Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2V5IIA7

Protein Details
Accession A0A2V5IIA7    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
35-56VSGPPQPKPLRKSRPGATKQGMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
1228-1249GPIKRPPQPGARGGKRGHLGVK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR034397  Prp24_RRM1  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR031766  RRM_occluded  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006396  P:RNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PF16842  RRM_occluded  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12296  RRM1_Prp24  
cd12299  RRM4_Prp24  
cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MDINSLLSPQDSNSQSGRTTPSAGSTPANNASVPVSGPPQPKPLRKSRPGATKQGMTSSPLAQHVYAPNQLPDPSPPTNSPKVGPSMGSGSGSGSGSGTPPATDLPPARQPSTPGMDTLADLASMQHHQPQRPGAPLLRSTESYESQLSPSTMFPHVNPISHNTPTPRSSFDIAMSDGPRETAQRSYLDSSLVPNAQRQATDLFAQIQENPQSYEAHVRFIRLLHAGFVNHVYPPNNPEIHGDPRKYDLLKDMRTAREEMDKLFAMGEDLWAEWIQDESMLAQSVEERIAVMELCQRSVEEEYGSTKLWGIYGEWVLYLYKSAHGDASQSSWTEEDRIVGREVFTWPSVLEVWHRGAESTQWRIHDSHMVWDRFLDLLVQDLARNATQEKVNHVRNFFEVRLATPHATWDQTFQLFSGFVSNYYNANYESIMADIVGRHATAAKEQYSAREEFEIKLRNATESGELGQEYALFTEYLDWELKQSRRKRQLGNFEFVKSIYQRAVLRFPTDCHMWEDLIMYLVNESMHGNTKTATMATLDRATRHCPGSGTLWSQYLLSSEREGQSFAKIADIKHKATSTGLLDVGGMEEVLKVHTAWCSYLRRQAFLSDSTDEDIDVAEVGIRSAIESVQELGEKKYGRNYQGDPLFRLERIYIRYLSESGSWDSARETFKGLVGRRGNSYEFWLTYYEWELISWSKFVQGEATIDAARRTPNPSYATAVLKQAIKRTDLDWPEKIMQVYIAHCEDYEDSDELQLAILETRKAMRAITARRERDAREAAARQAEQQAAAIEQATQVEKRKREDEVNVNGAVPAKRARAEESTPSILVTPEPVALQRDRENATVVVKHLPRGITEHKVRQFFRHCGAINSLKMFSAPNGNSETAIIEFNNRDEAVVAQTRDQKMIDGQAIEVQFGSGSTLFVTNFPPTADDQYIRDLFREHGEIIDIRFPSLKYNTHRRFCYVQFKTSGEAYSATQLDGSTVGNGLHLVAKISDPTRKQDRHGPMYEGREIHVSNLDWKASEQDVEELFLRFGAVEQVRIPRKVDGGSKGFCYIVFASKEEAEAALVMHEQEYRSRPLQVKLSTPQGAKRSATTILSRVSASRSPSVEANGIGEEVSSSDRAARTLGLMNVPDTVNDARIRALVEPYGRLIKIILRPDHQGAIVEFADIHAAGRASLELEGQEIAPGRKLHVGSVPEMLKQSAEKRGHSGTTGSKATTEKSGARLQPTGPIKRPPQPGARGGKRGHLGVKRATGGLQGQSHAQNGAPTTNTTMTTTTMTNNTDSSAPDDGQKMKKSNDDFRAMIQQSRAG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.26
3 0.3
4 0.34
5 0.28
6 0.3
7 0.27
8 0.29
9 0.29
10 0.31
11 0.3
12 0.26
13 0.3
14 0.3
15 0.31
16 0.26
17 0.24
18 0.23
19 0.22
20 0.2
21 0.17
22 0.16
23 0.22
24 0.26
25 0.28
26 0.37
27 0.44
28 0.52
29 0.57
30 0.65
31 0.69
32 0.74
33 0.79
34 0.79
35 0.82
36 0.81
37 0.83
38 0.79
39 0.76
40 0.69
41 0.67
42 0.59
43 0.51
44 0.47
45 0.4
46 0.36
47 0.32
48 0.32
49 0.26
50 0.29
51 0.3
52 0.31
53 0.32
54 0.31
55 0.3
56 0.31
57 0.31
58 0.29
59 0.28
60 0.31
61 0.3
62 0.32
63 0.35
64 0.4
65 0.46
66 0.47
67 0.45
68 0.42
69 0.44
70 0.41
71 0.37
72 0.33
73 0.3
74 0.29
75 0.28
76 0.23
77 0.19
78 0.19
79 0.18
80 0.15
81 0.11
82 0.1
83 0.1
84 0.12
85 0.11
86 0.09
87 0.09
88 0.11
89 0.12
90 0.16
91 0.17
92 0.22
93 0.3
94 0.34
95 0.36
96 0.36
97 0.38
98 0.41
99 0.46
100 0.4
101 0.33
102 0.31
103 0.29
104 0.28
105 0.26
106 0.19
107 0.12
108 0.11
109 0.1
110 0.1
111 0.11
112 0.12
113 0.17
114 0.22
115 0.24
116 0.29
117 0.36
118 0.38
119 0.41
120 0.44
121 0.42
122 0.43
123 0.45
124 0.46
125 0.42
126 0.4
127 0.4
128 0.4
129 0.37
130 0.34
131 0.32
132 0.28
133 0.26
134 0.27
135 0.23
136 0.2
137 0.19
138 0.19
139 0.2
140 0.2
141 0.19
142 0.26
143 0.27
144 0.28
145 0.28
146 0.31
147 0.33
148 0.34
149 0.38
150 0.33
151 0.36
152 0.38
153 0.39
154 0.36
155 0.36
156 0.37
157 0.34
158 0.32
159 0.3
160 0.28
161 0.3
162 0.27
163 0.24
164 0.21
165 0.2
166 0.18
167 0.17
168 0.17
169 0.16
170 0.18
171 0.19
172 0.24
173 0.26
174 0.26
175 0.26
176 0.24
177 0.23
178 0.25
179 0.25
180 0.22
181 0.21
182 0.24
183 0.24
184 0.24
185 0.23
186 0.21
187 0.2
188 0.21
189 0.2
190 0.18
191 0.18
192 0.19
193 0.18
194 0.21
195 0.21
196 0.21
197 0.21
198 0.2
199 0.2
200 0.2
201 0.29
202 0.25
203 0.29
204 0.28
205 0.28
206 0.28
207 0.27
208 0.29
209 0.22
210 0.22
211 0.17
212 0.19
213 0.17
214 0.17
215 0.19
216 0.16
217 0.15
218 0.17
219 0.16
220 0.16
221 0.19
222 0.24
223 0.23
224 0.23
225 0.26
226 0.28
227 0.36
228 0.42
229 0.4
230 0.36
231 0.39
232 0.43
233 0.4
234 0.36
235 0.36
236 0.37
237 0.38
238 0.42
239 0.45
240 0.44
241 0.46
242 0.46
243 0.4
244 0.39
245 0.37
246 0.33
247 0.3
248 0.26
249 0.24
250 0.23
251 0.2
252 0.13
253 0.12
254 0.11
255 0.07
256 0.07
257 0.08
258 0.08
259 0.08
260 0.06
261 0.07
262 0.06
263 0.06
264 0.06
265 0.05
266 0.06
267 0.07
268 0.07
269 0.06
270 0.07
271 0.08
272 0.08
273 0.07
274 0.06
275 0.06
276 0.06
277 0.06
278 0.07
279 0.11
280 0.11
281 0.12
282 0.12
283 0.12
284 0.14
285 0.16
286 0.16
287 0.12
288 0.12
289 0.15
290 0.16
291 0.17
292 0.15
293 0.14
294 0.13
295 0.12
296 0.11
297 0.09
298 0.11
299 0.12
300 0.12
301 0.11
302 0.11
303 0.11
304 0.1
305 0.11
306 0.08
307 0.1
308 0.11
309 0.11
310 0.12
311 0.12
312 0.13
313 0.13
314 0.15
315 0.14
316 0.13
317 0.13
318 0.13
319 0.13
320 0.13
321 0.12
322 0.12
323 0.13
324 0.14
325 0.15
326 0.15
327 0.15
328 0.15
329 0.16
330 0.16
331 0.14
332 0.13
333 0.11
334 0.12
335 0.12
336 0.11
337 0.12
338 0.13
339 0.15
340 0.16
341 0.16
342 0.14
343 0.14
344 0.19
345 0.22
346 0.25
347 0.25
348 0.25
349 0.28
350 0.28
351 0.3
352 0.31
353 0.27
354 0.29
355 0.35
356 0.34
357 0.32
358 0.31
359 0.31
360 0.24
361 0.23
362 0.15
363 0.06
364 0.07
365 0.08
366 0.08
367 0.07
368 0.08
369 0.09
370 0.09
371 0.1
372 0.09
373 0.11
374 0.14
375 0.15
376 0.22
377 0.28
378 0.35
379 0.38
380 0.39
381 0.38
382 0.37
383 0.41
384 0.34
385 0.31
386 0.24
387 0.21
388 0.24
389 0.25
390 0.23
391 0.18
392 0.2
393 0.18
394 0.18
395 0.17
396 0.16
397 0.16
398 0.16
399 0.16
400 0.14
401 0.13
402 0.12
403 0.12
404 0.12
405 0.1
406 0.09
407 0.11
408 0.12
409 0.12
410 0.13
411 0.14
412 0.11
413 0.11
414 0.11
415 0.1
416 0.09
417 0.09
418 0.07
419 0.06
420 0.06
421 0.05
422 0.06
423 0.06
424 0.05
425 0.05
426 0.07
427 0.07
428 0.09
429 0.12
430 0.12
431 0.15
432 0.15
433 0.19
434 0.21
435 0.21
436 0.2
437 0.2
438 0.2
439 0.19
440 0.24
441 0.27
442 0.23
443 0.26
444 0.25
445 0.23
446 0.22
447 0.22
448 0.18
449 0.13
450 0.14
451 0.11
452 0.11
453 0.1
454 0.09
455 0.08
456 0.07
457 0.06
458 0.06
459 0.05
460 0.05
461 0.06
462 0.06
463 0.08
464 0.08
465 0.08
466 0.09
467 0.15
468 0.19
469 0.26
470 0.33
471 0.42
472 0.51
473 0.58
474 0.65
475 0.68
476 0.76
477 0.73
478 0.73
479 0.65
480 0.56
481 0.5
482 0.42
483 0.36
484 0.25
485 0.21
486 0.14
487 0.16
488 0.16
489 0.18
490 0.23
491 0.21
492 0.23
493 0.22
494 0.23
495 0.22
496 0.22
497 0.2
498 0.19
499 0.19
500 0.17
501 0.16
502 0.16
503 0.12
504 0.12
505 0.1
506 0.07
507 0.05
508 0.06
509 0.05
510 0.05
511 0.05
512 0.05
513 0.1
514 0.1
515 0.1
516 0.1
517 0.11
518 0.11
519 0.11
520 0.1
521 0.08
522 0.08
523 0.1
524 0.13
525 0.13
526 0.14
527 0.16
528 0.19
529 0.2
530 0.21
531 0.2
532 0.17
533 0.18
534 0.2
535 0.21
536 0.21
537 0.19
538 0.18
539 0.18
540 0.17
541 0.15
542 0.13
543 0.12
544 0.1
545 0.1
546 0.12
547 0.13
548 0.13
549 0.14
550 0.13
551 0.13
552 0.13
553 0.12
554 0.13
555 0.13
556 0.13
557 0.21
558 0.24
559 0.24
560 0.25
561 0.25
562 0.22
563 0.21
564 0.23
565 0.16
566 0.15
567 0.13
568 0.11
569 0.1
570 0.1
571 0.09
572 0.06
573 0.05
574 0.03
575 0.03
576 0.03
577 0.03
578 0.04
579 0.03
580 0.04
581 0.05
582 0.06
583 0.07
584 0.11
585 0.15
586 0.17
587 0.23
588 0.24
589 0.24
590 0.24
591 0.26
592 0.23
593 0.21
594 0.22
595 0.17
596 0.17
597 0.16
598 0.15
599 0.13
600 0.11
601 0.09
602 0.05
603 0.04
604 0.04
605 0.03
606 0.03
607 0.03
608 0.03
609 0.03
610 0.03
611 0.03
612 0.03
613 0.03
614 0.04
615 0.04
616 0.05
617 0.06
618 0.07
619 0.07
620 0.11
621 0.11
622 0.11
623 0.18
624 0.21
625 0.22
626 0.26
627 0.27
628 0.3
629 0.35
630 0.37
631 0.31
632 0.31
633 0.29
634 0.25
635 0.24
636 0.18
637 0.15
638 0.17
639 0.17
640 0.15
641 0.15
642 0.16
643 0.15
644 0.16
645 0.14
646 0.13
647 0.11
648 0.12
649 0.11
650 0.1
651 0.11
652 0.13
653 0.13
654 0.12
655 0.12
656 0.11
657 0.13
658 0.18
659 0.18
660 0.23
661 0.25
662 0.25
663 0.25
664 0.27
665 0.26
666 0.21
667 0.24
668 0.18
669 0.15
670 0.15
671 0.15
672 0.13
673 0.13
674 0.14
675 0.11
676 0.1
677 0.09
678 0.09
679 0.09
680 0.09
681 0.09
682 0.07
683 0.08
684 0.09
685 0.09
686 0.09
687 0.08
688 0.09
689 0.09
690 0.1
691 0.08
692 0.09
693 0.09
694 0.09
695 0.09
696 0.09
697 0.12
698 0.12
699 0.17
700 0.19
701 0.2
702 0.23
703 0.24
704 0.26
705 0.24
706 0.24
707 0.21
708 0.21
709 0.2
710 0.21
711 0.2
712 0.19
713 0.19
714 0.19
715 0.24
716 0.26
717 0.29
718 0.26
719 0.28
720 0.28
721 0.29
722 0.27
723 0.2
724 0.17
725 0.14
726 0.14
727 0.13
728 0.12
729 0.11
730 0.1
731 0.11
732 0.1
733 0.1
734 0.11
735 0.1
736 0.09
737 0.09
738 0.09
739 0.08
740 0.08
741 0.06
742 0.04
743 0.04
744 0.05
745 0.05
746 0.05
747 0.06
748 0.07
749 0.08
750 0.08
751 0.1
752 0.16
753 0.22
754 0.31
755 0.39
756 0.4
757 0.42
758 0.45
759 0.43
760 0.43
761 0.42
762 0.34
763 0.31
764 0.31
765 0.3
766 0.31
767 0.29
768 0.24
769 0.23
770 0.21
771 0.16
772 0.14
773 0.13
774 0.09
775 0.09
776 0.08
777 0.05
778 0.05
779 0.06
780 0.06
781 0.07
782 0.13
783 0.19
784 0.22
785 0.26
786 0.28
787 0.31
788 0.34
789 0.4
790 0.42
791 0.43
792 0.44
793 0.4
794 0.38
795 0.35
796 0.33
797 0.26
798 0.19
799 0.14
800 0.12
801 0.14
802 0.15
803 0.18
804 0.2
805 0.23
806 0.26
807 0.29
808 0.29
809 0.27
810 0.27
811 0.24
812 0.19
813 0.16
814 0.13
815 0.09
816 0.07
817 0.07
818 0.08
819 0.1
820 0.11
821 0.14
822 0.15
823 0.19
824 0.21
825 0.21
826 0.22
827 0.21
828 0.22
829 0.2
830 0.19
831 0.21
832 0.19
833 0.2
834 0.2
835 0.2
836 0.18
837 0.22
838 0.26
839 0.27
840 0.32
841 0.39
842 0.42
843 0.48
844 0.48
845 0.51
846 0.53
847 0.49
848 0.47
849 0.46
850 0.41
851 0.37
852 0.42
853 0.39
854 0.35
855 0.33
856 0.29
857 0.22
858 0.22
859 0.2
860 0.15
861 0.17
862 0.16
863 0.16
864 0.19
865 0.2
866 0.19
867 0.19
868 0.19
869 0.12
870 0.13
871 0.1
872 0.09
873 0.09
874 0.1
875 0.12
876 0.11
877 0.1
878 0.1
879 0.1
880 0.12
881 0.15
882 0.15
883 0.16
884 0.22
885 0.23
886 0.24
887 0.23
888 0.2
889 0.18
890 0.21
891 0.19
892 0.14
893 0.13
894 0.16
895 0.15
896 0.15
897 0.13
898 0.1
899 0.08
900 0.07
901 0.08
902 0.05
903 0.05
904 0.05
905 0.06
906 0.07
907 0.08
908 0.1
909 0.09
910 0.1
911 0.1
912 0.11
913 0.11
914 0.16
915 0.17
916 0.16
917 0.17
918 0.22
919 0.25
920 0.23
921 0.22
922 0.19
923 0.18
924 0.19
925 0.21
926 0.15
927 0.13
928 0.14
929 0.15
930 0.15
931 0.18
932 0.16
933 0.14
934 0.15
935 0.15
936 0.18
937 0.2
938 0.25
939 0.27
940 0.39
941 0.47
942 0.53
943 0.55
944 0.55
945 0.57
946 0.57
947 0.62
948 0.55
949 0.51
950 0.49
951 0.48
952 0.45
953 0.42
954 0.36
955 0.26
956 0.23
957 0.18
958 0.18
959 0.17
960 0.14
961 0.13
962 0.12
963 0.11
964 0.11
965 0.1
966 0.06
967 0.06
968 0.06
969 0.06
970 0.06
971 0.06
972 0.07
973 0.07
974 0.07
975 0.07
976 0.07
977 0.1
978 0.12
979 0.17
980 0.17
981 0.24
982 0.34
983 0.36
984 0.39
985 0.46
986 0.54
987 0.57
988 0.59
989 0.57
990 0.54
991 0.56
992 0.57
993 0.48
994 0.4
995 0.35
996 0.31
997 0.26
998 0.24
999 0.2
1000 0.2
1001 0.22
1002 0.21
1003 0.18
1004 0.18
1005 0.2
1006 0.17
1007 0.17
1008 0.13
1009 0.14
1010 0.15
1011 0.16
1012 0.17
1013 0.14
1014 0.13
1015 0.12
1016 0.11
1017 0.08
1018 0.07
1019 0.12
1020 0.12
1021 0.12
1022 0.14
1023 0.22
1024 0.26
1025 0.28
1026 0.3
1027 0.25
1028 0.27
1029 0.3
1030 0.33
1031 0.32
1032 0.34
1033 0.35
1034 0.35
1035 0.35
1036 0.32
1037 0.28
1038 0.27
1039 0.21
1040 0.21
1041 0.21
1042 0.2
1043 0.21
1044 0.21
1045 0.22
1046 0.18
1047 0.17
1048 0.11
1049 0.09
1050 0.08
1051 0.06
1052 0.06
1053 0.06
1054 0.06
1055 0.07
1056 0.08
1057 0.11
1058 0.15
1059 0.19
1060 0.21
1061 0.27
1062 0.3
1063 0.34
1064 0.42
1065 0.41
1066 0.44
1067 0.44
1068 0.5
1069 0.49
1070 0.47
1071 0.48
1072 0.45
1073 0.46
1074 0.41
1075 0.38
1076 0.34
1077 0.32
1078 0.33
1079 0.3
1080 0.29
1081 0.26
1082 0.27
1083 0.25
1084 0.23
1085 0.25
1086 0.25
1087 0.26
1088 0.27
1089 0.26
1090 0.27
1091 0.28
1092 0.29
1093 0.27
1094 0.24
1095 0.21
1096 0.17
1097 0.15
1098 0.13
1099 0.11
1100 0.08
1101 0.07
1102 0.09
1103 0.07
1104 0.07
1105 0.1
1106 0.1
1107 0.11
1108 0.12
1109 0.11
1110 0.12
1111 0.16
1112 0.17
1113 0.17
1114 0.18
1115 0.18
1116 0.19
1117 0.19
1118 0.16
1119 0.16
1120 0.15
1121 0.16
1122 0.16
1123 0.16
1124 0.15
1125 0.16
1126 0.17
1127 0.15
1128 0.16
1129 0.17
1130 0.18
1131 0.18
1132 0.21
1133 0.24
1134 0.22
1135 0.21
1136 0.2
1137 0.22
1138 0.27
1139 0.33
1140 0.35
1141 0.33
1142 0.38
1143 0.4
1144 0.41
1145 0.36
1146 0.32
1147 0.24
1148 0.25
1149 0.22
1150 0.18
1151 0.15
1152 0.12
1153 0.13
1154 0.1
1155 0.1
1156 0.07
1157 0.07
1158 0.07
1159 0.07
1160 0.07
1161 0.07
1162 0.08
1163 0.08
1164 0.07
1165 0.07
1166 0.08
1167 0.08
1168 0.09
1169 0.11
1170 0.11
1171 0.15
1172 0.16
1173 0.17
1174 0.21
1175 0.22
1176 0.23
1177 0.26
1178 0.28
1179 0.26
1180 0.32
1181 0.32
1182 0.28
1183 0.29
1184 0.27
1185 0.22
1186 0.24
1187 0.26
1188 0.29
1189 0.32
1190 0.32
1191 0.36
1192 0.4
1193 0.4
1194 0.38
1195 0.38
1196 0.35
1197 0.38
1198 0.38
1199 0.33
1200 0.32
1201 0.32
1202 0.32
1203 0.32
1204 0.3
1205 0.26
1206 0.29
1207 0.37
1208 0.38
1209 0.41
1210 0.42
1211 0.38
1212 0.43
1213 0.48
1214 0.51
1215 0.48
1216 0.53
1217 0.55
1218 0.6
1219 0.68
1220 0.66
1221 0.67
1222 0.66
1223 0.7
1224 0.72
1225 0.74
1226 0.74
1227 0.68
1228 0.68
1229 0.62
1230 0.59
1231 0.58
1232 0.54
1233 0.51
1234 0.49
1235 0.53
1236 0.48
1237 0.45
1238 0.42
1239 0.37
1240 0.34
1241 0.34
1242 0.3
1243 0.25
1244 0.27
1245 0.28
1246 0.28
1247 0.25
1248 0.23
1249 0.19
1250 0.18
1251 0.2
1252 0.18
1253 0.17
1254 0.21
1255 0.23
1256 0.23
1257 0.23
1258 0.23
1259 0.22
1260 0.22
1261 0.22
1262 0.21
1263 0.23
1264 0.24
1265 0.23
1266 0.22
1267 0.22
1268 0.21
1269 0.21
1270 0.22
1271 0.22
1272 0.2
1273 0.22
1274 0.26
1275 0.31
1276 0.37
1277 0.43
1278 0.44
1279 0.45
1280 0.52
1281 0.56
1282 0.62
1283 0.63
1284 0.62
1285 0.57
1286 0.56
1287 0.62
1288 0.56
1289 0.52