Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2V5HDN6

Protein Details
Accession A0A2V5HDN6    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
310-345GSEFPRLSRKEKKALKREKKERKREERMRRKLGDGEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
315-340RLSRKEKKALKREKKERKREERMRRK
Subcellular Location(s) plas 17, E.R. 4, vacu 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007568  RTA1  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF04479  RTA1  
Amino Acid Sequences MSTTTSIATATSALTSATSTETCSHPQPGKNGYLPPEACDAILMYVPSFAAAVLFCVFFGFTTICHLVQAVIYKKRYAWVVTMGALWELLAFIFRALLTRKQNSDIYSTLYTIFFLLAPIWINAYLYMTLGRLIHFFLPTRRLANLTSTHYARLFVWLDIVAFLVQLAGAFMTTGEDQPQSTIMRGLHIYMGGIGMQEFFVLIFTGLAIHLHRKMLLMERDGLLDMGRVHRAAGPCRPTWKKLLAVMYLALALITVRIVFRLAQYARGTDVNNPVLTHEWYEYVFDAVPMFVALVGLNVVHPGQVLRGEGSEFPRLSRKEKKALKREKKERKREERMRRKLGDGESFEELGVLEGGHAGMRN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.08
3 0.08
4 0.1
5 0.1
6 0.12
7 0.14
8 0.17
9 0.2
10 0.23
11 0.29
12 0.33
13 0.37
14 0.42
15 0.45
16 0.49
17 0.5
18 0.51
19 0.49
20 0.52
21 0.48
22 0.43
23 0.42
24 0.36
25 0.31
26 0.27
27 0.22
28 0.14
29 0.15
30 0.13
31 0.08
32 0.08
33 0.08
34 0.08
35 0.07
36 0.06
37 0.05
38 0.05
39 0.06
40 0.07
41 0.07
42 0.07
43 0.07
44 0.07
45 0.06
46 0.08
47 0.07
48 0.06
49 0.12
50 0.14
51 0.14
52 0.14
53 0.15
54 0.13
55 0.14
56 0.21
57 0.22
58 0.26
59 0.28
60 0.29
61 0.29
62 0.32
63 0.33
64 0.29
65 0.25
66 0.24
67 0.24
68 0.24
69 0.24
70 0.21
71 0.19
72 0.16
73 0.13
74 0.07
75 0.05
76 0.04
77 0.04
78 0.03
79 0.03
80 0.04
81 0.04
82 0.06
83 0.09
84 0.16
85 0.22
86 0.27
87 0.29
88 0.33
89 0.36
90 0.35
91 0.37
92 0.31
93 0.3
94 0.26
95 0.25
96 0.22
97 0.2
98 0.18
99 0.14
100 0.13
101 0.08
102 0.07
103 0.06
104 0.06
105 0.07
106 0.06
107 0.07
108 0.06
109 0.07
110 0.06
111 0.07
112 0.07
113 0.06
114 0.06
115 0.06
116 0.07
117 0.07
118 0.07
119 0.07
120 0.08
121 0.09
122 0.09
123 0.1
124 0.12
125 0.15
126 0.16
127 0.18
128 0.17
129 0.18
130 0.18
131 0.21
132 0.23
133 0.24
134 0.26
135 0.25
136 0.26
137 0.24
138 0.24
139 0.2
140 0.2
141 0.16
142 0.13
143 0.13
144 0.11
145 0.11
146 0.1
147 0.1
148 0.06
149 0.04
150 0.04
151 0.03
152 0.03
153 0.03
154 0.02
155 0.02
156 0.02
157 0.02
158 0.02
159 0.03
160 0.04
161 0.04
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.06
166 0.08
167 0.07
168 0.07
169 0.09
170 0.08
171 0.1
172 0.1
173 0.1
174 0.09
175 0.08
176 0.08
177 0.06
178 0.06
179 0.04
180 0.04
181 0.03
182 0.03
183 0.03
184 0.03
185 0.03
186 0.03
187 0.03
188 0.03
189 0.03
190 0.03
191 0.03
192 0.03
193 0.03
194 0.04
195 0.04
196 0.06
197 0.07
198 0.08
199 0.08
200 0.08
201 0.1
202 0.15
203 0.18
204 0.18
205 0.18
206 0.18
207 0.19
208 0.18
209 0.17
210 0.11
211 0.09
212 0.08
213 0.08
214 0.08
215 0.08
216 0.08
217 0.11
218 0.14
219 0.16
220 0.21
221 0.24
222 0.25
223 0.34
224 0.37
225 0.37
226 0.4
227 0.41
228 0.39
229 0.4
230 0.43
231 0.36
232 0.33
233 0.31
234 0.26
235 0.21
236 0.17
237 0.11
238 0.06
239 0.05
240 0.03
241 0.03
242 0.03
243 0.03
244 0.03
245 0.04
246 0.05
247 0.06
248 0.13
249 0.13
250 0.19
251 0.2
252 0.21
253 0.22
254 0.24
255 0.24
256 0.21
257 0.27
258 0.25
259 0.24
260 0.24
261 0.23
262 0.23
263 0.23
264 0.21
265 0.16
266 0.14
267 0.13
268 0.15
269 0.14
270 0.13
271 0.12
272 0.1
273 0.09
274 0.08
275 0.08
276 0.06
277 0.06
278 0.04
279 0.04
280 0.04
281 0.04
282 0.04
283 0.04
284 0.04
285 0.04
286 0.04
287 0.04
288 0.05
289 0.05
290 0.06
291 0.07
292 0.09
293 0.09
294 0.1
295 0.11
296 0.14
297 0.18
298 0.23
299 0.22
300 0.23
301 0.3
302 0.32
303 0.38
304 0.46
305 0.5
306 0.54
307 0.64
308 0.72
309 0.75
310 0.84
311 0.88
312 0.89
313 0.92
314 0.93
315 0.95
316 0.95
317 0.96
318 0.95
319 0.96
320 0.95
321 0.95
322 0.95
323 0.95
324 0.94
325 0.88
326 0.82
327 0.78
328 0.75
329 0.73
330 0.66
331 0.59
332 0.52
333 0.48
334 0.42
335 0.34
336 0.27
337 0.18
338 0.14
339 0.09
340 0.05
341 0.05
342 0.06