Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1C6F5

Protein Details
Accession A0A0D1C6F5    Localization Confidence Low Confidence Score 9.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-24MSREQREHRNAKRKQETTREPAWHHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 9, mito 7, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001584  Integrase_cat-core  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0015074  P:DNA integration  
KEGG uma:UMAG_02565  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50994  INTEGRASE  
CDD cd09272  RNase_HI_RT_Ty1  
Amino Acid Sequences MSREQREHRNAKRKQETTREPAWHQRSRHPGPDETKQIHQHYLGRDEEKEPESPECSACSQGKQTRARMRPSQSDRATAPLELVHIDPITNYRGHANYHYALIAVDHFSSRLYAGPLCTKSAAFPARNKCIVKMERATARKLKTLRSDNGREWNRQQALDWQTQGGFKWQKTTPAVSAQNGRAESTISLTASVPHPIRHQENTPSRILRNHRAWPRVAAADQQGKHGVRATPAIMVGYDDEHKSWKFCSPDEPSLIRWSNSATLHQDKCWAGRHALLGAPEEVPEDESPVSATPIAERDDEAMVEELLSSVRSSENQELLEAHSDANWASDAILHRKSTSGSVAFVHGNPAAWKSATQKCLSLSAVEAEFVAATEAAREILFLKQLLRSIGLASGTPTVFSDNKGCIEESKDPAQHRKLKHIDTKFHFIRDNVQEGQVQVKYIDTKHNLADMLTKPVGKHVVQVARGGSHLEAAAETIQERALTYAQALRGGM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.84
2 0.85
3 0.84
4 0.81
5 0.83
6 0.79
7 0.74
8 0.77
9 0.77
10 0.73
11 0.68
12 0.69
13 0.7
14 0.71
15 0.74
16 0.69
17 0.68
18 0.67
19 0.72
20 0.72
21 0.66
22 0.66
23 0.65
24 0.63
25 0.59
26 0.57
27 0.53
28 0.49
29 0.51
30 0.48
31 0.44
32 0.43
33 0.41
34 0.43
35 0.39
36 0.36
37 0.33
38 0.3
39 0.29
40 0.29
41 0.27
42 0.24
43 0.24
44 0.27
45 0.27
46 0.27
47 0.34
48 0.38
49 0.46
50 0.5
51 0.58
52 0.62
53 0.67
54 0.71
55 0.71
56 0.73
57 0.74
58 0.75
59 0.76
60 0.69
61 0.67
62 0.6
63 0.56
64 0.5
65 0.4
66 0.32
67 0.22
68 0.2
69 0.16
70 0.16
71 0.12
72 0.1
73 0.1
74 0.1
75 0.11
76 0.13
77 0.12
78 0.12
79 0.14
80 0.16
81 0.18
82 0.21
83 0.25
84 0.23
85 0.24
86 0.23
87 0.2
88 0.18
89 0.16
90 0.14
91 0.1
92 0.09
93 0.08
94 0.08
95 0.08
96 0.09
97 0.08
98 0.09
99 0.1
100 0.1
101 0.12
102 0.19
103 0.2
104 0.22
105 0.22
106 0.21
107 0.2
108 0.26
109 0.3
110 0.28
111 0.34
112 0.4
113 0.46
114 0.52
115 0.52
116 0.47
117 0.5
118 0.49
119 0.49
120 0.45
121 0.45
122 0.47
123 0.49
124 0.52
125 0.5
126 0.49
127 0.49
128 0.47
129 0.47
130 0.48
131 0.54
132 0.55
133 0.56
134 0.6
135 0.58
136 0.66
137 0.63
138 0.59
139 0.54
140 0.56
141 0.5
142 0.44
143 0.4
144 0.39
145 0.4
146 0.39
147 0.36
148 0.27
149 0.26
150 0.26
151 0.25
152 0.25
153 0.24
154 0.2
155 0.25
156 0.26
157 0.31
158 0.33
159 0.35
160 0.3
161 0.34
162 0.36
163 0.33
164 0.37
165 0.33
166 0.34
167 0.32
168 0.3
169 0.22
170 0.2
171 0.17
172 0.15
173 0.13
174 0.09
175 0.1
176 0.09
177 0.11
178 0.1
179 0.14
180 0.13
181 0.13
182 0.15
183 0.18
184 0.22
185 0.23
186 0.26
187 0.32
188 0.39
189 0.41
190 0.43
191 0.41
192 0.39
193 0.42
194 0.44
195 0.43
196 0.42
197 0.46
198 0.49
199 0.51
200 0.51
201 0.47
202 0.44
203 0.38
204 0.32
205 0.26
206 0.24
207 0.27
208 0.26
209 0.25
210 0.26
211 0.24
212 0.24
213 0.24
214 0.2
215 0.15
216 0.16
217 0.15
218 0.12
219 0.12
220 0.11
221 0.08
222 0.08
223 0.07
224 0.06
225 0.07
226 0.06
227 0.07
228 0.09
229 0.09
230 0.09
231 0.1
232 0.13
233 0.14
234 0.14
235 0.21
236 0.25
237 0.29
238 0.33
239 0.33
240 0.3
241 0.35
242 0.35
243 0.29
244 0.22
245 0.2
246 0.2
247 0.19
248 0.2
249 0.18
250 0.23
251 0.24
252 0.24
253 0.27
254 0.24
255 0.26
256 0.28
257 0.25
258 0.2
259 0.21
260 0.22
261 0.18
262 0.19
263 0.17
264 0.14
265 0.13
266 0.12
267 0.1
268 0.09
269 0.08
270 0.08
271 0.07
272 0.08
273 0.07
274 0.07
275 0.07
276 0.07
277 0.08
278 0.07
279 0.07
280 0.06
281 0.08
282 0.1
283 0.09
284 0.09
285 0.11
286 0.1
287 0.1
288 0.11
289 0.09
290 0.07
291 0.07
292 0.06
293 0.05
294 0.05
295 0.05
296 0.04
297 0.04
298 0.05
299 0.06
300 0.1
301 0.13
302 0.15
303 0.15
304 0.15
305 0.15
306 0.16
307 0.18
308 0.14
309 0.11
310 0.09
311 0.09
312 0.09
313 0.09
314 0.07
315 0.05
316 0.05
317 0.07
318 0.09
319 0.13
320 0.17
321 0.17
322 0.17
323 0.18
324 0.19
325 0.18
326 0.2
327 0.16
328 0.15
329 0.15
330 0.17
331 0.18
332 0.17
333 0.17
334 0.13
335 0.13
336 0.12
337 0.13
338 0.12
339 0.11
340 0.12
341 0.16
342 0.23
343 0.26
344 0.27
345 0.28
346 0.28
347 0.31
348 0.3
349 0.25
350 0.19
351 0.18
352 0.16
353 0.14
354 0.13
355 0.09
356 0.09
357 0.08
358 0.07
359 0.04
360 0.04
361 0.04
362 0.04
363 0.05
364 0.05
365 0.05
366 0.06
367 0.07
368 0.09
369 0.09
370 0.1
371 0.12
372 0.14
373 0.15
374 0.15
375 0.14
376 0.13
377 0.14
378 0.14
379 0.12
380 0.12
381 0.14
382 0.12
383 0.12
384 0.11
385 0.13
386 0.13
387 0.15
388 0.18
389 0.17
390 0.19
391 0.21
392 0.21
393 0.19
394 0.24
395 0.28
396 0.3
397 0.34
398 0.37
399 0.39
400 0.47
401 0.55
402 0.57
403 0.54
404 0.6
405 0.61
406 0.65
407 0.71
408 0.71
409 0.72
410 0.71
411 0.78
412 0.71
413 0.67
414 0.61
415 0.52
416 0.52
417 0.48
418 0.48
419 0.39
420 0.38
421 0.35
422 0.33
423 0.38
424 0.29
425 0.24
426 0.18
427 0.19
428 0.2
429 0.21
430 0.28
431 0.27
432 0.29
433 0.3
434 0.33
435 0.31
436 0.28
437 0.33
438 0.27
439 0.3
440 0.29
441 0.29
442 0.26
443 0.3
444 0.35
445 0.28
446 0.31
447 0.32
448 0.37
449 0.37
450 0.4
451 0.37
452 0.34
453 0.34
454 0.31
455 0.22
456 0.17
457 0.15
458 0.12
459 0.1
460 0.1
461 0.11
462 0.1
463 0.1
464 0.09
465 0.09
466 0.09
467 0.09
468 0.1
469 0.1
470 0.1
471 0.12
472 0.16
473 0.17