Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2V5HCM4

Protein Details
Accession A0A2V5HCM4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
190-214LLPCWRRISRLHKGFRRPRDDDPKYBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019474  Ub_conjug_fac_E4_core  
IPR045132  UBE4  
IPR003613  Ubox_domain  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0000151  C:ubiquitin ligase complex  
GO:0034450  F:ubiquitin-ubiquitin ligase activity  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
GO:0030433  P:ubiquitin-dependent ERAD pathway  
Pfam View protein in Pfam  
PF04564  U-box  
PF10408  Ufd2P_core  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51698  U_BOX  
CDD cd16657  RING-Ubox_UBE4A  
Amino Acid Sequences MSDSQSEADKIRSKRLAKLGNPTPSSPVDGAASSQPASPSQSSPASRFPERPQSQPRSNLSSAAPSRASSPQPQTVQSEWKRIKIQPPTAASAVPDRSQTVTPVSGTPPPPRADESIEAFADRTLSAVFKLTLNEARQKDIHGQRLTYLPGLRGELEEQGREVRIELSVLDQALLEAASDAPQQKPLDYLLPCWRRISRLHKGFRRPRDDDPKYSLICEARRMCMSYCIFAITMPEMFGLESSEKSALKPYLLLDPEDDKGVDFEFIGEAVGRFNEDESIKPAFIAAVEEMSQELAGLTINDDYKPYLTALRNLVHNAAIAAAITESSIFNESRDPAQFEKKTLLGPWFSLSPLQSSVTMTYFSSPKTRDQSYILNAQRSIRMMQHMISSDLLDVINHMIRASKDARDRVLDWFAASLNINHKRRAMQVDPTTVSSDGFMFNITTCLDQLCEPFMDASFTKIDRVDANYLHRKPRVDMKDETKVNADQHASDAFYAKSAEGTSNFITEIFFLTVAAHHYGSESLTSKLEQLEKDLRHMESTINKFELERHRWLNNPVQLRVFEQALKKYKDKLDLGLALKYSLQGVLFDDQWQARSMLFMRYVVVWVLRVVSGTDFPKESLKLPLPEQQPEVFQCLPEYFIDDIVSNFKFIMWAMPQIITATQGDELVMLCITFLESSSYIKNPYLKAGLVSILFRGTWPRPGGGRGVLVDLLNSMPFANQHLLHALMKFYIEAEHTGTHTQFFDKFNIRYEIFQIIQCIWPNTHYRNKLYNQSKQNLDFFVRFVNLLLNDVTYVLDESFGAFITIHKTQTELRNAAAMEPTVRQEKEEQLAAAQRNAKSYMQLTNETVSMLKLFTDALADSFTMPEIVQRLADMLDYNLDAMVGPKSATLRVDNLQEYGFNPRALLSEIVDVYLNLTGKESFIVAVARDGRSYKPANFEKAAEILRKWSLKSPEELKRWEQFQHKVKAAKEEDEQAEEDLGEVPDDFLDPLMYTLMEDPVILPGSRVSIDRSTIRSHLLSDPHDPFNRAPLKMEDVTPDTELKAKIEAFKAERMAARRQAKVSDPMDTTTG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.62
3 0.66
4 0.63
5 0.71
6 0.71
7 0.72
8 0.72
9 0.65
10 0.6
11 0.52
12 0.51
13 0.41
14 0.34
15 0.26
16 0.23
17 0.23
18 0.21
19 0.22
20 0.18
21 0.19
22 0.18
23 0.18
24 0.22
25 0.23
26 0.22
27 0.25
28 0.31
29 0.33
30 0.36
31 0.43
32 0.44
33 0.47
34 0.5
35 0.52
36 0.56
37 0.56
38 0.62
39 0.64
40 0.67
41 0.71
42 0.74
43 0.73
44 0.7
45 0.68
46 0.62
47 0.54
48 0.54
49 0.48
50 0.45
51 0.4
52 0.31
53 0.34
54 0.36
55 0.38
56 0.36
57 0.4
58 0.43
59 0.45
60 0.48
61 0.5
62 0.48
63 0.55
64 0.52
65 0.56
66 0.51
67 0.55
68 0.58
69 0.58
70 0.62
71 0.62
72 0.66
73 0.64
74 0.65
75 0.64
76 0.59
77 0.54
78 0.47
79 0.43
80 0.38
81 0.31
82 0.28
83 0.24
84 0.25
85 0.26
86 0.26
87 0.23
88 0.22
89 0.22
90 0.23
91 0.24
92 0.27
93 0.3
94 0.34
95 0.36
96 0.36
97 0.37
98 0.39
99 0.39
100 0.39
101 0.39
102 0.39
103 0.38
104 0.36
105 0.33
106 0.3
107 0.26
108 0.22
109 0.17
110 0.12
111 0.08
112 0.08
113 0.08
114 0.1
115 0.11
116 0.11
117 0.13
118 0.16
119 0.22
120 0.25
121 0.33
122 0.32
123 0.36
124 0.35
125 0.37
126 0.43
127 0.44
128 0.5
129 0.45
130 0.44
131 0.42
132 0.44
133 0.44
134 0.38
135 0.32
136 0.25
137 0.23
138 0.24
139 0.23
140 0.21
141 0.2
142 0.22
143 0.22
144 0.2
145 0.19
146 0.19
147 0.19
148 0.18
149 0.17
150 0.13
151 0.11
152 0.11
153 0.1
154 0.1
155 0.11
156 0.11
157 0.1
158 0.09
159 0.09
160 0.09
161 0.08
162 0.06
163 0.04
164 0.04
165 0.05
166 0.08
167 0.09
168 0.1
169 0.15
170 0.16
171 0.16
172 0.17
173 0.18
174 0.23
175 0.22
176 0.27
177 0.32
178 0.37
179 0.38
180 0.41
181 0.41
182 0.38
183 0.45
184 0.49
185 0.5
186 0.55
187 0.64
188 0.68
189 0.77
190 0.83
191 0.86
192 0.86
193 0.8
194 0.8
195 0.81
196 0.79
197 0.75
198 0.73
199 0.7
200 0.61
201 0.57
202 0.51
203 0.44
204 0.39
205 0.41
206 0.36
207 0.33
208 0.34
209 0.35
210 0.32
211 0.35
212 0.35
213 0.28
214 0.26
215 0.24
216 0.21
217 0.19
218 0.2
219 0.13
220 0.12
221 0.1
222 0.1
223 0.08
224 0.08
225 0.08
226 0.09
227 0.08
228 0.08
229 0.1
230 0.12
231 0.12
232 0.12
233 0.17
234 0.16
235 0.16
236 0.17
237 0.16
238 0.21
239 0.22
240 0.23
241 0.2
242 0.22
243 0.22
244 0.22
245 0.2
246 0.13
247 0.12
248 0.12
249 0.1
250 0.07
251 0.07
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.05
261 0.06
262 0.09
263 0.09
264 0.1
265 0.14
266 0.16
267 0.16
268 0.15
269 0.15
270 0.12
271 0.11
272 0.12
273 0.09
274 0.07
275 0.07
276 0.08
277 0.08
278 0.08
279 0.07
280 0.05
281 0.05
282 0.04
283 0.03
284 0.03
285 0.04
286 0.06
287 0.07
288 0.07
289 0.08
290 0.08
291 0.09
292 0.1
293 0.1
294 0.14
295 0.15
296 0.19
297 0.23
298 0.25
299 0.26
300 0.26
301 0.26
302 0.21
303 0.19
304 0.15
305 0.11
306 0.08
307 0.06
308 0.05
309 0.04
310 0.04
311 0.03
312 0.04
313 0.04
314 0.05
315 0.07
316 0.07
317 0.07
318 0.09
319 0.11
320 0.13
321 0.15
322 0.18
323 0.19
324 0.28
325 0.29
326 0.28
327 0.3
328 0.28
329 0.28
330 0.27
331 0.27
332 0.19
333 0.19
334 0.19
335 0.16
336 0.16
337 0.16
338 0.14
339 0.13
340 0.13
341 0.13
342 0.12
343 0.12
344 0.13
345 0.13
346 0.13
347 0.11
348 0.12
349 0.12
350 0.12
351 0.17
352 0.17
353 0.22
354 0.26
355 0.28
356 0.29
357 0.31
358 0.36
359 0.34
360 0.42
361 0.39
362 0.36
363 0.35
364 0.34
365 0.32
366 0.28
367 0.26
368 0.18
369 0.18
370 0.17
371 0.17
372 0.18
373 0.17
374 0.17
375 0.16
376 0.14
377 0.11
378 0.11
379 0.1
380 0.07
381 0.06
382 0.06
383 0.07
384 0.06
385 0.06
386 0.07
387 0.08
388 0.12
389 0.14
390 0.17
391 0.21
392 0.24
393 0.26
394 0.27
395 0.29
396 0.28
397 0.29
398 0.24
399 0.19
400 0.17
401 0.16
402 0.14
403 0.13
404 0.1
405 0.15
406 0.24
407 0.26
408 0.27
409 0.28
410 0.29
411 0.33
412 0.38
413 0.33
414 0.33
415 0.36
416 0.39
417 0.39
418 0.38
419 0.36
420 0.29
421 0.26
422 0.18
423 0.14
424 0.1
425 0.08
426 0.07
427 0.06
428 0.06
429 0.07
430 0.07
431 0.06
432 0.06
433 0.06
434 0.06
435 0.07
436 0.07
437 0.08
438 0.07
439 0.07
440 0.07
441 0.07
442 0.09
443 0.08
444 0.09
445 0.1
446 0.1
447 0.11
448 0.11
449 0.12
450 0.11
451 0.14
452 0.15
453 0.15
454 0.21
455 0.29
456 0.31
457 0.35
458 0.36
459 0.34
460 0.33
461 0.41
462 0.4
463 0.37
464 0.4
465 0.41
466 0.48
467 0.48
468 0.47
469 0.4
470 0.36
471 0.32
472 0.29
473 0.24
474 0.15
475 0.15
476 0.15
477 0.12
478 0.1
479 0.11
480 0.08
481 0.08
482 0.08
483 0.07
484 0.06
485 0.07
486 0.07
487 0.07
488 0.1
489 0.1
490 0.1
491 0.1
492 0.09
493 0.09
494 0.08
495 0.09
496 0.06
497 0.05
498 0.05
499 0.05
500 0.06
501 0.07
502 0.08
503 0.07
504 0.06
505 0.07
506 0.07
507 0.07
508 0.08
509 0.08
510 0.08
511 0.08
512 0.08
513 0.09
514 0.1
515 0.13
516 0.11
517 0.14
518 0.2
519 0.2
520 0.22
521 0.24
522 0.22
523 0.2
524 0.21
525 0.19
526 0.19
527 0.22
528 0.21
529 0.2
530 0.2
531 0.19
532 0.24
533 0.3
534 0.28
535 0.29
536 0.31
537 0.32
538 0.34
539 0.38
540 0.4
541 0.36
542 0.35
543 0.32
544 0.3
545 0.29
546 0.28
547 0.26
548 0.2
549 0.18
550 0.17
551 0.22
552 0.27
553 0.3
554 0.3
555 0.33
556 0.35
557 0.39
558 0.38
559 0.33
560 0.31
561 0.33
562 0.33
563 0.29
564 0.26
565 0.2
566 0.19
567 0.17
568 0.13
569 0.07
570 0.06
571 0.05
572 0.06
573 0.07
574 0.07
575 0.08
576 0.09
577 0.09
578 0.1
579 0.11
580 0.1
581 0.08
582 0.09
583 0.1
584 0.1
585 0.11
586 0.1
587 0.1
588 0.1
589 0.1
590 0.09
591 0.08
592 0.06
593 0.06
594 0.06
595 0.05
596 0.05
597 0.05
598 0.06
599 0.08
600 0.09
601 0.1
602 0.09
603 0.1
604 0.12
605 0.13
606 0.14
607 0.16
608 0.19
609 0.2
610 0.22
611 0.28
612 0.28
613 0.3
614 0.31
615 0.26
616 0.25
617 0.24
618 0.27
619 0.2
620 0.17
621 0.16
622 0.14
623 0.14
624 0.12
625 0.14
626 0.1
627 0.1
628 0.1
629 0.1
630 0.1
631 0.12
632 0.12
633 0.09
634 0.09
635 0.08
636 0.08
637 0.07
638 0.1
639 0.08
640 0.09
641 0.1
642 0.1
643 0.1
644 0.11
645 0.11
646 0.09
647 0.08
648 0.07
649 0.07
650 0.06
651 0.06
652 0.06
653 0.06
654 0.05
655 0.05
656 0.04
657 0.03
658 0.03
659 0.04
660 0.03
661 0.03
662 0.05
663 0.06
664 0.07
665 0.09
666 0.1
667 0.12
668 0.13
669 0.17
670 0.15
671 0.18
672 0.18
673 0.17
674 0.16
675 0.16
676 0.16
677 0.13
678 0.13
679 0.1
680 0.09
681 0.09
682 0.08
683 0.11
684 0.11
685 0.16
686 0.17
687 0.18
688 0.19
689 0.2
690 0.22
691 0.2
692 0.2
693 0.15
694 0.16
695 0.15
696 0.13
697 0.12
698 0.1
699 0.08
700 0.07
701 0.06
702 0.05
703 0.04
704 0.05
705 0.07
706 0.09
707 0.09
708 0.1
709 0.11
710 0.13
711 0.14
712 0.14
713 0.12
714 0.1
715 0.09
716 0.09
717 0.08
718 0.07
719 0.07
720 0.07
721 0.09
722 0.1
723 0.11
724 0.12
725 0.12
726 0.13
727 0.12
728 0.13
729 0.14
730 0.15
731 0.19
732 0.23
733 0.24
734 0.27
735 0.31
736 0.31
737 0.28
738 0.29
739 0.29
740 0.24
741 0.24
742 0.21
743 0.18
744 0.2
745 0.2
746 0.19
747 0.15
748 0.17
749 0.21
750 0.25
751 0.33
752 0.35
753 0.39
754 0.45
755 0.49
756 0.56
757 0.59
758 0.62
759 0.62
760 0.63
761 0.63
762 0.59
763 0.58
764 0.51
765 0.46
766 0.38
767 0.3
768 0.26
769 0.21
770 0.18
771 0.15
772 0.15
773 0.12
774 0.13
775 0.12
776 0.1
777 0.1
778 0.1
779 0.09
780 0.06
781 0.07
782 0.05
783 0.06
784 0.05
785 0.06
786 0.06
787 0.06
788 0.06
789 0.05
790 0.06
791 0.1
792 0.12
793 0.12
794 0.12
795 0.14
796 0.18
797 0.25
798 0.31
799 0.28
800 0.27
801 0.29
802 0.3
803 0.29
804 0.26
805 0.19
806 0.14
807 0.13
808 0.16
809 0.17
810 0.17
811 0.18
812 0.2
813 0.24
814 0.25
815 0.26
816 0.24
817 0.21
818 0.27
819 0.27
820 0.28
821 0.29
822 0.26
823 0.27
824 0.3
825 0.28
826 0.24
827 0.26
828 0.28
829 0.26
830 0.28
831 0.28
832 0.26
833 0.26
834 0.24
835 0.22
836 0.15
837 0.12
838 0.09
839 0.08
840 0.07
841 0.06
842 0.06
843 0.07
844 0.07
845 0.07
846 0.08
847 0.08
848 0.08
849 0.08
850 0.08
851 0.07
852 0.07
853 0.08
854 0.09
855 0.09
856 0.09
857 0.08
858 0.09
859 0.09
860 0.09
861 0.08
862 0.07
863 0.08
864 0.08
865 0.08
866 0.07
867 0.06
868 0.06
869 0.06
870 0.07
871 0.06
872 0.06
873 0.07
874 0.08
875 0.1
876 0.12
877 0.13
878 0.16
879 0.19
880 0.24
881 0.23
882 0.24
883 0.22
884 0.21
885 0.2
886 0.24
887 0.24
888 0.19
889 0.18
890 0.17
891 0.18
892 0.2
893 0.2
894 0.14
895 0.15
896 0.15
897 0.16
898 0.15
899 0.13
900 0.12
901 0.14
902 0.12
903 0.09
904 0.1
905 0.09
906 0.1
907 0.1
908 0.1
909 0.07
910 0.08
911 0.09
912 0.08
913 0.13
914 0.16
915 0.16
916 0.17
917 0.19
918 0.19
919 0.25
920 0.29
921 0.28
922 0.34
923 0.39
924 0.44
925 0.45
926 0.45
927 0.42
928 0.42
929 0.43
930 0.37
931 0.32
932 0.29
933 0.33
934 0.34
935 0.33
936 0.35
937 0.39
938 0.39
939 0.45
940 0.49
941 0.53
942 0.58
943 0.61
944 0.6
945 0.59
946 0.59
947 0.59
948 0.58
949 0.58
950 0.61
951 0.64
952 0.65
953 0.64
954 0.63
955 0.67
956 0.63
957 0.58
958 0.52
959 0.51
960 0.47
961 0.44
962 0.42
963 0.33
964 0.3
965 0.24
966 0.21
967 0.15
968 0.13
969 0.1
970 0.09
971 0.08
972 0.07
973 0.08
974 0.08
975 0.06
976 0.07
977 0.06
978 0.07
979 0.07
980 0.07
981 0.07
982 0.08
983 0.09
984 0.08
985 0.08
986 0.08
987 0.1
988 0.12
989 0.11
990 0.1
991 0.1
992 0.12
993 0.14
994 0.14
995 0.16
996 0.17
997 0.22
998 0.26
999 0.29
1000 0.31
1001 0.32
1002 0.36
1003 0.32
1004 0.32
1005 0.34
1006 0.35
1007 0.36
1008 0.39
1009 0.42
1010 0.45
1011 0.47
1012 0.46
1013 0.41
1014 0.45
1015 0.48
1016 0.41
1017 0.4
1018 0.37
1019 0.42
1020 0.41
1021 0.42
1022 0.38
1023 0.34
1024 0.36
1025 0.34
1026 0.31
1027 0.25
1028 0.27
1029 0.27
1030 0.23
1031 0.23
1032 0.23
1033 0.26
1034 0.29
1035 0.35
1036 0.34
1037 0.39
1038 0.4
1039 0.4
1040 0.42
1041 0.41
1042 0.46
1043 0.48
1044 0.51
1045 0.52
1046 0.52
1047 0.53
1048 0.53
1049 0.58
1050 0.53
1051 0.5
1052 0.45