Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A395HZP6

Protein Details
Accession A0A395HZP6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
39-61ASKGEDGKPKKKKWTPAELRELDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
36-51KKEASKGEDGKPKKKK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, mito_nucl 9.333, cyto 8.5, cyto_mito 5.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR037212  Med7/Med21-like  
IPR009244  Mediatior_Med7  
IPR044888  Mediatior_Med7_sf  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF05983  Med7  
Amino Acid Sequences MADAGQQRALTTAFAPPPPLWKHFTPENIKRLEQIKKEASKGEDGKPKKKKWTPAELRELDLPPELRFLVPPAIPTSGHYSVFGELQSLSTALPSLQDQGITQLYPSTPSAEDDRQSPSEPTRPLNHAYYLLKISKSLLLNFLEFVGILSIAPEQFEAKVEDLRNLFINAHHLLNLYRPHQARESLIMMMEEQLGRTKKEIEEMDKLKAEITGVLERLEADGNAAQASAQADKDSKQNSATDAQAIEDAKLIWDLLDEKTNG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.23
3 0.22
4 0.29
5 0.33
6 0.36
7 0.35
8 0.34
9 0.39
10 0.43
11 0.51
12 0.54
13 0.58
14 0.62
15 0.61
16 0.59
17 0.58
18 0.59
19 0.58
20 0.53
21 0.53
22 0.54
23 0.55
24 0.57
25 0.57
26 0.53
27 0.54
28 0.53
29 0.52
30 0.53
31 0.54
32 0.61
33 0.66
34 0.69
35 0.71
36 0.74
37 0.76
38 0.76
39 0.81
40 0.81
41 0.81
42 0.85
43 0.76
44 0.72
45 0.66
46 0.58
47 0.47
48 0.4
49 0.31
50 0.21
51 0.2
52 0.18
53 0.14
54 0.13
55 0.14
56 0.15
57 0.14
58 0.15
59 0.15
60 0.16
61 0.16
62 0.18
63 0.23
64 0.22
65 0.22
66 0.21
67 0.2
68 0.19
69 0.2
70 0.18
71 0.11
72 0.08
73 0.08
74 0.08
75 0.07
76 0.06
77 0.05
78 0.05
79 0.05
80 0.05
81 0.05
82 0.07
83 0.07
84 0.07
85 0.07
86 0.09
87 0.1
88 0.09
89 0.09
90 0.08
91 0.08
92 0.09
93 0.1
94 0.1
95 0.09
96 0.11
97 0.15
98 0.16
99 0.16
100 0.16
101 0.2
102 0.19
103 0.2
104 0.2
105 0.18
106 0.22
107 0.23
108 0.24
109 0.24
110 0.25
111 0.27
112 0.27
113 0.26
114 0.24
115 0.23
116 0.22
117 0.21
118 0.2
119 0.17
120 0.15
121 0.15
122 0.15
123 0.16
124 0.14
125 0.15
126 0.15
127 0.15
128 0.15
129 0.14
130 0.1
131 0.09
132 0.08
133 0.05
134 0.04
135 0.03
136 0.03
137 0.04
138 0.04
139 0.04
140 0.04
141 0.04
142 0.04
143 0.06
144 0.07
145 0.08
146 0.12
147 0.12
148 0.15
149 0.15
150 0.16
151 0.16
152 0.15
153 0.14
154 0.11
155 0.15
156 0.13
157 0.13
158 0.13
159 0.12
160 0.12
161 0.15
162 0.19
163 0.16
164 0.21
165 0.21
166 0.24
167 0.26
168 0.27
169 0.25
170 0.26
171 0.26
172 0.2
173 0.2
174 0.17
175 0.15
176 0.14
177 0.13
178 0.09
179 0.07
180 0.12
181 0.13
182 0.14
183 0.15
184 0.17
185 0.17
186 0.24
187 0.27
188 0.27
189 0.35
190 0.37
191 0.41
192 0.39
193 0.38
194 0.32
195 0.28
196 0.23
197 0.16
198 0.17
199 0.16
200 0.15
201 0.15
202 0.15
203 0.14
204 0.15
205 0.14
206 0.1
207 0.09
208 0.09
209 0.09
210 0.09
211 0.09
212 0.08
213 0.08
214 0.1
215 0.09
216 0.09
217 0.1
218 0.11
219 0.13
220 0.19
221 0.2
222 0.21
223 0.22
224 0.23
225 0.25
226 0.28
227 0.28
228 0.25
229 0.23
230 0.22
231 0.22
232 0.22
233 0.18
234 0.16
235 0.14
236 0.12
237 0.12
238 0.11
239 0.07
240 0.08
241 0.1
242 0.11