Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A395HHV9

Protein Details
Accession A0A395HHV9    Localization Confidence High Confidence Score 19.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
25-49SAPEPPSKKALRKAKKAATTKPSESHydrophilic
259-285EAESDSEKRKKPRKPRQRKVWVNFLLGHydrophilic
296-315ATTRYKKRFGKDGEGKKNNNHydrophilic
329-352TEEQPRQARPPRAKQAKPDYTRYDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
31-42SKKALRKAKKAA
266-277KRKKPRKPRQRK
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 14.5, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MASIGEGTQKKRKLTDVEEIEIDVSAPEPPSKKALRKAKKAATTKPSESKPETEGVTAAEKPSSTAPQKRSDYGVWIGNLAFTVTKDDLRTFLTSNCSFADTTITRIHMPKGAEKFGKSQNKGFAYVDFSTQKAAQEAIGLSEQLLTGRRVLIKDAKSFAGRPDKPQEDGQKAGSGASGHAPSKRIFVGNLGFDATKEAIEEHFAQCGTVANVHVATFQDSGKCKGYAWVVFEDLAAAEAAVKGYVLVKEDEEEEEEEEAESDSEKRKKPRKPRQRKVWVNFLLGRRLRMEFAEDATTRYKKRFGKDGEGKKNNNSETGDAEAGEFEATEEQPRQARPPRAKQAKPDYTRYDQDTVQKLSGAIVESQGKKTTFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.59
3 0.57
4 0.56
5 0.53
6 0.5
7 0.43
8 0.35
9 0.28
10 0.18
11 0.11
12 0.08
13 0.09
14 0.12
15 0.13
16 0.15
17 0.23
18 0.3
19 0.37
20 0.46
21 0.56
22 0.62
23 0.71
24 0.8
25 0.82
26 0.84
27 0.85
28 0.85
29 0.83
30 0.81
31 0.78
32 0.77
33 0.72
34 0.7
35 0.67
36 0.61
37 0.54
38 0.5
39 0.44
40 0.36
41 0.31
42 0.26
43 0.25
44 0.22
45 0.19
46 0.16
47 0.14
48 0.15
49 0.17
50 0.22
51 0.25
52 0.32
53 0.36
54 0.45
55 0.49
56 0.5
57 0.52
58 0.46
59 0.45
60 0.41
61 0.41
62 0.31
63 0.29
64 0.26
65 0.21
66 0.2
67 0.15
68 0.11
69 0.07
70 0.11
71 0.11
72 0.13
73 0.14
74 0.15
75 0.16
76 0.18
77 0.2
78 0.17
79 0.18
80 0.24
81 0.23
82 0.24
83 0.23
84 0.22
85 0.2
86 0.19
87 0.23
88 0.16
89 0.2
90 0.2
91 0.21
92 0.21
93 0.23
94 0.24
95 0.21
96 0.22
97 0.25
98 0.27
99 0.31
100 0.32
101 0.32
102 0.36
103 0.42
104 0.5
105 0.46
106 0.46
107 0.48
108 0.48
109 0.49
110 0.44
111 0.36
112 0.32
113 0.3
114 0.3
115 0.23
116 0.21
117 0.2
118 0.2
119 0.19
120 0.14
121 0.13
122 0.09
123 0.1
124 0.1
125 0.09
126 0.09
127 0.08
128 0.07
129 0.07
130 0.07
131 0.06
132 0.08
133 0.07
134 0.07
135 0.09
136 0.1
137 0.1
138 0.13
139 0.19
140 0.21
141 0.24
142 0.25
143 0.26
144 0.25
145 0.26
146 0.29
147 0.32
148 0.3
149 0.32
150 0.38
151 0.38
152 0.39
153 0.44
154 0.45
155 0.38
156 0.39
157 0.35
158 0.29
159 0.27
160 0.25
161 0.2
162 0.14
163 0.1
164 0.1
165 0.11
166 0.09
167 0.11
168 0.12
169 0.12
170 0.14
171 0.14
172 0.13
173 0.11
174 0.13
175 0.14
176 0.13
177 0.13
178 0.12
179 0.11
180 0.1
181 0.12
182 0.09
183 0.07
184 0.06
185 0.06
186 0.05
187 0.08
188 0.1
189 0.09
190 0.09
191 0.09
192 0.09
193 0.09
194 0.1
195 0.08
196 0.07
197 0.07
198 0.06
199 0.07
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.08
204 0.08
205 0.08
206 0.12
207 0.13
208 0.16
209 0.18
210 0.18
211 0.16
212 0.18
213 0.21
214 0.2
215 0.21
216 0.2
217 0.18
218 0.18
219 0.18
220 0.15
221 0.11
222 0.09
223 0.06
224 0.04
225 0.04
226 0.03
227 0.04
228 0.03
229 0.03
230 0.03
231 0.04
232 0.05
233 0.06
234 0.07
235 0.07
236 0.08
237 0.09
238 0.1
239 0.11
240 0.11
241 0.11
242 0.1
243 0.1
244 0.09
245 0.09
246 0.08
247 0.07
248 0.06
249 0.07
250 0.13
251 0.19
252 0.25
253 0.34
254 0.42
255 0.52
256 0.63
257 0.73
258 0.78
259 0.83
260 0.89
261 0.91
262 0.94
263 0.96
264 0.91
265 0.91
266 0.85
267 0.79
268 0.74
269 0.66
270 0.64
271 0.54
272 0.5
273 0.41
274 0.37
275 0.32
276 0.26
277 0.27
278 0.19
279 0.2
280 0.24
281 0.22
282 0.23
283 0.27
284 0.3
285 0.28
286 0.29
287 0.35
288 0.35
289 0.41
290 0.48
291 0.5
292 0.57
293 0.65
294 0.74
295 0.77
296 0.8
297 0.78
298 0.75
299 0.76
300 0.66
301 0.6
302 0.52
303 0.43
304 0.37
305 0.37
306 0.31
307 0.23
308 0.22
309 0.17
310 0.15
311 0.13
312 0.09
313 0.06
314 0.07
315 0.08
316 0.1
317 0.12
318 0.14
319 0.18
320 0.2
321 0.27
322 0.34
323 0.44
324 0.51
325 0.61
326 0.69
327 0.76
328 0.8
329 0.83
330 0.85
331 0.86
332 0.82
333 0.8
334 0.77
335 0.74
336 0.74
337 0.7
338 0.62
339 0.56
340 0.58
341 0.56
342 0.52
343 0.46
344 0.41
345 0.35
346 0.32
347 0.31
348 0.24
349 0.18
350 0.17
351 0.24
352 0.26
353 0.28
354 0.33