Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B8NA52

Protein Details
Accession B8NA52    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
235-257AVVVKQTKLNPKPPFKKKDSRKGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
245-257PKPPFKKKDSRKG
Subcellular Location(s) mito 13, mito_nucl 12.499, nucl 10.5, cyto_mito 8.999, cyto_nucl 8.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010378  TRAPPC13  
Pfam View protein in Pfam  
PF06159  DUF974  
Amino Acid Sequences MARPRAHSGAEASKEPHSVSLKVLRLSRPSLSYQYPFPEANTKISNKASLSYPSDSVDNQFILAPNLTLPPAFGSAYVGETFACTLSANNELAEDETSRVVTSVRIVAEMQTPSQVASLELEPADDAPARDGLQKGQSLQKIVRFDLKEEGNHILAVSVSYTETLIGSDSQAASGRVRTFRKLYQFVAQPCLSVRTKSSELSPLEVENKSLGPYGKTRLLRFALEAQLENVGDGAVVVKQTKLNPKPPFKKKDSRKG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.33
3 0.33
4 0.28
5 0.25
6 0.27
7 0.33
8 0.35
9 0.38
10 0.42
11 0.4
12 0.42
13 0.44
14 0.43
15 0.38
16 0.38
17 0.39
18 0.4
19 0.38
20 0.37
21 0.38
22 0.38
23 0.35
24 0.33
25 0.35
26 0.32
27 0.35
28 0.37
29 0.35
30 0.36
31 0.38
32 0.39
33 0.32
34 0.32
35 0.29
36 0.29
37 0.31
38 0.29
39 0.28
40 0.26
41 0.27
42 0.25
43 0.24
44 0.21
45 0.16
46 0.14
47 0.14
48 0.13
49 0.13
50 0.13
51 0.1
52 0.09
53 0.09
54 0.09
55 0.08
56 0.07
57 0.07
58 0.09
59 0.09
60 0.08
61 0.09
62 0.09
63 0.11
64 0.11
65 0.09
66 0.08
67 0.08
68 0.08
69 0.06
70 0.06
71 0.05
72 0.05
73 0.06
74 0.09
75 0.09
76 0.09
77 0.09
78 0.09
79 0.09
80 0.1
81 0.09
82 0.07
83 0.07
84 0.07
85 0.07
86 0.07
87 0.07
88 0.06
89 0.07
90 0.08
91 0.08
92 0.09
93 0.09
94 0.1
95 0.12
96 0.13
97 0.12
98 0.1
99 0.1
100 0.09
101 0.09
102 0.09
103 0.06
104 0.07
105 0.07
106 0.07
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.06
111 0.06
112 0.05
113 0.05
114 0.05
115 0.06
116 0.06
117 0.08
118 0.08
119 0.08
120 0.11
121 0.12
122 0.13
123 0.17
124 0.17
125 0.18
126 0.19
127 0.23
128 0.22
129 0.22
130 0.27
131 0.23
132 0.23
133 0.26
134 0.27
135 0.23
136 0.23
137 0.24
138 0.18
139 0.18
140 0.16
141 0.11
142 0.09
143 0.08
144 0.06
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.07
159 0.08
160 0.08
161 0.11
162 0.13
163 0.19
164 0.21
165 0.24
166 0.27
167 0.32
168 0.39
169 0.41
170 0.41
171 0.42
172 0.46
173 0.45
174 0.47
175 0.42
176 0.34
177 0.31
178 0.34
179 0.28
180 0.22
181 0.22
182 0.22
183 0.25
184 0.25
185 0.27
186 0.29
187 0.29
188 0.31
189 0.31
190 0.26
191 0.28
192 0.27
193 0.25
194 0.19
195 0.18
196 0.16
197 0.17
198 0.16
199 0.14
200 0.17
201 0.22
202 0.28
203 0.32
204 0.33
205 0.38
206 0.4
207 0.38
208 0.38
209 0.39
210 0.36
211 0.33
212 0.33
213 0.26
214 0.26
215 0.24
216 0.21
217 0.16
218 0.1
219 0.08
220 0.07
221 0.07
222 0.05
223 0.06
224 0.07
225 0.08
226 0.11
227 0.17
228 0.27
229 0.34
230 0.43
231 0.52
232 0.62
233 0.72
234 0.8
235 0.84
236 0.83
237 0.87