Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A2V5IBD0

Protein Details
Accession A0A2V5IBD0    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
193-218SAIFHRRMRSHPTRRARRTRVPWSGFHydrophilic
284-315GRGVVRREWGGKKRRKTRKTRRRMEEGDLRGGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
278-306LRLRGGGRGVVRREWGGKKRRKTRKTRRR
Subcellular Location(s) plas 23, E.R. 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007568  RTA1  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF04479  RTA1  
Amino Acid Sequences MPTYLLYQYAPSLPAAIAATVCFGLLTICHAIHYCAQRTWFFTPFIIGGIFETTGYTGRIINSTQTPNWTTAPYIMQSLLLLVAPSLFAASIYMILARIIRLTDGDTRSVLPAHWITRVFVVGDVLAFLAQAGGELSPFLSTIRPLLADKSLNHSGGLLAKSNSSTTTKTANWIVITGLAIQIVFFAAFILVSAIFHRRMRSHPTRRARRTRVPWSGFLWVLYLTNALILGRSVFRVVEFAMGRDGVLQRREVWLYVFDGGVMALVMLLLLVWHPSRLRLRGGGRGVVRREWGGKKRRKTRKTRRRMEEGDLRGGWV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.14
3 0.12
4 0.1
5 0.1
6 0.11
7 0.09
8 0.09
9 0.06
10 0.06
11 0.05
12 0.05
13 0.09
14 0.1
15 0.1
16 0.11
17 0.11
18 0.13
19 0.19
20 0.25
21 0.25
22 0.26
23 0.29
24 0.31
25 0.36
26 0.38
27 0.36
28 0.32
29 0.28
30 0.28
31 0.25
32 0.24
33 0.19
34 0.14
35 0.11
36 0.11
37 0.11
38 0.08
39 0.08
40 0.08
41 0.08
42 0.09
43 0.09
44 0.09
45 0.09
46 0.11
47 0.11
48 0.14
49 0.18
50 0.22
51 0.22
52 0.26
53 0.26
54 0.27
55 0.28
56 0.26
57 0.22
58 0.2
59 0.21
60 0.18
61 0.17
62 0.15
63 0.14
64 0.12
65 0.12
66 0.1
67 0.07
68 0.06
69 0.04
70 0.04
71 0.04
72 0.04
73 0.04
74 0.03
75 0.03
76 0.03
77 0.04
78 0.04
79 0.04
80 0.04
81 0.04
82 0.05
83 0.05
84 0.05
85 0.05
86 0.05
87 0.05
88 0.05
89 0.08
90 0.13
91 0.14
92 0.15
93 0.16
94 0.16
95 0.17
96 0.17
97 0.14
98 0.12
99 0.13
100 0.13
101 0.16
102 0.16
103 0.15
104 0.16
105 0.17
106 0.13
107 0.11
108 0.1
109 0.07
110 0.06
111 0.06
112 0.05
113 0.04
114 0.03
115 0.03
116 0.02
117 0.02
118 0.02
119 0.02
120 0.02
121 0.02
122 0.03
123 0.03
124 0.03
125 0.03
126 0.04
127 0.04
128 0.04
129 0.05
130 0.05
131 0.06
132 0.07
133 0.08
134 0.1
135 0.12
136 0.13
137 0.19
138 0.21
139 0.2
140 0.19
141 0.18
142 0.16
143 0.17
144 0.17
145 0.11
146 0.09
147 0.09
148 0.1
149 0.1
150 0.11
151 0.1
152 0.11
153 0.11
154 0.15
155 0.15
156 0.17
157 0.18
158 0.18
159 0.16
160 0.16
161 0.14
162 0.1
163 0.1
164 0.08
165 0.07
166 0.05
167 0.05
168 0.04
169 0.04
170 0.03
171 0.03
172 0.03
173 0.02
174 0.02
175 0.02
176 0.02
177 0.03
178 0.03
179 0.03
180 0.04
181 0.06
182 0.09
183 0.1
184 0.12
185 0.14
186 0.17
187 0.27
188 0.37
189 0.45
190 0.53
191 0.63
192 0.72
193 0.8
194 0.87
195 0.87
196 0.86
197 0.85
198 0.86
199 0.85
200 0.79
201 0.72
202 0.65
203 0.6
204 0.5
205 0.41
206 0.31
207 0.21
208 0.17
209 0.13
210 0.1
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.05
215 0.04
216 0.04
217 0.05
218 0.05
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.07
223 0.08
224 0.08
225 0.12
226 0.12
227 0.12
228 0.13
229 0.13
230 0.13
231 0.14
232 0.16
233 0.15
234 0.16
235 0.17
236 0.17
237 0.2
238 0.21
239 0.19
240 0.19
241 0.16
242 0.17
243 0.17
244 0.15
245 0.12
246 0.11
247 0.1
248 0.08
249 0.06
250 0.04
251 0.03
252 0.02
253 0.02
254 0.02
255 0.02
256 0.02
257 0.02
258 0.04
259 0.04
260 0.06
261 0.07
262 0.13
263 0.19
264 0.23
265 0.27
266 0.32
267 0.36
268 0.43
269 0.47
270 0.48
271 0.47
272 0.52
273 0.51
274 0.47
275 0.46
276 0.4
277 0.43
278 0.46
279 0.5
280 0.54
281 0.6
282 0.68
283 0.76
284 0.84
285 0.87
286 0.9
287 0.92
288 0.93
289 0.94
290 0.95
291 0.94
292 0.93
293 0.89
294 0.87
295 0.86
296 0.81
297 0.78