FuNGI

A0A395H964

Protein Details

Accession

A0A395H964

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
15-40	GSNGPPPLRNRRPKVADPLVRPKRRP	Basic
134-153	SQFTRPVRLQRRDPRARSHE	Hydrophilic
516-538	GTDTSRKKGKSKHPSSQPTPQPS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
23-40	RNRRPKVADPLVRPKRRP
411-434	REKREKEARRVLGKKVRKALQKRE
521-527	RKKGKSK

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MTTPSNDHPMPTPTGSNGPPPLRNRRPKVADPLVRPKRRPAMRTPVSTSAANGASRLPSSRPVTSNVLPGSRIEKIGPALPRHEFSANGFSGPLLSETYVDYPIVTTRRALREGLKHHIARFTSKKSVDPRDESQFTRPVRLQRRDPRARSHEAHAERGHFNSKMGPEQSTQTDELEREELEARKVAREKERAENMAQIAPSVGSAPKRHNAPKQKTQQVAKTDMTPEEIARTRIKYEEALPWHLEDFDNKNIWVGNYEAALSETHAVFVLENTGRMRMIPVEKWYRFSAKNQFKALTIEEAERFMAKKVKDPRWFMEKQQELAQRKELEQFAKQQKVYAGKQGTPAGVEGLEADEMDFEEDRFADDEEHDDLFNEDEEAKAAEKRIKKDQLKANVFDLKNEKDYEEEEIREKREKEARRVLGKKVRKALQKREKNYDYSSGSDVNPYSDDESSDESETERPKEEEVKAEEEKSKKEPSSRGNLTPSGRSRHMDLLKKGTVTAPRKRLGSPSDASGTDTSRKKGKSKHPSSQPTPQPSSRPMSPSAASTLPVSKKRVRNVLAAGAGSISDVDGGAGSGGEMSESGKAKKLKLNPPSVTSQSVTPQGSRAGSPVPLGSKSFSGSRASSPESLRGPTRISTPGPSSNTQGFPTPAEIHAAIPQSGILSSDLLRIFRPRIGESKENHRRFIAIVKDVGVYGKEDRLLRPGSLKGP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.34
2	0.34
3	0.37
4	0.4
5	0.41
6	0.45
7	0.5
8	0.58
9	0.63
10	0.72
11	0.73
12	0.76
13	0.79
14	0.8
15	0.83
16	0.83
17	0.81
18	0.79
19	0.83
20	0.83
21	0.83
22	0.78
23	0.77
24	0.76
25	0.76
26	0.73
27	0.72
28	0.72
29	0.72
30	0.77
31	0.75
32	0.72
33	0.67
34	0.61
35	0.53
36	0.46
37	0.41
38	0.33
39	0.27
40	0.21
41	0.19
42	0.2
43	0.21
44	0.18
45	0.23
46	0.27
47	0.33
48	0.33
49	0.37
50	0.43
51	0.42
52	0.47
53	0.43
54	0.4
55	0.35
56	0.34
57	0.34
58	0.29
59	0.28
60	0.21
61	0.21
62	0.21
63	0.26
64	0.3
65	0.29
66	0.31
67	0.34
68	0.34
69	0.35
70	0.34
71	0.3
72	0.28
73	0.33
74	0.29
75	0.26
76	0.24
77	0.2
78	0.19
79	0.19
80	0.16
81	0.09
82	0.09
83	0.09
84	0.1
85	0.12
86	0.13
87	0.12
88	0.11
89	0.11
90	0.15
91	0.16
92	0.15
93	0.16
94	0.22
95	0.27
96	0.29
97	0.31
98	0.34
99	0.41
100	0.46
101	0.51
102	0.53
103	0.5
104	0.5
105	0.53
106	0.48
107	0.48
108	0.49
109	0.48
110	0.48
111	0.47
112	0.52
113	0.55
114	0.63
115	0.62
116	0.62
117	0.6
118	0.61
119	0.63
120	0.59
121	0.56
122	0.54
123	0.47
124	0.47
125	0.45
126	0.46
127	0.52
128	0.57
129	0.62
130	0.65
131	0.75
132	0.79
133	0.8
134	0.81
135	0.78
136	0.78
137	0.72
138	0.68
139	0.67
140	0.6
141	0.62
142	0.54
143	0.51
144	0.44
145	0.43
146	0.41
147	0.31
148	0.29
149	0.26
150	0.25
151	0.27
152	0.27
153	0.26
154	0.24
155	0.27
156	0.29
157	0.28
158	0.27
159	0.22
160	0.22
161	0.21
162	0.21
163	0.19
164	0.16
165	0.14
166	0.17
167	0.17
168	0.16
169	0.19
170	0.18
171	0.22
172	0.25
173	0.29
174	0.34
175	0.4
176	0.43
177	0.49
178	0.55
179	0.52
180	0.5
181	0.49
182	0.42
183	0.38
184	0.33
185	0.24
186	0.18
187	0.15
188	0.13
189	0.1
190	0.1
191	0.1
192	0.13
193	0.17
194	0.21
195	0.27
196	0.34
197	0.42
198	0.51
199	0.57
200	0.64
201	0.7
202	0.75
203	0.76
204	0.75
205	0.73
206	0.68
207	0.65
208	0.56
209	0.5
210	0.44
211	0.37
212	0.34
213	0.28
214	0.22
215	0.21
216	0.21
217	0.2
218	0.21
219	0.21
220	0.2
221	0.2
222	0.22
223	0.19
224	0.2
225	0.24
226	0.25
227	0.28
228	0.27
229	0.26
230	0.25
231	0.24
232	0.21
233	0.17
234	0.18
235	0.18
236	0.19
237	0.18
238	0.18
239	0.18
240	0.18
241	0.16
242	0.13
243	0.09
244	0.08
245	0.09
246	0.08
247	0.08
248	0.08
249	0.07
250	0.08
251	0.07
252	0.07
253	0.07
254	0.07
255	0.06
256	0.06
257	0.09
258	0.08
259	0.09
260	0.09
261	0.1
262	0.1
263	0.1
264	0.11
265	0.1
266	0.13
267	0.14
268	0.19
269	0.27
270	0.28
271	0.31
272	0.33
273	0.35
274	0.33
275	0.38
276	0.42
277	0.43
278	0.48
279	0.48
280	0.47
281	0.43
282	0.44
283	0.39
284	0.31
285	0.23
286	0.19
287	0.16
288	0.16
289	0.15
290	0.13
291	0.12
292	0.11
293	0.14
294	0.13
295	0.19
296	0.28
297	0.37
298	0.44
299	0.48
300	0.5
301	0.54
302	0.56
303	0.52
304	0.53
305	0.46
306	0.41
307	0.43
308	0.46
309	0.41
310	0.41
311	0.43
312	0.35
313	0.33
314	0.35
315	0.31
316	0.26
317	0.24
318	0.31
319	0.33
320	0.37
321	0.35
322	0.33
323	0.34
324	0.38
325	0.37
326	0.35
327	0.31
328	0.27
329	0.3
330	0.3
331	0.27
332	0.21
333	0.2
334	0.13
335	0.1
336	0.09
337	0.06
338	0.05
339	0.04
340	0.04
341	0.04
342	0.03
343	0.03
344	0.04
345	0.04
346	0.03
347	0.04
348	0.04
349	0.04
350	0.05
351	0.05
352	0.05
353	0.05
354	0.07
355	0.09
356	0.09
357	0.08
358	0.08
359	0.08
360	0.08
361	0.08
362	0.06
363	0.05
364	0.04
365	0.05
366	0.05
367	0.06
368	0.06
369	0.08
370	0.12
371	0.16
372	0.2
373	0.28
374	0.37
375	0.4
376	0.48
377	0.54
378	0.59
379	0.6
380	0.59
381	0.54
382	0.53
383	0.49
384	0.44
385	0.41
386	0.32
387	0.3
388	0.29
389	0.25
390	0.18
391	0.19
392	0.21
393	0.19
394	0.18
395	0.19
396	0.21
397	0.23
398	0.27
399	0.27
400	0.27
401	0.33
402	0.38
403	0.42
404	0.49
405	0.54
406	0.58
407	0.61
408	0.64
409	0.65
410	0.67
411	0.65
412	0.63
413	0.62
414	0.61
415	0.66
416	0.69
417	0.71
418	0.74
419	0.73
420	0.76
421	0.73
422	0.69
423	0.63
424	0.59
425	0.51
426	0.43
427	0.4
428	0.32
429	0.28
430	0.26
431	0.23
432	0.17
433	0.15
434	0.13
435	0.13
436	0.11
437	0.11
438	0.11
439	0.14
440	0.14
441	0.14
442	0.13
443	0.12
444	0.15
445	0.17
446	0.17
447	0.17
448	0.16
449	0.17
450	0.22
451	0.23
452	0.26
453	0.27
454	0.32
455	0.31
456	0.33
457	0.36
458	0.33
459	0.35
460	0.33
461	0.35
462	0.31
463	0.36
464	0.4
465	0.41
466	0.48
467	0.5
468	0.51
469	0.5
470	0.52
471	0.49
472	0.49
473	0.48
474	0.43
475	0.41
476	0.37
477	0.36
478	0.39
479	0.44
480	0.45
481	0.44
482	0.46
483	0.46
484	0.45
485	0.42
486	0.37
487	0.39
488	0.39
489	0.43
490	0.43
491	0.44
492	0.46
493	0.47
494	0.49
495	0.45
496	0.44
497	0.37
498	0.34
499	0.33
500	0.31
501	0.32
502	0.28
503	0.26
504	0.27
505	0.28
506	0.27
507	0.3
508	0.33
509	0.37
510	0.45
511	0.53
512	0.58
513	0.64
514	0.72
515	0.76
516	0.83
517	0.83
518	0.84
519	0.81
520	0.79
521	0.75
522	0.69
523	0.63
524	0.59
525	0.58
526	0.52
527	0.47
528	0.42
529	0.4
530	0.37
531	0.34
532	0.32
533	0.27
534	0.24
535	0.22
536	0.25
537	0.26
538	0.3
539	0.35
540	0.39
541	0.45
542	0.51
543	0.58
544	0.55
545	0.56
546	0.55
547	0.55
548	0.5
549	0.43
550	0.36
551	0.27
552	0.23
553	0.17
554	0.13
555	0.06
556	0.04
557	0.03
558	0.03
559	0.03
560	0.03
561	0.03
562	0.03
563	0.03
564	0.03
565	0.03
566	0.03
567	0.03
568	0.04
569	0.08
570	0.1
571	0.11
572	0.17
573	0.2
574	0.24
575	0.31
576	0.39
577	0.45
578	0.52
579	0.62
580	0.59
581	0.61
582	0.64
583	0.61
584	0.56
585	0.48
586	0.41
587	0.34
588	0.37
589	0.34
590	0.28
591	0.26
592	0.26
593	0.26
594	0.24
595	0.22
596	0.18
597	0.18
598	0.18
599	0.19
600	0.18
601	0.19
602	0.2
603	0.2
604	0.19
605	0.2
606	0.21
607	0.21
608	0.22
609	0.22
610	0.24
611	0.28
612	0.31
613	0.33
614	0.33
615	0.37
616	0.35
617	0.37
618	0.36
619	0.34
620	0.32
621	0.29
622	0.32
623	0.3
624	0.3
625	0.32
626	0.35
627	0.4
628	0.42
629	0.42
630	0.43
631	0.44
632	0.44
633	0.4
634	0.38
635	0.32
636	0.29
637	0.31
638	0.29
639	0.24
640	0.25
641	0.24
642	0.22
643	0.25
644	0.25
645	0.2
646	0.18
647	0.17
648	0.14
649	0.13
650	0.13
651	0.09
652	0.09
653	0.09
654	0.14
655	0.16
656	0.16
657	0.18
658	0.2
659	0.22
660	0.23
661	0.27
662	0.26
663	0.33
664	0.39
665	0.45
666	0.46
667	0.55
668	0.63
669	0.64
670	0.63
671	0.56
672	0.5
673	0.45
674	0.49
675	0.45
676	0.39
677	0.37
678	0.35
679	0.35
680	0.33
681	0.32
682	0.25
683	0.19
684	0.17
685	0.18
686	0.21
687	0.22
688	0.23
689	0.29
690	0.31
691	0.3
692	0.32

A0A395H964

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer