Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2V5H9M7

Protein Details
Accession A0A2V5H9M7    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
66-90FQPTKRPQLATQKPKPKPTLPKAPIHydrophilic
116-144GFYAGPKRQRGGRKKRKKNREVQEFIQNWHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
121-135PKRQRGGRKKRKKNR
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_nucl 13.5, cyto 11
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000467  G_patch_dom  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR040052  RBM17  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF01585  G-patch  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50174  G_PATCH  
Amino Acid Sequences MSSDPAPPKPGGGLSLYANLLDPSADNSPGTISRAPVVFRQGAEAEAHPDDPAAKKQQLSAASLRFQPTKRPQLATQKPKPKPTLPKAPIAATPAAASVKTTLADWAATEDDDVNGFYAGPKRQRGGRKKRKKNREVQEFIQNWDDIYDPSRPNNYEEYKHSDEQIAEIREWKDRLYAHRMARSPSRDSYSEDDDYARPRNRQFAPPGSFAPPPGLNDAAPRPPVESPPPEERIETQDDVSMGGIPPPPPPDEPPAHVPDDPTGEDAYLRRIQMSTAGSSAVPPPPPPSRPLDVLQPASATISRAPVRYTLPPPPEDIPASEAELEEVFAKEQPVDDEPGDDGQRSLRPGQKGFAERLMAKYGWTKGSGLGATGSGIVKPLQVKVEKQKKRPDSEGGGFVTPAGRGKVIGGARKSEEEGKFGPMSEVIVLKGMLDGMDLEAELAGDGESGGLMQEIGEECSDKYGRVERVYIPRESTKPPVPVFVKFTNQLSALRAVNALEGRIFNGNAITARFYDTQRFEEGDYDG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.24
3 0.23
4 0.2
5 0.2
6 0.17
7 0.15
8 0.12
9 0.1
10 0.1
11 0.12
12 0.13
13 0.13
14 0.13
15 0.16
16 0.17
17 0.2
18 0.18
19 0.17
20 0.19
21 0.22
22 0.23
23 0.24
24 0.29
25 0.28
26 0.26
27 0.29
28 0.26
29 0.25
30 0.26
31 0.24
32 0.22
33 0.2
34 0.2
35 0.16
36 0.16
37 0.17
38 0.17
39 0.23
40 0.25
41 0.27
42 0.28
43 0.31
44 0.36
45 0.37
46 0.39
47 0.4
48 0.37
49 0.38
50 0.4
51 0.41
52 0.41
53 0.39
54 0.44
55 0.48
56 0.53
57 0.56
58 0.57
59 0.61
60 0.67
61 0.76
62 0.77
63 0.78
64 0.78
65 0.79
66 0.83
67 0.82
68 0.8
69 0.8
70 0.79
71 0.8
72 0.73
73 0.75
74 0.69
75 0.65
76 0.59
77 0.52
78 0.43
79 0.32
80 0.29
81 0.22
82 0.19
83 0.16
84 0.14
85 0.11
86 0.11
87 0.1
88 0.1
89 0.09
90 0.09
91 0.09
92 0.09
93 0.1
94 0.09
95 0.09
96 0.09
97 0.09
98 0.09
99 0.09
100 0.09
101 0.07
102 0.06
103 0.06
104 0.08
105 0.12
106 0.17
107 0.22
108 0.25
109 0.27
110 0.34
111 0.45
112 0.54
113 0.61
114 0.68
115 0.73
116 0.82
117 0.9
118 0.94
119 0.94
120 0.94
121 0.93
122 0.93
123 0.89
124 0.82
125 0.82
126 0.72
127 0.64
128 0.57
129 0.46
130 0.35
131 0.28
132 0.24
133 0.14
134 0.14
135 0.17
136 0.15
137 0.18
138 0.23
139 0.23
140 0.25
141 0.32
142 0.34
143 0.33
144 0.36
145 0.42
146 0.43
147 0.43
148 0.41
149 0.36
150 0.32
151 0.31
152 0.32
153 0.26
154 0.2
155 0.23
156 0.23
157 0.24
158 0.25
159 0.23
160 0.2
161 0.21
162 0.26
163 0.29
164 0.35
165 0.37
166 0.43
167 0.44
168 0.44
169 0.48
170 0.47
171 0.44
172 0.4
173 0.4
174 0.35
175 0.37
176 0.38
177 0.37
178 0.33
179 0.29
180 0.28
181 0.25
182 0.27
183 0.3
184 0.29
185 0.26
186 0.27
187 0.34
188 0.35
189 0.4
190 0.43
191 0.45
192 0.47
193 0.46
194 0.47
195 0.43
196 0.4
197 0.34
198 0.31
199 0.23
200 0.19
201 0.18
202 0.17
203 0.13
204 0.15
205 0.18
206 0.17
207 0.17
208 0.16
209 0.15
210 0.15
211 0.18
212 0.2
213 0.2
214 0.22
215 0.27
216 0.31
217 0.3
218 0.3
219 0.29
220 0.29
221 0.3
222 0.26
223 0.21
224 0.18
225 0.17
226 0.17
227 0.15
228 0.11
229 0.07
230 0.07
231 0.08
232 0.07
233 0.08
234 0.1
235 0.11
236 0.12
237 0.14
238 0.18
239 0.19
240 0.22
241 0.25
242 0.27
243 0.27
244 0.26
245 0.24
246 0.2
247 0.21
248 0.18
249 0.15
250 0.12
251 0.09
252 0.1
253 0.1
254 0.13
255 0.12
256 0.12
257 0.11
258 0.11
259 0.11
260 0.15
261 0.16
262 0.13
263 0.11
264 0.11
265 0.11
266 0.11
267 0.13
268 0.11
269 0.1
270 0.09
271 0.13
272 0.16
273 0.18
274 0.2
275 0.23
276 0.24
277 0.27
278 0.28
279 0.3
280 0.31
281 0.31
282 0.29
283 0.24
284 0.21
285 0.18
286 0.17
287 0.12
288 0.08
289 0.11
290 0.12
291 0.13
292 0.13
293 0.15
294 0.17
295 0.21
296 0.24
297 0.27
298 0.29
299 0.29
300 0.32
301 0.31
302 0.31
303 0.27
304 0.24
305 0.2
306 0.17
307 0.17
308 0.14
309 0.12
310 0.1
311 0.1
312 0.09
313 0.07
314 0.06
315 0.06
316 0.06
317 0.06
318 0.06
319 0.06
320 0.08
321 0.09
322 0.11
323 0.11
324 0.11
325 0.11
326 0.14
327 0.14
328 0.12
329 0.11
330 0.1
331 0.12
332 0.13
333 0.17
334 0.2
335 0.23
336 0.24
337 0.27
338 0.31
339 0.32
340 0.32
341 0.32
342 0.3
343 0.27
344 0.29
345 0.29
346 0.23
347 0.21
348 0.23
349 0.22
350 0.2
351 0.2
352 0.19
353 0.16
354 0.19
355 0.18
356 0.14
357 0.12
358 0.11
359 0.1
360 0.1
361 0.09
362 0.06
363 0.07
364 0.07
365 0.08
366 0.09
367 0.11
368 0.14
369 0.17
370 0.22
371 0.32
372 0.42
373 0.49
374 0.56
375 0.64
376 0.68
377 0.73
378 0.73
379 0.7
380 0.68
381 0.64
382 0.62
383 0.54
384 0.46
385 0.39
386 0.33
387 0.26
388 0.19
389 0.16
390 0.11
391 0.08
392 0.08
393 0.09
394 0.15
395 0.17
396 0.23
397 0.23
398 0.25
399 0.27
400 0.29
401 0.3
402 0.32
403 0.3
404 0.28
405 0.28
406 0.29
407 0.28
408 0.27
409 0.25
410 0.18
411 0.18
412 0.15
413 0.14
414 0.09
415 0.1
416 0.09
417 0.08
418 0.08
419 0.07
420 0.06
421 0.05
422 0.05
423 0.04
424 0.05
425 0.04
426 0.04
427 0.04
428 0.04
429 0.04
430 0.04
431 0.03
432 0.03
433 0.03
434 0.03
435 0.03
436 0.03
437 0.03
438 0.03
439 0.03
440 0.03
441 0.05
442 0.05
443 0.07
444 0.07
445 0.08
446 0.08
447 0.13
448 0.14
449 0.13
450 0.16
451 0.22
452 0.26
453 0.28
454 0.32
455 0.34
456 0.44
457 0.47
458 0.47
459 0.45
460 0.47
461 0.48
462 0.5
463 0.5
464 0.47
465 0.51
466 0.49
467 0.53
468 0.49
469 0.5
470 0.52
471 0.5
472 0.49
473 0.45
474 0.46
475 0.41
476 0.39
477 0.36
478 0.32
479 0.31
480 0.26
481 0.24
482 0.23
483 0.19
484 0.21
485 0.2
486 0.18
487 0.15
488 0.14
489 0.15
490 0.18
491 0.17
492 0.14
493 0.14
494 0.15
495 0.14
496 0.16
497 0.16
498 0.14
499 0.19
500 0.21
501 0.23
502 0.3
503 0.32
504 0.34
505 0.35
506 0.36
507 0.33