FuNGI

A0A395HCA0

Protein Details

Accession

A0A395HCA0

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
333-352	GTPIRRKKRKGALTNPSAYS	Hydrophilic
447-470	KTSAQAKRKGAKAKRGKNGNEAIG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
337-342	RRKKRK
452-464	AKRKGAKAKRGKN

Subcellular Location(s)

nucl 15, mito 7, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MPPRKQWIDKKNATTYQLFHRAQHDPLIHDPSADDRVLAPVSGPAPVPSSSASASAPQHRGQNLADLNQAFGGAAVRKNEGEAANYGIYYDDSKYDYMQHLRELGTGAGDAHFVEAKTKGKEKGKGLKLEDALRQVSLDDGRSEFGGAESVYSYDMRSTASSYVRQPTYQDQQNVPDAIAGFQPDMDPRLREVLEALEDEEYVDENDNEDVFGQLTTRAEEMDQGDWEDTLFDDVEEEEDDGWESDATEKAPVQMNTTDARARYQDTEQPDGELPVPEQPAPDMHPEDQGWMREFAKFKKDAKGKTAAPAAPASVVPSEQQSTLASTVFTVGGTPIRRKKRKGALTNPSAYSMTSSSLARTEGHRLLDDRFERVEALYSLDEEDEEFDDSMSMVSGMTGMTNMTGMTGISTASSQAPSLIDANGDAVRPSHNFNNIMDDFLAGWDDKTSAQAKRKGAKAKRGKNGNEAIGIRMLDEVRQGLGPARLGGKVSGRA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.7
2	0.63
3	0.62
4	0.63
5	0.56
6	0.5
7	0.49
8	0.48
9	0.46
10	0.5
11	0.43
12	0.37
13	0.41
14	0.45
15	0.39
16	0.35
17	0.33
18	0.3
19	0.31
20	0.26
21	0.21
22	0.15
23	0.18
24	0.18
25	0.18
26	0.14
27	0.13
28	0.13
29	0.14
30	0.14
31	0.12
32	0.14
33	0.14
34	0.16
35	0.14
36	0.16
37	0.15
38	0.17
39	0.17
40	0.19
41	0.22
42	0.28
43	0.31
44	0.31
45	0.36
46	0.35
47	0.38
48	0.34
49	0.38
50	0.33
51	0.31
52	0.33
53	0.28
54	0.27
55	0.24
56	0.23
57	0.15
58	0.12
59	0.12
60	0.1
61	0.12
62	0.13
63	0.15
64	0.15
65	0.16
66	0.19
67	0.18
68	0.18
69	0.16
70	0.19
71	0.17
72	0.17
73	0.17
74	0.13
75	0.13
76	0.13
77	0.12
78	0.1
79	0.11
80	0.12
81	0.13
82	0.16
83	0.2
84	0.24
85	0.24
86	0.24
87	0.25
88	0.25
89	0.26
90	0.24
91	0.19
92	0.14
93	0.13
94	0.11
95	0.09
96	0.08
97	0.07
98	0.07
99	0.08
100	0.07
101	0.09
102	0.11
103	0.15
104	0.19
105	0.24
106	0.3
107	0.36
108	0.43
109	0.49
110	0.57
111	0.6
112	0.64
113	0.63
114	0.63
115	0.6
116	0.57
117	0.52
118	0.46
119	0.39
120	0.31
121	0.28
122	0.21
123	0.19
124	0.16
125	0.14
126	0.11
127	0.11
128	0.11
129	0.11
130	0.11
131	0.09
132	0.08
133	0.08
134	0.07
135	0.07
136	0.06
137	0.06
138	0.07
139	0.07
140	0.07
141	0.06
142	0.07
143	0.07
144	0.08
145	0.09
146	0.12
147	0.14
148	0.17
149	0.2
150	0.26
151	0.26
152	0.26
153	0.27
154	0.29
155	0.35
156	0.38
157	0.39
158	0.34
159	0.37
160	0.4
161	0.37
162	0.31
163	0.24
164	0.19
165	0.15
166	0.14
167	0.11
168	0.07
169	0.07
170	0.07
171	0.07
172	0.08
173	0.09
174	0.09
175	0.09
176	0.13
177	0.13
178	0.13
179	0.13
180	0.12
181	0.12
182	0.12
183	0.11
184	0.08
185	0.08
186	0.08
187	0.07
188	0.06
189	0.05
190	0.06
191	0.05
192	0.05
193	0.06
194	0.06
195	0.05
196	0.05
197	0.05
198	0.05
199	0.05
200	0.04
201	0.05
202	0.05
203	0.06
204	0.06
205	0.06
206	0.06
207	0.08
208	0.09
209	0.09
210	0.09
211	0.09
212	0.09
213	0.08
214	0.08
215	0.06
216	0.05
217	0.05
218	0.04
219	0.04
220	0.04
221	0.04
222	0.04
223	0.05
224	0.05
225	0.04
226	0.04
227	0.05
228	0.04
229	0.05
230	0.04
231	0.04
232	0.04
233	0.05
234	0.05
235	0.06
236	0.06
237	0.07
238	0.11
239	0.12
240	0.13
241	0.13
242	0.15
243	0.15
244	0.17
245	0.17
246	0.13
247	0.14
248	0.13
249	0.14
250	0.15
251	0.16
252	0.18
253	0.21
254	0.25
255	0.23
256	0.24
257	0.23
258	0.21
259	0.2
260	0.16
261	0.12
262	0.11
263	0.12
264	0.1
265	0.1
266	0.09
267	0.1
268	0.11
269	0.14
270	0.13
271	0.13
272	0.16
273	0.16
274	0.18
275	0.19
276	0.19
277	0.17
278	0.17
279	0.16
280	0.17
281	0.2
282	0.2
283	0.25
284	0.28
285	0.29
286	0.36
287	0.42
288	0.42
289	0.45
290	0.5
291	0.45
292	0.45
293	0.49
294	0.4
295	0.36
296	0.33
297	0.28
298	0.21
299	0.19
300	0.15
301	0.1
302	0.09
303	0.08
304	0.09
305	0.1
306	0.09
307	0.1
308	0.09
309	0.11
310	0.11
311	0.11
312	0.09
313	0.08
314	0.09
315	0.08
316	0.07
317	0.06
318	0.06
319	0.09
320	0.12
321	0.18
322	0.25
323	0.36
324	0.43
325	0.47
326	0.56
327	0.63
328	0.71
329	0.75
330	0.78
331	0.78
332	0.79
333	0.81
334	0.72
335	0.64
336	0.54
337	0.43
338	0.34
339	0.25
340	0.18
341	0.14
342	0.13
343	0.12
344	0.12
345	0.13
346	0.12
347	0.14
348	0.18
349	0.2
350	0.22
351	0.22
352	0.23
353	0.24
354	0.31
355	0.3
356	0.26
357	0.24
358	0.23
359	0.22
360	0.21
361	0.21
362	0.14
363	0.15
364	0.13
365	0.12
366	0.12
367	0.12
368	0.11
369	0.09
370	0.1
371	0.08
372	0.09
373	0.09
374	0.08
375	0.08
376	0.08
377	0.08
378	0.07
379	0.05
380	0.04
381	0.04
382	0.04
383	0.04
384	0.04
385	0.04
386	0.04
387	0.04
388	0.04
389	0.04
390	0.04
391	0.04
392	0.04
393	0.04
394	0.05
395	0.05
396	0.05
397	0.05
398	0.06
399	0.07
400	0.08
401	0.08
402	0.09
403	0.09
404	0.1
405	0.12
406	0.11
407	0.09
408	0.09
409	0.11
410	0.11
411	0.11
412	0.1
413	0.09
414	0.11
415	0.13
416	0.17
417	0.2
418	0.25
419	0.27
420	0.27
421	0.36
422	0.33
423	0.34
424	0.3
425	0.25
426	0.2
427	0.18
428	0.19
429	0.1
430	0.1
431	0.08
432	0.09
433	0.08
434	0.12
435	0.17
436	0.22
437	0.31
438	0.37
439	0.45
440	0.52
441	0.59
442	0.66
443	0.7
444	0.74
445	0.77
446	0.8
447	0.82
448	0.84
449	0.82
450	0.81
451	0.8
452	0.74
453	0.7
454	0.61
455	0.53
456	0.46
457	0.4
458	0.31
459	0.26
460	0.22
461	0.15
462	0.16
463	0.14
464	0.12
465	0.13
466	0.13
467	0.14
468	0.17
469	0.17
470	0.18
471	0.19
472	0.19
473	0.2
474	0.22

A0A395HCA0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer