Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A395HH88

Protein Details
Accession A0A395HH88    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
97-124SVTSRPPSTPRSPKRKPRSVLKPDQPSHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
107-114RSPKRKPR
Subcellular Location(s) mito 13, nucl 6, extr 4, cyto_nucl 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR043519  NT_sf  
IPR045862  Trf4-like  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0031499  C:TRAMP complex  
GO:0043631  P:RNA polyadenylation  
Amino Acid Sequences MRVLCPSRRQPLSFTSVAPYLKSSLPLLSQARCFHESRSSSKNSAIFQHSLQRTLEAHRSSNRASLIRRVPGKADPEDTPEDAAKGEVPSFNSPTASVTSRPPSTPRSPKRKPRSVLKPDQPSHTSQPTVLHRSIRWNPDPKNGRSAQSPWLEDLDSTLSFSDGLSQLDAEICALEKYLRPTPPEEEQVYTVATDVARWLEGTVPHGPLIIGSWRTGLAMSHSDLDLLLPVPDSVRSIESVRKPSATRPKALNLHRSLLRDVEQTLRKCPSFDHHIYRSTEMGSITAIHSRTGLRLRFYCGEGSPPIIEYIRDYCAEYPSLRPLYMATRLILESQGVYGRHASSITSEALVMLVVAFLKMNHGRFRRSDNLGETLLALLQMYGTQVDFAKTGISVDPPEFFDADTIKIASRMHGLDDIPAHLRGQRAIINLRRTAAVRGNKVAATRLCLQNPTNYMDDLGRSCIETTALKSALAGAYERLGTALDTWERFPLVDPNRSVLSRILHANFDDFNDVRRRLALGGRAST
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.42
3 0.41
4 0.39
5 0.35
6 0.3
7 0.26
8 0.25
9 0.25
10 0.22
11 0.2
12 0.2
13 0.27
14 0.29
15 0.3
16 0.34
17 0.36
18 0.41
19 0.42
20 0.42
21 0.38
22 0.43
23 0.43
24 0.43
25 0.48
26 0.48
27 0.46
28 0.51
29 0.52
30 0.45
31 0.48
32 0.48
33 0.42
34 0.39
35 0.46
36 0.42
37 0.41
38 0.38
39 0.35
40 0.31
41 0.34
42 0.39
43 0.33
44 0.36
45 0.38
46 0.42
47 0.41
48 0.44
49 0.43
50 0.4
51 0.39
52 0.44
53 0.46
54 0.48
55 0.51
56 0.48
57 0.47
58 0.48
59 0.51
60 0.46
61 0.43
62 0.37
63 0.38
64 0.4
65 0.38
66 0.35
67 0.29
68 0.25
69 0.21
70 0.2
71 0.16
72 0.12
73 0.13
74 0.13
75 0.16
76 0.19
77 0.21
78 0.22
79 0.21
80 0.2
81 0.2
82 0.22
83 0.21
84 0.19
85 0.21
86 0.27
87 0.28
88 0.3
89 0.32
90 0.36
91 0.43
92 0.52
93 0.58
94 0.62
95 0.7
96 0.79
97 0.86
98 0.89
99 0.87
100 0.86
101 0.88
102 0.87
103 0.88
104 0.87
105 0.87
106 0.8
107 0.79
108 0.72
109 0.66
110 0.62
111 0.56
112 0.47
113 0.38
114 0.41
115 0.41
116 0.44
117 0.41
118 0.39
119 0.35
120 0.43
121 0.49
122 0.5
123 0.51
124 0.53
125 0.54
126 0.6
127 0.67
128 0.6
129 0.62
130 0.57
131 0.52
132 0.48
133 0.47
134 0.45
135 0.42
136 0.41
137 0.33
138 0.32
139 0.3
140 0.25
141 0.23
142 0.19
143 0.13
144 0.12
145 0.11
146 0.09
147 0.09
148 0.09
149 0.1
150 0.08
151 0.08
152 0.08
153 0.08
154 0.08
155 0.08
156 0.08
157 0.05
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.05
162 0.05
163 0.07
164 0.11
165 0.17
166 0.19
167 0.21
168 0.24
169 0.28
170 0.32
171 0.35
172 0.33
173 0.29
174 0.28
175 0.27
176 0.24
177 0.2
178 0.16
179 0.11
180 0.09
181 0.07
182 0.06
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.06
187 0.07
188 0.07
189 0.11
190 0.12
191 0.12
192 0.12
193 0.12
194 0.12
195 0.1
196 0.11
197 0.1
198 0.09
199 0.08
200 0.09
201 0.09
202 0.09
203 0.09
204 0.08
205 0.07
206 0.08
207 0.09
208 0.09
209 0.09
210 0.09
211 0.09
212 0.09
213 0.07
214 0.05
215 0.05
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.05
220 0.05
221 0.06
222 0.06
223 0.07
224 0.09
225 0.14
226 0.18
227 0.23
228 0.23
229 0.25
230 0.25
231 0.32
232 0.41
233 0.39
234 0.39
235 0.37
236 0.43
237 0.48
238 0.52
239 0.53
240 0.45
241 0.46
242 0.45
243 0.44
244 0.38
245 0.32
246 0.29
247 0.21
248 0.19
249 0.21
250 0.23
251 0.22
252 0.25
253 0.26
254 0.25
255 0.24
256 0.24
257 0.23
258 0.25
259 0.29
260 0.33
261 0.33
262 0.39
263 0.4
264 0.41
265 0.36
266 0.29
267 0.25
268 0.18
269 0.15
270 0.1
271 0.09
272 0.08
273 0.1
274 0.1
275 0.08
276 0.09
277 0.09
278 0.12
279 0.17
280 0.18
281 0.18
282 0.19
283 0.23
284 0.24
285 0.25
286 0.24
287 0.19
288 0.2
289 0.18
290 0.18
291 0.14
292 0.13
293 0.12
294 0.11
295 0.11
296 0.09
297 0.11
298 0.11
299 0.12
300 0.12
301 0.12
302 0.14
303 0.15
304 0.14
305 0.14
306 0.18
307 0.19
308 0.18
309 0.17
310 0.17
311 0.18
312 0.22
313 0.21
314 0.16
315 0.16
316 0.16
317 0.17
318 0.15
319 0.12
320 0.08
321 0.08
322 0.1
323 0.09
324 0.09
325 0.1
326 0.11
327 0.11
328 0.11
329 0.1
330 0.09
331 0.11
332 0.11
333 0.1
334 0.09
335 0.08
336 0.08
337 0.08
338 0.06
339 0.04
340 0.03
341 0.03
342 0.03
343 0.03
344 0.03
345 0.07
346 0.1
347 0.12
348 0.19
349 0.22
350 0.26
351 0.28
352 0.36
353 0.39
354 0.41
355 0.44
356 0.4
357 0.42
358 0.39
359 0.37
360 0.29
361 0.22
362 0.18
363 0.13
364 0.09
365 0.05
366 0.04
367 0.04
368 0.04
369 0.04
370 0.04
371 0.05
372 0.05
373 0.06
374 0.07
375 0.07
376 0.07
377 0.06
378 0.08
379 0.08
380 0.09
381 0.09
382 0.1
383 0.12
384 0.13
385 0.14
386 0.13
387 0.13
388 0.13
389 0.12
390 0.13
391 0.12
392 0.12
393 0.1
394 0.12
395 0.12
396 0.12
397 0.14
398 0.13
399 0.14
400 0.16
401 0.16
402 0.17
403 0.18
404 0.18
405 0.17
406 0.17
407 0.16
408 0.15
409 0.16
410 0.15
411 0.16
412 0.18
413 0.2
414 0.27
415 0.33
416 0.37
417 0.37
418 0.38
419 0.37
420 0.35
421 0.35
422 0.36
423 0.37
424 0.36
425 0.37
426 0.39
427 0.38
428 0.38
429 0.4
430 0.32
431 0.3
432 0.32
433 0.34
434 0.34
435 0.36
436 0.37
437 0.37
438 0.39
439 0.38
440 0.33
441 0.28
442 0.27
443 0.24
444 0.26
445 0.21
446 0.21
447 0.17
448 0.16
449 0.16
450 0.15
451 0.16
452 0.15
453 0.17
454 0.2
455 0.2
456 0.19
457 0.18
458 0.2
459 0.19
460 0.18
461 0.16
462 0.1
463 0.11
464 0.12
465 0.12
466 0.1
467 0.09
468 0.08
469 0.09
470 0.13
471 0.15
472 0.16
473 0.17
474 0.19
475 0.19
476 0.19
477 0.2
478 0.25
479 0.28
480 0.34
481 0.34
482 0.37
483 0.4
484 0.4
485 0.4
486 0.35
487 0.33
488 0.29
489 0.34
490 0.33
491 0.31
492 0.32
493 0.33
494 0.29
495 0.28
496 0.3
497 0.23
498 0.26
499 0.31
500 0.31
501 0.29
502 0.3
503 0.3
504 0.27
505 0.32
506 0.34