FuNGI

A0A367YIB9

Protein Details

Accession

A0A367YIB9

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
56-85	DDEDEVETRKRKKHKKRRRERLVEDRDDAL	Basic
99-122	LQGSGKSKVKKLKRKQVEEDDDDI	Hydrophilic
382-410	YSKEIREKAPPNKKKTKPNSRKHIKVTLY	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
64-76	RKRKKHKKRRRER
105-112	SKVKKLKR
387-404	REKAPPNKKKTKPNSRKH

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 14, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR041692 HHH_9 IPR012340 NA-bd_OB-fold IPR012337 RNaseH-like_sf IPR010994 RuvA_2-like IPR036860 SH2_dom_sf IPR028083 Spt6_acidic_N_dom IPR042066 Spt6_death-like IPR032706 Spt6_HHH IPR028088 Spt6_HTH_DNA-bd_dom IPR035420 Spt6_SH2 IPR035018 Spt6_SH2_C IPR035019 Spt6_SH2_N IPR023323 Tex-like_dom_sf IPR023319 Tex-like_HTH_dom_sf IPR017072 TF_Spt6 IPR037027 YqgF/RNaseH-like_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003746 F:translation elongation factor activity GO:0006139 P:nucleobase-containing compound metabolic process GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF14635 HHH_7 PF17674 HHH_9 PF14641 HTH_44 PF14633 SH2_2 PF14632 SPT6_acidic
CDD	cd09928 SH2_Cterm_SPT6_like cd09918 SH2_Nterm_SPT6_like

Amino Acid Sequences

MALEDEIERTNHEDNSQSEGEGDDLRQPVVDSSEEDDDEDDEEEIQKVREGFIVDDDEDEVETRKRKKHKKRRRERLVEDRDDALDDDDLQLLLENTGLQGSGKSKVKKLKRKQVEEDDDDIIEADEQQYQSREQSGMRNMFSDDEDEEGLDDEEGASQFDDFIEEDEFSDEGEEAQPRIDTSKLSSVDRQSLQELFEVFGDGNEYDWALEAQEMEDTGNLDKEEPATLDEVFEHSELKERMLTDEDNLIRIIDVPERYQKYRSTLTYIDLEGEELEMEKNWITDMMIRERATPLPEDAEDAYRECYASEYDPNNRIRLFNEDELWRIVKLDIEYHSLYEKRLNTEKLIESLELDDDLVKDIKSLDTMVAVQDVHDYLQFTYSKEIREKAPPNKKKTKPNSRKHIKVTLYERIKSNILYDAVKAYGITAKQFGENVQDQSSKGFEVPYRIHATDDSWEAPDELIDRLVQDDDAMFKTRTLPEKRFAITEKGRATIVNNSPFADFKYAKDLEPLDIVTKPDVLLRMLEAEKLGLGGYDRWFDSIFNCFKSDGFFRRFRKMEQRRETVLRMAFKKLCSMVALNTKEDLRRECERLISNMVRRAFGYEFGSTANGDFDTAVVGVYIRDTGKVVQTLKSNENPIRNHVIVVSGFNANTKKLYDIITSIVQENRLSTSAMKDEYDDSAIVPVIWGQDETARLFQNSERAAKEFPDKYLQDPLLEYVTLGEDILSLTFSPHQKLISVDLVKDAIESAFVDMVNLVGVKINDATRIGLLRNINTHLYGVLVNRSALIESELTTANIFINCASSLNVVVDKTITSSDYAIEVLDSTRIHPEDYELAKKWHLVSFAQRLEEKSDKKKLRTLQAIRQELINRYEETRQPFKILSNDDAFFILTGEHPYELRGTVVPITIIKVSKNYHVPQARIKGMRVVTPSLIEGRIDELQIPQVVQGVVLELYSDTFTAVLSLRKEDIKRAMASTIHHEYGKWDFQAQDADVARERAKENAKLAKTRNVQHPLYRNFNFRQAEEYLAPQKVGDCVIRPSSKGPQFLTITWKVAPNLFQHLLIEERSRGRFREYIVDGMTYEDLDQLIFQHIQVIAKNVSSMVHNGKFREGTMSVVNEWLESYTKANPKNSAYVFCYDHKLPGNFLLLFKINSNTKVVTWHVKTSVNGYILKTFTYPDMIGLCNGFKQTVKNMLQPKSYSYNGY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.23
2	0.31
3	0.3
4	0.26
5	0.24
6	0.23
7	0.23
8	0.2
9	0.19
10	0.17
11	0.17
12	0.17
13	0.17
14	0.17
15	0.16
16	0.17
17	0.17
18	0.14
19	0.17
20	0.21
21	0.21
22	0.21
23	0.2
24	0.18
25	0.18
26	0.17
27	0.13
28	0.1
29	0.11
30	0.11
31	0.12
32	0.12
33	0.13
34	0.13
35	0.13
36	0.15
37	0.16
38	0.16
39	0.19
40	0.22
41	0.2
42	0.2
43	0.2
44	0.18
45	0.16
46	0.16
47	0.15
48	0.15
49	0.22
50	0.28
51	0.35
52	0.45
53	0.56
54	0.67
55	0.76
56	0.83
57	0.87
58	0.92
59	0.96
60	0.97
61	0.97
62	0.96
63	0.96
64	0.95
65	0.92
66	0.84
67	0.75
68	0.64
69	0.55
70	0.45
71	0.35
72	0.25
73	0.17
74	0.14
75	0.12
76	0.11
77	0.09
78	0.09
79	0.08
80	0.07
81	0.07
82	0.06
83	0.05
84	0.06
85	0.06
86	0.05
87	0.07
88	0.09
89	0.17
90	0.24
91	0.28
92	0.34
93	0.44
94	0.54
95	0.63
96	0.72
97	0.76
98	0.8
99	0.86
100	0.9
101	0.92
102	0.91
103	0.86
104	0.8
105	0.71
106	0.6
107	0.5
108	0.4
109	0.29
110	0.19
111	0.13
112	0.09
113	0.09
114	0.1
115	0.12
116	0.13
117	0.14
118	0.16
119	0.18
120	0.19
121	0.18
122	0.25
123	0.33
124	0.37
125	0.36
126	0.36
127	0.34
128	0.34
129	0.32
130	0.27
131	0.19
132	0.16
133	0.15
134	0.14
135	0.13
136	0.12
137	0.11
138	0.09
139	0.08
140	0.06
141	0.07
142	0.07
143	0.07
144	0.07
145	0.06
146	0.06
147	0.06
148	0.07
149	0.06
150	0.07
151	0.08
152	0.09
153	0.09
154	0.11
155	0.11
156	0.09
157	0.1
158	0.08
159	0.08
160	0.1
161	0.1
162	0.09
163	0.1
164	0.11
165	0.1
166	0.12
167	0.12
168	0.11
169	0.15
170	0.22
171	0.24
172	0.27
173	0.32
174	0.34
175	0.41
176	0.42
177	0.4
178	0.34
179	0.33
180	0.31
181	0.28
182	0.25
183	0.18
184	0.16
185	0.15
186	0.12
187	0.1
188	0.11
189	0.09
190	0.08
191	0.08
192	0.08
193	0.07
194	0.07
195	0.07
196	0.06
197	0.06
198	0.06
199	0.06
200	0.06
201	0.06
202	0.06
203	0.06
204	0.07
205	0.07
206	0.09
207	0.09
208	0.09
209	0.09
210	0.1
211	0.11
212	0.1
213	0.11
214	0.11
215	0.11
216	0.1
217	0.1
218	0.11
219	0.11
220	0.11
221	0.1
222	0.09
223	0.16
224	0.16
225	0.17
226	0.18
227	0.17
228	0.19
229	0.22
230	0.22
231	0.17
232	0.24
233	0.23
234	0.21
235	0.21
236	0.19
237	0.15
238	0.16
239	0.16
240	0.13
241	0.14
242	0.15
243	0.24
244	0.28
245	0.31
246	0.33
247	0.35
248	0.37
249	0.42
250	0.42
251	0.4
252	0.37
253	0.38
254	0.37
255	0.34
256	0.3
257	0.23
258	0.21
259	0.14
260	0.13
261	0.1
262	0.07
263	0.07
264	0.05
265	0.06
266	0.06
267	0.06
268	0.06
269	0.06
270	0.06
271	0.1
272	0.14
273	0.19
274	0.24
275	0.25
276	0.26
277	0.28
278	0.29
279	0.27
280	0.24
281	0.2
282	0.17
283	0.17
284	0.18
285	0.17
286	0.18
287	0.17
288	0.16
289	0.17
290	0.14
291	0.14
292	0.12
293	0.11
294	0.11
295	0.12
296	0.17
297	0.2
298	0.25
299	0.32
300	0.34
301	0.35
302	0.34
303	0.33
304	0.29
305	0.31
306	0.32
307	0.28
308	0.3
309	0.28
310	0.29
311	0.3
312	0.3
313	0.23
314	0.18
315	0.15
316	0.14
317	0.13
318	0.15
319	0.15
320	0.18
321	0.19
322	0.18
323	0.21
324	0.2
325	0.2
326	0.22
327	0.23
328	0.24
329	0.29
330	0.3
331	0.3
332	0.34
333	0.35
334	0.32
335	0.31
336	0.26
337	0.2
338	0.19
339	0.17
340	0.12
341	0.11
342	0.08
343	0.07
344	0.08
345	0.08
346	0.07
347	0.07
348	0.08
349	0.08
350	0.08
351	0.08
352	0.07
353	0.07
354	0.08
355	0.08
356	0.08
357	0.08
358	0.07
359	0.07
360	0.07
361	0.07
362	0.07
363	0.08
364	0.07
365	0.11
366	0.12
367	0.11
368	0.16
369	0.18
370	0.21
371	0.23
372	0.25
373	0.24
374	0.33
375	0.4
376	0.46
377	0.55
378	0.6
379	0.67
380	0.75
381	0.8
382	0.82
383	0.84
384	0.86
385	0.85
386	0.87
387	0.89
388	0.89
389	0.9
390	0.86
391	0.85
392	0.77
393	0.74
394	0.7
395	0.68
396	0.63
397	0.57
398	0.52
399	0.45
400	0.42
401	0.35
402	0.29
403	0.24
404	0.2
405	0.18
406	0.17
407	0.15
408	0.14
409	0.14
410	0.12
411	0.09
412	0.1
413	0.09
414	0.1
415	0.1
416	0.1
417	0.11
418	0.12
419	0.11
420	0.14
421	0.16
422	0.17
423	0.18
424	0.18
425	0.18
426	0.19
427	0.19
428	0.14
429	0.12
430	0.12
431	0.1
432	0.14
433	0.16
434	0.2
435	0.24
436	0.24
437	0.24
438	0.23
439	0.23
440	0.2
441	0.21
442	0.17
443	0.13
444	0.13
445	0.12
446	0.12
447	0.11
448	0.09
449	0.07
450	0.07
451	0.06
452	0.06
453	0.06
454	0.07
455	0.06
456	0.05
457	0.05
458	0.06
459	0.08
460	0.1
461	0.1
462	0.1
463	0.13
464	0.17
465	0.25
466	0.29
467	0.31
468	0.33
469	0.38
470	0.38
471	0.38
472	0.37
473	0.37
474	0.35
475	0.38
476	0.35
477	0.31
478	0.3
479	0.28
480	0.27
481	0.27
482	0.29
483	0.27
484	0.26
485	0.26
486	0.26
487	0.26
488	0.25
489	0.23
490	0.18
491	0.14
492	0.21
493	0.21
494	0.21
495	0.23
496	0.23
497	0.18
498	0.19
499	0.18
500	0.12
501	0.12
502	0.12
503	0.1
504	0.1
505	0.09
506	0.09
507	0.09
508	0.08
509	0.07
510	0.07
511	0.1
512	0.1
513	0.1
514	0.09
515	0.08
516	0.07
517	0.07
518	0.07
519	0.03
520	0.04
521	0.05
522	0.06
523	0.07
524	0.07
525	0.08
526	0.08
527	0.09
528	0.09
529	0.14
530	0.15
531	0.15
532	0.16
533	0.15
534	0.15
535	0.18
536	0.2
537	0.2
538	0.24
539	0.31
540	0.33
541	0.41
542	0.42
543	0.44
544	0.51
545	0.55
546	0.61
547	0.61
548	0.64
549	0.6
550	0.63
551	0.61
552	0.54
553	0.48
554	0.42
555	0.36
556	0.35
557	0.32
558	0.29
559	0.29
560	0.24
561	0.21
562	0.17
563	0.16
564	0.15
565	0.21
566	0.22
567	0.2
568	0.21
569	0.21
570	0.21
571	0.22
572	0.2
573	0.17
574	0.2
575	0.22
576	0.22
577	0.25
578	0.25
579	0.26
580	0.29
581	0.28
582	0.27
583	0.3
584	0.3
585	0.26
586	0.24
587	0.25
588	0.2
589	0.18
590	0.18
591	0.12
592	0.12
593	0.12
594	0.12
595	0.09
596	0.09
597	0.08
598	0.05
599	0.05
600	0.05
601	0.04
602	0.04
603	0.04
604	0.04
605	0.03
606	0.03
607	0.03
608	0.03
609	0.04
610	0.04
611	0.04
612	0.05
613	0.06
614	0.07
615	0.1
616	0.11
617	0.13
618	0.16
619	0.19
620	0.22
621	0.24
622	0.27
623	0.28
624	0.33
625	0.31
626	0.32
627	0.34
628	0.31
629	0.29
630	0.24
631	0.23
632	0.17
633	0.16
634	0.14
635	0.09
636	0.09
637	0.1
638	0.11
639	0.09
640	0.1
641	0.1
642	0.09
643	0.1
644	0.11
645	0.1
646	0.11
647	0.13
648	0.14
649	0.14
650	0.15
651	0.14
652	0.13
653	0.12
654	0.12
655	0.11
656	0.1
657	0.1
658	0.09
659	0.1
660	0.11
661	0.12
662	0.12
663	0.11
664	0.12
665	0.12
666	0.13
667	0.11
668	0.09
669	0.08
670	0.08
671	0.07
672	0.06
673	0.05
674	0.04
675	0.04
676	0.04
677	0.04
678	0.06
679	0.07
680	0.08
681	0.1
682	0.1
683	0.1
684	0.11
685	0.12
686	0.16
687	0.17
688	0.19
689	0.18
690	0.19
691	0.2
692	0.2
693	0.26
694	0.22
695	0.22
696	0.26
697	0.25
698	0.26
699	0.31
700	0.3
701	0.24
702	0.23
703	0.22
704	0.16
705	0.15
706	0.13
707	0.07
708	0.07
709	0.07
710	0.06
711	0.05
712	0.04
713	0.04
714	0.04
715	0.04
716	0.03
717	0.04
718	0.07
719	0.08
720	0.1
721	0.11
722	0.11
723	0.12
724	0.13
725	0.16
726	0.19
727	0.19
728	0.18
729	0.18
730	0.18
731	0.17
732	0.16
733	0.13
734	0.06
735	0.05
736	0.05
737	0.05
738	0.05
739	0.05
740	0.05
741	0.05
742	0.05
743	0.05
744	0.04
745	0.04
746	0.04
747	0.04
748	0.05
749	0.06
750	0.07
751	0.07
752	0.08
753	0.08
754	0.08
755	0.09
756	0.09
757	0.12
758	0.12
759	0.13
760	0.15
761	0.16
762	0.16
763	0.15
764	0.15
765	0.11
766	0.11
767	0.11
768	0.1
769	0.1
770	0.09
771	0.09
772	0.09
773	0.09
774	0.08
775	0.07
776	0.08
777	0.06
778	0.07
779	0.09
780	0.09
781	0.09
782	0.09
783	0.09
784	0.08
785	0.08
786	0.07
787	0.06
788	0.06
789	0.06
790	0.07
791	0.07
792	0.07
793	0.07
794	0.08
795	0.09
796	0.08
797	0.08
798	0.07
799	0.07
800	0.07
801	0.07
802	0.07
803	0.07
804	0.07
805	0.08
806	0.08
807	0.08
808	0.07
809	0.06
810	0.06
811	0.06
812	0.07
813	0.07
814	0.07
815	0.11
816	0.11
817	0.12
818	0.11
819	0.13
820	0.18
821	0.21
822	0.25
823	0.23
824	0.25
825	0.25
826	0.27
827	0.26
828	0.22
829	0.21
830	0.18
831	0.23
832	0.3
833	0.32
834	0.33
835	0.32
836	0.31
837	0.36
838	0.41
839	0.4
840	0.39
841	0.46
842	0.5
843	0.52
844	0.57
845	0.58
846	0.61
847	0.66
848	0.65
849	0.64
850	0.68
851	0.69
852	0.63
853	0.6
854	0.53
855	0.46
856	0.42
857	0.36
858	0.27
859	0.25
860	0.29
861	0.29
862	0.33
863	0.35
864	0.33
865	0.33
866	0.33
867	0.33
868	0.35
869	0.35
870	0.32
871	0.31
872	0.3
873	0.28
874	0.28
875	0.25
876	0.18
877	0.15
878	0.1
879	0.07
880	0.08
881	0.08
882	0.08
883	0.08
884	0.09
885	0.1
886	0.09
887	0.1
888	0.09
889	0.09
890	0.1
891	0.1
892	0.1
893	0.09
894	0.11
895	0.12
896	0.13
897	0.12
898	0.16
899	0.17
900	0.22
901	0.28
902	0.28
903	0.35
904	0.39
905	0.42
906	0.45
907	0.5
908	0.52
909	0.48
910	0.47
911	0.44
912	0.41
913	0.42
914	0.37
915	0.33
916	0.27
917	0.25
918	0.25
919	0.21
920	0.2
921	0.16
922	0.13
923	0.14
924	0.14
925	0.13
926	0.13
927	0.11
928	0.13
929	0.13
930	0.13
931	0.1
932	0.11
933	0.1
934	0.09
935	0.09
936	0.07
937	0.07
938	0.06
939	0.07
940	0.04
941	0.05
942	0.06
943	0.06
944	0.05
945	0.05
946	0.05
947	0.06
948	0.07
949	0.1
950	0.11
951	0.13
952	0.15
953	0.2
954	0.21
955	0.25
956	0.31
957	0.33
958	0.34
959	0.33
960	0.34
961	0.31
962	0.32
963	0.34
964	0.33
965	0.29
966	0.28
967	0.26
968	0.26
969	0.29
970	0.32
971	0.25
972	0.22
973	0.2
974	0.22
975	0.26
976	0.24
977	0.24
978	0.21
979	0.23
980	0.23
981	0.25
982	0.24
983	0.23
984	0.23
985	0.24
986	0.29
987	0.31
988	0.36
989	0.42
990	0.46
991	0.5
992	0.53
993	0.56
994	0.57
995	0.6
996	0.63
997	0.61
998	0.6
999	0.61
1000	0.67
1001	0.64
1002	0.66
1003	0.63
1004	0.6
1005	0.55
1006	0.6
1007	0.55
1008	0.46
1009	0.44
1010	0.37
1011	0.38
1012	0.33
1013	0.35
1014	0.32
1015	0.3
1016	0.29
1017	0.25
1018	0.24
1019	0.2
1020	0.21
1021	0.18
1022	0.14
1023	0.18
1024	0.25
1025	0.27
1026	0.27
1027	0.3
1028	0.38
1029	0.41
1030	0.44
1031	0.42
1032	0.42
1033	0.43
1034	0.44
1035	0.48
1036	0.42
1037	0.39
1038	0.35
1039	0.36
1040	0.3
1041	0.29
1042	0.31
1043	0.26
1044	0.3
1045	0.29
1046	0.28
1047	0.25
1048	0.26
1049	0.25
1050	0.24
1051	0.24
1052	0.19
1053	0.23
1054	0.28
1055	0.3
1056	0.3
1057	0.33
1058	0.34
1059	0.35
1060	0.4
1061	0.39
1062	0.39
1063	0.38
1064	0.37
1065	0.31
1066	0.31
1067	0.28
1068	0.18
1069	0.15
1070	0.11
1071	0.09
1072	0.08
1073	0.08
1074	0.07
1075	0.1
1076	0.1
1077	0.1
1078	0.13
1079	0.14
1080	0.16
1081	0.17
1082	0.2
1083	0.18
1084	0.18
1085	0.18
1086	0.15
1087	0.15
1088	0.14
1089	0.18
1090	0.22
1091	0.27
1092	0.3
1093	0.31
1094	0.35
1095	0.35
1096	0.34
1097	0.36
1098	0.29
1099	0.26
1100	0.27
1101	0.29
1102	0.24
1103	0.26
1104	0.25
1105	0.19
1106	0.19
1107	0.17
1108	0.14
1109	0.12
1110	0.14
1111	0.2
1112	0.27
1113	0.32
1114	0.36
1115	0.41
1116	0.43
1117	0.51
1118	0.51
1119	0.5
1120	0.47
1121	0.46
1122	0.46
1123	0.43
1124	0.45
1125	0.37
1126	0.4
1127	0.41
1128	0.39
1129	0.36
1130	0.37
1131	0.39
1132	0.34
1133	0.34
1134	0.33
1135	0.28
1136	0.28
1137	0.27
1138	0.28
1139	0.26
1140	0.27
1141	0.3
1142	0.27
1143	0.25
1144	0.28
1145	0.31
1146	0.35
1147	0.36
1148	0.39
1149	0.4
1150	0.42
1151	0.42
1152	0.43
1153	0.45
1154	0.39
1155	0.38
1156	0.34
1157	0.36
1158	0.32
1159	0.32
1160	0.28
1161	0.23
1162	0.21
1163	0.23
1164	0.2
1165	0.18
1166	0.19
1167	0.19
1168	0.2
1169	0.2
1170	0.2
1171	0.17
1172	0.18
1173	0.17
1174	0.16
1175	0.19
1176	0.24
1177	0.32
1178	0.35
1179	0.41
1180	0.49
1181	0.53
1182	0.58
1183	0.56
1184	0.57
1185	0.53

A0A367YIB9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer