Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A395HCQ0

Protein Details
Accession A0A395HCQ0    Localization Confidence High Confidence Score 25.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MSTLRNAVQRRNHRERGQLQHydrophilic
36-63LRAKDYNTKKEKIKRLQEKVRDRNPDEFHydrophilic
176-197ADDRREQRTLKKKKLREEDEKEBasic
208-227FGKRQAQKKSRKQIEAERQAHydrophilic
229-251VEARRARKMKKRAAEARANKLKAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
180-190REQRTLKKKKL
211-250RQAQKKSRKQIEAERQALVEARRARKMKKRAAEARANKLK
286-294KWKIRERKR
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007144  SSU_processome_Utp11  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF03998  Utp11  
Amino Acid Sequences MSTLRNAVQRRNHRERGQLQGREKWGILEKHKDYSLRAKDYNTKKEKIKRLQEKVRDRNPDEFAFGMMSGTSARQGKHGSGARDSAAARGLSHDAIKLLKTQDAGYLRTVGERIRRQMEKLEEEVRLQDGMKEILDGEGEKKGGQEGGSDVEEDDMDFDFDFGDEEEKKAKKLVFADDRREQRTLKKKKLREEDEKEEEESDGEEDSFGKRQAQKKSRKQIEAERQALVEARRARKMKKRAAEARANKLKALQKQYKDITAAERELDWQRGRMDNVVGGTNKNGVKWKIRERKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.78
3 0.79
4 0.79
5 0.77
6 0.74
7 0.72
8 0.7
9 0.64
10 0.58
11 0.51
12 0.48
13 0.47
14 0.47
15 0.48
16 0.47
17 0.49
18 0.52
19 0.5
20 0.46
21 0.5
22 0.52
23 0.5
24 0.49
25 0.49
26 0.55
27 0.63
28 0.7
29 0.67
30 0.64
31 0.65
32 0.72
33 0.78
34 0.79
35 0.8
36 0.8
37 0.83
38 0.88
39 0.89
40 0.9
41 0.9
42 0.89
43 0.88
44 0.81
45 0.77
46 0.72
47 0.64
48 0.55
49 0.45
50 0.36
51 0.27
52 0.23
53 0.16
54 0.1
55 0.09
56 0.07
57 0.06
58 0.09
59 0.1
60 0.11
61 0.14
62 0.16
63 0.16
64 0.24
65 0.28
66 0.27
67 0.28
68 0.29
69 0.27
70 0.28
71 0.27
72 0.2
73 0.18
74 0.16
75 0.13
76 0.14
77 0.14
78 0.12
79 0.13
80 0.12
81 0.1
82 0.11
83 0.11
84 0.12
85 0.12
86 0.12
87 0.13
88 0.13
89 0.17
90 0.19
91 0.2
92 0.18
93 0.19
94 0.17
95 0.17
96 0.17
97 0.14
98 0.19
99 0.22
100 0.25
101 0.29
102 0.3
103 0.31
104 0.36
105 0.4
106 0.36
107 0.36
108 0.35
109 0.29
110 0.29
111 0.28
112 0.23
113 0.18
114 0.14
115 0.11
116 0.09
117 0.08
118 0.08
119 0.07
120 0.06
121 0.06
122 0.06
123 0.06
124 0.06
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.06
130 0.07
131 0.06
132 0.06
133 0.06
134 0.08
135 0.08
136 0.08
137 0.07
138 0.07
139 0.07
140 0.06
141 0.06
142 0.04
143 0.04
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.03
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.12
154 0.12
155 0.13
156 0.15
157 0.16
158 0.17
159 0.2
160 0.27
161 0.33
162 0.38
163 0.44
164 0.49
165 0.53
166 0.53
167 0.52
168 0.45
169 0.44
170 0.5
171 0.53
172 0.57
173 0.61
174 0.64
175 0.72
176 0.81
177 0.81
178 0.81
179 0.8
180 0.78
181 0.76
182 0.72
183 0.63
184 0.53
185 0.44
186 0.34
187 0.25
188 0.16
189 0.1
190 0.07
191 0.06
192 0.06
193 0.08
194 0.09
195 0.09
196 0.14
197 0.19
198 0.26
199 0.37
200 0.46
201 0.55
202 0.64
203 0.75
204 0.79
205 0.8
206 0.79
207 0.79
208 0.81
209 0.8
210 0.72
211 0.62
212 0.53
213 0.47
214 0.44
215 0.34
216 0.3
217 0.27
218 0.29
219 0.35
220 0.39
221 0.46
222 0.53
223 0.62
224 0.65
225 0.67
226 0.73
227 0.75
228 0.8
229 0.83
230 0.82
231 0.82
232 0.82
233 0.74
234 0.64
235 0.62
236 0.6
237 0.57
238 0.59
239 0.57
240 0.53
241 0.6
242 0.64
243 0.61
244 0.57
245 0.5
246 0.46
247 0.43
248 0.39
249 0.32
250 0.28
251 0.28
252 0.29
253 0.34
254 0.29
255 0.26
256 0.29
257 0.32
258 0.33
259 0.32
260 0.31
261 0.27
262 0.28
263 0.29
264 0.27
265 0.24
266 0.23
267 0.26
268 0.25
269 0.25
270 0.3
271 0.29
272 0.38
273 0.45
274 0.55