Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B8NPX0

Protein Details
Accession B8NPX0    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
29-51AEESKARISKRRRTQTQDDESDQHydrophilic
61-84EDLKLSKSKGKAKKPQQRSEEDVIHydrophilic
104-129EQETKSSKRKPLDKGKPPKKNKTGVVBasic
270-291LDGMQRKNEEKKKRKMEFGDAGBasic
298-317LKVRRTFKQNEVKKGRHTIKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
68-74SKGKAKK
110-125SKRKPLDKGKPPKKNK
171-177RRRSNKR
280-283KKKR
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039119  ABT1/Esf2  
IPR034353  ABT1/ESF2_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
CDD cd12263  RRM_ABT1_like  
Amino Acid Sequences MTTRKRNEFLDLAPSDDEDNDRGYDSEAAEESKARISKRRRTQTQDDESDQSDNDSVASDEDLKLSKSKGKAKKPQQRSEEDVISDNDDEQQETSGTQYLDVTEQETKSSKRKPLDKGKPPKKNKTGVVYLSSLPPYLKPFALKSMLEARSFGPITKVFLSPSVRPASAPRRRSNKRKTYTDGWVEFASKKTAKLCAETLNASIVGGRKGGWYHDDVWNMKYLKGFKWGDLMEQVQRERQEREAKQRIEDARARKEDKVFLQGVETGKVLDGMQRKNEEKKKRKMEFGDAGGQQTEELKVRRTFKQNEVKKGRHTIKDGEAALEDDTKRVLGKIF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.28
3 0.25
4 0.24
5 0.15
6 0.16
7 0.14
8 0.15
9 0.14
10 0.15
11 0.16
12 0.15
13 0.16
14 0.15
15 0.16
16 0.16
17 0.16
18 0.16
19 0.19
20 0.22
21 0.22
22 0.3
23 0.38
24 0.48
25 0.58
26 0.67
27 0.71
28 0.77
29 0.85
30 0.87
31 0.88
32 0.85
33 0.79
34 0.71
35 0.63
36 0.56
37 0.45
38 0.36
39 0.26
40 0.18
41 0.14
42 0.11
43 0.09
44 0.08
45 0.09
46 0.09
47 0.09
48 0.11
49 0.11
50 0.12
51 0.13
52 0.15
53 0.19
54 0.24
55 0.34
56 0.42
57 0.51
58 0.61
59 0.7
60 0.79
61 0.84
62 0.87
63 0.86
64 0.83
65 0.8
66 0.77
67 0.7
68 0.61
69 0.52
70 0.44
71 0.38
72 0.31
73 0.23
74 0.19
75 0.15
76 0.14
77 0.12
78 0.11
79 0.09
80 0.09
81 0.1
82 0.1
83 0.1
84 0.1
85 0.09
86 0.09
87 0.1
88 0.1
89 0.12
90 0.11
91 0.12
92 0.13
93 0.16
94 0.18
95 0.24
96 0.3
97 0.34
98 0.39
99 0.47
100 0.55
101 0.64
102 0.72
103 0.76
104 0.81
105 0.85
106 0.88
107 0.89
108 0.9
109 0.87
110 0.84
111 0.8
112 0.75
113 0.72
114 0.64
115 0.59
116 0.5
117 0.42
118 0.36
119 0.31
120 0.24
121 0.17
122 0.15
123 0.14
124 0.13
125 0.13
126 0.13
127 0.14
128 0.17
129 0.2
130 0.19
131 0.19
132 0.26
133 0.28
134 0.26
135 0.26
136 0.23
137 0.23
138 0.23
139 0.21
140 0.15
141 0.13
142 0.15
143 0.16
144 0.16
145 0.12
146 0.16
147 0.19
148 0.17
149 0.21
150 0.21
151 0.19
152 0.19
153 0.23
154 0.3
155 0.35
156 0.4
157 0.43
158 0.51
159 0.58
160 0.68
161 0.74
162 0.75
163 0.75
164 0.76
165 0.76
166 0.71
167 0.72
168 0.69
169 0.6
170 0.51
171 0.44
172 0.38
173 0.32
174 0.28
175 0.24
176 0.17
177 0.17
178 0.16
179 0.21
180 0.21
181 0.23
182 0.23
183 0.23
184 0.25
185 0.25
186 0.24
187 0.19
188 0.18
189 0.15
190 0.14
191 0.1
192 0.09
193 0.08
194 0.07
195 0.07
196 0.08
197 0.09
198 0.1
199 0.11
200 0.14
201 0.18
202 0.23
203 0.23
204 0.23
205 0.28
206 0.27
207 0.26
208 0.26
209 0.24
210 0.21
211 0.29
212 0.29
213 0.23
214 0.29
215 0.28
216 0.26
217 0.27
218 0.27
219 0.22
220 0.25
221 0.25
222 0.22
223 0.25
224 0.26
225 0.26
226 0.3
227 0.37
228 0.39
229 0.49
230 0.55
231 0.54
232 0.54
233 0.59
234 0.55
235 0.52
236 0.53
237 0.5
238 0.49
239 0.55
240 0.56
241 0.52
242 0.53
243 0.52
244 0.48
245 0.48
246 0.4
247 0.33
248 0.31
249 0.31
250 0.29
251 0.24
252 0.21
253 0.14
254 0.13
255 0.13
256 0.12
257 0.13
258 0.18
259 0.2
260 0.25
261 0.31
262 0.35
263 0.45
264 0.54
265 0.6
266 0.64
267 0.72
268 0.77
269 0.78
270 0.84
271 0.81
272 0.81
273 0.78
274 0.74
275 0.71
276 0.61
277 0.56
278 0.47
279 0.4
280 0.3
281 0.23
282 0.2
283 0.16
284 0.16
285 0.21
286 0.27
287 0.32
288 0.39
289 0.47
290 0.52
291 0.58
292 0.67
293 0.7
294 0.75
295 0.8
296 0.78
297 0.77
298 0.81
299 0.79
300 0.77
301 0.73
302 0.69
303 0.67
304 0.68
305 0.61
306 0.53
307 0.45
308 0.38
309 0.34
310 0.32
311 0.25
312 0.18
313 0.17
314 0.16
315 0.15