FuNGI

A0A395HCN4

Protein Details

Accession

A0A395HCN4

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
271-296	AVEKAKATVKRRERKKNQPHPLNFSA	Hydrophilic
496-518	LLEKWKEEERRKRRAEKGLPSDG	Basic
668-724	KTDRSEHKSVTAKRKERKEDQGKSTTNKEKARKKNFLMTLGKAKSKNKRSLVQTRAV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
262-287	NKKTRKKSRAVEKAKATVKRRERKKN
465-466	RG
476-479	GERK
503-511	EERRKRRAE
664-739	AKEGKTDRSEHKSVTAKRKERKEDQGKSTTNKEKARKKNFLMTLGKAKSKNKRSLVQTRAVLKAHQDRAKRGGRRG

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, cyto_nucl 12.5, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016024 ARM-type_fold IPR027312 Sda1 IPR007949 SDA1_C IPR012977 SDA1_N
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0015031 P:protein transport GO:0042273 P:ribosomal large subunit biogenesis GO:0000055 P:ribosomal large subunit export from nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF08158 NUC130_3NT PF05285 SDA1

Amino Acid Sequences

MVKRKLGALEKVEADLPNLQHKIRRDPKSYIEDFRAQHYQYESHREIFMAAPAATTETGLISLRELIDFLAHVADCYPEILKDFPQQLIDILTQHHLILQPELREKIVGSLVLLRKKELMDSATLLQTLFPILISTPSKTLRALLFQKILMDLRSSNAKTTNHKLNRTMQTVLYNLVTSDRTSSKGLWAIKLTRELWKRQIWTDAKAVEVMKEASLADNEKVIVGGVRFFLGGDKEREEMEDESSDEEAIDLGKVKHQVGINKKTRKKSRAVEKAKATVKRRERKKNQPHPLNFSALHLLHDPQGYAESLFSKHLQNTKSKLNLDQKLLVLQLVTRLVGLHKLHIMHLYSYFQKYLTPRQPSVTSFLASLAQASHDLVPPDDLEPLVQKIANEFVSEASASEVASAGLNAIREICVRQPLAMNETLLQDLVMYRKSKDKGVMMAGRGLLSLFREVNPEMLKRRDRGKDASIGLRSGERKEKRFAEQEAGGIEGLELLEKWKEEERRKRRAEKGLPSDGEDDEDVDDEEADWAAWNVEDDEDSDDSGDWIQVESDVEIELSDSEDEKDGPPTKKAKSNEDTKAETKPEEETAEAKFSKLATTRILTPADLAKLQELRTEAAVNALVPGSKGATRHRDDPLTAEEIEGLAALSAGKATREERIAHAKEGKTDRSEHKSVTAKRKERKEDQGKSTTNKEKARKKNFLMTLGKAKSKNKRSLVQTRAVLKAHQDRAKRGGRRGNVGAVA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.32
2	0.29
3	0.26
4	0.28
5	0.3
6	0.3
7	0.32
8	0.37
9	0.46
10	0.51
11	0.58
12	0.56
13	0.61
14	0.68
15	0.73
16	0.74
17	0.7
18	0.66
19	0.65
20	0.59
21	0.59
22	0.56
23	0.47
24	0.45
25	0.42
26	0.41
27	0.39
28	0.47
29	0.44
30	0.4
31	0.4
32	0.36
33	0.34
34	0.29
35	0.27
36	0.21
37	0.17
38	0.15
39	0.14
40	0.16
41	0.14
42	0.13
43	0.11
44	0.07
45	0.09
46	0.09
47	0.09
48	0.08
49	0.1
50	0.1
51	0.1
52	0.1
53	0.09
54	0.09
55	0.09
56	0.08
57	0.09
58	0.08
59	0.08
60	0.09
61	0.09
62	0.09
63	0.1
64	0.1
65	0.08
66	0.1
67	0.12
68	0.15
69	0.2
70	0.23
71	0.23
72	0.24
73	0.24
74	0.23
75	0.24
76	0.22
77	0.17
78	0.16
79	0.16
80	0.15
81	0.15
82	0.16
83	0.15
84	0.15
85	0.18
86	0.2
87	0.22
88	0.27
89	0.28
90	0.27
91	0.25
92	0.24
93	0.23
94	0.21
95	0.17
96	0.13
97	0.2
98	0.25
99	0.3
100	0.3
101	0.28
102	0.28
103	0.29
104	0.29
105	0.25
106	0.22
107	0.19
108	0.21
109	0.23
110	0.22
111	0.22
112	0.2
113	0.16
114	0.14
115	0.12
116	0.09
117	0.06
118	0.05
119	0.05
120	0.1
121	0.12
122	0.13
123	0.17
124	0.19
125	0.21
126	0.21
127	0.24
128	0.21
129	0.27
130	0.3
131	0.32
132	0.33
133	0.32
134	0.32
135	0.31
136	0.3
137	0.23
138	0.2
139	0.15
140	0.15
141	0.22
142	0.22
143	0.22
144	0.26
145	0.29
146	0.34
147	0.4
148	0.49
149	0.49
150	0.53
151	0.56
152	0.6
153	0.64
154	0.62
155	0.58
156	0.49
157	0.45
158	0.41
159	0.37
160	0.28
161	0.2
162	0.16
163	0.16
164	0.14
165	0.11
166	0.14
167	0.13
168	0.15
169	0.17
170	0.18
171	0.19
172	0.24
173	0.26
174	0.25
175	0.28
176	0.29
177	0.3
178	0.34
179	0.32
180	0.35
181	0.38
182	0.4
183	0.43
184	0.45
185	0.46
186	0.42
187	0.51
188	0.45
189	0.45
190	0.45
191	0.39
192	0.33
193	0.33
194	0.31
195	0.22
196	0.2
197	0.17
198	0.12
199	0.11
200	0.11
201	0.09
202	0.1
203	0.11
204	0.09
205	0.09
206	0.09
207	0.09
208	0.09
209	0.08
210	0.07
211	0.06
212	0.07
213	0.06
214	0.06
215	0.06
216	0.06
217	0.07
218	0.09
219	0.11
220	0.13
221	0.14
222	0.15
223	0.15
224	0.16
225	0.18
226	0.16
227	0.16
228	0.14
229	0.13
230	0.14
231	0.14
232	0.13
233	0.1
234	0.08
235	0.06
236	0.05
237	0.05
238	0.06
239	0.06
240	0.08
241	0.11
242	0.11
243	0.15
244	0.17
245	0.23
246	0.3
247	0.4
248	0.47
249	0.55
250	0.61
251	0.67
252	0.74
253	0.74
254	0.74
255	0.73
256	0.75
257	0.76
258	0.78
259	0.77
260	0.73
261	0.76
262	0.73
263	0.71
264	0.65
265	0.63
266	0.65
267	0.66
268	0.7
269	0.73
270	0.77
271	0.81
272	0.87
273	0.89
274	0.9
275	0.91
276	0.87
277	0.84
278	0.78
279	0.71
280	0.6
281	0.5
282	0.44
283	0.33
284	0.28
285	0.21
286	0.18
287	0.15
288	0.15
289	0.13
290	0.09
291	0.1
292	0.09
293	0.08
294	0.08
295	0.07
296	0.08
297	0.09
298	0.1
299	0.11
300	0.14
301	0.18
302	0.21
303	0.25
304	0.28
305	0.32
306	0.36
307	0.36
308	0.41
309	0.45
310	0.47
311	0.45
312	0.43
313	0.38
314	0.34
315	0.32
316	0.25
317	0.16
318	0.11
319	0.1
320	0.07
321	0.07
322	0.06
323	0.06
324	0.06
325	0.1
326	0.11
327	0.1
328	0.11
329	0.12
330	0.12
331	0.14
332	0.15
333	0.11
334	0.12
335	0.13
336	0.13
337	0.14
338	0.13
339	0.11
340	0.13
341	0.15
342	0.23
343	0.28
344	0.32
345	0.32
346	0.34
347	0.37
348	0.35
349	0.38
350	0.3
351	0.23
352	0.18
353	0.18
354	0.15
355	0.13
356	0.12
357	0.07
358	0.06
359	0.06
360	0.06
361	0.06
362	0.06
363	0.07
364	0.07
365	0.07
366	0.07
367	0.07
368	0.07
369	0.06
370	0.05
371	0.06
372	0.07
373	0.07
374	0.07
375	0.06
376	0.06
377	0.09
378	0.09
379	0.08
380	0.08
381	0.08
382	0.08
383	0.08
384	0.07
385	0.06
386	0.05
387	0.05
388	0.05
389	0.05
390	0.04
391	0.04
392	0.04
393	0.03
394	0.04
395	0.04
396	0.04
397	0.04
398	0.05
399	0.05
400	0.06
401	0.07
402	0.1
403	0.1
404	0.11
405	0.13
406	0.14
407	0.16
408	0.16
409	0.16
410	0.13
411	0.14
412	0.13
413	0.11
414	0.09
415	0.06
416	0.06
417	0.07
418	0.09
419	0.09
420	0.1
421	0.16
422	0.18
423	0.2
424	0.24
425	0.25
426	0.25
427	0.31
428	0.33
429	0.28
430	0.29
431	0.27
432	0.23
433	0.2
434	0.17
435	0.11
436	0.08
437	0.09
438	0.07
439	0.07
440	0.09
441	0.1
442	0.13
443	0.14
444	0.16
445	0.18
446	0.24
447	0.27
448	0.28
449	0.36
450	0.39
451	0.41
452	0.44
453	0.44
454	0.45
455	0.45
456	0.48
457	0.41
458	0.36
459	0.32
460	0.3
461	0.28
462	0.24
463	0.3
464	0.29
465	0.32
466	0.38
467	0.41
468	0.43
469	0.47
470	0.47
471	0.43
472	0.39
473	0.37
474	0.31
475	0.28
476	0.22
477	0.16
478	0.13
479	0.07
480	0.06
481	0.04
482	0.04
483	0.04
484	0.05
485	0.05
486	0.07
487	0.12
488	0.2
489	0.29
490	0.41
491	0.49
492	0.59
493	0.68
494	0.75
495	0.79
496	0.82
497	0.82
498	0.81
499	0.81
500	0.79
501	0.72
502	0.65
503	0.59
504	0.48
505	0.4
506	0.3
507	0.21
508	0.13
509	0.12
510	0.1
511	0.07
512	0.07
513	0.06
514	0.06
515	0.05
516	0.05
517	0.04
518	0.04
519	0.04
520	0.04
521	0.04
522	0.05
523	0.05
524	0.05
525	0.06
526	0.09
527	0.09
528	0.09
529	0.09
530	0.09
531	0.09
532	0.09
533	0.08
534	0.05
535	0.05
536	0.05
537	0.05
538	0.06
539	0.06
540	0.06
541	0.05
542	0.05
543	0.05
544	0.05
545	0.05
546	0.05
547	0.05
548	0.06
549	0.07
550	0.07
551	0.08
552	0.09
553	0.15
554	0.2
555	0.22
556	0.27
557	0.32
558	0.36
559	0.43
560	0.47
561	0.51
562	0.52
563	0.59
564	0.62
565	0.63
566	0.64
567	0.58
568	0.6
569	0.53
570	0.46
571	0.38
572	0.32
573	0.29
574	0.25
575	0.24
576	0.2
577	0.19
578	0.24
579	0.23
580	0.2
581	0.19
582	0.17
583	0.2
584	0.21
585	0.21
586	0.2
587	0.22
588	0.26
589	0.29
590	0.3
591	0.25
592	0.25
593	0.25
594	0.24
595	0.22
596	0.19
597	0.18
598	0.2
599	0.2
600	0.21
601	0.19
602	0.18
603	0.19
604	0.19
605	0.16
606	0.15
607	0.15
608	0.12
609	0.11
610	0.1
611	0.09
612	0.08
613	0.08
614	0.08
615	0.09
616	0.12
617	0.18
618	0.27
619	0.31
620	0.36
621	0.41
622	0.43
623	0.43
624	0.44
625	0.42
626	0.37
627	0.33
628	0.28
629	0.22
630	0.18
631	0.17
632	0.13
633	0.08
634	0.04
635	0.04
636	0.04
637	0.03
638	0.04
639	0.04
640	0.05
641	0.07
642	0.09
643	0.13
644	0.17
645	0.19
646	0.24
647	0.34
648	0.37
649	0.4
650	0.47
651	0.44
652	0.49
653	0.53
654	0.53
655	0.46
656	0.49
657	0.52
658	0.52
659	0.54
660	0.48
661	0.5
662	0.54
663	0.6
664	0.64
665	0.67
666	0.68
667	0.73
668	0.82
669	0.84
670	0.84
671	0.86
672	0.86
673	0.85
674	0.85
675	0.86
676	0.83
677	0.78
678	0.79
679	0.77
680	0.74
681	0.73
682	0.74
683	0.74
684	0.79
685	0.84
686	0.84
687	0.82
688	0.83
689	0.81
690	0.81
691	0.77
692	0.73
693	0.72
694	0.68
695	0.68
696	0.63
697	0.65
698	0.66
699	0.69
700	0.73
701	0.7
702	0.73
703	0.76
704	0.81
705	0.8
706	0.79
707	0.76
708	0.72
709	0.7
710	0.63
711	0.55
712	0.53
713	0.55
714	0.55
715	0.55
716	0.54
717	0.54
718	0.62
719	0.7
720	0.69
721	0.68
722	0.68
723	0.69
724	0.71
725	0.7

A0A395HCN4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer