Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A395HWA9

Protein Details
Accession A0A395HWA9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
12-41SPPPDAVVKKRIIRKKRRPARVQIEADKAKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
20-32KKRIIRKKRRPAR
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 10.5, pero 6, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039171  Cwc2/Slt11  
IPR034181  Cwc2_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR032297  Torus  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PF16131  Torus  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
PS50103  ZF_C3H1  
CDD cd12360  RRM_cwf2  
Amino Acid Sequences MADADTTPKDPSPPPDAVVKKRIIRKKRRPARVQIEADKAKEIQAQFQPQSGTTYNIYYNKWAGGDREDYSQAAAKTRCNLARDSGYTKADAQPGAHICLHFARGLCHRGQDCEYLHRRPTIHDITPPQMDVFGREKFNDYRDDMGGVGSFLRQNRTIYVGKIHVSDDIEEVVARHFAEWGEIDRIRVLTSRGVAFVTYKTEAMAQFAKEAMAHQSLDHNEILNVRWATQDPNPLAQKREARRIEEQAAEAIRRALPAEFIAQIEGKDANAKRQKTSYDLEGYDEPDQVRFAVGLQKTEDSQPEQLALEGAEEQRGQAVIPGAQAEQGGIFSSSTLAALGAARASVSSKPQQVASAQPLVAYDSDDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.4
3 0.47
4 0.5
5 0.55
6 0.56
7 0.57
8 0.64
9 0.72
10 0.73
11 0.77
12 0.81
13 0.85
14 0.88
15 0.91
16 0.92
17 0.93
18 0.92
19 0.91
20 0.89
21 0.86
22 0.85
23 0.79
24 0.71
25 0.62
26 0.52
27 0.44
28 0.39
29 0.32
30 0.3
31 0.32
32 0.38
33 0.36
34 0.39
35 0.38
36 0.34
37 0.38
38 0.32
39 0.28
40 0.22
41 0.23
42 0.26
43 0.28
44 0.29
45 0.27
46 0.27
47 0.25
48 0.25
49 0.23
50 0.21
51 0.21
52 0.24
53 0.22
54 0.25
55 0.24
56 0.23
57 0.23
58 0.25
59 0.21
60 0.24
61 0.24
62 0.22
63 0.25
64 0.31
65 0.34
66 0.32
67 0.33
68 0.32
69 0.36
70 0.38
71 0.39
72 0.37
73 0.35
74 0.34
75 0.34
76 0.33
77 0.3
78 0.26
79 0.22
80 0.23
81 0.24
82 0.26
83 0.25
84 0.21
85 0.19
86 0.2
87 0.21
88 0.16
89 0.15
90 0.14
91 0.18
92 0.21
93 0.21
94 0.25
95 0.24
96 0.26
97 0.28
98 0.3
99 0.27
100 0.33
101 0.38
102 0.37
103 0.38
104 0.39
105 0.37
106 0.35
107 0.41
108 0.38
109 0.35
110 0.36
111 0.37
112 0.37
113 0.38
114 0.36
115 0.27
116 0.22
117 0.2
118 0.19
119 0.19
120 0.18
121 0.18
122 0.19
123 0.22
124 0.22
125 0.25
126 0.25
127 0.23
128 0.22
129 0.21
130 0.21
131 0.18
132 0.16
133 0.14
134 0.1
135 0.08
136 0.06
137 0.07
138 0.07
139 0.1
140 0.11
141 0.12
142 0.12
143 0.17
144 0.18
145 0.17
146 0.2
147 0.2
148 0.19
149 0.19
150 0.19
151 0.15
152 0.15
153 0.14
154 0.12
155 0.1
156 0.09
157 0.08
158 0.07
159 0.06
160 0.06
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.06
167 0.07
168 0.1
169 0.1
170 0.11
171 0.11
172 0.11
173 0.1
174 0.11
175 0.1
176 0.08
177 0.09
178 0.1
179 0.1
180 0.1
181 0.09
182 0.1
183 0.09
184 0.11
185 0.1
186 0.09
187 0.09
188 0.11
189 0.11
190 0.12
191 0.13
192 0.11
193 0.1
194 0.1
195 0.1
196 0.09
197 0.09
198 0.09
199 0.09
200 0.09
201 0.09
202 0.12
203 0.13
204 0.15
205 0.15
206 0.13
207 0.12
208 0.12
209 0.13
210 0.15
211 0.14
212 0.12
213 0.13
214 0.13
215 0.15
216 0.17
217 0.23
218 0.19
219 0.25
220 0.29
221 0.3
222 0.32
223 0.35
224 0.4
225 0.38
226 0.47
227 0.45
228 0.46
229 0.49
230 0.52
231 0.51
232 0.45
233 0.41
234 0.34
235 0.32
236 0.27
237 0.22
238 0.18
239 0.14
240 0.12
241 0.12
242 0.09
243 0.08
244 0.09
245 0.1
246 0.1
247 0.1
248 0.11
249 0.1
250 0.1
251 0.11
252 0.1
253 0.08
254 0.14
255 0.14
256 0.23
257 0.29
258 0.31
259 0.33
260 0.37
261 0.39
262 0.38
263 0.41
264 0.38
265 0.37
266 0.36
267 0.36
268 0.34
269 0.34
270 0.31
271 0.29
272 0.23
273 0.17
274 0.17
275 0.14
276 0.12
277 0.09
278 0.09
279 0.14
280 0.15
281 0.16
282 0.18
283 0.19
284 0.2
285 0.22
286 0.24
287 0.21
288 0.22
289 0.21
290 0.2
291 0.19
292 0.18
293 0.16
294 0.14
295 0.11
296 0.11
297 0.1
298 0.1
299 0.1
300 0.1
301 0.1
302 0.1
303 0.09
304 0.09
305 0.11
306 0.1
307 0.11
308 0.12
309 0.11
310 0.12
311 0.12
312 0.1
313 0.08
314 0.07
315 0.07
316 0.07
317 0.07
318 0.06
319 0.07
320 0.07
321 0.07
322 0.07
323 0.06
324 0.06
325 0.06
326 0.07
327 0.06
328 0.06
329 0.06
330 0.06
331 0.08
332 0.09
333 0.15
334 0.21
335 0.26
336 0.28
337 0.29
338 0.32
339 0.33
340 0.38
341 0.38
342 0.37
343 0.32
344 0.31
345 0.3
346 0.29
347 0.27