Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A395HDT2

Protein Details
Accession A0A395HDT2    Localization Confidence Low Confidence Score 9.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
194-214LPCWRRISRLHKGFRRSREDDBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 11.5, cyto 5.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019474  Ub_conjug_fac_E4_core  
IPR045132  UBE4  
IPR003613  Ubox_domain  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0000151  C:ubiquitin ligase complex  
GO:0034450  F:ubiquitin-ubiquitin ligase activity  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
GO:0030433  P:ubiquitin-dependent ERAD pathway  
Pfam View protein in Pfam  
PF04564  U-box  
PF10408  Ufd2P_core  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51698  U_BOX  
CDD cd16657  RING-Ubox_UBE4A  
Amino Acid Sequences MSESQSEADKIRSKRLAKLGNPTPPAQTEGAAESASSQPASPSLSTQSPRFPSDRYHAQSASNPGSAPGSSAPSPQLLPQSDWKRIKITPAASASSVPDRSQTVTPVSGTPPPSRAEETIEAFQDRTLSAVFKLSLNEARQKDIHGQRLTYLPGLRSELEDQGREVRVDVSVLDQALLEAASNAPRQKPLDYLLPCWRRISRLHKGFRRSREDDPKFNAIGEARRLCLSYCIFAITMPEMFGLEPSEKSPLKPYLLLDPEDDKGVDFEFIGEAVKRFDEDESLKPAFIAAVEEMSQELAAMTINDDYKPYMTALRNLVRHAVIAAAITESSIFNATRDPATFEKSTLLGPWFRLSPLQSSVTLTYFSSPKTRDQAYILNAQRSIRMMQHMISADLLDIVNHLIRASKDARECVLDWFAASLNINHKRRAMQVDPNTVSSDGFMFNLTTCLDQLCEPFMDASFTKIDRVDANYLHRNPRVDMRDETKINADKHASDAFYAKTADGASNFITEIFFLTVAAHHYGSESLTSKLEQLEKDLRHMESTINKFELERHRWVNNPVQLRVFEQALKKYKDKLDLGLALKYSLQGVLFDDQWQARSMLFMRYVIVWLLRVVSGTNFPKEPIRLPLPPQQPEVFQCLPEYFLDDIVSNFKFIMWCMPQIITATQGDELVMLCITFLESSDYIKNPYLKAGLVSILFRGTWPRPGGARGVLVDLLNSMPFANEHLLHALMKFYIEAEHTGTHTQFFDKFNIRYEIFQIIKCIWPNTLYRNKLYNQSKQNLDFFVRFVNLLLNDVTFVLDESFGAFITIYKTQTELRNAAGMDPTVRQQKEEHLASAQRNAKSYMQLTNETVAMLKLFTDALADSFTMPEIVQRLADMLDYNLETMVGPKSASLRVDNLQEYGFNPRALLSEIVDVYLNLMLKENFIIAVARDGRSYKPANFVKAAEILQKFSLKSPEEFQRWEQLQQKVKEAKEADEQAEEDLGEVPDEFLDPLMYTLMEDPVILPGSRVSIDRATIRSHLLSDPHDPFNRAPLKMEDVIPDTEMKARIEAFKNERLAERRRGLVSEQMDTSG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.62
3 0.66
4 0.63
5 0.71
6 0.71
7 0.72
8 0.72
9 0.65
10 0.6
11 0.52
12 0.5
13 0.41
14 0.33
15 0.26
16 0.24
17 0.23
18 0.19
19 0.17
20 0.15
21 0.16
22 0.16
23 0.14
24 0.12
25 0.11
26 0.13
27 0.16
28 0.14
29 0.15
30 0.19
31 0.25
32 0.29
33 0.32
34 0.38
35 0.39
36 0.43
37 0.43
38 0.41
39 0.41
40 0.46
41 0.53
42 0.51
43 0.53
44 0.5
45 0.52
46 0.55
47 0.56
48 0.53
49 0.44
50 0.37
51 0.31
52 0.31
53 0.28
54 0.24
55 0.18
56 0.18
57 0.18
58 0.2
59 0.2
60 0.21
61 0.22
62 0.22
63 0.27
64 0.25
65 0.28
66 0.36
67 0.41
68 0.49
69 0.53
70 0.53
71 0.51
72 0.5
73 0.54
74 0.52
75 0.49
76 0.47
77 0.46
78 0.46
79 0.42
80 0.41
81 0.37
82 0.35
83 0.34
84 0.26
85 0.24
86 0.23
87 0.26
88 0.27
89 0.26
90 0.24
91 0.24
92 0.25
93 0.25
94 0.26
95 0.28
96 0.3
97 0.3
98 0.29
99 0.29
100 0.32
101 0.33
102 0.32
103 0.33
104 0.34
105 0.35
106 0.36
107 0.36
108 0.33
109 0.29
110 0.28
111 0.23
112 0.18
113 0.14
114 0.12
115 0.11
116 0.1
117 0.13
118 0.14
119 0.14
120 0.15
121 0.18
122 0.23
123 0.26
124 0.34
125 0.32
126 0.35
127 0.35
128 0.37
129 0.43
130 0.44
131 0.5
132 0.44
133 0.44
134 0.42
135 0.44
136 0.43
137 0.38
138 0.33
139 0.25
140 0.24
141 0.27
142 0.25
143 0.25
144 0.25
145 0.27
146 0.28
147 0.27
148 0.26
149 0.28
150 0.29
151 0.26
152 0.24
153 0.18
154 0.16
155 0.15
156 0.14
157 0.11
158 0.11
159 0.11
160 0.1
161 0.09
162 0.09
163 0.08
164 0.08
165 0.06
166 0.04
167 0.05
168 0.08
169 0.11
170 0.13
171 0.14
172 0.18
173 0.21
174 0.22
175 0.24
176 0.25
177 0.32
178 0.32
179 0.37
180 0.43
181 0.46
182 0.46
183 0.48
184 0.46
185 0.4
186 0.45
187 0.49
188 0.5
189 0.55
190 0.64
191 0.67
192 0.75
193 0.8
194 0.82
195 0.82
196 0.76
197 0.76
198 0.77
199 0.77
200 0.75
201 0.72
202 0.69
203 0.6
204 0.55
205 0.47
206 0.38
207 0.35
208 0.35
209 0.3
210 0.26
211 0.26
212 0.26
213 0.24
214 0.27
215 0.24
216 0.18
217 0.17
218 0.17
219 0.16
220 0.15
221 0.17
222 0.13
223 0.12
224 0.1
225 0.09
226 0.08
227 0.08
228 0.09
229 0.09
230 0.09
231 0.09
232 0.1
233 0.16
234 0.16
235 0.17
236 0.22
237 0.25
238 0.26
239 0.28
240 0.28
241 0.32
242 0.35
243 0.35
244 0.31
245 0.3
246 0.28
247 0.26
248 0.25
249 0.16
250 0.13
251 0.12
252 0.1
253 0.07
254 0.07
255 0.06
256 0.06
257 0.07
258 0.07
259 0.07
260 0.07
261 0.08
262 0.08
263 0.08
264 0.09
265 0.12
266 0.15
267 0.18
268 0.23
269 0.24
270 0.23
271 0.22
272 0.22
273 0.17
274 0.14
275 0.13
276 0.06
277 0.07
278 0.07
279 0.08
280 0.08
281 0.08
282 0.07
283 0.05
284 0.05
285 0.04
286 0.03
287 0.03
288 0.04
289 0.06
290 0.07
291 0.07
292 0.07
293 0.08
294 0.09
295 0.1
296 0.1
297 0.14
298 0.15
299 0.19
300 0.25
301 0.3
302 0.31
303 0.31
304 0.33
305 0.27
306 0.26
307 0.21
308 0.15
309 0.1
310 0.08
311 0.08
312 0.05
313 0.05
314 0.05
315 0.05
316 0.05
317 0.05
318 0.06
319 0.06
320 0.06
321 0.08
322 0.09
323 0.1
324 0.11
325 0.14
326 0.14
327 0.19
328 0.19
329 0.19
330 0.19
331 0.19
332 0.18
333 0.16
334 0.17
335 0.13
336 0.14
337 0.15
338 0.14
339 0.14
340 0.15
341 0.15
342 0.16
343 0.18
344 0.19
345 0.18
346 0.19
347 0.2
348 0.19
349 0.19
350 0.16
351 0.14
352 0.13
353 0.13
354 0.16
355 0.17
356 0.2
357 0.24
358 0.26
359 0.26
360 0.28
361 0.32
362 0.3
363 0.38
364 0.36
365 0.33
366 0.33
367 0.31
368 0.29
369 0.25
370 0.24
371 0.16
372 0.17
373 0.15
374 0.15
375 0.18
376 0.17
377 0.16
378 0.15
379 0.13
380 0.1
381 0.1
382 0.09
383 0.05
384 0.05
385 0.05
386 0.05
387 0.05
388 0.05
389 0.06
390 0.06
391 0.1
392 0.12
393 0.16
394 0.18
395 0.19
396 0.2
397 0.21
398 0.22
399 0.2
400 0.2
401 0.15
402 0.13
403 0.13
404 0.12
405 0.1
406 0.09
407 0.08
408 0.15
409 0.24
410 0.25
411 0.26
412 0.28
413 0.29
414 0.32
415 0.38
416 0.34
417 0.35
418 0.4
419 0.47
420 0.47
421 0.47
422 0.44
423 0.37
424 0.32
425 0.23
426 0.18
427 0.09
428 0.08
429 0.07
430 0.06
431 0.06
432 0.07
433 0.07
434 0.07
435 0.06
436 0.06
437 0.06
438 0.07
439 0.07
440 0.08
441 0.07
442 0.07
443 0.07
444 0.07
445 0.09
446 0.08
447 0.09
448 0.1
449 0.1
450 0.11
451 0.11
452 0.12
453 0.11
454 0.14
455 0.15
456 0.15
457 0.2
458 0.26
459 0.28
460 0.32
461 0.32
462 0.3
463 0.29
464 0.34
465 0.33
466 0.3
467 0.31
468 0.31
469 0.35
470 0.35
471 0.35
472 0.32
473 0.34
474 0.31
475 0.3
476 0.27
477 0.2
478 0.22
479 0.23
480 0.18
481 0.13
482 0.14
483 0.12
484 0.12
485 0.12
486 0.09
487 0.09
488 0.09
489 0.09
490 0.07
491 0.08
492 0.07
493 0.07
494 0.07
495 0.07
496 0.06
497 0.06
498 0.06
499 0.05
500 0.04
501 0.04
502 0.04
503 0.05
504 0.06
505 0.07
506 0.07
507 0.06
508 0.07
509 0.07
510 0.07
511 0.08
512 0.08
513 0.08
514 0.08
515 0.08
516 0.09
517 0.1
518 0.13
519 0.11
520 0.14
521 0.2
522 0.2
523 0.22
524 0.24
525 0.22
526 0.2
527 0.21
528 0.19
529 0.19
530 0.22
531 0.21
532 0.2
533 0.2
534 0.19
535 0.24
536 0.3
537 0.28
538 0.3
539 0.31
540 0.32
541 0.34
542 0.38
543 0.4
544 0.37
545 0.35
546 0.32
547 0.3
548 0.29
549 0.28
550 0.26
551 0.2
552 0.18
553 0.17
554 0.22
555 0.27
556 0.3
557 0.3
558 0.33
559 0.35
560 0.39
561 0.38
562 0.33
563 0.31
564 0.33
565 0.33
566 0.29
567 0.26
568 0.2
569 0.19
570 0.17
571 0.13
572 0.07
573 0.06
574 0.05
575 0.06
576 0.07
577 0.07
578 0.08
579 0.09
580 0.09
581 0.1
582 0.11
583 0.1
584 0.08
585 0.09
586 0.1
587 0.1
588 0.11
589 0.1
590 0.1
591 0.1
592 0.1
593 0.09
594 0.08
595 0.06
596 0.06
597 0.06
598 0.05
599 0.05
600 0.05
601 0.06
602 0.1
603 0.12
604 0.13
605 0.13
606 0.14
607 0.16
608 0.17
609 0.18
610 0.19
611 0.22
612 0.22
613 0.27
614 0.35
615 0.39
616 0.4
617 0.41
618 0.37
619 0.34
620 0.34
621 0.37
622 0.29
623 0.22
624 0.21
625 0.18
626 0.18
627 0.16
628 0.17
629 0.1
630 0.1
631 0.1
632 0.1
633 0.1
634 0.12
635 0.12
636 0.09
637 0.09
638 0.08
639 0.08
640 0.08
641 0.13
642 0.11
643 0.12
644 0.13
645 0.13
646 0.14
647 0.15
648 0.15
649 0.11
650 0.1
651 0.1
652 0.09
653 0.09
654 0.08
655 0.07
656 0.07
657 0.05
658 0.05
659 0.04
660 0.03
661 0.03
662 0.04
663 0.03
664 0.03
665 0.06
666 0.06
667 0.08
668 0.11
669 0.11
670 0.13
671 0.16
672 0.18
673 0.16
674 0.17
675 0.16
676 0.15
677 0.15
678 0.13
679 0.12
680 0.11
681 0.11
682 0.1
683 0.09
684 0.09
685 0.08
686 0.12
687 0.11
688 0.16
689 0.17
690 0.18
691 0.19
692 0.2
693 0.22
694 0.2
695 0.2
696 0.15
697 0.16
698 0.15
699 0.13
700 0.12
701 0.1
702 0.08
703 0.07
704 0.06
705 0.05
706 0.04
707 0.04
708 0.06
709 0.07
710 0.08
711 0.08
712 0.09
713 0.1
714 0.1
715 0.1
716 0.09
717 0.07
718 0.07
719 0.06
720 0.05
721 0.06
722 0.06
723 0.07
724 0.09
725 0.1
726 0.11
727 0.12
728 0.12
729 0.13
730 0.12
731 0.13
732 0.14
733 0.15
734 0.19
735 0.23
736 0.24
737 0.27
738 0.31
739 0.31
740 0.29
741 0.29
742 0.31
743 0.27
744 0.27
745 0.25
746 0.21
747 0.24
748 0.24
749 0.22
750 0.16
751 0.17
752 0.19
753 0.26
754 0.34
755 0.34
756 0.36
757 0.4
758 0.41
759 0.48
760 0.52
761 0.53
762 0.52
763 0.55
764 0.57
765 0.55
766 0.56
767 0.49
768 0.46
769 0.38
770 0.3
771 0.26
772 0.21
773 0.18
774 0.15
775 0.16
776 0.12
777 0.13
778 0.13
779 0.1
780 0.1
781 0.1
782 0.1
783 0.06
784 0.07
785 0.06
786 0.05
787 0.05
788 0.06
789 0.06
790 0.05
791 0.05
792 0.05
793 0.05
794 0.08
795 0.1
796 0.11
797 0.11
798 0.13
799 0.16
800 0.21
801 0.25
802 0.24
803 0.23
804 0.26
805 0.25
806 0.25
807 0.23
808 0.18
809 0.15
810 0.14
811 0.17
812 0.21
813 0.21
814 0.22
815 0.22
816 0.28
817 0.35
818 0.36
819 0.33
820 0.3
821 0.35
822 0.35
823 0.42
824 0.41
825 0.35
826 0.35
827 0.36
828 0.34
829 0.34
830 0.34
831 0.32
832 0.3
833 0.31
834 0.31
835 0.29
836 0.28
837 0.23
838 0.21
839 0.15
840 0.11
841 0.08
842 0.07
843 0.06
844 0.05
845 0.05
846 0.06
847 0.06
848 0.06
849 0.07
850 0.07
851 0.07
852 0.07
853 0.07
854 0.07
855 0.07
856 0.08
857 0.09
858 0.09
859 0.09
860 0.08
861 0.09
862 0.09
863 0.09
864 0.08
865 0.07
866 0.09
867 0.09
868 0.09
869 0.08
870 0.08
871 0.07
872 0.08
873 0.09
874 0.08
875 0.07
876 0.08
877 0.11
878 0.14
879 0.16
880 0.16
881 0.19
882 0.21
883 0.26
884 0.26
885 0.25
886 0.22
887 0.21
888 0.2
889 0.24
890 0.24
891 0.19
892 0.18
893 0.17
894 0.18
895 0.2
896 0.2
897 0.14
898 0.15
899 0.15
900 0.16
901 0.15
902 0.13
903 0.12
904 0.13
905 0.12
906 0.08
907 0.1
908 0.1
909 0.1
910 0.11
911 0.1
912 0.08
913 0.08
914 0.09
915 0.07
916 0.14
917 0.16
918 0.16
919 0.17
920 0.19
921 0.2
922 0.26
923 0.3
924 0.26
925 0.34
926 0.37
927 0.41
928 0.42
929 0.42
930 0.39
931 0.39
932 0.37
933 0.35
934 0.32
935 0.29
936 0.29
937 0.31
938 0.28
939 0.27
940 0.33
941 0.28
942 0.29
943 0.33
944 0.4
945 0.42
946 0.45
947 0.45
948 0.48
949 0.47
950 0.52
951 0.53
952 0.52
953 0.56
954 0.55
955 0.62
956 0.59
957 0.57
958 0.58
959 0.53
960 0.49
961 0.48
962 0.5
963 0.43
964 0.38
965 0.38
966 0.31
967 0.29
968 0.25
969 0.17
970 0.14
971 0.12
972 0.09
973 0.09
974 0.08
975 0.08
976 0.08
977 0.08
978 0.06
979 0.07
980 0.06
981 0.07
982 0.07
983 0.07
984 0.07
985 0.08
986 0.09
987 0.08
988 0.08
989 0.08
990 0.1
991 0.12
992 0.11
993 0.1
994 0.1
995 0.12
996 0.14
997 0.14
998 0.15
999 0.16
1000 0.2
1001 0.24
1002 0.26
1003 0.27
1004 0.28
1005 0.31
1006 0.28
1007 0.28
1008 0.28
1009 0.27
1010 0.29
1011 0.33
1012 0.36
1013 0.4
1014 0.41
1015 0.42
1016 0.39
1017 0.45
1018 0.48
1019 0.41
1020 0.4
1021 0.38
1022 0.41
1023 0.41
1024 0.43
1025 0.37
1026 0.34
1027 0.34
1028 0.32
1029 0.28
1030 0.23
1031 0.24
1032 0.25
1033 0.22
1034 0.2
1035 0.21
1036 0.28
1037 0.32
1038 0.39
1039 0.41
1040 0.46
1041 0.49
1042 0.5
1043 0.55
1044 0.54
1045 0.56
1046 0.57
1047 0.56
1048 0.55
1049 0.53
1050 0.54
1051 0.49
1052 0.51
1053 0.48
1054 0.43