Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1CD17

Protein Details
Accession A0A0D1CD17    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
228-253GITPPMQWARKRRFRKRAARRAIETTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
25-32RPKRAIRP
237-249RKRRFRKRAARRA
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 14, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR037817  TAF7  
IPR006751  TAFII55_prot_cons_reg  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0051123  P:RNA polymerase II preinitiation complex assembly  
KEGG uma:UMAG_10620  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04658  TAFII55_N  
CDD cd08047  TAF7  
Amino Acid Sequences MSEGSGSASPAPRASPGELGPGGTRPKRAIRPTAKALLAREQSPEGWEHGGGRRSQPSRPIRTSSGARPQIKLKMKASGGGTAAGTGQGPKTQAYMQSYDRELDSEDDETGQGLAFEEQLIFRMPVGPECDKLRDSIQKRQLGDDVWFKFKDSRRAVVHVGDSLFSAKLVDLPTITESHKTLDNRQFFKVADIAQMLVVEGKIADESQASSGGGGKGFNIDDFIYPHGITPPMQWARKRRFRKRAARRAIETTEKEVERLLKADKKAEQVEYEMIDAADEGGSEEDEDEQRGGQARRGATSPGGSQAETPMPDGSDVGSQDEGADDGGEDGEGQGHRRRTDMDEDGGQHGYDDQDLDEDDVDEDLAAELDAALEEEEDDDDDGSTRGANSEAQSRGSDQEDLWDDDDDDDADEADEEDEYEEDENDEEKEQRVREAQLEAECRELETLVRRKQADVDGTMNLIIKNRHQQALRKLATERDMKRNQLADLKQTRKERKEASQAAAASAAAAAAAETEEAAGASSHADANIQSRAGDDYIMQPLGHSQPSVTASLSSSATADAVARDDPPKTPSQSRGMPPPALPASRNASQPSTTATRPEASIAQSQEGGGDLWDDDEEEEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.25
3 0.24
4 0.29
5 0.28
6 0.29
7 0.27
8 0.28
9 0.34
10 0.32
11 0.35
12 0.33
13 0.41
14 0.49
15 0.55
16 0.61
17 0.63
18 0.69
19 0.73
20 0.76
21 0.72
22 0.66
23 0.62
24 0.61
25 0.55
26 0.47
27 0.43
28 0.37
29 0.34
30 0.32
31 0.3
32 0.23
33 0.21
34 0.2
35 0.21
36 0.25
37 0.29
38 0.29
39 0.32
40 0.39
41 0.39
42 0.43
43 0.49
44 0.53
45 0.58
46 0.62
47 0.63
48 0.59
49 0.63
50 0.65
51 0.64
52 0.65
53 0.65
54 0.62
55 0.59
56 0.59
57 0.62
58 0.65
59 0.64
60 0.55
61 0.54
62 0.52
63 0.54
64 0.5
65 0.45
66 0.37
67 0.31
68 0.28
69 0.2
70 0.2
71 0.15
72 0.13
73 0.09
74 0.09
75 0.09
76 0.1
77 0.1
78 0.13
79 0.14
80 0.19
81 0.23
82 0.26
83 0.28
84 0.32
85 0.33
86 0.32
87 0.3
88 0.26
89 0.23
90 0.2
91 0.19
92 0.16
93 0.15
94 0.14
95 0.13
96 0.13
97 0.11
98 0.09
99 0.07
100 0.06
101 0.06
102 0.06
103 0.06
104 0.06
105 0.06
106 0.07
107 0.09
108 0.08
109 0.08
110 0.12
111 0.12
112 0.14
113 0.2
114 0.21
115 0.22
116 0.25
117 0.29
118 0.25
119 0.27
120 0.3
121 0.34
122 0.37
123 0.44
124 0.5
125 0.53
126 0.53
127 0.54
128 0.51
129 0.43
130 0.42
131 0.41
132 0.35
133 0.34
134 0.33
135 0.32
136 0.36
137 0.39
138 0.45
139 0.41
140 0.45
141 0.44
142 0.49
143 0.5
144 0.47
145 0.44
146 0.36
147 0.32
148 0.25
149 0.21
150 0.18
151 0.15
152 0.11
153 0.1
154 0.06
155 0.09
156 0.09
157 0.09
158 0.08
159 0.09
160 0.11
161 0.13
162 0.13
163 0.13
164 0.13
165 0.14
166 0.19
167 0.2
168 0.27
169 0.34
170 0.41
171 0.42
172 0.43
173 0.44
174 0.39
175 0.39
176 0.33
177 0.26
178 0.2
179 0.17
180 0.16
181 0.14
182 0.13
183 0.11
184 0.08
185 0.07
186 0.05
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.05
194 0.06
195 0.07
196 0.06
197 0.06
198 0.08
199 0.08
200 0.09
201 0.08
202 0.07
203 0.08
204 0.08
205 0.08
206 0.08
207 0.08
208 0.08
209 0.09
210 0.1
211 0.1
212 0.1
213 0.11
214 0.11
215 0.11
216 0.1
217 0.1
218 0.18
219 0.22
220 0.25
221 0.3
222 0.38
223 0.47
224 0.57
225 0.66
226 0.68
227 0.73
228 0.81
229 0.87
230 0.9
231 0.91
232 0.91
233 0.89
234 0.82
235 0.78
236 0.72
237 0.68
238 0.59
239 0.52
240 0.47
241 0.39
242 0.34
243 0.29
244 0.26
245 0.2
246 0.19
247 0.19
248 0.19
249 0.2
250 0.24
251 0.26
252 0.28
253 0.3
254 0.3
255 0.27
256 0.24
257 0.24
258 0.2
259 0.17
260 0.13
261 0.1
262 0.09
263 0.07
264 0.06
265 0.04
266 0.03
267 0.03
268 0.03
269 0.03
270 0.03
271 0.03
272 0.04
273 0.04
274 0.05
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.1
279 0.1
280 0.11
281 0.15
282 0.15
283 0.16
284 0.17
285 0.17
286 0.14
287 0.15
288 0.13
289 0.13
290 0.14
291 0.13
292 0.12
293 0.13
294 0.13
295 0.12
296 0.12
297 0.09
298 0.08
299 0.08
300 0.08
301 0.07
302 0.07
303 0.07
304 0.07
305 0.07
306 0.06
307 0.06
308 0.06
309 0.05
310 0.04
311 0.04
312 0.03
313 0.03
314 0.03
315 0.03
316 0.03
317 0.02
318 0.04
319 0.04
320 0.06
321 0.1
322 0.12
323 0.13
324 0.14
325 0.16
326 0.18
327 0.23
328 0.24
329 0.23
330 0.23
331 0.24
332 0.25
333 0.23
334 0.2
335 0.14
336 0.12
337 0.1
338 0.08
339 0.06
340 0.04
341 0.04
342 0.05
343 0.05
344 0.05
345 0.05
346 0.05
347 0.05
348 0.04
349 0.04
350 0.04
351 0.03
352 0.03
353 0.03
354 0.02
355 0.02
356 0.02
357 0.02
358 0.02
359 0.02
360 0.02
361 0.02
362 0.03
363 0.03
364 0.03
365 0.04
366 0.04
367 0.04
368 0.04
369 0.04
370 0.04
371 0.04
372 0.04
373 0.04
374 0.05
375 0.06
376 0.07
377 0.13
378 0.14
379 0.15
380 0.16
381 0.17
382 0.18
383 0.19
384 0.19
385 0.12
386 0.16
387 0.17
388 0.18
389 0.18
390 0.16
391 0.15
392 0.14
393 0.14
394 0.1
395 0.08
396 0.06
397 0.05
398 0.05
399 0.05
400 0.05
401 0.04
402 0.04
403 0.04
404 0.04
405 0.04
406 0.05
407 0.05
408 0.05
409 0.05
410 0.06
411 0.06
412 0.07
413 0.08
414 0.08
415 0.1
416 0.13
417 0.13
418 0.15
419 0.18
420 0.19
421 0.2
422 0.21
423 0.22
424 0.24
425 0.27
426 0.25
427 0.24
428 0.22
429 0.2
430 0.19
431 0.16
432 0.12
433 0.18
434 0.25
435 0.28
436 0.34
437 0.34
438 0.35
439 0.39
440 0.42
441 0.38
442 0.33
443 0.3
444 0.26
445 0.25
446 0.25
447 0.22
448 0.18
449 0.16
450 0.14
451 0.15
452 0.22
453 0.25
454 0.3
455 0.32
456 0.39
457 0.46
458 0.56
459 0.54
460 0.49
461 0.47
462 0.46
463 0.49
464 0.51
465 0.47
466 0.46
467 0.5
468 0.5
469 0.54
470 0.52
471 0.49
472 0.48
473 0.45
474 0.45
475 0.49
476 0.52
477 0.53
478 0.6
479 0.67
480 0.64
481 0.7
482 0.66
483 0.65
484 0.7
485 0.7
486 0.65
487 0.61
488 0.56
489 0.49
490 0.43
491 0.34
492 0.23
493 0.16
494 0.11
495 0.05
496 0.04
497 0.03
498 0.03
499 0.03
500 0.03
501 0.03
502 0.03
503 0.03
504 0.03
505 0.04
506 0.04
507 0.04
508 0.04
509 0.05
510 0.06
511 0.06
512 0.06
513 0.07
514 0.09
515 0.12
516 0.11
517 0.11
518 0.11
519 0.13
520 0.13
521 0.13
522 0.11
523 0.12
524 0.15
525 0.16
526 0.15
527 0.13
528 0.16
529 0.19
530 0.19
531 0.16
532 0.13
533 0.16
534 0.19
535 0.2
536 0.18
537 0.15
538 0.15
539 0.18
540 0.18
541 0.14
542 0.12
543 0.11
544 0.11
545 0.1
546 0.09
547 0.08
548 0.09
549 0.09
550 0.11
551 0.12
552 0.14
553 0.16
554 0.19
555 0.25
556 0.29
557 0.35
558 0.39
559 0.45
560 0.51
561 0.54
562 0.6
563 0.6
564 0.58
565 0.52
566 0.54
567 0.52
568 0.46
569 0.42
570 0.38
571 0.38
572 0.39
573 0.42
574 0.38
575 0.36
576 0.35
577 0.35
578 0.36
579 0.34
580 0.32
581 0.32
582 0.31
583 0.3
584 0.3
585 0.32
586 0.29
587 0.27
588 0.32
589 0.3
590 0.29
591 0.27
592 0.26
593 0.23
594 0.21
595 0.17
596 0.11
597 0.1
598 0.07
599 0.07
600 0.08
601 0.08