSLVPVNQTPNLPAATGSSRFSAIPNEDFSQATKALYERELARGVSENEEIFTGEESVSTGSQPQWANKYRPRKPRYFNRVQMGYEWNKYNQTHYDHDNPPPKVVQGYKFNIFYPDLIDKTKAPTYRIEREHGRKRGQSFAAAGEEDTCLIRFMAGPPYEDIAFRIVDKEWDYSAKRERGFKSTFDKVDSPIV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.73
2 0.78
3 0.78
4 0.8
5 0.82
6 0.82
7 0.84
8 0.87
9 0.89
10 0.88
11 0.89
12 0.89
13 0.9
14 0.9
15 0.89
16 0.88
17 0.87
18 0.86
19 0.85
20 0.84
21 0.81
22 0.77
23 0.75
24 0.68
25 0.65
26 0.65
27 0.57
28 0.54
29 0.52
30 0.47
31 0.47
32 0.53
33 0.55
34 0.55
35 0.64
36 0.66
37 0.68
38 0.72
39 0.68
40 0.66
41 0.64
42 0.65
43 0.64
44 0.65
45 0.61
46 0.58
47 0.59
48 0.53
49 0.47
50 0.43
51 0.38
52 0.31
53 0.27
54 0.27
55 0.22
56 0.21
57 0.2
58 0.18
59 0.15
60 0.12
61 0.12
62 0.12
63 0.12
64 0.11
65 0.12
66 0.14
67 0.18
68 0.23
69 0.29
70 0.32
71 0.38
72 0.44
73 0.53
74 0.6
75 0.62
76 0.64
77 0.68
78 0.71
79 0.73
80 0.72
81 0.71
82 0.64
83 0.59
84 0.56
85 0.51
86 0.47
87 0.39
88 0.38
89 0.32
90 0.33
91 0.32
92 0.29
93 0.24
94 0.22
95 0.22
96 0.26
97 0.24
98 0.25
99 0.29
100 0.28
101 0.29
102 0.29
103 0.32
104 0.24
105 0.25
106 0.21
107 0.18
108 0.17
109 0.15
110 0.15
111 0.11
112 0.1
113 0.07
114 0.05
115 0.04
116 0.04
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.05
121 0.05
122 0.07
123 0.06
124 0.07
125 0.07
126 0.06
127 0.06
128 0.07
129 0.08
130 0.07
131 0.07
132 0.09
133 0.09
134 0.1
135 0.1
136 0.09
137 0.09
138 0.08
139 0.08
140 0.07
141 0.06
142 0.08
143 0.11
144 0.13
145 0.14
146 0.14
147 0.16
148 0.16
149 0.21
150 0.21
151 0.19
152 0.23
153 0.26
154 0.32
155 0.38
156 0.43
157 0.44
158 0.5
159 0.59
160 0.59
161 0.57
162 0.56
163 0.54
164 0.52
165 0.54
166 0.54
167 0.46
168 0.44
169 0.42
170 0.39
171 0.33
172 0.29
173 0.22
174 0.15
175 0.14
176 0.1
177 0.08
178 0.08
179 0.07
180 0.08
181 0.08
182 0.08
183 0.08
184 0.08
185 0.12
186 0.13
187 0.14
188 0.15
189 0.16
190 0.17
191 0.19
192 0.19
193 0.17
194 0.16
195 0.21
196 0.21
197 0.22
198 0.23
199 0.23
200 0.23
201 0.26
202 0.28
203 0.28
204 0.32
205 0.36
206 0.38
207 0.38
208 0.38
209 0.34
210 0.31
211 0.27
212 0.2
213 0.16
214 0.1
215 0.09
216 0.08
217 0.08
218 0.07
219 0.06
220 0.06
221 0.08
222 0.1
223 0.13
224 0.15
225 0.2
226 0.26
227 0.33
228 0.38
229 0.43
230 0.47
231 0.52
232 0.53
233 0.49
234 0.44
235 0.46
236 0.42
237 0.41
238 0.36
239 0.29
240 0.25
241 0.25
242 0.24
243 0.17
244 0.22
245 0.21
246 0.26
247 0.3
248 0.34
249 0.35
250 0.37
251 0.38
252 0.32
253 0.31
254 0.26
255 0.23
256 0.2
257 0.18
258 0.16
259 0.16
260 0.16
261 0.12
262 0.12
263 0.13
264 0.12
265 0.15
266 0.18
267 0.16
268 0.16
269 0.14
270 0.17
271 0.16
272 0.16
273 0.14
274 0.14
275 0.13
276 0.13
277 0.14
278 0.11
279 0.11
280 0.12
281 0.12
282 0.1
283 0.09
284 0.1
285 0.09
286 0.09
287 0.08
288 0.08
289 0.08
290 0.09
291 0.09
292 0.08
293 0.09
294 0.1
295 0.11
296 0.12
297 0.12
298 0.11
299 0.13
300 0.13
301 0.12
302 0.11
303 0.1
304 0.09
305 0.09
306 0.09
307 0.07
308 0.07
309 0.06
310 0.06
311 0.05
312 0.1
313 0.17
314 0.19
315 0.2
316 0.22
317 0.25
318 0.29
319 0.34
320 0.3
321 0.28
322 0.27
323 0.31
324 0.34
325 0.35
326 0.37
327 0.35
328 0.41
329 0.37
330 0.37
331 0.35
332 0.36
333 0.36
334 0.32
335 0.3
336 0.3
337 0.31
338 0.29
339 0.28
340 0.25
341 0.27
342 0.27
343 0.25
344 0.19
345 0.19
346 0.19
347 0.17
348 0.15
349 0.12
350 0.13
351 0.15
352 0.15
353 0.14
354 0.15
355 0.15
356 0.15
357 0.16
358 0.16
359 0.17
360 0.19
361 0.2
362 0.2
363 0.2
364 0.21
365 0.2
366 0.18
367 0.16
368 0.13
369 0.12
370 0.13
371 0.13
372 0.15
373 0.13
374 0.16
375 0.18
376 0.17
377 0.17
378 0.18
379 0.19
380 0.19
381 0.19
382 0.16
383 0.14
384 0.15
385 0.14
386 0.11
387 0.1
388 0.08
389 0.07
390 0.07
391 0.07
392 0.08
393 0.07
394 0.07
395 0.08
396 0.08
397 0.13
398 0.15
399 0.18
400 0.25
401 0.31
402 0.39
403 0.46
404 0.56
405 0.6
406 0.69
407 0.73
408 0.75
409 0.79
410 0.83
411 0.85
412 0.85
413 0.85
414 0.83
415 0.81
416 0.72
417 0.66
418 0.63
419 0.58
420 0.52
421 0.46
422 0.39
423 0.39
424 0.38
425 0.38
426 0.37
427 0.37
428 0.37
429 0.39
430 0.46
431 0.45
432 0.53
433 0.57
434 0.52
435 0.5
436 0.47
437 0.42
438 0.39
439 0.4
440 0.38
441 0.38
442 0.42
443 0.44
444 0.44
445 0.44
446 0.42
447 0.38
448 0.32
449 0.28
450 0.27
451 0.24
452 0.25
453 0.26
454 0.24
455 0.28
456 0.33
457 0.31
458 0.28
459 0.35
460 0.41
461 0.49
462 0.52
463 0.53
464 0.58
465 0.65
466 0.74
467 0.74
468 0.74
469 0.71
470 0.7
471 0.73
472 0.66
473 0.6
474 0.52
475 0.47
476 0.42
477 0.36
478 0.32
479 0.24
480 0.22
481 0.18
482 0.16
483 0.12
484 0.09
485 0.09
486 0.09
487 0.09
488 0.11
489 0.19
490 0.19
491 0.21
492 0.22
493 0.25
494 0.25
495 0.25
496 0.24
497 0.17
498 0.17
499 0.15
500 0.15
501 0.13
502 0.16
503 0.19
504 0.2
505 0.2
506 0.26
507 0.28
508 0.34
509 0.42
510 0.46
511 0.48
512 0.54
513 0.56
514 0.58
515 0.59
516 0.59
517 0.57
518 0.59
519 0.58
520 0.56
521 0.54