FuNGI

A0A395HCW6

Protein Details

Accession

A0A395HCW6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
2-26	ATAISKPTSHTPKMKRPPPPFVQTG	Hydrophilic
421-440	SPLHRDPPPSPKRRKRTVAE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
431-435	PKRRK

Subcellular Location(s)

nucl 14.5, mito 9.5, cyto_nucl 9.333, cyto_mito 6.833

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR021950 Spt20 IPR046468 Spt20-like_SEP
Gene Ontology	GO:0000124 C:SAGA complex GO:0003712 F:transcription coregulator activity
Pfam	View protein in Pfam PF12090 Spt20

Amino Acid Sequences

MATAISKPTSHTPKMKRPPPPFVQTGVNGVKSQQSSSSSPPSSAKRLPGATQPTSASSASGSLLNGANGAANSGTASNKGPLNRPKKEAQKPGDQASRTQKPLLRSLSIDNDRRAGNRCPEPYVKSSSYILKKFAKCQPSLILHLHPTHFRFEQQDGSFPYNSEMKVIIEHIRAGTVPHDMMEELLRANVRFYEGTLPHASGSPASGCLIVRVVDHKSVSAQARKSTAPSSNESNTPFSIHNYNEHVTPSAYVPYPKQSQLNSEKSVAKETSTASQPDNKANGEQAGDSGSRAEEATSNSTQPKQPPKPRVFTTVLHPTPRSLQAELTLLATTPDPKAAKQPASNASSRTQASSTTAPPSPGASSSQPDRGPVPKRQKMLVEPQDFLECESKLTRALAPPLFLDPVDSFDAMQDLLKYMESPLHRDPPPSPKRRKRTVAELAADEALAAEEERFMLIMDERLEPTTSGGAGGPKSAVVDDTGGGAPFEPRFSRFKTLENIRMQHEEKAKREHEVKLKQELAKRQQQEQERERRRALEQRQAEENAKEEARRQHIAAQQAQAQLAVQQQNRHVMAQTNGVSQAPQSSPVVRNQTPHNISSPVVGSTIATQAGVPMSMTPSMQGAGSPPRPPSALQHAHPTVMSHPMAPSRSQQGQSRHGTPQMTQGTPAMSHATPIMRNVTPTQRMSHASPSHSTMAPTPVMNQATMMGTPQMGSQMGLTPQQQQQQQQQQMLFQQRQQLLATQGHMAQNQFSPKQVAQMQANAHAQQNIQAHQQQMLQAQQQNFQAQPKFSNSQAYQAQLMRAQLAQMHMAQQQQQQSQGQQSQTQQGQVHQNSPHMNPQQQMLIAAAQANGGLRQNLQGGNVPQSLSFAQRYQQLFAQRLVRLRQEMAAKYVPQYGSPSQFPPNIQQQYTTGLENAAKVWVQEIMRRERDMVQHRATQVAAVQAQVMQQQQQQNMMQNSRGNS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.75
2	0.8
3	0.82
4	0.82
5	0.85
6	0.84
7	0.82
8	0.75
9	0.69
10	0.67
11	0.58
12	0.58
13	0.53
14	0.47
15	0.39
16	0.36
17	0.38
18	0.32
19	0.32
20	0.27
21	0.27
22	0.29
23	0.34
24	0.43
25	0.38
26	0.4
27	0.44
28	0.46
29	0.48
30	0.49
31	0.49
32	0.47
33	0.5
34	0.5
35	0.53
36	0.55
37	0.51
38	0.49
39	0.45
40	0.41
41	0.4
42	0.37
43	0.29
44	0.21
45	0.19
46	0.16
47	0.16
48	0.13
49	0.12
50	0.13
51	0.12
52	0.12
53	0.11
54	0.11
55	0.09
56	0.1
57	0.07
58	0.06
59	0.07
60	0.08
61	0.09
62	0.09
63	0.11
64	0.14
65	0.17
66	0.2
67	0.28
68	0.37
69	0.47
70	0.52
71	0.55
72	0.61
73	0.69
74	0.76
75	0.78
76	0.75
77	0.75
78	0.75
79	0.78
80	0.77
81	0.68
82	0.65
83	0.65
84	0.66
85	0.59
86	0.58
87	0.53
88	0.49
89	0.57
90	0.55
91	0.48
92	0.42
93	0.44
94	0.48
95	0.53
96	0.54
97	0.48
98	0.46
99	0.44
100	0.44
101	0.44
102	0.41
103	0.41
104	0.44
105	0.45
106	0.48
107	0.52
108	0.55
109	0.54
110	0.55
111	0.49
112	0.43
113	0.43
114	0.46
115	0.49
116	0.47
117	0.48
118	0.49
119	0.51
120	0.55
121	0.61
122	0.6
123	0.53
124	0.54
125	0.55
126	0.52
127	0.53
128	0.5
129	0.46
130	0.42
131	0.45
132	0.43
133	0.39
134	0.36
135	0.36
136	0.33
137	0.31
138	0.31
139	0.3
140	0.36
141	0.33
142	0.37
143	0.36
144	0.39
145	0.37
146	0.33
147	0.33
148	0.28
149	0.27
150	0.22
151	0.19
152	0.15
153	0.15
154	0.18
155	0.19
156	0.17
157	0.18
158	0.16
159	0.16
160	0.15
161	0.15
162	0.14
163	0.12
164	0.11
165	0.1
166	0.11
167	0.1
168	0.11
169	0.11
170	0.1
171	0.08
172	0.1
173	0.1
174	0.1
175	0.11
176	0.1
177	0.12
178	0.11
179	0.12
180	0.19
181	0.18
182	0.23
183	0.24
184	0.24
185	0.22
186	0.23
187	0.22
188	0.14
189	0.15
190	0.11
191	0.1
192	0.1
193	0.11
194	0.1
195	0.1
196	0.11
197	0.1
198	0.1
199	0.12
200	0.14
201	0.16
202	0.16
203	0.16
204	0.16
205	0.21
206	0.26
207	0.29
208	0.29
209	0.3
210	0.33
211	0.33
212	0.35
213	0.34
214	0.35
215	0.33
216	0.34
217	0.37
218	0.36
219	0.39
220	0.39
221	0.38
222	0.32
223	0.3
224	0.27
225	0.24
226	0.25
227	0.23
228	0.24
229	0.26
230	0.26
231	0.25
232	0.25
233	0.24
234	0.19
235	0.19
236	0.16
237	0.15
238	0.15
239	0.15
240	0.16
241	0.21
242	0.24
243	0.25
244	0.28
245	0.27
246	0.34
247	0.42
248	0.47
249	0.44
250	0.45
251	0.46
252	0.43
253	0.47
254	0.38
255	0.3
256	0.25
257	0.24
258	0.24
259	0.23
260	0.24
261	0.21
262	0.27
263	0.28
264	0.31
265	0.33
266	0.29
267	0.27
268	0.26
269	0.26
270	0.2
271	0.18
272	0.13
273	0.13
274	0.12
275	0.11
276	0.1
277	0.08
278	0.08
279	0.08
280	0.08
281	0.07
282	0.1
283	0.15
284	0.15
285	0.17
286	0.19
287	0.21
288	0.24
289	0.29
290	0.37
291	0.42
292	0.5
293	0.59
294	0.64
295	0.69
296	0.69
297	0.7
298	0.64
299	0.56
300	0.54
301	0.54
302	0.5
303	0.46
304	0.43
305	0.36
306	0.36
307	0.39
308	0.34
309	0.25
310	0.22
311	0.21
312	0.22
313	0.21
314	0.18
315	0.13
316	0.1
317	0.1
318	0.1
319	0.09
320	0.07
321	0.11
322	0.11
323	0.11
324	0.18
325	0.23
326	0.27
327	0.28
328	0.34
329	0.37
330	0.4
331	0.41
332	0.37
333	0.34
334	0.33
335	0.32
336	0.27
337	0.21
338	0.18
339	0.2
340	0.2
341	0.2
342	0.19
343	0.2
344	0.19
345	0.19
346	0.19
347	0.17
348	0.15
349	0.16
350	0.14
351	0.16
352	0.17
353	0.23
354	0.21
355	0.22
356	0.23
357	0.27
358	0.3
359	0.37
360	0.45
361	0.45
362	0.47
363	0.49
364	0.5
365	0.48
366	0.54
367	0.55
368	0.47
369	0.42
370	0.41
371	0.4
372	0.36
373	0.33
374	0.25
375	0.15
376	0.13
377	0.13
378	0.12
379	0.12
380	0.13
381	0.13
382	0.12
383	0.17
384	0.16
385	0.16
386	0.16
387	0.17
388	0.16
389	0.14
390	0.14
391	0.09
392	0.12
393	0.12
394	0.11
395	0.1
396	0.1
397	0.1
398	0.08
399	0.08
400	0.05
401	0.05
402	0.05
403	0.05
404	0.05
405	0.05
406	0.09
407	0.09
408	0.14
409	0.16
410	0.23
411	0.23
412	0.25
413	0.28
414	0.35
415	0.44
416	0.49
417	0.57
418	0.6
419	0.69
420	0.76
421	0.82
422	0.76
423	0.76
424	0.76
425	0.73
426	0.66
427	0.57
428	0.49
429	0.41
430	0.36
431	0.25
432	0.15
433	0.07
434	0.05
435	0.04
436	0.03
437	0.02
438	0.03
439	0.03
440	0.03
441	0.03
442	0.03
443	0.03
444	0.05
445	0.07
446	0.07
447	0.08
448	0.09
449	0.09
450	0.08
451	0.09
452	0.08
453	0.06
454	0.06
455	0.06
456	0.07
457	0.06
458	0.06
459	0.06
460	0.05
461	0.06
462	0.05
463	0.05
464	0.04
465	0.04
466	0.04
467	0.06
468	0.06
469	0.06
470	0.06
471	0.05
472	0.06
473	0.06
474	0.07
475	0.06
476	0.08
477	0.11
478	0.14
479	0.2
480	0.21
481	0.24
482	0.3
483	0.35
484	0.41
485	0.43
486	0.42
487	0.38
488	0.42
489	0.4
490	0.38
491	0.4
492	0.37
493	0.35
494	0.4
495	0.39
496	0.38
497	0.4
498	0.41
499	0.43
500	0.45
501	0.46
502	0.46
503	0.5
504	0.49
505	0.5
506	0.52
507	0.5
508	0.5
509	0.48
510	0.46
511	0.48
512	0.51
513	0.56
514	0.56
515	0.61
516	0.6
517	0.63
518	0.59
519	0.56
520	0.53
521	0.53
522	0.51
523	0.49
524	0.46
525	0.45
526	0.47
527	0.47
528	0.45
529	0.36
530	0.32
531	0.25
532	0.21
533	0.18
534	0.18
535	0.21
536	0.24
537	0.25
538	0.24
539	0.27
540	0.3
541	0.35
542	0.34
543	0.31
544	0.29
545	0.29
546	0.28
547	0.22
548	0.18
549	0.14
550	0.15
551	0.18
552	0.16
553	0.17
554	0.18
555	0.23
556	0.24
557	0.23
558	0.2
559	0.18
560	0.18
561	0.21
562	0.2
563	0.16
564	0.16
565	0.16
566	0.15
567	0.13
568	0.15
569	0.1
570	0.1
571	0.1
572	0.13
573	0.15
574	0.2
575	0.27
576	0.25
577	0.27
578	0.29
579	0.37
580	0.37
581	0.36
582	0.33
583	0.28
584	0.27
585	0.26
586	0.24
587	0.15
588	0.13
589	0.12
590	0.09
591	0.09
592	0.09
593	0.08
594	0.07
595	0.06
596	0.06
597	0.06
598	0.06
599	0.05
600	0.04
601	0.05
602	0.06
603	0.06
604	0.06
605	0.06
606	0.06
607	0.06
608	0.06
609	0.07
610	0.12
611	0.15
612	0.17
613	0.17
614	0.18
615	0.19
616	0.2
617	0.23
618	0.27
619	0.31
620	0.3
621	0.37
622	0.37
623	0.36
624	0.36
625	0.32
626	0.23
627	0.22
628	0.21
629	0.14
630	0.14
631	0.17
632	0.18
633	0.18
634	0.2
635	0.2
636	0.25
637	0.28
638	0.33
639	0.36
640	0.43
641	0.47
642	0.48
643	0.45
644	0.44
645	0.42
646	0.36
647	0.39
648	0.36
649	0.31
650	0.28
651	0.26
652	0.23
653	0.22
654	0.22
655	0.17
656	0.11
657	0.11
658	0.12
659	0.13
660	0.13
661	0.14
662	0.18
663	0.15
664	0.17
665	0.2
666	0.25
667	0.28
668	0.29
669	0.3
670	0.29
671	0.32
672	0.33
673	0.39
674	0.36
675	0.33
676	0.34
677	0.35
678	0.35
679	0.32
680	0.3
681	0.23
682	0.23
683	0.21
684	0.19
685	0.17
686	0.19
687	0.19
688	0.18
689	0.17
690	0.14
691	0.14
692	0.14
693	0.12
694	0.08
695	0.07
696	0.07
697	0.07
698	0.07
699	0.07
700	0.07
701	0.07
702	0.09
703	0.1
704	0.12
705	0.13
706	0.16
707	0.2
708	0.25
709	0.28
710	0.3
711	0.38
712	0.46
713	0.5
714	0.49
715	0.47
716	0.44
717	0.47
718	0.51
719	0.44
720	0.37
721	0.39
722	0.36
723	0.37
724	0.35
725	0.32
726	0.28
727	0.28
728	0.26
729	0.2
730	0.22
731	0.22
732	0.23
733	0.2
734	0.18
735	0.19
736	0.23
737	0.22
738	0.2
739	0.22
740	0.21
741	0.27
742	0.28
743	0.3
744	0.27
745	0.32
746	0.32
747	0.34
748	0.36
749	0.32
750	0.3
751	0.26
752	0.24
753	0.24
754	0.26
755	0.22
756	0.24
757	0.25
758	0.24
759	0.25
760	0.27
761	0.24
762	0.24
763	0.25
764	0.26
765	0.28
766	0.29
767	0.31
768	0.33
769	0.33
770	0.31
771	0.34
772	0.32
773	0.29
774	0.31
775	0.33
776	0.33
777	0.32
778	0.39
779	0.34
780	0.37
781	0.38
782	0.37
783	0.35
784	0.33
785	0.34
786	0.27
787	0.27
788	0.22
789	0.19
790	0.17
791	0.15
792	0.15
793	0.15
794	0.13
795	0.15
796	0.16
797	0.18
798	0.22
799	0.24
800	0.29
801	0.29
802	0.32
803	0.32
804	0.33
805	0.38
806	0.39
807	0.37
808	0.36
809	0.37
810	0.41
811	0.4
812	0.42
813	0.37
814	0.37
815	0.44
816	0.42
817	0.45
818	0.39
819	0.42
820	0.41
821	0.42
822	0.46
823	0.42
824	0.43
825	0.38
826	0.38
827	0.36
828	0.32
829	0.31
830	0.23
831	0.18
832	0.15
833	0.15
834	0.12
835	0.09
836	0.09
837	0.08
838	0.09
839	0.09
840	0.09
841	0.09
842	0.11
843	0.14
844	0.14
845	0.16
846	0.2
847	0.21
848	0.25
849	0.26
850	0.25
851	0.22
852	0.23
853	0.23
854	0.21
855	0.22
856	0.18
857	0.19
858	0.26
859	0.28
860	0.29
861	0.32
862	0.35
863	0.35
864	0.38
865	0.42
866	0.38
867	0.42
868	0.43
869	0.45
870	0.41
871	0.4
872	0.4
873	0.41
874	0.4
875	0.4
876	0.4
877	0.36
878	0.35
879	0.39
880	0.35
881	0.29
882	0.33
883	0.32
884	0.33
885	0.34
886	0.36
887	0.35
888	0.38
889	0.39
890	0.4
891	0.46
892	0.47
893	0.45
894	0.43
895	0.4
896	0.42
897	0.42
898	0.36
899	0.26
900	0.22
901	0.23
902	0.21
903	0.2
904	0.16
905	0.14
906	0.13
907	0.13
908	0.16
909	0.16
910	0.2
911	0.26
912	0.33
913	0.38
914	0.39
915	0.41
916	0.42
917	0.5
918	0.54
919	0.56
920	0.52
921	0.54
922	0.53
923	0.53
924	0.47
925	0.39
926	0.33
927	0.3
928	0.25
929	0.19
930	0.18
931	0.16
932	0.18
933	0.2
934	0.19
935	0.17
936	0.21
937	0.27
938	0.28
939	0.33
940	0.36
941	0.41
942	0.46
943	0.46
944	0.46

A0A395HCW6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer