Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1C3A9

Protein Details
Accession A0A0D1C3A9    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
19-39QQDPRKQLHHQQQQQLHQPYSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 26.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR034069  R3H_Cip2  
IPR001374  R3H_dom  
IPR036867  R3H_dom_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003729  F:mRNA binding  
KEGG uma:UMAG_03771  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01424  R3H  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51061  R3H  
PS50102  RRM  
CDD cd02639  R3H_RRM  
Amino Acid Sequences MSTDSVHHAFRGLNLGDAQQDPRKQLHHQQQQQLHQPYSSPTRHTESTSLRSPTILTTDLHGQHGYHTASIGASHPVTAPSDGSIGQSAAARFERFFPSSPNTSTSNPSSAGQTFTSSIGSAAGLAANGAFGSFGQSLAPGSMASSSISSAHFGSSSNAPRKAPSRAAIPAQWSSQDPSSLVPPAGTSPPNNMGSLPSYHDPIAQTAAAAAANNNNNNNGDDDVIPTAIVVKNIPFSVKKEQLLQIIEDLGIPMPYAFNYHMDQGVFRGLAFANFRSAEEADAVVAALNGFDVSGRKLRVEYKKVLQAGEKERIEKEKAIKRMQSMQLEKERRRQNDEYTAHAYLMPGYNASNGHLAANDAYSADPAISGLQHAVYDGSVIAPLTADSLRKVPSSQRLAAAVERPSGPSSSTSNPGVGASNQFGAAAGAAAAKKEELDLNDAATLEIYSRVLLFKDDRMRDELAFSRSLTPLERRTVHLVAQRLGLFHYSMGDGDERYAIVTKNDVHAQARPLRSQASTIGRAQRSTGIDAAATGGFLGPGSAATTGRAGLRLKKSAPDMKRDRDGSTGYSAANGYLHSSNGSSSLAARKSNSNLRDGYSSTMGRRTQNGSNNSNSNSNSNSTATGGAAGLQNLFASPFDAPPVPSLTNVNAPEGSSHTSSPTHSTLLRQPRGPPTPGSSDSRNFAVRSRVPTAGTSSTGSTTSPPPPAHAGFQLHINGSPTKYHSSEQATTQEPLEF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.22
3 0.23
4 0.24
5 0.27
6 0.26
7 0.29
8 0.3
9 0.33
10 0.36
11 0.39
12 0.48
13 0.54
14 0.58
15 0.64
16 0.7
17 0.75
18 0.8
19 0.84
20 0.81
21 0.72
22 0.61
23 0.54
24 0.5
25 0.51
26 0.46
27 0.4
28 0.38
29 0.42
30 0.44
31 0.46
32 0.48
33 0.47
34 0.5
35 0.53
36 0.52
37 0.46
38 0.44
39 0.4
40 0.35
41 0.31
42 0.27
43 0.19
44 0.19
45 0.26
46 0.28
47 0.29
48 0.27
49 0.23
50 0.23
51 0.28
52 0.26
53 0.19
54 0.17
55 0.15
56 0.15
57 0.15
58 0.15
59 0.13
60 0.11
61 0.12
62 0.12
63 0.13
64 0.14
65 0.14
66 0.14
67 0.11
68 0.13
69 0.12
70 0.13
71 0.13
72 0.11
73 0.11
74 0.13
75 0.12
76 0.15
77 0.17
78 0.17
79 0.16
80 0.2
81 0.24
82 0.24
83 0.25
84 0.27
85 0.31
86 0.35
87 0.37
88 0.37
89 0.35
90 0.35
91 0.39
92 0.37
93 0.34
94 0.31
95 0.29
96 0.3
97 0.27
98 0.28
99 0.23
100 0.22
101 0.2
102 0.19
103 0.19
104 0.15
105 0.14
106 0.11
107 0.1
108 0.08
109 0.07
110 0.06
111 0.05
112 0.05
113 0.04
114 0.04
115 0.04
116 0.03
117 0.03
118 0.03
119 0.07
120 0.07
121 0.07
122 0.07
123 0.08
124 0.08
125 0.09
126 0.09
127 0.05
128 0.05
129 0.06
130 0.06
131 0.07
132 0.07
133 0.07
134 0.08
135 0.09
136 0.1
137 0.1
138 0.1
139 0.09
140 0.1
141 0.12
142 0.17
143 0.25
144 0.3
145 0.33
146 0.33
147 0.36
148 0.39
149 0.43
150 0.42
151 0.37
152 0.37
153 0.38
154 0.41
155 0.4
156 0.41
157 0.37
158 0.33
159 0.31
160 0.27
161 0.26
162 0.23
163 0.21
164 0.17
165 0.16
166 0.17
167 0.17
168 0.16
169 0.13
170 0.12
171 0.13
172 0.16
173 0.16
174 0.15
175 0.18
176 0.23
177 0.25
178 0.25
179 0.22
180 0.21
181 0.21
182 0.22
183 0.22
184 0.17
185 0.18
186 0.17
187 0.19
188 0.18
189 0.17
190 0.18
191 0.13
192 0.12
193 0.1
194 0.1
195 0.09
196 0.08
197 0.07
198 0.1
199 0.12
200 0.14
201 0.15
202 0.16
203 0.17
204 0.18
205 0.19
206 0.15
207 0.13
208 0.12
209 0.13
210 0.12
211 0.11
212 0.1
213 0.08
214 0.1
215 0.09
216 0.09
217 0.08
218 0.08
219 0.1
220 0.1
221 0.12
222 0.12
223 0.15
224 0.23
225 0.28
226 0.29
227 0.32
228 0.35
229 0.37
230 0.37
231 0.33
232 0.26
233 0.21
234 0.2
235 0.15
236 0.12
237 0.08
238 0.06
239 0.05
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.06
244 0.06
245 0.09
246 0.1
247 0.11
248 0.12
249 0.12
250 0.12
251 0.12
252 0.12
253 0.1
254 0.09
255 0.09
256 0.07
257 0.09
258 0.11
259 0.1
260 0.11
261 0.11
262 0.12
263 0.13
264 0.13
265 0.12
266 0.11
267 0.11
268 0.08
269 0.07
270 0.07
271 0.05
272 0.04
273 0.04
274 0.03
275 0.02
276 0.02
277 0.02
278 0.03
279 0.03
280 0.05
281 0.08
282 0.09
283 0.1
284 0.12
285 0.19
286 0.28
287 0.33
288 0.36
289 0.38
290 0.43
291 0.45
292 0.44
293 0.39
294 0.38
295 0.38
296 0.41
297 0.37
298 0.33
299 0.33
300 0.35
301 0.35
302 0.31
303 0.34
304 0.33
305 0.38
306 0.42
307 0.43
308 0.42
309 0.48
310 0.5
311 0.5
312 0.46
313 0.45
314 0.49
315 0.54
316 0.54
317 0.55
318 0.56
319 0.52
320 0.57
321 0.54
322 0.5
323 0.53
324 0.52
325 0.49
326 0.46
327 0.43
328 0.36
329 0.32
330 0.27
331 0.17
332 0.16
333 0.11
334 0.07
335 0.06
336 0.07
337 0.07
338 0.08
339 0.08
340 0.07
341 0.07
342 0.07
343 0.07
344 0.06
345 0.06
346 0.05
347 0.04
348 0.04
349 0.04
350 0.04
351 0.03
352 0.03
353 0.03
354 0.03
355 0.03
356 0.03
357 0.03
358 0.03
359 0.03
360 0.04
361 0.04
362 0.03
363 0.04
364 0.03
365 0.03
366 0.03
367 0.03
368 0.03
369 0.03
370 0.03
371 0.04
372 0.05
373 0.05
374 0.06
375 0.07
376 0.09
377 0.09
378 0.1
379 0.13
380 0.2
381 0.25
382 0.26
383 0.26
384 0.26
385 0.27
386 0.28
387 0.27
388 0.2
389 0.17
390 0.15
391 0.15
392 0.14
393 0.14
394 0.13
395 0.11
396 0.14
397 0.15
398 0.17
399 0.17
400 0.17
401 0.16
402 0.16
403 0.15
404 0.12
405 0.12
406 0.09
407 0.09
408 0.09
409 0.08
410 0.08
411 0.07
412 0.06
413 0.04
414 0.03
415 0.04
416 0.04
417 0.04
418 0.04
419 0.04
420 0.04
421 0.05
422 0.06
423 0.06
424 0.1
425 0.1
426 0.11
427 0.11
428 0.11
429 0.11
430 0.09
431 0.08
432 0.05
433 0.05
434 0.05
435 0.04
436 0.05
437 0.05
438 0.05
439 0.07
440 0.08
441 0.13
442 0.21
443 0.22
444 0.24
445 0.27
446 0.29
447 0.27
448 0.29
449 0.28
450 0.22
451 0.22
452 0.21
453 0.2
454 0.18
455 0.19
456 0.18
457 0.18
458 0.2
459 0.24
460 0.25
461 0.26
462 0.31
463 0.32
464 0.33
465 0.33
466 0.32
467 0.28
468 0.29
469 0.27
470 0.21
471 0.21
472 0.17
473 0.13
474 0.1
475 0.1
476 0.07
477 0.07
478 0.08
479 0.08
480 0.07
481 0.07
482 0.08
483 0.07
484 0.07
485 0.08
486 0.07
487 0.07
488 0.1
489 0.1
490 0.13
491 0.15
492 0.16
493 0.16
494 0.18
495 0.23
496 0.28
497 0.3
498 0.28
499 0.28
500 0.28
501 0.27
502 0.26
503 0.27
504 0.26
505 0.27
506 0.3
507 0.37
508 0.36
509 0.35
510 0.35
511 0.34
512 0.3
513 0.29
514 0.25
515 0.18
516 0.16
517 0.16
518 0.16
519 0.11
520 0.08
521 0.06
522 0.05
523 0.04
524 0.04
525 0.04
526 0.03
527 0.03
528 0.04
529 0.05
530 0.05
531 0.06
532 0.06
533 0.07
534 0.08
535 0.11
536 0.12
537 0.18
538 0.24
539 0.28
540 0.29
541 0.32
542 0.38
543 0.44
544 0.47
545 0.5
546 0.53
547 0.55
548 0.62
549 0.6
550 0.56
551 0.51
552 0.49
553 0.42
554 0.37
555 0.32
556 0.24
557 0.23
558 0.2
559 0.17
560 0.15
561 0.12
562 0.11
563 0.1
564 0.11
565 0.1
566 0.1
567 0.1
568 0.11
569 0.11
570 0.09
571 0.1
572 0.16
573 0.18
574 0.2
575 0.21
576 0.24
577 0.3
578 0.37
579 0.38
580 0.36
581 0.35
582 0.36
583 0.37
584 0.35
585 0.33
586 0.29
587 0.29
588 0.26
589 0.31
590 0.32
591 0.31
592 0.34
593 0.35
594 0.37
595 0.43
596 0.49
597 0.47
598 0.49
599 0.51
600 0.5
601 0.5
602 0.44
603 0.39
604 0.34
605 0.32
606 0.29
607 0.26
608 0.24
609 0.21
610 0.2
611 0.17
612 0.15
613 0.13
614 0.11
615 0.11
616 0.1
617 0.09
618 0.08
619 0.08
620 0.07
621 0.08
622 0.06
623 0.06
624 0.07
625 0.07
626 0.1
627 0.11
628 0.12
629 0.13
630 0.18
631 0.18
632 0.18
633 0.2
634 0.2
635 0.26
636 0.27
637 0.27
638 0.23
639 0.23
640 0.23
641 0.23
642 0.25
643 0.2
644 0.19
645 0.19
646 0.2
647 0.22
648 0.25
649 0.25
650 0.24
651 0.23
652 0.27
653 0.33
654 0.42
655 0.46
656 0.44
657 0.48
658 0.55
659 0.6
660 0.59
661 0.54
662 0.49
663 0.52
664 0.53
665 0.52
666 0.48
667 0.46
668 0.46
669 0.46
670 0.44
671 0.36
672 0.35
673 0.39
674 0.38
675 0.41
676 0.43
677 0.42
678 0.4
679 0.41
680 0.44
681 0.38
682 0.35
683 0.3
684 0.27
685 0.25
686 0.24
687 0.22
688 0.2
689 0.21
690 0.23
691 0.28
692 0.27
693 0.29
694 0.35
695 0.37
696 0.38
697 0.39
698 0.39
699 0.33
700 0.38
701 0.37
702 0.32
703 0.31
704 0.31
705 0.28
706 0.25
707 0.27
708 0.26
709 0.29
710 0.31
711 0.3
712 0.34
713 0.39
714 0.41
715 0.43
716 0.45
717 0.43
718 0.42