Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2V5HZS0

Protein Details
Accession A0A2V5HZS0    Localization Confidence High Confidence Score 26.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MSKTKSVSKKGEKPVDKALSHydrophilic
41-67IAKAVVTKEKKSSKKKKEPTPSESSESHydrophilic
126-149EDEKPAKKETKKETKKVAKKEESSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
9-58KKGEKPVDKALSKVKDAGVSKAAQSPKSKSKQIAKAVVTKEKKSSKKKKE
130-145PAKKETKKETKKVAKK
466-515GRGGGRGGFGGRGGGGGFGGRGGGGRGGGRGGRGGFGGRGGGAGGFNKGK
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSKTKSVSKKGEKPVDKALSKVKDAGVSKAAQSPKSKSKQIAKAVVTKEKKSSKKKKEPTPSESSESESDSDEEMESDSSSSSESEDEKPAKKDNKKKVESESDSDSDSDEDMKDASSSESESESEDEKPAKKETKKETKKVAKKEESSDSESSESEDSDSESEKEAPKKAEKKVESESDSDSDSSSSEDEAPKKAAKESSDSDSDSDSESEDEKKAEKESSDSDSSDSDSSDSESEESDEAPKESKKRKAEDESAATPKKTKVEQPAEGASANLFVGNLSWNVDEEWLQREFEGFGELSGCRIMTERETGRSRGFGYVEFTNAADAAKAFEAKKGAEIDGRTINLDYATGRPANNQGAPRDRAENRARNFGDQASPESDTLFIGNLPFSANEDSVGELFGAQGTILGIRLPTDPESGRPKGFGYVQYSSVDEARAAYNELNGAELEGRAVRLDFSTPRQNNNGGGRGGGRGGFGGRGGGGGFGGRGGGGRGGGRGGRGGFGGRGGGAGGFNKGKGSIPEYKGTKVTF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.8
3 0.7
4 0.65
5 0.64
6 0.59
7 0.55
8 0.54
9 0.46
10 0.43
11 0.43
12 0.44
13 0.39
14 0.34
15 0.34
16 0.37
17 0.38
18 0.36
19 0.4
20 0.43
21 0.49
22 0.55
23 0.59
24 0.61
25 0.67
26 0.71
27 0.76
28 0.77
29 0.72
30 0.73
31 0.73
32 0.74
33 0.7
34 0.64
35 0.64
36 0.64
37 0.69
38 0.71
39 0.76
40 0.77
41 0.83
42 0.89
43 0.91
44 0.93
45 0.93
46 0.9
47 0.89
48 0.83
49 0.78
50 0.69
51 0.63
52 0.53
53 0.45
54 0.38
55 0.3
56 0.25
57 0.2
58 0.2
59 0.15
60 0.13
61 0.12
62 0.11
63 0.1
64 0.09
65 0.08
66 0.07
67 0.08
68 0.08
69 0.08
70 0.09
71 0.12
72 0.14
73 0.21
74 0.26
75 0.29
76 0.33
77 0.4
78 0.48
79 0.55
80 0.62
81 0.66
82 0.72
83 0.74
84 0.77
85 0.78
86 0.79
87 0.76
88 0.7
89 0.66
90 0.56
91 0.51
92 0.45
93 0.37
94 0.27
95 0.21
96 0.17
97 0.11
98 0.1
99 0.09
100 0.09
101 0.08
102 0.08
103 0.08
104 0.08
105 0.08
106 0.09
107 0.1
108 0.1
109 0.11
110 0.12
111 0.13
112 0.14
113 0.15
114 0.18
115 0.2
116 0.22
117 0.27
118 0.34
119 0.37
120 0.45
121 0.53
122 0.61
123 0.68
124 0.73
125 0.78
126 0.81
127 0.85
128 0.86
129 0.87
130 0.84
131 0.79
132 0.78
133 0.76
134 0.7
135 0.68
136 0.58
137 0.5
138 0.42
139 0.37
140 0.32
141 0.24
142 0.18
143 0.12
144 0.11
145 0.1
146 0.1
147 0.11
148 0.1
149 0.11
150 0.14
151 0.17
152 0.2
153 0.23
154 0.26
155 0.33
156 0.39
157 0.44
158 0.51
159 0.49
160 0.51
161 0.54
162 0.57
163 0.52
164 0.47
165 0.44
166 0.36
167 0.34
168 0.29
169 0.23
170 0.16
171 0.13
172 0.11
173 0.09
174 0.08
175 0.09
176 0.12
177 0.13
178 0.15
179 0.17
180 0.18
181 0.19
182 0.21
183 0.22
184 0.2
185 0.24
186 0.25
187 0.27
188 0.28
189 0.27
190 0.25
191 0.23
192 0.22
193 0.18
194 0.15
195 0.11
196 0.09
197 0.1
198 0.11
199 0.11
200 0.11
201 0.11
202 0.12
203 0.13
204 0.14
205 0.13
206 0.14
207 0.16
208 0.21
209 0.21
210 0.21
211 0.2
212 0.19
213 0.2
214 0.18
215 0.15
216 0.1
217 0.08
218 0.09
219 0.08
220 0.08
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.07
226 0.08
227 0.08
228 0.08
229 0.1
230 0.12
231 0.17
232 0.24
233 0.32
234 0.36
235 0.41
236 0.48
237 0.53
238 0.57
239 0.57
240 0.56
241 0.53
242 0.53
243 0.5
244 0.42
245 0.37
246 0.32
247 0.28
248 0.25
249 0.25
250 0.28
251 0.33
252 0.36
253 0.38
254 0.38
255 0.36
256 0.34
257 0.29
258 0.19
259 0.13
260 0.1
261 0.06
262 0.05
263 0.03
264 0.03
265 0.04
266 0.04
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.06
271 0.06
272 0.07
273 0.07
274 0.1
275 0.1
276 0.1
277 0.09
278 0.1
279 0.1
280 0.09
281 0.1
282 0.07
283 0.06
284 0.07
285 0.07
286 0.07
287 0.07
288 0.06
289 0.05
290 0.06
291 0.06
292 0.07
293 0.12
294 0.13
295 0.19
296 0.22
297 0.23
298 0.24
299 0.25
300 0.25
301 0.22
302 0.21
303 0.16
304 0.17
305 0.16
306 0.16
307 0.15
308 0.14
309 0.11
310 0.1
311 0.09
312 0.06
313 0.05
314 0.06
315 0.05
316 0.07
317 0.08
318 0.09
319 0.11
320 0.11
321 0.14
322 0.14
323 0.14
324 0.15
325 0.16
326 0.17
327 0.18
328 0.19
329 0.17
330 0.15
331 0.15
332 0.12
333 0.11
334 0.09
335 0.08
336 0.1
337 0.11
338 0.11
339 0.12
340 0.15
341 0.18
342 0.21
343 0.23
344 0.25
345 0.3
346 0.33
347 0.33
348 0.36
349 0.34
350 0.39
351 0.45
352 0.49
353 0.45
354 0.52
355 0.51
356 0.47
357 0.48
358 0.41
359 0.36
360 0.29
361 0.3
362 0.23
363 0.24
364 0.21
365 0.2
366 0.18
367 0.14
368 0.13
369 0.1
370 0.07
371 0.06
372 0.06
373 0.06
374 0.06
375 0.06
376 0.08
377 0.1
378 0.1
379 0.1
380 0.1
381 0.11
382 0.1
383 0.11
384 0.08
385 0.06
386 0.06
387 0.05
388 0.05
389 0.04
390 0.04
391 0.04
392 0.04
393 0.04
394 0.04
395 0.04
396 0.05
397 0.06
398 0.08
399 0.1
400 0.13
401 0.14
402 0.19
403 0.27
404 0.29
405 0.29
406 0.28
407 0.28
408 0.28
409 0.3
410 0.3
411 0.3
412 0.29
413 0.3
414 0.3
415 0.3
416 0.28
417 0.26
418 0.21
419 0.14
420 0.13
421 0.12
422 0.11
423 0.12
424 0.11
425 0.11
426 0.12
427 0.12
428 0.11
429 0.1
430 0.1
431 0.09
432 0.08
433 0.09
434 0.08
435 0.08
436 0.08
437 0.08
438 0.08
439 0.08
440 0.12
441 0.14
442 0.19
443 0.3
444 0.32
445 0.37
446 0.41
447 0.43
448 0.46
449 0.49
450 0.49
451 0.39
452 0.37
453 0.34
454 0.3
455 0.29
456 0.23
457 0.16
458 0.12
459 0.12
460 0.11
461 0.1
462 0.09
463 0.08
464 0.08
465 0.08
466 0.07
467 0.06
468 0.06
469 0.06
470 0.05
471 0.05
472 0.04
473 0.05
474 0.05
475 0.06
476 0.07
477 0.08
478 0.09
479 0.11
480 0.12
481 0.12
482 0.15
483 0.14
484 0.14
485 0.14
486 0.15
487 0.14
488 0.14
489 0.14
490 0.11
491 0.1
492 0.1
493 0.09
494 0.09
495 0.09
496 0.13
497 0.13
498 0.14
499 0.14
500 0.15
501 0.17
502 0.19
503 0.24
504 0.3
505 0.33
506 0.41
507 0.44
508 0.47