Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A395HT04

Protein Details
Accession A0A395HT04    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
154-173QTSKKGGKKRRGKGQQLQELHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
144-166GKKRKRAQEEQTSKKGGKKRRGK
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto 10.5, cyto_mito 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010301  RRP1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0030688  C:preribosome, small subunit precursor  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF05997  Nop52  
Amino Acid Sequences MTDLGKTPFIKELASSDKKLRDKATTSLTLFLRAKTDLSNLDLLKLWKGLFFCFYHSDRPLTQQALARTLSYNLVPTLPKATTQKFLRAFWLTIGRDFHSIDRLRLDKYLFLIRCYVGVGFEVFVRGGKQKEDLNGAGDGDVEGKKRKRAQEEQTSKKGGKKRRGKGQQLQELPKEDEEKVEDGEKNDWTALESYLAILEDGPLCPVNFDPDQPPANEAEDFIPMPHGPDGLRYHVMDIWVDELEKVLEFEEEVTAEDGTTVKKPKGQVPGDLLLRPLERLRTESPYKPVRVRAAEALDDERLVQWGWKERKVESESEDDSEDEEWGGFGEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.38
3 0.4
4 0.48
5 0.52
6 0.56
7 0.55
8 0.53
9 0.51
10 0.54
11 0.55
12 0.54
13 0.51
14 0.52
15 0.48
16 0.48
17 0.45
18 0.39
19 0.34
20 0.27
21 0.27
22 0.22
23 0.25
24 0.2
25 0.22
26 0.26
27 0.24
28 0.24
29 0.26
30 0.25
31 0.23
32 0.23
33 0.2
34 0.16
35 0.17
36 0.17
37 0.18
38 0.18
39 0.2
40 0.24
41 0.26
42 0.3
43 0.32
44 0.34
45 0.31
46 0.36
47 0.37
48 0.34
49 0.35
50 0.33
51 0.33
52 0.33
53 0.33
54 0.28
55 0.24
56 0.23
57 0.21
58 0.17
59 0.16
60 0.12
61 0.14
62 0.13
63 0.13
64 0.16
65 0.15
66 0.18
67 0.22
68 0.24
69 0.3
70 0.33
71 0.4
72 0.4
73 0.41
74 0.43
75 0.41
76 0.38
77 0.33
78 0.39
79 0.31
80 0.3
81 0.32
82 0.27
83 0.26
84 0.27
85 0.24
86 0.24
87 0.24
88 0.22
89 0.25
90 0.25
91 0.25
92 0.26
93 0.26
94 0.19
95 0.21
96 0.28
97 0.23
98 0.23
99 0.24
100 0.21
101 0.21
102 0.2
103 0.17
104 0.09
105 0.09
106 0.08
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.06
111 0.06
112 0.07
113 0.09
114 0.09
115 0.1
116 0.12
117 0.14
118 0.16
119 0.19
120 0.19
121 0.18
122 0.18
123 0.17
124 0.14
125 0.12
126 0.1
127 0.08
128 0.08
129 0.08
130 0.12
131 0.14
132 0.19
133 0.24
134 0.29
135 0.36
136 0.44
137 0.52
138 0.59
139 0.67
140 0.7
141 0.71
142 0.69
143 0.62
144 0.59
145 0.56
146 0.53
147 0.53
148 0.56
149 0.58
150 0.65
151 0.73
152 0.77
153 0.79
154 0.81
155 0.79
156 0.75
157 0.71
158 0.63
159 0.56
160 0.48
161 0.41
162 0.33
163 0.25
164 0.19
165 0.17
166 0.16
167 0.13
168 0.15
169 0.15
170 0.14
171 0.15
172 0.15
173 0.13
174 0.12
175 0.11
176 0.1
177 0.1
178 0.09
179 0.07
180 0.07
181 0.07
182 0.07
183 0.07
184 0.06
185 0.04
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.06
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.1
195 0.1
196 0.11
197 0.13
198 0.16
199 0.18
200 0.18
201 0.19
202 0.17
203 0.18
204 0.16
205 0.15
206 0.12
207 0.12
208 0.12
209 0.11
210 0.11
211 0.09
212 0.1
213 0.1
214 0.09
215 0.08
216 0.13
217 0.15
218 0.18
219 0.2
220 0.19
221 0.2
222 0.21
223 0.21
224 0.16
225 0.14
226 0.12
227 0.1
228 0.1
229 0.08
230 0.07
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.06
238 0.06
239 0.06
240 0.07
241 0.07
242 0.07
243 0.07
244 0.07
245 0.07
246 0.08
247 0.12
248 0.14
249 0.14
250 0.18
251 0.21
252 0.27
253 0.37
254 0.38
255 0.4
256 0.44
257 0.49
258 0.49
259 0.47
260 0.41
261 0.34
262 0.32
263 0.27
264 0.23
265 0.2
266 0.19
267 0.23
268 0.27
269 0.32
270 0.37
271 0.41
272 0.47
273 0.5
274 0.55
275 0.55
276 0.58
277 0.58
278 0.57
279 0.56
280 0.54
281 0.51
282 0.47
283 0.45
284 0.41
285 0.33
286 0.28
287 0.25
288 0.19
289 0.15
290 0.13
291 0.12
292 0.14
293 0.23
294 0.29
295 0.34
296 0.36
297 0.37
298 0.46
299 0.48
300 0.49
301 0.44
302 0.45
303 0.43
304 0.42
305 0.42
306 0.33
307 0.3
308 0.26
309 0.22
310 0.14
311 0.11
312 0.09