FuNGI

A0A395HQK5

Protein Details

Accession

A0A395HQK5

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
332-351	GTPIRRKKRKGALTNPSAYS	Hydrophilic
441-464	NTGAQAKRKGVKYKRGKHGNEAIG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
336-341	RRKKRK
447-457	KRKGVKYKRGK

Subcellular Location(s)

nucl 15, mito 9, cyto 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MPPRKQWIDKKNATTYQLFHRSQHDPLIHDPSADDRVLAPVSGPAPSSSSTSDAHRGQDLATLSRQFGTGAVRKNEGEAANYGIFYDDTKYDYMQHLRELGTGAGDAHFVEAKNPAAGAGNKGKMKLEDALRQVSLDDEQRSEFGGSYAPSEMHSTASTYSRKPTYQDQQNVPDAIAGFQPNMDPRLREVLEALEDEEYVDEDDNEDVFGQLTTRAEEIDQGDWEDTLYDEFDEEDEGWESDATEKAPVQTDTTAAKAQYEKRAGADDAEMPEHDAPAPDMHPEDQGWMREFAKFKKDAKSGAKPPVPAAAPSVVPSEQQSTLASTVFTVGGTPIRRKKRKGALTNPSAYSMTSSALARTEGHRLLDDRFDRVEQLYALDEEDEFDDSMSMVSGMTGMTAMTGMSAISEAPSLVDANGQTVNPRHNFTSVMDDFLAGWDDNTGAQAKRKGVKYKRGKHGNEAIGIQMLDEVRQGLGPARVGGSSGRVSGRA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.7
2	0.63
3	0.62
4	0.63
5	0.57
6	0.5
7	0.5
8	0.49
9	0.48
10	0.53
11	0.46
12	0.39
13	0.42
14	0.48
15	0.42
16	0.38
17	0.35
18	0.31
19	0.32
20	0.28
21	0.23
22	0.15
23	0.18
24	0.18
25	0.18
26	0.14
27	0.13
28	0.13
29	0.14
30	0.14
31	0.12
32	0.13
33	0.15
34	0.17
35	0.16
36	0.18
37	0.19
38	0.22
39	0.28
40	0.29
41	0.3
42	0.29
43	0.28
44	0.25
45	0.28
46	0.26
47	0.22
48	0.23
49	0.22
50	0.21
51	0.21
52	0.21
53	0.17
54	0.16
55	0.2
56	0.22
57	0.28
58	0.3
59	0.33
60	0.33
61	0.34
62	0.37
63	0.31
64	0.28
65	0.21
66	0.23
67	0.21
68	0.21
69	0.19
70	0.15
71	0.14
72	0.12
73	0.13
74	0.09
75	0.11
76	0.12
77	0.13
78	0.14
79	0.2
80	0.24
81	0.23
82	0.24
83	0.25
84	0.25
85	0.25
86	0.24
87	0.19
88	0.14
89	0.13
90	0.11
91	0.09
92	0.08
93	0.07
94	0.07
95	0.08
96	0.07
97	0.08
98	0.1
99	0.11
100	0.11
101	0.1
102	0.1
103	0.12
104	0.13
105	0.17
106	0.21
107	0.25
108	0.26
109	0.27
110	0.28
111	0.26
112	0.28
113	0.28
114	0.27
115	0.28
116	0.31
117	0.33
118	0.32
119	0.31
120	0.28
121	0.24
122	0.21
123	0.18
124	0.16
125	0.14
126	0.14
127	0.15
128	0.16
129	0.15
130	0.13
131	0.1
132	0.1
133	0.1
134	0.1
135	0.11
136	0.1
137	0.1
138	0.12
139	0.12
140	0.11
141	0.11
142	0.11
143	0.12
144	0.17
145	0.18
146	0.18
147	0.22
148	0.24
149	0.25
150	0.27
151	0.33
152	0.38
153	0.46
154	0.52
155	0.53
156	0.55
157	0.57
158	0.55
159	0.46
160	0.38
161	0.28
162	0.21
163	0.17
164	0.12
165	0.08
166	0.08
167	0.09
168	0.09
169	0.11
170	0.11
171	0.1
172	0.11
173	0.18
174	0.19
175	0.18
176	0.17
177	0.16
178	0.17
179	0.16
180	0.15
181	0.08
182	0.08
183	0.08
184	0.07
185	0.06
186	0.05
187	0.05
188	0.04
189	0.04
190	0.05
191	0.05
192	0.05
193	0.05
194	0.04
195	0.04
196	0.04
197	0.04
198	0.05
199	0.05
200	0.06
201	0.06
202	0.06
203	0.06
204	0.08
205	0.09
206	0.09
207	0.09
208	0.09
209	0.09
210	0.08
211	0.08
212	0.06
213	0.05
214	0.04
215	0.04
216	0.04
217	0.04
218	0.04
219	0.04
220	0.04
221	0.04
222	0.05
223	0.05
224	0.05
225	0.06
226	0.05
227	0.05
228	0.06
229	0.06
230	0.06
231	0.06
232	0.06
233	0.07
234	0.08
235	0.09
236	0.09
237	0.09
238	0.1
239	0.11
240	0.12
241	0.13
242	0.11
243	0.12
244	0.14
245	0.17
246	0.21
247	0.23
248	0.21
249	0.21
250	0.23
251	0.22
252	0.2
253	0.18
254	0.13
255	0.12
256	0.12
257	0.11
258	0.1
259	0.1
260	0.1
261	0.08
262	0.07
263	0.06
264	0.07
265	0.07
266	0.07
267	0.07
268	0.08
269	0.09
270	0.09
271	0.1
272	0.11
273	0.13
274	0.14
275	0.15
276	0.15
277	0.17
278	0.19
279	0.2
280	0.25
281	0.28
282	0.3
283	0.36
284	0.38
285	0.42
286	0.48
287	0.54
288	0.54
289	0.58
290	0.58
291	0.5
292	0.49
293	0.47
294	0.39
295	0.31
296	0.26
297	0.19
298	0.16
299	0.16
300	0.18
301	0.13
302	0.12
303	0.13
304	0.14
305	0.13
306	0.13
307	0.13
308	0.12
309	0.13
310	0.13
311	0.11
312	0.08
313	0.09
314	0.08
315	0.07
316	0.06
317	0.06
318	0.09
319	0.12
320	0.18
321	0.25
322	0.36
323	0.43
324	0.47
325	0.56
326	0.63
327	0.71
328	0.75
329	0.78
330	0.78
331	0.8
332	0.81
333	0.72
334	0.64
335	0.54
336	0.43
337	0.34
338	0.25
339	0.17
340	0.13
341	0.12
342	0.1
343	0.11
344	0.12
345	0.11
346	0.12
347	0.17
348	0.17
349	0.17
350	0.18
351	0.19
352	0.2
353	0.27
354	0.27
355	0.24
356	0.24
357	0.24
358	0.24
359	0.23
360	0.22
361	0.15
362	0.15
363	0.14
364	0.12
365	0.12
366	0.11
367	0.1
368	0.09
369	0.09
370	0.09
371	0.08
372	0.07
373	0.07
374	0.07
375	0.07
376	0.06
377	0.05
378	0.04
379	0.04
380	0.04
381	0.04
382	0.03
383	0.03
384	0.03
385	0.03
386	0.03
387	0.03
388	0.03
389	0.03
390	0.03
391	0.03
392	0.03
393	0.03
394	0.04
395	0.04
396	0.04
397	0.04
398	0.05
399	0.06
400	0.06
401	0.08
402	0.07
403	0.09
404	0.11
405	0.11
406	0.13
407	0.15
408	0.22
409	0.23
410	0.26
411	0.26
412	0.26
413	0.28
414	0.27
415	0.34
416	0.28
417	0.29
418	0.26
419	0.24
420	0.23
421	0.22
422	0.22
423	0.12
424	0.11
425	0.08
426	0.08
427	0.08
428	0.09
429	0.12
430	0.11
431	0.16
432	0.21
433	0.27
434	0.34
435	0.42
436	0.51
437	0.57
438	0.67
439	0.73
440	0.78
441	0.83
442	0.87
443	0.84
444	0.83
445	0.84
446	0.8
447	0.72
448	0.63
449	0.53
450	0.45
451	0.4
452	0.3
453	0.22
454	0.16
455	0.12
456	0.11
457	0.11
458	0.08
459	0.09
460	0.1
461	0.11
462	0.13
463	0.14
464	0.15
465	0.15
466	0.15
467	0.16
468	0.16
469	0.17
470	0.16
471	0.18

A0A395HQK5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer