Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2V5IF88

Protein Details
Accession A0A2V5IF88    Localization Confidence High Confidence Score 20
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
23-55SVRSSRQSSHDPNPNPRKRQRRNGAADDRKIQDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
471-479PGPRGMKIR
555-629PNGRPGRGGRGGGGGGGGGGRGRDSYQPSSGGRNARPPPAPSRPTRGGGGGRGGGRGGKRGGGPGGDAYRPSRRW
Subcellular Location(s) nucl 26
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Amino Acid Sequences MSAPPSDDGDSRTAAVGQLNGASVRSSRQSSHDPNPNPRKRQRRNGAADDRKIQDFVPQGATFSAHSLDVDPDDETSSSGSDSESVGTSSSEEEGDKAGAAAAPPVSWNKGSKSAIRTSLRGSRNAAEGNQPKPAASKFDAVNDQFWRSRSASTSSASDRGDAAPSKSDRDDEMEEGEVDEAESSAESSQMQGSVDSDDSDSLDSEADDSILLNIGERGPGQNLGQTQDGILTPDGDDEYEPVTNGYRKRGAQDDLIDSPKMSKEDTHRRYAQRYPTAPSVLADLHQEDMDFQAKYRFYDRDINAIDLQLPIACTECLQEGHLAEVCPSKECVHCNAWNEHQSSLCPTWRRCQRCRERGHDDDTCPSALKGSASETPCDLCGSSDHLELDCDMMWKLSNPHDSTSGPVLVSISCAKCCSNRHLIGDCPSLKKPLLSSTWTLHGIEPGMITNTNSVVNNSRRGGGNRGGQAPGPRGMKIRGRADQHRPPSSDSDDMMSRLRQPVNRSNNNNNNNNNNNNNNNNSNRGHIRFGAGIGANNRNIAPPGGGYRQRSLSPNGRPGRGGRGGGGGGGGGGRGRDSYQPSSGGRNARPPPAPSRPTRGGGGGRGGGRGGKRGGGPGGDAYRPSRRW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.17
3 0.15
4 0.13
5 0.12
6 0.13
7 0.12
8 0.12
9 0.12
10 0.11
11 0.14
12 0.17
13 0.19
14 0.2
15 0.26
16 0.35
17 0.42
18 0.51
19 0.58
20 0.61
21 0.69
22 0.78
23 0.82
24 0.83
25 0.85
26 0.87
27 0.87
28 0.91
29 0.91
30 0.9
31 0.9
32 0.91
33 0.92
34 0.91
35 0.87
36 0.83
37 0.76
38 0.67
39 0.58
40 0.47
41 0.42
42 0.36
43 0.32
44 0.32
45 0.28
46 0.27
47 0.27
48 0.28
49 0.22
50 0.2
51 0.18
52 0.11
53 0.11
54 0.12
55 0.13
56 0.12
57 0.13
58 0.12
59 0.11
60 0.13
61 0.12
62 0.11
63 0.11
64 0.1
65 0.09
66 0.09
67 0.08
68 0.08
69 0.08
70 0.09
71 0.09
72 0.09
73 0.09
74 0.09
75 0.09
76 0.1
77 0.1
78 0.09
79 0.09
80 0.09
81 0.1
82 0.1
83 0.09
84 0.08
85 0.08
86 0.08
87 0.07
88 0.08
89 0.07
90 0.07
91 0.08
92 0.1
93 0.13
94 0.14
95 0.17
96 0.19
97 0.27
98 0.3
99 0.34
100 0.39
101 0.42
102 0.49
103 0.5
104 0.49
105 0.46
106 0.52
107 0.49
108 0.47
109 0.45
110 0.38
111 0.39
112 0.4
113 0.35
114 0.36
115 0.38
116 0.36
117 0.38
118 0.35
119 0.31
120 0.31
121 0.31
122 0.28
123 0.26
124 0.29
125 0.25
126 0.3
127 0.36
128 0.34
129 0.37
130 0.33
131 0.34
132 0.32
133 0.32
134 0.31
135 0.26
136 0.27
137 0.26
138 0.28
139 0.27
140 0.27
141 0.3
142 0.28
143 0.31
144 0.3
145 0.27
146 0.24
147 0.22
148 0.23
149 0.2
150 0.19
151 0.21
152 0.22
153 0.24
154 0.24
155 0.24
156 0.22
157 0.25
158 0.27
159 0.22
160 0.22
161 0.2
162 0.19
163 0.18
164 0.17
165 0.12
166 0.09
167 0.07
168 0.05
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.05
176 0.06
177 0.06
178 0.07
179 0.06
180 0.07
181 0.08
182 0.09
183 0.09
184 0.08
185 0.08
186 0.08
187 0.08
188 0.08
189 0.07
190 0.06
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.04
198 0.05
199 0.05
200 0.04
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.06
205 0.06
206 0.07
207 0.08
208 0.08
209 0.1
210 0.11
211 0.13
212 0.13
213 0.12
214 0.11
215 0.11
216 0.11
217 0.1
218 0.09
219 0.08
220 0.07
221 0.07
222 0.08
223 0.06
224 0.06
225 0.06
226 0.07
227 0.07
228 0.07
229 0.06
230 0.08
231 0.11
232 0.13
233 0.16
234 0.2
235 0.2
236 0.23
237 0.27
238 0.28
239 0.28
240 0.3
241 0.3
242 0.28
243 0.3
244 0.27
245 0.22
246 0.21
247 0.19
248 0.16
249 0.13
250 0.13
251 0.2
252 0.31
253 0.35
254 0.41
255 0.46
256 0.49
257 0.54
258 0.57
259 0.57
260 0.54
261 0.52
262 0.49
263 0.46
264 0.44
265 0.4
266 0.33
267 0.26
268 0.18
269 0.16
270 0.13
271 0.1
272 0.09
273 0.08
274 0.08
275 0.06
276 0.07
277 0.09
278 0.08
279 0.07
280 0.11
281 0.11
282 0.13
283 0.15
284 0.15
285 0.16
286 0.25
287 0.26
288 0.29
289 0.3
290 0.31
291 0.28
292 0.28
293 0.25
294 0.16
295 0.15
296 0.08
297 0.07
298 0.05
299 0.05
300 0.05
301 0.04
302 0.05
303 0.06
304 0.06
305 0.06
306 0.07
307 0.06
308 0.08
309 0.09
310 0.08
311 0.08
312 0.1
313 0.1
314 0.1
315 0.11
316 0.11
317 0.12
318 0.14
319 0.17
320 0.2
321 0.23
322 0.26
323 0.28
324 0.31
325 0.34
326 0.34
327 0.3
328 0.26
329 0.23
330 0.23
331 0.22
332 0.22
333 0.21
334 0.21
335 0.29
336 0.37
337 0.45
338 0.46
339 0.55
340 0.62
341 0.68
342 0.74
343 0.74
344 0.75
345 0.72
346 0.73
347 0.67
348 0.58
349 0.51
350 0.45
351 0.37
352 0.28
353 0.23
354 0.17
355 0.13
356 0.11
357 0.08
358 0.1
359 0.15
360 0.15
361 0.16
362 0.16
363 0.16
364 0.16
365 0.16
366 0.13
367 0.08
368 0.08
369 0.12
370 0.13
371 0.13
372 0.14
373 0.13
374 0.13
375 0.13
376 0.13
377 0.08
378 0.08
379 0.06
380 0.06
381 0.06
382 0.07
383 0.09
384 0.13
385 0.19
386 0.2
387 0.21
388 0.24
389 0.24
390 0.26
391 0.26
392 0.22
393 0.16
394 0.15
395 0.14
396 0.11
397 0.12
398 0.13
399 0.12
400 0.11
401 0.12
402 0.13
403 0.17
404 0.2
405 0.25
406 0.3
407 0.34
408 0.38
409 0.4
410 0.42
411 0.43
412 0.47
413 0.43
414 0.38
415 0.35
416 0.33
417 0.3
418 0.28
419 0.25
420 0.24
421 0.25
422 0.24
423 0.26
424 0.26
425 0.3
426 0.3
427 0.3
428 0.24
429 0.21
430 0.18
431 0.15
432 0.13
433 0.1
434 0.09
435 0.09
436 0.09
437 0.08
438 0.09
439 0.1
440 0.1
441 0.11
442 0.17
443 0.2
444 0.25
445 0.25
446 0.26
447 0.27
448 0.3
449 0.34
450 0.33
451 0.36
452 0.35
453 0.37
454 0.35
455 0.34
456 0.34
457 0.32
458 0.32
459 0.27
460 0.24
461 0.24
462 0.28
463 0.32
464 0.37
465 0.41
466 0.42
467 0.47
468 0.53
469 0.6
470 0.65
471 0.67
472 0.67
473 0.62
474 0.6
475 0.59
476 0.55
477 0.49
478 0.41
479 0.35
480 0.3
481 0.29
482 0.28
483 0.23
484 0.21
485 0.24
486 0.27
487 0.27
488 0.33
489 0.41
490 0.49
491 0.58
492 0.63
493 0.68
494 0.74
495 0.79
496 0.8
497 0.76
498 0.74
499 0.71
500 0.7
501 0.66
502 0.62
503 0.6
504 0.57
505 0.57
506 0.54
507 0.51
508 0.51
509 0.46
510 0.45
511 0.45
512 0.43
513 0.42
514 0.36
515 0.36
516 0.31
517 0.3
518 0.29
519 0.23
520 0.22
521 0.23
522 0.26
523 0.23
524 0.23
525 0.23
526 0.19
527 0.2
528 0.18
529 0.14
530 0.12
531 0.16
532 0.23
533 0.28
534 0.31
535 0.34
536 0.37
537 0.39
538 0.41
539 0.43
540 0.44
541 0.47
542 0.54
543 0.55
544 0.54
545 0.53
546 0.52
547 0.54
548 0.51
549 0.44
550 0.35
551 0.33
552 0.31
553 0.28
554 0.26
555 0.16
556 0.11
557 0.09
558 0.08
559 0.05
560 0.05
561 0.05
562 0.06
563 0.08
564 0.13
565 0.19
566 0.23
567 0.26
568 0.3
569 0.32
570 0.37
571 0.42
572 0.45
573 0.42
574 0.47
575 0.49
576 0.52
577 0.55
578 0.54
579 0.57
580 0.59
581 0.63
582 0.59
583 0.64
584 0.63
585 0.61
586 0.6
587 0.57
588 0.51
589 0.49
590 0.48
591 0.44
592 0.38
593 0.35
594 0.33
595 0.31
596 0.27
597 0.28
598 0.24
599 0.23
600 0.23
601 0.26
602 0.28
603 0.25
604 0.26
605 0.27
606 0.29
607 0.27
608 0.29
609 0.3