Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A395HVM1

Protein Details
Accession A0A395HVM1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
459-480MIAIPRRKRPDPRTHTARPSSSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
465-466RK
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 13.333, cyto 9, cyto_mito 5.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024662  Trs65  
Gene Ontology GO:1990071  C:TRAPPII protein complex  
GO:0006891  P:intra-Golgi vesicle-mediated transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF12735  Trs65  
Amino Acid Sequences MPSLDVPGEFLRHAVLDTVVPHASDVDLEAALTSALEGGADDLTSVLSLIPQRSVLFFDEFCTVRIVLRLSNCSPASLKQYLPQLEVGLDAFAIDPAETVAENPTPTRDLIFSGAVKAQEPLVVVNEFEGDSGEGNHVYVIWSIEAFLKRPRIRITHPSLLFIASANLNLAKNQRQISRGDDYLPPLIPASANVLQPLSSDKSLSLKDPFLPASRLLRVVPAKQTEDPIYHIQQHSGHPIRVVPAASARIRYARLNSYSGRPTTVASLDFEVTPFLTCDVTFDKAELRLSDGTIETLSDAPGLVPPIKCLPRDDVTLVYKLTPEYGQNPSPSTTVMVSVLDISLEAVIHLSDNCNPRILMQWRTNVDFSLPLNPTFGAPSQALQRNNRPASLPMNQNLNNASAAATGINRTSLRDRAYSTTDLGVSVSFTGPPRVEVGKPFAWNVFIVNRSTTARKFAMIAIPRRKRPDPRTHTARPSSSSASVRKETQVAEAVTDDNIVHALQKSVAGQEAELVSMSTDVRAGPLLPGTCFATELKLLPLAVGALRLEAVRLVDVNTNETTDIRDLPDILSFDRNEVPPVSSS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.11
3 0.11
4 0.12
5 0.15
6 0.14
7 0.14
8 0.14
9 0.13
10 0.12
11 0.1
12 0.11
13 0.09
14 0.08
15 0.08
16 0.08
17 0.07
18 0.07
19 0.07
20 0.05
21 0.04
22 0.04
23 0.04
24 0.03
25 0.04
26 0.05
27 0.05
28 0.05
29 0.05
30 0.05
31 0.05
32 0.05
33 0.04
34 0.06
35 0.09
36 0.1
37 0.11
38 0.13
39 0.14
40 0.15
41 0.18
42 0.18
43 0.19
44 0.18
45 0.19
46 0.22
47 0.22
48 0.22
49 0.22
50 0.19
51 0.16
52 0.19
53 0.19
54 0.18
55 0.22
56 0.27
57 0.26
58 0.33
59 0.33
60 0.32
61 0.32
62 0.32
63 0.35
64 0.32
65 0.31
66 0.28
67 0.36
68 0.36
69 0.36
70 0.34
71 0.28
72 0.25
73 0.24
74 0.2
75 0.12
76 0.1
77 0.08
78 0.06
79 0.06
80 0.06
81 0.05
82 0.04
83 0.04
84 0.05
85 0.05
86 0.05
87 0.08
88 0.09
89 0.1
90 0.1
91 0.12
92 0.13
93 0.14
94 0.15
95 0.13
96 0.14
97 0.16
98 0.19
99 0.17
100 0.18
101 0.2
102 0.19
103 0.18
104 0.17
105 0.14
106 0.12
107 0.12
108 0.11
109 0.11
110 0.11
111 0.1
112 0.1
113 0.1
114 0.09
115 0.09
116 0.08
117 0.06
118 0.06
119 0.07
120 0.08
121 0.07
122 0.07
123 0.07
124 0.06
125 0.07
126 0.07
127 0.07
128 0.06
129 0.06
130 0.07
131 0.11
132 0.12
133 0.13
134 0.17
135 0.26
136 0.27
137 0.32
138 0.37
139 0.38
140 0.44
141 0.52
142 0.56
143 0.57
144 0.55
145 0.53
146 0.49
147 0.43
148 0.37
149 0.27
150 0.2
151 0.11
152 0.1
153 0.08
154 0.09
155 0.09
156 0.1
157 0.14
158 0.17
159 0.21
160 0.25
161 0.28
162 0.28
163 0.31
164 0.34
165 0.36
166 0.32
167 0.3
168 0.28
169 0.28
170 0.28
171 0.26
172 0.21
173 0.16
174 0.15
175 0.12
176 0.11
177 0.14
178 0.14
179 0.14
180 0.15
181 0.14
182 0.14
183 0.14
184 0.17
185 0.14
186 0.11
187 0.12
188 0.12
189 0.15
190 0.16
191 0.18
192 0.18
193 0.16
194 0.17
195 0.19
196 0.21
197 0.19
198 0.2
199 0.2
200 0.21
201 0.21
202 0.21
203 0.19
204 0.23
205 0.23
206 0.24
207 0.27
208 0.26
209 0.28
210 0.27
211 0.3
212 0.26
213 0.25
214 0.26
215 0.25
216 0.24
217 0.25
218 0.24
219 0.24
220 0.25
221 0.25
222 0.29
223 0.28
224 0.26
225 0.22
226 0.23
227 0.22
228 0.21
229 0.2
230 0.12
231 0.11
232 0.15
233 0.15
234 0.16
235 0.15
236 0.15
237 0.16
238 0.17
239 0.18
240 0.19
241 0.21
242 0.24
243 0.24
244 0.27
245 0.29
246 0.28
247 0.26
248 0.22
249 0.2
250 0.18
251 0.18
252 0.14
253 0.12
254 0.12
255 0.11
256 0.11
257 0.1
258 0.09
259 0.07
260 0.07
261 0.06
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.07
266 0.08
267 0.1
268 0.1
269 0.1
270 0.11
271 0.12
272 0.12
273 0.11
274 0.12
275 0.1
276 0.1
277 0.1
278 0.09
279 0.09
280 0.08
281 0.08
282 0.06
283 0.05
284 0.05
285 0.04
286 0.04
287 0.04
288 0.04
289 0.06
290 0.07
291 0.07
292 0.08
293 0.13
294 0.15
295 0.16
296 0.17
297 0.21
298 0.21
299 0.23
300 0.23
301 0.23
302 0.23
303 0.23
304 0.22
305 0.18
306 0.16
307 0.13
308 0.13
309 0.1
310 0.09
311 0.11
312 0.15
313 0.17
314 0.18
315 0.19
316 0.2
317 0.19
318 0.18
319 0.16
320 0.12
321 0.11
322 0.1
323 0.09
324 0.07
325 0.07
326 0.07
327 0.05
328 0.05
329 0.04
330 0.03
331 0.03
332 0.03
333 0.03
334 0.03
335 0.03
336 0.03
337 0.04
338 0.09
339 0.12
340 0.12
341 0.13
342 0.13
343 0.14
344 0.21
345 0.24
346 0.26
347 0.28
348 0.34
349 0.35
350 0.38
351 0.38
352 0.3
353 0.28
354 0.23
355 0.19
356 0.2
357 0.19
358 0.17
359 0.17
360 0.17
361 0.17
362 0.16
363 0.15
364 0.11
365 0.1
366 0.11
367 0.17
368 0.23
369 0.26
370 0.29
371 0.36
372 0.43
373 0.44
374 0.44
375 0.39
376 0.36
377 0.37
378 0.39
379 0.37
380 0.3
381 0.36
382 0.36
383 0.36
384 0.34
385 0.3
386 0.24
387 0.19
388 0.17
389 0.1
390 0.09
391 0.08
392 0.07
393 0.06
394 0.06
395 0.09
396 0.09
397 0.11
398 0.14
399 0.17
400 0.2
401 0.21
402 0.24
403 0.25
404 0.3
405 0.3
406 0.28
407 0.25
408 0.23
409 0.21
410 0.18
411 0.14
412 0.1
413 0.09
414 0.08
415 0.08
416 0.08
417 0.11
418 0.11
419 0.12
420 0.14
421 0.16
422 0.17
423 0.18
424 0.24
425 0.25
426 0.27
427 0.27
428 0.25
429 0.23
430 0.22
431 0.21
432 0.19
433 0.17
434 0.17
435 0.16
436 0.18
437 0.2
438 0.24
439 0.23
440 0.25
441 0.24
442 0.23
443 0.24
444 0.24
445 0.29
446 0.32
447 0.4
448 0.45
449 0.52
450 0.57
451 0.63
452 0.67
453 0.69
454 0.72
455 0.75
456 0.73
457 0.76
458 0.79
459 0.81
460 0.84
461 0.81
462 0.75
463 0.68
464 0.64
465 0.58
466 0.55
467 0.52
468 0.48
469 0.47
470 0.46
471 0.44
472 0.42
473 0.4
474 0.36
475 0.33
476 0.34
477 0.28
478 0.26
479 0.24
480 0.22
481 0.19
482 0.19
483 0.14
484 0.08
485 0.09
486 0.07
487 0.08
488 0.08
489 0.09
490 0.09
491 0.1
492 0.11
493 0.11
494 0.14
495 0.13
496 0.12
497 0.14
498 0.14
499 0.12
500 0.12
501 0.11
502 0.08
503 0.09
504 0.09
505 0.06
506 0.06
507 0.06
508 0.07
509 0.07
510 0.08
511 0.08
512 0.12
513 0.13
514 0.13
515 0.15
516 0.17
517 0.16
518 0.17
519 0.16
520 0.15
521 0.16
522 0.16
523 0.17
524 0.16
525 0.16
526 0.14
527 0.14
528 0.12
529 0.11
530 0.11
531 0.09
532 0.07
533 0.08
534 0.08
535 0.08
536 0.08
537 0.09
538 0.08
539 0.09
540 0.1
541 0.14
542 0.15
543 0.19
544 0.19
545 0.19
546 0.19
547 0.18
548 0.2
549 0.17
550 0.18
551 0.17
552 0.18
553 0.18
554 0.18
555 0.22
556 0.2
557 0.2
558 0.24
559 0.22
560 0.24
561 0.28
562 0.28
563 0.27
564 0.27